基于人源性乳腺癌类器官的质谱成像数据分析

目的 介绍一种兼容高通量常压质谱成像数据的可视化分析流程。方法 2022年10月于北京大学第三医院进行手术切除获得乳腺癌组织,并采用机械压滤法悬浮过夜获得人源性乳腺癌类器官。将类器官转移至载玻片上,喷涂2,5-二羟基苯甲酸(DHB)基质进行质谱分析,并将通过常压的质谱成像数据进行格式转换后,导入MSiReader软件,经过数据预处理、二维及三维质谱成像数据的可视化,共定位分析等操作,实现对质谱成像数据的可视化分析。结果 采用MSireader软件将.Raw转化为.imzML格式数据以便于读取;经数据预处理后发现,选用Mean进行数据归一化时背景去除效果最显著;在MSiReader软件中,可在二维质谱图中直观观察不同分子在类器官表面的异质性空间分布情况,质谱成像数据除了以二维伪彩图的形式展示分子的信号强度外,还可以更加清晰直观地以三维展示;MSiReader软件中的RGB共定位分析工具,除了能够查看单个分子在类器官表面的分布情况,还有利于寻找分布于特定空间区域的分子共定位情况。结论 利用MSiReader软件,提出了一种基于人源性乳腺癌类器官达到可视化分析常压的质谱成像数据分析系统。     

昼夜节律与骨代谢研究现状的可视化文献计量分析

目的 分析昼夜节律与骨代谢领域研究现况、热点及发展趋势,以期为日后研究提供参考。方法 以Web of Science核心数据库2000年1月1日至2022年11月30日收录文献为基础,采用VOSviewer 1.6.16和CiteSpace 6.1.R4软件对文献发表年度、国家/地区、机构、作者、期刊、关键词、引用情况等进行数据可视化分析。结果 共检索295篇文献,发文量总体趋于平缓稳定,在地域上广泛分布于美国、英国、亚洲、欧洲等多个国家和地区,其中美国、英国在论文数量和深度上颇为突出,研究机构以大学及其附属医疗机构为主,2010年后各机构和作者间联系较为紧密。研究内容上聚焦于昼夜节律与骨吸收、骨转化等骨代谢间机制的探索,包含骨代谢标志物、基因表达等维度。研究前沿包括Rev-erb α、骨折风险等。结论 昼夜节律和骨代谢相关文献的刊文量仍相对较少,应进一步发挥高质量期刊的引领作用,以期为骨代谢异常防控提供新的思路和治疗方案。未来基于基因表达层面的影响机制以及如何在昼夜节律视角下精准降低骨折风险仍是研究的重点方向。     

烧伤相关凝血功能障碍研究现状与发展的可视化分析

目的对烧伤相关凝血功能障碍的文献进行可视化分析, 探讨国内外烧伤相关凝血功能障碍的研究现状、演进过程、热点主题以及未来研究趋势。方法采用文献计量学方法进行分析。检索《Web of Science》和《中国知网》数据库1950年1月1日—2022年5月1日发表的符合入选标准的烧伤相关凝血功能障碍的文献, 进行发文量分析。同前检索《Web of Science》数据库核心合集和《中国知网》数据库中烧伤相关凝血功能障碍的文献, 采用CiteSpace5.8.R3软件行关键词共现分析、聚类分析及文献共被引分析。结果从《Web of Science》和《中国知网》数据库分别检索到501、235篇文献。国内外分别于1975、1950年开始出现烧伤相关凝血功能障碍的文献, 随后相关文献逐渐增加。《中国知网》数据库235篇文献中烧伤、凝血功能、血小板等关键词出现频次和中心性较高, 《Web of Science》数据库核心合集340篇文献中burn、coagulation、deep vein thrombosis等关键词出现频次和中心性较高。《中国知网》数据库中, 突现强度排前6的关键词为烧伤患者、临...     

营养不良可视化系统构建

目的 建立营养不良可视化系统,呈现我国不同人群、不同时空营养问题的变迁。方法 依托中国居民营养与健康监测系统、中国健康与营养调查系统、农村义务教育学生营养改善监测计划营养健康状况系统和贫困地区儿童营养改善项目监测系统,根据拟合并的以上监测系统数据特点和营养不良可视化系统建立的需求,采用客户端/服务器体系结构(C/S架构)应用模式,利用Visual Studio 2019开发工具集和Python 3.7-10以及C#8.0语言编程进行数据整合,建立数据预处理、数据转换和数据集成计算流程。结果 基于融合集成的数据库,营养不良可视化系统提供了多库融合指标体系下不同人群的营养状况可视化展示系统。本系统能够对数据进行修改和更新,并对包括生长迟缓、低体重、消瘦、微量营养素缺乏、超重肥胖等营养不良状况进行查询、显示和分析。结论 营养不良可视化系统可动态呈现我国居民营养不良时间序列和空间分布,探明不同时期营养问题的区域特征及主要挑战。     

我国公立医院高质量发展研究热点及趋势分析——基于CiteSpace的可视化分析

基于中国知网数据库收录的关于公立医院高质量发展研究的期刊文献,采用CiteSpace软件对2018年—2023年3月的文献核心作者、研究机构、关键词共现、关键词聚类等进行了可视化图谱分析。结果表明:(1) 2021年后我国公立医院高质量发展的研究数量开始大幅增加,发文作者及机构较为分散,机构间合作较少。(2)近几年我国公立医院高质量发展研究的热点主要集中在党建、全面预算管理、精细化管理、文化建设等几个方面。(3)我国公立医院高质量发展提到的对医院发展的精细化管理等方面具有较大发展空间,如何进行高效的成本管控是未来公立医院高质量发展的重中之重。     

腧穴配伍规律可视分析教学软件的研发与应用

基于偏序数学原理设计一套操作简便的腧穴配穴规律可视分析教学软件,该软件适用于对古籍、教材和临床医案中针灸处方腧穴配伍数据的结构化整理、规律知识可视化的辅助教学。其以插件形式安装在办公软件Microsoft Office Excel中,可生成符合针灸专业师生认知的知识可视化图形及关联规则。意在帮助教师和学生更好地发现和分析腧穴配伍数据中所蕴含的规律和结构化知识,以期对腧穴配伍教学效果的提高发挥积极作用。     

基于CiteSpace的中医药治疗斑秃知识图谱可视化分析

目的：基于文献计量学探讨中医药治疗斑秃的研究现状和热点。方法：检索中国知网2000年1月1日—2021年12月31日发表的中医药治疗斑秃的中文文献,统计不同年度的发文量并进行趋势分析。运用CiteSpace5.8.R3软件绘制中医药治疗斑秃的作者合作网络图、发文机构合作网络图及关键词知识图谱（包括关键词共现、聚类和突现网络图）。结果：共检索出1 294篇中文文献,对数据进行可识别的格式转化及去重,最终纳入616篇文献,涉及研究机构286所,关键词493个。检索时间范围内整体年度发文量较平稳,篇幅数在每年30篇左右,2009年及2011年为发文量的小高峰,2005年及2017年为发文量的2个低谷,其中2017年最少。发文量最多的作者是禤国维及陈达灿,分别发文11篇及10篇,该领域部分作者之间存在一定联系,以发文量较多的作者之间联系较为密切。研究机构分析显示,发文量≥2篇的机构52所,排名前5的机构分别是广州中医药大学、成都中医药大学、广东省中医院、天津中医药大学和陕西中医药大学。关键词共现网络中,频次较高的关键词依次是中医药疗法、梅花针、临床观察、中西医结合治疗、针灸疗法等。关键词聚类分...     

基于CiteSpace可视化分析中医药治疗特发性肺纤维化研究现状

目的：分析中医药治疗特发性肺纤维化（IPF）的研究现状、热点及前沿。方法：检索中国知网2000年1月1日至2021年8月8日收录的中医药治疗IPF相关文献,应用CiteSpace 5.7.R5W软件以研究机构、作者为节点进行合作网络分析,以关键词为节点进行共现、聚类、时间线分析。结果：共纳入文献472篇,2000年至2017年发文量基本呈上升趋势,2018年至2020年发文量较前减少。纳入文献共涉及200个研究机构,其中发文量最多的是辽宁中医药大学。939位作者中有67位核心作者,占作者总人数7.16%,形成以庞立健、郭静、张伟、樊茂蓉为中心的多个合作团队。关键词共现分析得到“特发性肺纤维化”“肺功能”“转化生长因子-β1(TGF-β1)”等13个高中心性关键词,关键词聚类分析得到14个类别。结论：2000年至2021年中医治疗IPF相关研究发展态势良好,但研究机构、研究者合作较为局限。气虚血瘀型IPF的临床治疗方法、药物以及中医药治疗IPF在上皮间质转化（EMT）、血管新生相关通路、炎症反应方面的疗效机制是近20年的研究焦点,基于Wnt/β-catenin信号通路的补阳还五汤治疗IP...     

电针治疗脑卒中后遗症文献的可视化数据挖掘与分析

目的:通过对电针治疗脑卒中后遗症(PSS)文献的网络可视化数据挖掘与分析,总结电针治疗PSS的刺激参数和用穴规律,为临床应用提供参考。方法:检索中国知网(CNKI)、万方数据知识服务平台、维普资讯中文期刊服务平台(VIP)、中国生物医学文献服务系统(SinoMed)、超星期刊(CHAOXING)、读秀(DUXIU)及PubMed、Ovid、Embase、Cochrane Library数据库中电针治疗PSS的临床文献。根据纳入、排除标准筛选文献,建立电针治疗PSS的临床文献数据库,运用SPSS Modeler14.1软件建模,进行关联规则分析,利用Cytoscape 3.6.0软件进行网络可视化分析。结果:共纳入354篇文献,涉及PSS病种13个,其中偏瘫占比最高(51.13%),其次为抑郁症(17.51%)和吞咽障碍(14.97%),共涉及穴位228个,总频次1 690次。在使用穴位频次≥3的8个PSS病种(偏瘫、抑郁症、吞咽障碍、认知障碍、尿失禁、尿潴留、言语障碍、便秘)中,涉及波形275次,其中疏密波使用频次最高(123次),其次为连续波(95次);涉及频率275次,其中低频使用...     

结直肠癌领域的中医药研究现状、热点演化与整合展望——基于文献计量学的可视化图谱分析

目的 利用知识图谱方法分析近40余年国内中医药在结直肠癌领域的研究现状,并探讨未来发展趋势,为研究人员深入该领域研究提供参考。方法 以结直肠癌为研究主题,文献来源于中国知识资源总库(CNKI)、中国学术期刊数据库(万方数据)、中文科技期刊数据库(维普网)、中国生物医学文献数据库(CBM),发表时间1978年1月—2021年1月的相关文献。使用Excel 2019对发表年份、期刊来源、基金项目等文献基本情况进行统计分析,利用VOSviewer和CiteSpace软件对作者、机构、关键词进行可视化图谱分析。结果 共纳入了5118篇中文文献,年发文量呈整体上升态势,期刊来源丰富,基金论文占比高。虽形成了以杨宇飞、李琦等作者为代表的核心团队,但团队、机构及地域间缺乏紧密合作。研究主要围绕结直肠癌的病因病机、发病机制、中医证候规律、临床治疗等方面展开,治疗上提倡中西医结合及多学科参与,治疗后的康复问题成为医学焦点。结论 中医药在结直肠癌领域的研究整体呈上升态势,中西医结合是结直肠癌诊治的未来之路,多学科参与是未来的治疗模式,今后应加强团队间、地域间的交流合作,优势互补,促进中医药在结直肠癌领域的...