基于液相色谱-质谱技术的乳腺癌转移相关 代谢标志物的筛选

摘要：目的 应用代谢组学技术筛选与乳腺癌转移相关的代谢标志物。方法 收集100例乳腺癌患者和50例 健康志愿者的血清标本,采用高效液相色谱-轨道离子阱质谱联用（HPLC-LTQ Orbitrap XL MS）代谢组学研究平台分 析乳腺癌未转移患者、乳腺癌转移患者和健康人群血清标本的代谢轮廓,并通过模式识别方法结合非参数检验对数 据进行分析。结果 由乳腺癌未转移组、乳腺癌转移组和健康对照组的代谢轮廓构建的正交偏最小二乘判别分析 （OPLS-DA）模型具有很好的判别能力（R2=95.2%,Q2=86.7%）,可以鉴别出用于区分乳腺癌转移与否的8个代谢标志 物,包括溶血磷脂酸［18∶1（9Z）/0∶0］、溶血磷脂酰胆碱（18∶0）、溶血磷脂酰胆碱［20∶3（5Z,8Z,11Z）］、胆碱、磷酸二羟 丙酮（18∶0e）、2R,3S-番石榴酸、芥酸、L-氢化乳清酸。结论 利用代谢组学方法获得的血清代谢轮廓可以用来构建 区分模型和寻找乳腺癌转移相关的代谢标志物,为乳腺癌的早期诊治、预后评估和药物治疗靶点的选择提供支持和 依据。     

基因表达谱数据分类算法综述

基因表达谱数据的分类算法有很多种,每种分类算法有其各自的特点,不同分类算法在不同基因表达谱数据中的分类效果也有所不同。本文主要对目前应用较多的四种分类算法(判别分析、决策树、支持向量机、集成算法)的特点和研究进展进行综述,为相关研究和应用提供科学指导。     

基于指纹图谱及化学模式识别研究盐制对五子衍宗丸化学成分的影响

目的建立不同炮制品组方五子衍宗丸(Wuzi Yanzong Pills,WYP)的HPLC指纹图谱,研究盐制对WYP化学成分的影响。方法采用HPLC法建立不同炮制品组方WYP的指纹图谱,并进行相似度评价,采用方差分析、聚类分析(CA)、主成分分析(PCA)与偏最小二乘法-判别分析(PLS-DA)对结果进行评价。结果 WYP全生品组、药典组、盐制组指纹图谱相似度均大于0.9,标定了18个共有峰,利用对照品指认出绿原酸(5号峰)、鞣花酸(10号峰)、金丝桃苷(11号峰)、异槲皮苷(12号峰)、毛蕊花糖苷(13号峰)、紫云英苷(14号峰)、槲皮素(15号峰)、山柰酚(17号峰)、五味子醇甲(18号峰)9个成分,归属性分析表明峰2来源于枸杞子,峰3、5、7、9、11、12、14、15、17来源于菟丝子,峰6、8、10、16来源于覆盆子,峰13来源于车前子,峰18来源于五味子,峰1是覆盆子和五味子共有成分,峰4是枸杞子和覆盆子共有成分。药物炮制后组方WYP未出现色谱峰的增加,但峰面积发生变化。通过CA将WYP全生品组、药典组、盐制组聚为3类,PCA筛选出4个主成分,PLS-DA标记出峰1、13(毛蕊花糖苷)、10(鞣花酸)、7、4、11(金丝桃苷)、12(异槲皮苷)、3、5(绿原酸)共9个差异性成分;绿原酸、鞣花酸、金丝桃苷、异槲皮苷、山柰酚、五味子醇甲及峰1、3、4、7、8共11个成分可能是不同炮制品组方WYP的差异标志物。结论建立的指纹图谱测定方法稳定、可靠,炮制后组方WYP的化学成分发生变化,结果可为WYP中如何选用药物炮制品提供一定的依据。     

近红外光谱法快速鉴别市售不同厂家生产的藿胆丸

目的:建立快速鉴别市售不同厂家生产的藿胆丸的方法。方法:采用近红外光谱法。采集7个厂家的藿胆丸样品的近红外光谱,并用判别分析方法和聚类分析方法分别对数据进行分析。结果:聚类分析中,当类间距离为0.64时,K厂家和G厂家样品首先聚为一类,当类间距离为1.84时,其他5个厂家样品自成一类;所建立的判别分析模型错判例数为0,判别分析准确率为100%。结论:所建立的近红外光谱法可以快速、准确、无损地对不同厂家生产的藿胆丸制剂进行定性分析。     

对重症严重急性呼吸综合征临床诊断标准的决策树判别分析

2003年严重急性呼吸综合征（severe acute respiratory syndrome，SARS）在我国爆发，卫生部针对此情况推出重症SARS的诊治标准，但仅是经验性的总结。目前经过对临床资料全面的收集和遴选，特别是通过对影像资料的量化处理，有机会对这种疾病的演变规律进行更深入的分析；临床上急性肺损伤的病理生理机制与SARS相似，我们应用1994年美国胸科与危重病学分会提出的急性肺损伤（ALI）和急性呼吸窘迫综合征（ARDS）的标准，对确诊的重症SARS患者临床资料进行数据再分析。     

刺老苞不同炮制品对成肌细胞C2C12增殖活性和成分的影响

目的：基于刺老苞不同炮制品对成肌细胞C2C12增殖活性的影响,利用UPLC-ESI-MS/MS方法探究不同炮制品存在药效差异的物质基础。方法：MTT法检测不同浓度（25、50、100、200μg/mL）刺老苞生品、清炒品、盐炙品对成肌细胞C2C12增殖的影响。采用UPLC-ESI-MS/MS方法分析3种刺老苞炮制品的化学成分,并对其进行主成分分析、正交偏最小二乘法判别分析、聚类分析等多元统计分析,初步推断不同刺老苞炮制品的成分差异。结果：MTT检测结果显示,在一定浓度范围内3种刺老苞炮制品均促进成肌细胞C2C12增殖,除了50μg/mL刺老苞生品和清炒品外,其余各浓度刺老苞生品、清炒品、盐炙品两两比较均具有显著性差异（P<0.01,P<0.05）。多元统计分析显示,3种炮制品存在药效差异可能与酚酸类、萜类、生物碱、黄酮类等成分有关。结论：该研究从药物的药效差异出发,结合代谢组学,初步阐述了刺老苞不同炮制品存在药效差异的物质基础,为民族药的进一步开发和应用奠定理论基础。     

基于QAMS联合化学计量学综合评价麻芩消咳颗粒质量

目的：建立麻芩消咳颗粒多指标成分联合化学计量学的综合质量评价方法。方法：采用一测多评法（QAMS）收集12批麻芩消咳颗粒样品,以黄芩苷为含量测定内参物,运用外标法和QAMS计算麻芩消咳颗粒中苦杏仁苷、桑辛素M、桑黄酮G、桑黄酮C、桑皮酮E、桑辛素、黄芩苷、汉黄芩苷、黄芩素和汉黄芩素的含量,对比2种方法的差异,再应用聚类分析（CA）、主成分分析（PCA）、偏最小二乘法-判别分析（PLS-DA）对含量数据进行综合分析,挖掘影响麻芩消咳颗粒质量的主要潜在标志物。结果：10个成分线性关系均良好（r≥0.999 1）,方法准确可靠,平均回收率为96.94%～100.18%(RSD<2.0%)。2种方法 t检验结果 P值均大于0.05。化学计量学方法显示12批麻芩消咳颗粒分为3类;黄芩苷、桑黄酮G、苦杏仁苷、桑辛素是影响麻芩消咳颗粒质量的主要潜在标志物。结论：建立的QAMS联合化学计量学方法操作便捷、结果准确,有效地降低了检验成本,能够更加全面地评价麻芩消咳颗粒的整体质量,可为提升其质量控制标准提供参考。     

基于多元统计学方法的维药没食子药材红外光谱研究

目的：建立了不同批次的没食子药材红外光谱、二阶导数红外光谱,结合多元统计分析对25批没食子进行了研究,为没食子药材鉴别提供新的方法。方法：采用傅里叶变换红外光谱仪采集不同批次没食子药材红外光谱,利用OMNIC软件对25批没食子药材样品的红外指纹图谱进行基线校正、平滑等处理,采用Microsoft Excel2016进行正态分布分析,采用SPSS 22.0软件进行聚类分析和主成分分析,采用SIMCA 14.1软件进行正交偏最小二乘法-判别分析,以变量重要性投影（VIP）值>1为标准,筛选影响没食子药材成分质量的标志性波数。结果：对25批没食子药材样品进行了红外光谱分析,其相关系数为0.932 7～0.995 6。二阶导数图谱可以分离出原光谱中的一些相互重叠的吸收峰。正态分布曲线结果表明,广西来源与安徽来源没食子药材质量存在明显差异,中国广西、广东与伊朗哈吉阿巴德来源没食子药材样品质量相近。聚类分析表明,25批没食子药材在10～15个组间的间距下可以聚成4类。主成分分析发现,累积方差贡献率为89.565%;广西来源没食子药材的综合得分最高,安徽来源没食子药材的综合得分最低。正交偏最小...     

基于中药拉曼谱图的寒热药性判别研究

从中药的整体性出发,开展中药拉曼谱图与其寒热药性的相关性分析,并对中药寒热药性进行统计判别研究。本研究选取寒凉性中药109种、温热性中药128种,共计237种中药;经样品前处理后,利用如海光电SEED 3000近红外拉曼光谱仪进行检测,得到每味中药的拉曼谱图;并对量化后的中药拉曼数据进行特征筛选和统计检验,筛选出与寒热药性密切相关的特征拉曼位移及其峰强,然后基于5种算法进行寒热药性的判别建模。经比较分析发现,相较于其他模型,随机森林(RF)模型展现出最佳的效果,对测试集判别的正确率高于90%,曲线下面积(AUC)和精确度大于0.90。本研究基于大样本量中药的分析,中药的拉曼数据与其寒热药性之间具有显著的相关性,可作为药性表征指标,结合RF算法进行寒热药性的判别分析。     

基于化学模式识别技术提升参威骨痹片的质量标准并监测其生产中质控指标的转移率变化

目的:提升参威骨痹片的质量标准,初步探索其质量控制指标成分在批间含量差异较大的原因。方法:采用HPLC建立参威骨痹片的指纹图谱,以Diamonsil C18(4. 6 mm×250 mm,5μm)为色谱柱,流动相乙腈(A)-0. 1%磷酸水溶液(B)梯度洗脱(0～5 min,10%A;5～15 min,10%～12%A;15～30 min,12%～26%A;30～43 min,26%～31%A,43～50 min,31%～40%A,50～70 min,40%～55%A;70～84 min,55%～72. 5%A),检测波长230 nm。以共有峰为自变量绘制正交偏最小二乘法-判别分析-变量重要性投影(OPLS-DA-VIP)图,将共有峰对该制剂各批次间指纹图谱差异的贡献度量化,寻找差异较大的色谱峰,结合相关文献,筛选出与参威骨痹片临床适应症相关的成分并进行其含量测定的专属性试验,最终选定质控指标。通过HPLC-二极管阵列检测器(DAD)同时对本品及其生产过程中间体中质控指标进行测定,检测波长236,276,230,322 nm,其他条件同HPLC指纹图谱检测方法。结果:HPLC指纹图谱共标定了26个共有峰,各批次样品指纹图谱与对照指纹图谱的相似度均≥0. 950。优选出马钱苷酸、龙胆苦苷、芍药苷、蛇床子素为参威骨痹片的质控指标,四者的平均质量分数分别为161. 02,401. 80,255. 54,80. 68μg·g-1。结论:所建立的指纹图谱及多指标定量分析方法稳定、可靠,可用于参威骨痹片的质量控制。原料药批间质控指标成分含量差异和生产过程中间体的质控方法不够完善是引起该制剂批间质控指标成分含量差异较大的主要原因。