基因芯片技术在肿瘤研究中的应用

生物芯片是近几年来发展起来的一项新兴生物技术，用芯片制作的仪器具有体积小、便于携带、无污染、分析速度快、所用样品少等优点，广泛应用于基因表达分析、新基因发现、基因组文库作图、基因突变及多态性分析、疾病诊断、药物筛选和基因测序等领域。本文就基因芯片在肿瘤研究中的应用、存在问题及发展前景等作一综述。     

23S rDNA基因芯片对临床常见致病菌的检测

目的 建立含有10种细菌探针的检测用基因芯片模型。方法 使用合成的23S rDNA寡核苷酸探针，制备基因芯片。细菌核糖体DNA经过23S rDNA通用引物扩增后与芯片上的探针杂交，用荧光扫描仪检测信号。结果 基因芯片检测临床致病菌具有较高的特异性和灵敏性。结论 寡核苷酸探针基因芯片检测系统具有一定的种属鉴别能力，比常规培养法快速、准确。     

Wnt信号传导途径与胚胎着床

胚胎着床是一个受到精确调控的复杂过程，其机制尚未明了。Wnt信号传导途径是调控细胞生长、发育和分化的关键途径，在肿瘤发生和胚胎发育方面有着重要作用。生命活动机制的相似性和基因芯片检测技术的应用使近2年来认识到Wnt信号传导途径介导了围着床期胚胎与子宫内膜、上皮与间质之间的信号交流，在胚胎着床方面有着重要作用，为揭示胚胎着床的机制提供了新切入点。就Wnt信号传导途径和在胚胎着床中的作用综述。     

基因芯片检测血清标本的丙型肝炎病毒基因型

目的：探讨丙型肝炎病毒(HCV)基因分型检测芯片在临床的初步应用及意义。方法：基因芯片检测150例血清标本中HCV基因型，并与HCVRNA定性及测序结果进行比较。结果：HCV基因分型检测芯片检出的阳性结果与HCV—RNA定性及测序结果的相对符合率为100．0％。结论：HCV基因分型检测芯片是一种准确性好、灵敏度高、特异性强、操作简便快速的基因检测方法，可以为临床诊断、治疗提供有力保证。     

微流体芯片及其表面效应

微流体芯片又称为“芯片上的实验室”，是用半导体集成技术制作的新型固体元件，它能够对微量流体进行复杂、精确的操作。在人类基因组的结构分析完成后的今天，该技术与基因芯片技术一样，成为最有发展前途的新技术，对后基因组研究中基因和蛋白质功能研究起着革命性的推动作用。微流体芯片技术的进步，将推动人类基因组计划的快速发展。     

氟斑牙儿童环境应答基因的筛选

目的利用基因芯片技术筛选氟斑牙人群环境应答基因,为氟中毒分子发病机制的进一步研究提供线索。方法利用Affymetrix公司生产的HG-U133A基因芯片分别检测对照组、高氟负荷组(高氟地区无氟斑牙人群)、氟斑牙患者组的白细胞基因表达谱,并利用生物信息学方法对检测结果进行分析。结果高氟负荷组与对照组比较,差异表达基因有1057个,其中显著上调的基因有148个,显著下调的基因有61个;氟斑牙患者组与对照组相比,差异表达基因有964个,其中有71个基因显著上调,60个基因显著下调;氟斑牙患者组与高氟负荷组比较,差异表达基因有633个,其中显著上调和下调的基因分别有15个和67个。结论多种基因与氟中毒的发生相关。     

诊断败血症基因芯片的构建

目的:利用基因芯片诊断识别败血症的致病菌种类,达到快速准确诊断目的.方法:从细菌体内提取总DNA分子,然后进行16SrDNA PCR扩增,最后完成基因芯片的制备.结果:11种标准菌株进行PCR扩增产物为308bp,与设计相符合.此PCR扩增产物与所制作的芯片进行杂交,结果显示致病菌DNA只与相应的检测探针杂交.结论:基因芯片对败血症致病菌实现高通量、并行检测,一次实验即可得出全部结果;操作简便、快速,整个检测4～6 h即可出结果;特异性强、敏感度高,可以检测败血症的所有致病菌.     

两种氨基修饰的基因芯片表面制备方法比较

目的探讨两种氨基化方法修饰玻片表面的过程及其在基因芯片制备中应用的可行性。方法玻片经清洗、硅烷化后，一种用多组分多氨化合物包被，经次亚苯基二异硫氰酸盐表面活化；另一种方法采用的包被剂是丙烯酸-丙烯酰胺单体，活化剂是碳二业胺／N-羟基琥珀亚胺酯官能团分子。将被修饰好的玻片用于λ噬菌体基闲组DNA芯片的制备，并进行杂交检测分析结果经两种方法修饰后玻片表面分别形成分支结构和聚合物涂层，与商业化的芯片比较发现，两种芯片杂交、扫描检测后显示所得点阵的杂交信号均匀、稳定、清晰，杂交点饱满、同一性好。结论两种方法修饰的玻片用于制备基因芯片均取得了成功，其中丙烯酸-丙烯酰胺聚合物包被法处理过程简单、成本低廉、能大规模生产，是一种较理想的芯片表面制备方法。     

基因芯片新技术及其在生物和医学领域的应用

随着包括人类基因组计划(HGP)在内的许多物种的基因组计划的完成,大量基因组数据信息迅速积累,使研究者能够不再局限于通过一个或少数几个基因片面地探索生命的奥秘,而能够大规模地系统分析特定状态下,生命个体或群体表现出的完整的生命过程.     

As2O3对卵巢癌耐顺铂细胞珠的诱导凋亡作用

目的研究三氧化二砷(As2O3)对卵巢癌耐顺铂细胞株COC1/DDP的作用,探讨As2O3抑制肿瘤细胞生长的作用机制。方法①用MTT法检测不同浓度、不同作用时间的As2O3对COC1/DDP的生长抑制率。②用Annexin V-FITC/PI双染色流式细胞术检测As2O3作用于COC1/DDP发生的细胞凋亡。③用cDNA基因芯片筛查与As2O3诱导凋亡发生相关的基因,并用实时定量PCR技术验证结果。结果①As2O3对COC1/DDP有生长抑制作用,其生长抑制作用随着药物浓度的升高和作用时间的延长逐渐增强。②As2O3对COC1/DDP有凋亡诱导作用,随时间延长和剂量加大,凋亡发生率增加(P<0.05)。2.0μmol/LAs2O3作用24 h开始出现凋亡细胞,72 h达高峰,96 h细胞出现坏死。③COC1/DDP细胞在As2O3作用前后上调基因15个,下调基因10个,其中凋亡相关基因Bax、p53、c-Myc的上调,以及耐药基因LRP的下调与As2O3诱导COC1/DDP发生凋亡有关。基因芯片的结果与实时定量PCR验证结果相符合。结论As2O3对卵巢癌耐药细胞株COC1/DDP有生长抑制作用,发生机制与As2O3诱导细胞凋亡发生有关。促凋亡基因和耐药相关基因参与As2O3诱导卵巢癌耐药细胞株凋亡的作用。