评估乳腺癌复发风险的新方法

自20世纪90年代以来,北美和英国等国家的乳腺癌发病率虽然呈上升趋势,但死亡率却均下降,目前认为原因与早期诊断和综合治疗的进步,特别是术后辅助治疗的进步有关。乳腺癌辅助治疗的关键在于对肿瘤个体的复发转移风险评估,医生根据评估结果来确定患者具体的术后辅助治疗方案(例如:是否需要化疗?选择何种化疗方案等)。那么,     

基因芯片研究尿道下裂的基因表达差异

目的筛选出与尿道下裂发病相关的基因。方法尿道下裂病人的尿道或包皮组织,年龄配对的包皮过长患儿组织作为对照,提取组织mRNA,合成双股cDNA并纯化,再逆转录成cRNA,生物素标记的cRNA打成碎片后与人类基因芯片进行杂交,计算机工作站自动扫描并记录芯片上的信号强度,转化为EXCEL数据库,总共分析了22000个基因的表达差异。结果发现一组表达有显著差异的基因,包括CYR61,CTGF,ATF3和GADD45。结论这些表达差异的基因可能参与尿道下裂的发生和发展,为进一步研究关键基因提供了依据。     

槌果藤对局灶节段肾小球硬化鼠模型的治疗作用及作用机制的初步探讨

目的：探讨槌果藤对局灶节段肾小球硬化大鼠模型的治疗作用及作用机制。方法：通过左肾切除并阿霉素尾静脉注射的方法建立FSGS模型。按不同灌胃给药浓度将动物分为75g/L组（A组）、150g/L组（B组）、300g/L组（C组）、600g/L组（D组）,另两组分别为安慰剂对照组（E组）和假手术组（F组）。造模后4周给药,疗程4周。各组动物于治疗前后均分别测定24h尿蛋白定量、血常规、肾功能、谷丙转氨酶（ALT）、总蛋白（TP）、白蛋白（Alb）、胆固醇（TC）水平。治疗后取D、E、F组肾组织抽提总RNA,杂交高密度cDNA芯片并分析结果。结果：各槌果藤煎剂组治疗后24h尿蛋白水平均较治疗前显著下降,其中又以D组下降程度最为显著（P〈0.05）。同时各治疗组治疗后血浆白蛋白均较治疗前有显著上升,血胆固醇、肌酐、尿素氮水平均较治疗前有显著降低,而各治疗组治疗前后血红蛋白、白细胞总数、血小板数和谷丙转氨酶水平均无统计学差异（P〉0.05）。基因芯片检测结果显示与E组比较,D组有包括转化生长因子-β1（TGF-β1）、肿瘤坏死因子α（TNF-α）受体、足细胞相关蛋白（Podocin）、纤维连接蛋白等与FSGS发生发展密切相关的基因表达具有统计学差异。结论：本实验中不同浓度的槌果藤煎剂对FSGS大鼠模型均有减少尿蛋白的作用,其中以600g/L组为最强。观察期内各组均未发现骨髓抑制、肝损害等副反应。槌果藤可能通过下调TNF-α受体、EGF受体、TGF-β1、PDGF、纤维连接蛋白、肾特异性膜蛋白、足细胞相关蛋白Podocin以及ILK的基因表达,上调锌指蛋白216以及硒蛋白的表达等起到免疫调节、抗氧化、抗纤维化作用,其确切作用机制需要进一步研究。     

人类白细胞Ⅰ、Ⅱ类抗原的中分辨度基因芯片分型技术研究

目的 应用基因芯片技术进行北方汉族人群人类白细胞抗原（HLA）Ⅰ、Ⅱ类中分辨度分型研究.方法 根据中国北方汉族人群HLA-Ⅰ、Ⅱ类常见的基因位点以及临床应用中对分型分辨度的实际需要,设计特异性寡核苷酸中分辨度分型探针,制成基因分型芯片.采用带荧光标记的引物,用合适的PCR方法扩增HLA-Ⅰ、Ⅱ类抗原上的多态性区域,产物与芯片上探针杂交.杂交结果经荧光扫描并用特定软件分析判断阳性探针,以此确定样品基因型.共检测30份临床样本.结果 所有样本的HLA-Ⅰ、Ⅱ类抗原基因分型均获成功.此中分辨度探针可分辨出598个Ⅰ类抗原等位基因,511个Ⅱ类抗原等位基因,可捡出Ⅰ抗原特异性57个,Ⅱ抗原特异性30个.结论 基因芯片用于HLA-Ⅰ、Ⅱ类抗原分型可行.     

人鼻腔NK/T细胞淋巴瘤基因表达谱的建立与分析

目的建立并分析人鼻腔NK／T细胞淋巴瘤的基因表达谱。方法鼻腔NK／T细胞淋巴瘤组织和正常淋巴结组织各6例,分别进行总RNA的提取,通过逆转录过程获得标记有荧光的cDNA,分别与2张相同的包含有4096条基因的基因芯片进行杂交,根据杂交结果筛选出与鼻腔NK／T细胞淋巴瘤相关的基因。结果2张芯片中,差异表达趋势一致并且表达强度均相差1倍以上的基因共有365条（8．9％）,包括癌基因和抑癌基因,细胞周期相关基因,细胞凋亡相关基因,DNA合成、修复和重组相关基因,DNA结合、转录和转录因子基因,细胞信号传递相关基因,细胞代谢相关基因以及蛋白翻译、合成相关基因等,其中37条基因差异表达4倍以上。结论鼻腔NK／T细胞淋巴瘤有多条差异表达基因,初步建立了其基因表达谱。     

基因芯片技术及其在食品检测中的应用

1996年，Schena等首次制出世界上第一块基因芯片，并证实了基因芯片的实用价值和应用潜力；基因芯片一出现即引起科研学术界的广泛关注，并日益成为遗传作图、DNA测序、基因表达、突变检测、基因诊断等基因分析最重要的技术平台。     

人膀胱移行细胞癌复发相关基因的筛选

目的：应用基因芯片技术筛选人膀胱移行细胞癌复发相关基因。方法：使用人肿瘤基因表达谱芯片检测11例膀胱移行细胞癌患者的正常膀胱粘膜组织、原发膀胱癌组织及复发膀胱癌组织的基因表达谱．筛选出在原发膀胱癌组织及复发膀胱癌组织中差异表达的基因，并用半定量RT—PCR对部分差异表达基因进行验证。结果：以正常膀胱粘膜组织为对照，11例膀胱肿瘤组织中有87个基因表达明显下调，102个基因表达明显上调．其中有15个基因的表达在原发膀胱癌组织及复发膀胱癌组织呈相反变化。结论：膀胱肿瘤与正常膀胱粘膜组织之间存在大量差异表达的基因，说明膀胱肿瘤的发生与发展是多种肿瘤相关基因表达失常或肿瘤抑制基因失活所致：在原发膀胱癌组织及复发膀胱癌组织中呈反向变化的15个基因可能与膀胱癌的复发有关。     

硫化镍转化人支气管上皮细胞基因差异表达芯片的研究

背景与目的近年研究发现硫化镍(NiS)可引起人支气管上皮细胞(humanbronchialepithelialcell,16HBE)发生恶性转化及转化细胞致癌性,其机制可能与NiS引起基因突变、多种转录因子的异常表达有关。为此,本研究利用NiS恶性转化的体外培养细胞模型,用cDNA微阵列技术研究经NiS转化后的16HBE细胞基因的差异表达,从基因组水平探讨NiS所致细胞恶变的相关基因差异改变。方法分别提取16HBE和经NiS单独处理发生转化的NiS16HBE细胞的总RNA,逆转录合成cDNA并以Cy3dCTP和Cy5dCTP荧光素分别标记制作探针。探针混合后与含4000个人类基因的芯片杂交。以ScanArray4000扫描仪扫描芯片,以GenPixPro3.0软件分析荧光信号,然后对差异表达的基因进行生物学信息分析。结果NiS16HBE细胞样本与16HBE细胞样本比较,呈现差异表达的基因有151个(3.78%),其中81个(53.64%)上调,70个(46.36%)下调。结论NiS的转化作用与应激反应基因、免疫相关基因、DNA合成和修复基因、代谢相关基因、原癌基因和抑癌基因等多类基因的异常表达有关。     

基因芯片在骨质疏松症研究中的应用

基因芯片是分子生物学与微电子技术相结合的DNA分析检测技术,发展十分迅速,其突出特点在于高度并行性、高通量、微型化和自动化,已成为后基因组时代生命科学研究的重要技术[1].基因芯片是应用最广泛的生物芯片,目前主要用于疾病的DNA测序、基因功能及调控、诊断、药物筛选和遗传图谱等研究.骨质疏松症的发生、发展是一个多基因、多步骤、多阶段的复杂过程,其演化过程涉及大量的基因突变、缺失、扩增及失活等异常表达信息,因此,发挥基因芯片技术多样本、高通量、高效率和平行监测识别功能,对阐明骨质疏松症的病因,揭示其发病机制以及开辟新的诊断途径和治疗策略具有重要价值.     

邻苯二甲酸二酯诱导果蝇脑组织基因差异表达谱的研究

[目的] 获得邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯[di(2-ethylhexyl) phthalate，DEHP]诱导果蝇脑组织的基因差异表达谱。[方法] 设喂饲0．2％DEHP浓度的果蝇为实验组，乳化剂为对照组，2周后断头进行总RNA抽提，DNaseI消化去除DNA污染；用Oligotex mRNA MiNi Kit(QIAGEN)得到纯的mRNA；合成双链cDNA；采用体外转录的方法获得大量cRNA与Affymetrix的果蝇表达谱芯片进行杂交，计算机扫描处理数据。[结果] 差异表达的基因片段共计35个：①上调的基因有20个，包括CYP6A2、CYP6A8、CYP6W1、CYP4P1、UGl36Bb、GST、羧酸酯酶、转甲基酶、氧化还原酶、ESTIO、JHEHI、KEAPI、CC．6908、CGl942、CGl0560、CG11529、CGl0553、CGl283、CGl2505等；②下调的基因有15个，包括MST57Da、MST57Db、ACP95EF、OS-E、OS-C、PBPRP3、PBPRP1、AIO、CGl8628、CG11391、CG1挖耐、CG8424、CG5290、CGl3947、CGl5263等。差异表达基因中大多数与信号传导、细胞代谢、生长、发育、组织分化及转录因子等功能相关，尚有一些基因功能未知。[结论] 运用高通量基因芯片技术获得DEHP诱导果蝇脑组织的基因差异表达谱，为从分子水平系统研究DEHP的毒性机制提供有益的线索。