三氧化二砷对HepG2细胞表达基因调节作用

目的 应用基因芯片技术，阐明低剂量三氧化二砷作用于肝HepG2细胞之后，无机砷对差异表达基因的调节作用。方法 应用基因表达谱芯片技术，对5μmol／L三氧化二砷诱导的HepG2细胞和以生理盐水处理的相同细胞的mRNA进行差异显示分析，研究三氧化二砷诱导人HepG2细胞后的差异表达基因。结果 HepG2细胞经5μool／L三氧化二砷诱导后。所检测的4096条目的基因中有123条产生差异表达，其中48条基因表达上调，75条基因表达下调。结论 应用基因表达谱芯片成功筛选了低剂量三氧化二砷诱导肝细胞后的差异表达基因，无机砷对肝细胞有双向调节作用。     

肠道常见病原菌检测基因芯片的制备与评价

目的建立并评价快速准确地检测肠道致病菌的基因芯片检测方法。方法在基因芯片制备基础上，通过对靶基因的扩增、杂交和对杂交结果的分析，对常见肠道致病菌的检测和鉴定效果进行评价。结果应用包含38种特异性探针的基因芯片，对涉及沙门菌、志贺菌、霍乱弧菌、致泻性大肠埃希菌、空肠弯曲菌、小肠结肠炎耶尔森菌、副溶血弧菌和单核细胞李斯特菌等8个菌属的16株致病菌进行检测，均得到特异性杂交图谱。结论制备的基因芯片能够同时检测多种重要的肠道致病菌，为肠道致病菌感染的快速诊断提供了准确、快速、灵敏的方法。     

基因芯片技术及其应用

随着人类基因组学计划（HGP）的完成，基因组学研究的重心自然地从结构基因组学转向功能基因组学，弄清每个基因的功能、发现与其它基因的关系及其表达调控方式，成为后基因组时代的重要研究目标，现已建立的诸如Southern印迹、Northern印迹等有关基因表达、调控和功能研究技术操作复杂、自动化程度低．迫切要求建立一种高速度、高通量的测定核酸序列、检验基因表达的技术，正是在这种背景下基因芯片（genechip）技术应运而生。     

MRP3基因参与卵巢癌细胞拓扑替康耐药机制形成的研究

目的:分析人卵巢癌SKOV3/TPT多药耐药的分子机制,寻找可能参与拓扑替康(TPT)耐药机制的新基因。方法:采用大剂量间歇诱导法,对SKOV3细胞株用TPT反复冲击诱导培养,获得稳定的SKOV3/TPT;利用Affymetrix U133A基因表达谱芯片,比较SKOV3及SKOV3/TPT细胞的基因表达;从中选择高表达的MRP3基因进行RT-PCR验证。再将MRP3反义及正义寡核苷酸片段分别用脂质体转染进耐药细胞,用MTT法、流式细胞仪及半定量RT-PCR检测体外转染后细胞内TPT的荧光强度、耐药指数及MRP3 mRNA表达的改变。结果:基因芯片检测发现,有7个差异表达基因可能参与了SKOV3/TPT细胞的耐药,其中4个基因被上调,3个基因被下调,MRP3为上调最明显的基因。MRP3反义寡核苷酸转染SKOV3/TPT细胞后,可明显降低细胞内TPT的浓度及耐药指数(P<0.05),细胞内MRP3 mRNA的表达较未转染细胞下降了60.16%(P<0.05)。结论:SKOV3/TPT细胞耐药表型的形成涉及多个基因表达的改变。MRP3的高表达导致细胞内药物浓度降低,可能是卵巢癌细胞对TPT耐药的主要原因。     

出入境人员3种蚊媒病毒性传染病快速检测基因芯片的研究项目设计

流行性乙型脑炎、登革热、西尼罗热是3种重要的蚊媒病毒性传染病。近年来这3种传染病的流行态势日益严峻,引起了全球世界的广泛关注。快速识别病原微生物是目前检验检疫机构在国境口岸对出入境人员实施卫生检疫时所亟需解决的问题,近年来出现的生物芯片技术解决这一问题成为可能。本研究其目的在于用基因芯片检测多种蚊媒病毒性传染病的病原体,可实现大规模集成化的快速检验,从而适应对国境口岸出入境人员卫生检疫的需要。     

基因芯片筛选同时参与肺腺癌不同癌变进程的分子靶标

目的 探讨同时参与肺腺癌不同癌变进程的基因群，以期进一步筛选出肺腺癌的分子靶标。方法 选取术后临床分期为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ期的肺腺癌组织标本共10例为实验组，相应的癌旁组织10例为对照组。与含13824个基因的基因芯片进行杂交，最后结合分期和临床预后对海量数据进行数据挖掘。在不同分期及不同预后的标本中均差异表达的基因即为入选基因。结果 10例肺腺癌标本共差异表达基因119条，其中，含已报道与肺癌相关的基因26条，尚未报道与肺癌相关的基因46条，完全未知功能的新基因47条。结论 119条基因是肺腺癌发生、发展过程中的重要分子标记，是肺腺癌分子靶的候选基因。     

碳酸缓冲液对光气损伤大鼠AT-Ⅱ细胞基因表达的影响

目的观察碳酸缓冲液干预对光气染毒后大鼠AT-Ⅱ细胞基因表达的影响,以深入探讨其作用的分子机制.方法分别抽提正常组、损伤组及干预组AT-Ⅱ细胞总RNA,通过逆转录方法,进行荧光标记后,制备成cDNA探针,与表达谱芯片进行杂交及扫描测定,通过计算机进行数据处理、基因库对比并筛选出差异表达基因.结果经碳酸缓冲液干预后,筛选出的差异表达基因数由单纯损伤组的161条降低到了115条,且大部分与肺损伤相关基因的异常表达均得到了抑制,并出现了新的差异基因.结论碳酸缓冲液在干预光气中毒中具有一定的保护作用,为探讨光气中毒和临床治疗机制提供了新的思路.     

超保守区非编码RNA在银屑病外周血单个核细胞中差异表达的初步研究

目的:用高通量Arraystar T-UCR芯片研究超保守区非编码RNA(T-UCR)在银屑病外周血单个核细胞(PBMC)中的差异表达谱。方法:抽取7例寻常型银屑病患者及3例正常人的外周血,分离PBMC后提取总RNA,将总RNA纯化,转录合成荧光标记的cRNA,cRNA样本片段化后与芯片杂交,使用Agilent G2505C芯片扫描仪扫描芯片,配合数据处理软件读取、处理数据,筛选出1.5倍及以上差异表达基因。结果:共有109种已知T-UCR在PBMC中表达,银屑病组与健康对照组相比,有5个T-UCR呈共同差异表达,其中上调1个,下调4个;有2 043种可能是新的T-UCR在PBMC中表达,共182种呈共同差异表达,其中上调100个,下调82个;与UCR区域重叠的mRNAs和UCR邻近基因分别有232个和67个表达有差异,Gene Ontology分析发现在参与细胞生理过程的36个差异表达的与UCR区域重叠的mRNAs中,有5个参与T细胞免疫活性相关的生物过程,例如T细胞活化、免疫反应中T细胞的分化等。结论:T-UCR可能参与寻常型银屑病的发病。