大鼠肝癌细胞与胎肝细胞间抑癌微小RNAs的表达差异

微小RNAs(miRNAs)是一类短序列、非编码、具有调控功能的单链小分子RNA[1],通过与其靶mRNA分子互补结合,在翻译水平上特异性抑制基因表达,参与调控生物生长和发育等许多复杂的生命过程[2,3],异常的miRNAs表达可能与人类许多疾病乃至肿瘤的发生和发展都密切相关[3,4].已知的miRNAs参与癌症发生的机制包括细胞黏附、血管生成、蛋白质水解、细胞信号系统、细胞增殖、侵袭转移和细胞死亡[5].miRNAs在肝癌组织中异常表达,它可能参与了肝细胞癌变及肝癌转移的病理过程[6].本研究应用Exiqon miRNA基因芯片技术,建立大鼠肝癌细胞和胎肝细胞之间miRNAs的差异表达谱,探索肝癌诊断和预后的新指标.DOI:10.3760/cma.j.issn.1007-3418.2009.02.016     

微小RNA在大鼠心脏逆重构中的变化

目的 构建大鼠心脏肥厚及移植模型来模拟临床心脏重构及逆重构过程,检测该过程中心脏胶原、转化生长因子-β(TGF-β)及微小RNA(miRNA)的改变,阐述TGF-β胶原轴在该过程中的变化并筛选部分可能参与该过程的miRNA.方法 实验Lewis大鼠分为4组,分别为假手术组、心脏肥厚组、肥厚移植组及单纯移植组.以动物超声心动图、免疫组织化学、心肌细胞横截面积检测、实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)检测等方法对模型心肌细胞、心脏胶原和TGF-β的表达进行检测.miRNA芯片检测各组心脏组织miRNA的变化,对其中部分有意义的miRNA进行qRT-PCR验证,并通过miRNA靶点数据库分析其功能.结果 心脏肥厚组大鼠心脏重量、左心室重量、心室壁厚度和心肌横截面积均高于假手术组,而肥厚移植组均低于心脏肥厚组.单纯移植组心脏重量及心脏与整体重量比值均低于假手术组.心脏肥厚组胶原及TGF-β表达均高于假手术组,肥厚移植组中其表达高于心脏肥厚组.经基因芯片检测发现有82个miRNA在4个实验组中发生了2倍以上的变化,心脏肥厚组有1个miRNA高于假手术组,9个miRNA低于假手术组;肥厚移植组有26个miRNA高于心脏肥厚组,6个低于心脏肥厚组;单纯移植组有29个miRNA高于假手术组,11个低于假手术组.对其中6个miRNA进行验证,结果发现各组均发生了显著性变化,各组间△△CT差大于2倍,差异有统计学意义(P＜0.05).结论 大鼠心肌肥厚及卸负荷模型能较好的模拟心脏重构及逆重构过程.胶原和TGF-β在心脏肥厚模型中增加,且经卸负荷处理后增加更多.较多miRNA在肥厚过程中发生了改变,经对部分miRNA作用靶点的查找发现,miRNA可能通过不同的机制影响心脏重构及逆重构过程.

Abstract：

Objective To establish a reverse remodeling heart model in rats and observe collagen and TGF-β expression and relevant rmicroRNAs changes during reverse remodeling. Methods Lewis rats were divided into four groups including sham(NL, n = 10), abdominal aortic constriction(AAC, n = 10),heterotopic transplantation of abdominal aortic constriction(AAC-HT, n = 9)and heterotopic transplantation of normal heart(HT, n = 8). Left ventricular wall thickness and LV cavity were measured by echocardiography. The cardiomyocyte cross-sectional area(CSA)was determined on HE stained sections.Immunohistochemical and qRT-PCR were used to detect collagen and TGF-β expressions. miRNAs were detected by MicroRNA microarray. Results Heart weight, left ventricular wall thickness and CSA were significantly increased in AAC hearts compared to those in the NL and AAC-HT hearts. The collagen and TGF-β were increased in AAC hearts and further increased in AAC-HT hearts. miRNA microarray evidenced more than two folds changes on 82 miRNAs compared to NL(10 in AAC, 32 in AAC-HT and 40 in HT).Conclusion Rat abdominal aortic constriction and heterotopic transplantation could be used as a reverse remodeling heart model and significant collagen and TGF-β as well microRNA expression changes were evidenced in this model.     

微小RNA-182通过靶基因Rac1调控高糖诱导的心肌细胞肥大

目的 探讨微小RNA(miR)-182调控高糖诱导的心肌细胞肥大的机制.方法 利用生物信息学方法预测调控Ras相关的C3肉毒素底物1(Rac1)的候选miR.在糖尿病组小鼠(db/db小鼠)和对照组小鼠(db/m小鼠)心肌组织中验证所有候选miR的表达,并分别与Rac1 mRNA做Pearson相关性分析.体外实验,将原代培养的乳鼠心肌细胞分为对照组(葡萄糖浓5 mmol/L)和高糖组(葡萄糖浓度33 mmol/L,HG组).光镜下观察各组乳鼠心肌细胞的形态学变化.采用实时逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测两组乳鼠心肌细胞中miR-182和Rac1 mRNA表达水平.再将原代乳鼠心肌细胞分为4组,分别为正常糖组(葡萄糖浓度5 mmol/L,对照组)、高糖组(葡萄糖浓度33mmol/L,HG组)、正常糖+miR-182模拟物组(miR-182组)和高糖+miR-182模拟物组(HG+ miR-182组).采用Lipofectamine2000转染miR-182模拟物(终浓度为100 nmol/L).分别采用RT-PCR和蛋白免疫印迹法检测乳鼠心肌细胞中Rac1、β-肌球蛋白重链(β-MHC)、α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)的mRNA和蛋白表达水平.结果 生物信息学方法预测到参与调控Rac1的候选miR共6个,分别为miR-182、miR-142-3p、miR-140、miR-101a、miR-429和miR-200b.糖尿病组小鼠心肌组织中miR-182和miR-142-3pmRNA表达水平均明显低于对照组(P均＜0.05),且miR-182、miR-142-3p mRNA均与Rac1 mRNA表达水平呈负相关(相关系数分别为r=-0.89102,r=-0.837 19),miR-182与Rac1负相关性最为显著.体外实验结果显示HG组乳鼠心肌细胞中miR-182 mRNA表达水平明显低于对照组(P＜0.05),Rac1 mRNA表达水平则明显高于对照组(P＜0.05);光镜下观察HG+ miR-182组乳鼠心肌细胞肥大程度轻于HG组;HG+ miR-182组乳鼠心肌细胞Rac1和β-MHC mRNA及蛋白表达水平均明显高于HG组(P均＜0.05).结论 miR-182可能通过其靶基因Rac1对高糖诱导的心肌细胞肥大进行调控.     

微RNA-374b与前列腺癌恶性程度及生化复发的分析

目的检测前列腺癌组织及良性前列腺组织中微RNA-374b表达,探讨其与前列腺癌恶性程度及生化复发的关系。方法收集广州医科大学附属广州市第一人民医院、中山大学附属第二医院、广州市红十字会医院2000年至2010年泌尿外科103例前列腺癌手术后的样本和25例前列腺增生手术获取的前列腺良性组织样本。采用原位杂交技术检测微RNA．374b在前列腺癌组织及良性前列腺组织中表达,并对微RNA．374b表达与前列腺癌患者年龄、术前PSA、临床分期、病理分期、Gleason评分、是否生化复发、是否转移及是否死亡的关系进行统计分析。根据微RNA．374b的相对表达量,以中位数（M=4．50）将其分为低表达组及高表达组,运用Kaplan．meier方法及Log．rank检验进行总体生存率和无生化复发生存率分析。结果微RNA．374b在前列腺癌的表达低于良性组织（3．97±1．17比4．70±0．71,P〈0．05）。微RNA．374b的表达量同Gleason评分、病理分期、转移、是否生存及生化复发有关（均P〈0．05）,同年龄、PSA水平及临床分期无关（均P〉0．05）。微RNA．374b低表达组无生化复发生存率低于高表达组（P〈0．05）,高表达组的生化复发时间高于低表达组（P〈0．05）。微RNA．374b表达与总体生存率无关。结论微RNA．374b的低表达与前列腺癌恶性程度有关,有望成为评价前列腺癌恶性程度及生化复发的指标。     

炎性肿块肺纤维化组织中miR-21和TGFβ1的表达变化

[目的]观察炎性肿块肺纤维化组织中miR-21和转化生长因子β1(transforming growth factorβ1,TGFβ1)的表达变化,探讨两者的表达变化是否与肺纤维化形成有关.[方法]选择10例炎性肺部肿块标本,每例分别按纤维化组织和旁近正常肺组织配对留取,所有标本均采用Real-time PCR方法检测组织中miR-21和TGFβ1的表达量变化,分析其表达是否与肺纤维化有关.[结果]肺纤维化组织中miR-21和TGFβ1的表达明显高于正常旁近肺组织,且两者相比较差异均有显著性(P＜0.01).[结论]miR-21和TGFβ1在炎性肿块肺纤维化组织中高表达,其高表达与炎症导致的肺纤维化形成有关.     

miRNA表达与儿童急性淋巴细胞白血病预后及复发的相关性研究

目的 筛选儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)相关的microRNA(miRNA),研究miRNA的表达与ALL复发以及预后是否相关,寻找判断复发以及预后的新指标.方法 采用基因芯片技术分析49例初诊ALL患儿和作为对照组的12例原发免疫性血小板减少症(ITP)患儿的miRNA表达谱,实时定量RT-PCR方法验证异常的miRNA表达.分析miRNA表达与预后相关指标、泼尼松早期反应以及1年内是否复发的相关性.结果 miRNA表达谱在儿童ALL中有特异的表达模式,且与泼尼松治疗反应和早期复发存在相关关系;8个特异表达水平的miRNA(miR-18a、miR-532、miR-218、miR-625、miR-193a、miR-638、miR-550和miR-633)能幕本区分泼尼松治疗试验敏感与不敏感的患者.而早期复发的患儿无论初诊时临床分型属高危或非高危,均有一些相同特征的miRNA异常表达,其中miR-7、miR-216和let-7i表达上调,miR-486、miR-191、miR-150、miR-487和miR-342表达下调.结论 在儿童ALL中异常的miRNA表达谱提示miRNA在白血病发生中起重要作用,其表达信息可能为更准确地评估儿童ALL的预后、更合理的分型治疗以及复发前进行临床早期干预提供依据.

Abstract：

Objective To screen childhood ALL related microRNAs ( miRNAs), analyze association of miRNAs expression profiles with prognosis and relapse in childhood acute lymphoblastic leukemia (ALL) and explore new indicator for predicting relapse and prognosis. Methods miRNAs expression profile was analyzed by gene chip in 49 newly diagnosed childhood ALL and 12 primary immune thrombocytopenia (ITP) cases( as control group). Abnormal expression of miRNAs was verified by qRT-PCR. The correlation of miRNAs expression pattern with indicators predicting early prednisone response and relapse within a year was analyzed. Results Specific expression of miRNAs profiles associated with prednisone response and early relapse in childhood ALL was identified. Eight miRNAs ( miR-18a, miR-532, miR-218, miR-625, miR-193a, miR-638, miR-550 and miR-633 ) could distinguish prednisone sensitive from insensitive. The early relapse of newly diagnosed patients with either high-risk or non-high-risk clinical types had some characteristics of abnormal expression of miRNAs, including miR-7, miR-216 and let-7i upregulated, while miR-486, miR-191, miR-150,miR-487 and miR-342 downregulated. Conclusions The initial screening reveals miRNAs differentially expressed from normal in ALL suggesting the potential roles of them in leukemogenesis. MiRNAs expression signatures may be useful for predicting prognosis and relapse in childhood ALL and directing personalized treatment.     

食管癌组织miR-133表达对其癌细胞生长的影响

[目的]探讨食管癌组织中miR-133表达对其癌细胞生长的影响.[方法]采用RT-PCR法检测miR-133在食管癌组织中的表达.利用脂质体Lipofectamine 2000将miR-133 mimics、anti-miR-133及其分别相应的对照转入食管癌细胞中,RT-PCR检测miR-133的表达,MTT法检测细...     

坐骨神经预损伤后miR-124-3p调节GAP-43表达并促进轴突生长的实验研究

 目的 通过研究坐骨神经预损伤后背根神经节中microRNA表达谱变化,探讨坐骨神经预损伤促进脊髓后索损伤修复机制。方法 利用微阵列芯片技术和生物信息学方法,研究与坐骨神经预损伤促进脊髓后索损伤修复有关的microRNA,并用RT-qPCR技术、Western blot技术、免疫荧光染色、反义miRNA寡核苷酸抑制剂等技术验证。结果 单纯脊髓后索损伤组miR-124-3p在大鼠脊髓后索损伤后7 d、14 d明显上调;坐骨神经预损伤组,脊髓后索损伤后7 d、14 d背根神经节中miR-124-3p明显下调。与正常背根神经节神经元相比,抑制miR-124-3p后GAP-43表达增加,神经元轴突延长。与对照组相比,各组各时间窗STAT3 mRNA表达差异无统计学意义,坐骨神经预损伤组STAT3蛋白在脊髓后索损伤后7 d和14 d表达上调而单纯脊髓后索损伤组脊髓后索损伤后7 d和14 d STAT3蛋白表达下调。与正常背根神经节神经元相比抑制miR-124-3p的神经元STAT3免疫荧光增强、轴突延长,p-STAT3、GAP-43蛋白表达明显上调。与正常背根神经节神经元相比AG490+AMO-124共同处理的神经元轴突长度无明显差异,STAT3表达明显上调,而p- STAT3和GAP-43表达无明显差异。结论 背根神经节神经元中miR-124-3p下调通过STAT3蛋白的上调促使GAP-43蛋白表达增加是坐骨神经预损伤促进脊髓后索损伤修复的机制之一。     

调节青少年特发性脊柱侧凸患者椎旁肌改变的关键微RNA

目的探寻调节青少年特发性脊柱侧凸(AIS)患者椎旁肌改变的关键微RNA(miRNA)。方法对3例女性AIS患者凹侧与凸侧椎旁肌组织进行RNA高通量测序,获得差异表达miRNA。使用27例AIS手术患者的椎旁肌组织采用实时荧光定量PCR法验证测序的质量和差异,并将miRNA的相对差异表达量与患者临床参数进行相关性分析。结果 AIS患者凹侧与凸侧椎旁肌组织存在18个差异表达miRNA。实时荧光定量PCR法检测结果显示,miR-516、miR-517、mi R-495的表达差异具有统计学意义(P 0.05)。两侧椎旁肌miR-516相对表达量差值与患者发病年龄呈负相关(r=-0.452),miR-517相对表达量差值与侧凸Cobb角呈负相关(r=-0.378)。结论 AIS患者两侧椎旁肌miR-516、miR-517、miR-495存在不对称表达,其中miR-516、miR-517的不对称表达与发病年龄和侧凸角度相关。