耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌产酶耐药机制及同源性分析

目的探讨肺炎克雷伯菌对碳青霉烯类抗菌药物耐药的主要产酶机制及同源性。方法收集长沙市第一医院2016年12月-2017年12月临床分离的非重复碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(CRKP),采用改良碳青霉烯酶灭活试验(mCIM)检测碳青霉烯酶,聚合酶链反应(PCR)法检测常见耐药编码基因。脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型(MLST)分析同源性。结果共收集到57株CRKP,mCIM试验阳性率为91.23%(52/57)。PCR共检出6种耐药基因,包括blaSHV、blaCTX-M-9群、blaKPC-2、blaTEM、blaCTX-M-1群和blaNDM-1,检出率分别为94.74%、68.42%、68.42%、56.14%、3.51%和1.75%,其中2株携带blaCTX-M-1群的菌株经测序证实为blaCTX-M-80和blaCTX-M-123,blaCTX-M-9群中1株为blaCTX-M-27,2株为blaCTX-M-14,其余均为blaCTX-M-65。PFGE结果显示,57株CRKP可分为A~H共8种不同的型别,以A型为主,占76.79%,其中A6亚型占32.56%。MLST结果显示,共检出ST11和ST29两种型别,以ST11为主,占75.00%。结论该院临床分离的肺炎克雷伯菌对碳青霉烯类抗菌药物耐药的重要机制为产KPC-2型碳青霉烯酶,且同时携带多种超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)耐药基因。PFGE和MLST结果表明:该院临床分离的CRKP存在克隆传播,需加强流行病学监控。     

ADULT综合征与Tp63基因突变

ADULT综合征是一种外胚层发育异常疾病,属常染色体显性遗传,临床表现为四肢发育畸形、神经性皮炎改变(包括指/趾剥脱性皮炎)、皮肤干燥、乳腺和乳头发育不全或缺失、缺指(趾)畸形和并指症、指(趾)甲发育异常、泪管闭锁、少汗、牙齿发育不全等症状,该病由Tp63基因错义突变所引起.Tp63基因主要在各种上皮组织的发育、分化和形态发生过程中起作用,对于胚胎形成过程的外胚层发育具有重要的意义.研究发现ADULT综合征与Tp63基因外显子3'、4、6、8的核苷酸发生错义突变相关.Tp63基因的突变位点不同导致临床表现存在差异,即使突变位点相同,患者的临床表现还存在地域、种族和个体差异.本文就ADULT综合征的临床表现与Tpi3基因突变的关系进行综述.     

Design and application research of nucleotide sequence analysis system software

INTRODUCTION　　From integrallevel and celllevel,the research of organism and diseasediagnosishave already entered molecular level.Molecular biology is the science to researchstructure and function of organism macromolecule.Based on differentgene code se-…     

搜索空间逐步缩小的遗传算法用于尿沉渣图像特征选择的研究

基于尿沉渣图像特征选择问题,提出一种新的特征优选方法,首先引入类空间分层分类思想,将多类成分特征集优选问题转化为两类成分的特征集优选问题以减少特征数,从而减少了后续分类器的维数复杂度并提高了优选后的特征集对成分的识别率;针对红细胞和白细胞的特征集优选问题,采用改进的遗传算法进行处理,先根据统计实验结果,锁定待选特征集中形态特征和纹理特征相应的两个可分度最大且相互独立的特征,然后使用基因位逐步锁定技术,结合小生境技术和自适应交叉变异算子,提高了遗传算法的搜索性能;最后,为了提高特征集的优选效果和稳定性,引入"多票投选"机制。就多个尿沉渣成分样本进行验证实验,结果表明,该算法优选的特征集与通过其他方式获得的特征集相比,识别率较高,而且明显减少了后续分类器的维数复杂度。     

胃肠道恶性肿瘤及其周边组织中c-myc基因mRNA表达与临床意义

目的　探讨胃肠道恶性肿瘤及其周围边组织中c -mycmRNA表达与手术切缘的安全性关系。方法　用RT -PCR方法检测了 12例胃癌和 16例肠癌标本肿瘤中心及周边组织中c-mycmRNA的表达。结果　肿瘤的各种分型与各个分期c -mycmRNA的表达无显著性差异。肿瘤周边组织中 ,距肿瘤边缘 4cm处c -mycmRNA表达率显著下降 (P <0 .0 5 ) ,距肿瘤边缘 5cm以远表达率为 0。结论　根据c -mycmRNA表达 ,距肿瘤边缘 5cm处可定为肿瘤较安全的切缘     

利用核磁技术确定游离羟基碳苷的结构和构型

确定游离羟基碳苷的结构和苷键的构型。方法 :以核磁共振谱 (氢谱 ,碳谱 ,氢氢相关谱等 )为主 ,辅以其它波谱数据推断。结果 :证实了所合成的五个游离羟基碳苷a～e均为 β 吡喃构型。 结论 :在无对照品的情况下采用多种波谱数据直接确证游离羟基碳苷的结构和构型是可行的。     

59例老年人肺结核临床特点分析

目的 探讨老年人肺结核病的临床特点,方法 回顾性分析了５９例６０岁以上老年肺结核的临床表现、肺Ｘ线特征、诊断及效果。结果 ①５９例患以肺结核诊断入院２１例（３５．６％）,其他疾病（非结核病）入院３８例（６４．４％）,其中１４例为复发性肺结核;②５４例（９１．５％）合并有不同脏器疾病;③４４例经抗结核治疗后治愈或好转,总有效率为７４．６％;④死亡７例（１３．４％）,其中因确诊晚未及治疗的３例,     

广东地区GBV-C/HGV5'NCR区序列变异的研究

目的 了解广东地区ＧＢＶ－Ｃ／ＨＧＶ５＇ＮＣＲ区的序列变异情况。方法 以ＧＢＶ－Ｃ和ＨＧＶ的５＇ＮＣＲ区安全同源的序列设计合成引物用于套式ＲＴ－ＰＣＲ。从广东地区的１０例ＧＢＶ－Ｃ／ＨＧＶ感染者血中扩增了１０个充列,分别克隆对ｐＵＣ１９、ｐＴ－Ａｄｖ载体。以３５Ｓ标记的双脱氧链末端终止法对这１０个序列分别进行正反两个方向的序列测定。结果 １０株充列相互间同源性最大为１００％,最小为８４．４％。与Ｇ     

基于多尺度特征融合与反向注意力的COVID-19病灶分割

针对新型冠状病毒肺炎（COVID-19）分割问题中感染区域具有高变异性以及病灶与背景对比度低等问题,提出一种基于多尺度特征融合与反向注意力的COVID-19感染分割网络。首先,利用残差网络作为主干网络进行特征提取,并使用全局上下文聚合策略对不同层次特征进行融合得到粗略的分割结果;其次,在网络瓶颈处添加多尺度特征融合模块,利用空洞卷积与多核池化增强网络分割不同尺度病变的能力;最后,设计一种级联结构的反向注意力模块,利用互补区域的细节特征增强背景与目标的对比度。本文方法在COVID-19 CT分割测试集上的准确率、特异性、灵敏度分别达到0.714、0.700和0.958,误检和漏检区域明显减少,细小病灶的分割能力显著提升。     

Performance of point-of care molecular and antigen-based tests for SARS-CoV-2: a living systematic review and meta-analysis

BackgroundMolecular and antigen point-of-care tests (POCTs) have augmented our ability to rapidly identify and manage SARS-CoV-2 infection. However, their clinical performance varies among individual studies.ObjectivesThe evaluation of the performance of molecular and antigen-based POCTs in confirmed, suspected, or probable COVID-19 cases compared with that of laboratory-based RT-PCR in real-life settings.Data sourcesMEDLINE/PubMed, Scopus, Embase, Web of Science, Cochrane Library, Cochrane COVID-19 study register, and COVID-19 Living Evidence Database from the University of Bern.Study eligibility criteriaPeer-reviewed or preprint observational studies or randomized controlled trials that evaluated any type of commercially available antigen and/or molecular POCTs for SARS-CoV-2, including multiplex PCR panels, approved by the United States Food and Drug Administration, with Emergency Use Authorization, and/or marked with Conformitè Europëenne from European Commission/European Union.ParticipantsClose contacts and/or patients with symptomatic and/or asymptomatic confirmed, suspected, or probable COVID-19 infection of any age.Test/sMolecular and/or antigen-based SARS-CoV-2 POCTs.Reference standardLaboratory-based SARS-CoV-2 RT-PCR.Assessment of risk of biasEligible studies were subjected to quality-control and risk-of-bias assessment using the Quality Assessment of Diagnostic Accuracy Studies 2 tool.Methods of data synthesisSummary sensitivities and specificities with their 95% CIs were estimated using a bivariate model. Subgroup analysis was performed when at least three studies informed the outcome.ResultsA total of 123 eligible publications (97 and 26 studies assessing antigen-based and molecular POCTs, respectively) were retrieved from 4674 initial records. The pooled sensitivity and specificity for 13 molecular-based POCTs were 92.8% (95% CI, 88.9–95.4%) and 97.6% (95% CI, 96.6–98.3%), respectively. The sensitivity of antigen-based POCTs pooled from 138 individual evaluations was considerably lower than that of molecular POCTs; the pooled sensitivity and specificity rates were 70.6% (95% CI, 67.2–73.8%) and 98.9% (95% CI, 98.5–99.2%), respectively.DiscussionFurther studies are needed to evaluate the performance of molecular and antigen-based POCTs in underrepresented patient subgroups and different respiratory samples.