高压氧病区脑损害患者分离病原菌及耐药性

目的了解高压氧病区脑损害患者分离的病原菌及耐药性,为临床抗感染治疗提供参考。方法对2013年1月—2014年12月某院高压氧病区975例脑损害患者的血、痰、尿等标本的细菌培养及药敏试验结果进行回顾性分析。结果共检出病原菌1 328株,其中革兰阴性菌877株,占66.04%;革兰阳性菌213株,占16.04%;真菌238株,占17.92%。分离居前5位的病原菌分别为铜绿假单胞菌、肺炎克雷伯菌、大肠埃希菌、鲍曼不动杆菌和白假丝酵母菌。标本主要来源于痰和尿,分别占58.59%、35.24%。肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌、大肠埃希菌对亚胺培南的耐药率分别为16.67%、81.82%、82.44%、4.65%。革兰阳性菌未发现耐万古霉素菌株,粪肠球菌对绝大多数所测试抗菌药物的耐药率均低于屎肠球菌。结论高压氧病区脑损害患者以呼吸系统、泌尿系统感染为主,病原菌以革兰阴性菌为主。     

98株洋葱伯克霍尔德菌临床分布及耐药性

目的分析临床分离的洋葱伯克霍尔德菌的耐药情况,为临床合理用药提供依据。方法回顾性分析2013年1月—2014年12月某院临床各科室送检标本中分离的洋葱伯克霍尔德菌,对其药敏结果进行统计分析。结果 2013年1月—2014年12月共检出洋葱伯克霍尔德菌98株,标本类型分布主要为痰(86株,占87.76%),科室分布以重症监护病房(ICU)检出最多(46株,占46.94%),洋葱伯克霍尔德菌对替卡西林/克拉维酸的耐药率最高,为73.47%,对哌拉西林/他唑巴坦和头孢哌酮/舒巴坦的耐药率均为16.33%,对米诺环素的耐药率最低,为5.10%。结论洋葱伯克霍尔德菌引起的感染耐药性高,应加强医院感染的预防与控制,及早进行病原学检查,治疗上应结合药敏结果合理用药。     

结肠癌根治术后肠道菌群及益生菌干预对结肠癌预后的影响

目的 考察结肠癌根治术后肠道菌群与结肠癌预后的关系,以及益生菌干预对结肠癌预后的影响.方法 收集2010年4月至2013年4月在我院收治并确诊的Ⅱ期结肠癌患者185例,患者均接受根治术,按照实际接受的治疗方案分为益生菌干预组(80例)和益生菌未干预组(105例),选择同期健康体检者20例为对照组.收集术前和术后1个月粪便,采用荧光定量PCR检测粪便的乳酸杆菌属、双歧杆菌属、大肠杆菌和肠球菌属.分析结肠癌患者术后4年生存情况及与肠道菌群数量的关系.结果 两组术前双歧杆菌属、乳酸杆菌属、大肠杆菌和肠球菌属差异无统计学意义(P＞0.05),根治术后,双歧杆菌属、乳酸杆菌属、双歧杆菌属、大肠杆菌和肠球菌属均明显降低(P＜0.05),益生菌干预组和益生菌未干预组的菌群术前、术后差异均无统计学意义(P＞0.05).4年随访,无1例失访.105例益生菌未干预组中存活90例(85.71％),15例(14.29％)死亡,其中14例为结肠癌转移死亡,1例为心血管病死亡.乳酸杆菌属(x2 =6.700,P=0.035)和双歧杆菌属(x2=5.777,P=0.016)数量越高,大肠杆菌(x2=3.301,P=0.069)和肠球菌属(x2=4.780,P=0.029)数量越低,结肠癌患者4年生存时间越长.80例益生菌干预组中存活76例(95.00％),4例(5.00％)患者死亡,其中3例为结肠癌转移死亡,1例交通意外死亡.与益生菌未干预组比较,益生菌干预组的存活例数较多(x2=4.248,P =0.039),因结肠癌转移死亡例数较少(x2=4.997,P=0.025).结论 结肠癌根治术后,双歧杆菌属和乳酸杆菌属数量越高,大肠杆菌和肠球菌属数量越低,结肠癌的预后较好.给予益生菌干预可明显改善结肠癌根治术后患者的生存情况.     

Strategies to limit immune-activation in HIV patients

Introduction: Antiretroviral treatment of HIV infection reduces, but does not eliminate, viral replication and down modulates immune activation. The persistence of low level HIV replication in the host, nevertheless, drives a smouldering degree of immune activation that is observed throughout the natural history of disease and is the main driving force sustaining morbidity and mortality.

Areas covered: Early start of antiretroviral therapy (ART) and intensive management of behavioural risk factors are possible but, at best, marginally successful ways to manage immune activation. We review alternative, possible strategies to reduce immune activation in HIV infection including timing of ART initiation and ART intensification to reduce HIV residual viremia; switch of ART to newer molecules with reduced toxicity; use of anti inflammatory/immunomodulatory agents and, finally, interventions aimed at modifying the composition of the microbiota.

Expert commentary: Current therapeutic strategies to limit immune activation are only marginally successful. Because HIV eradication is currently impossible, intensive studies are needed to determine if and how immune activation can be silenced in HIV infection.     

孕期生殖道菌群变化特征及其与妊娠结局的相关性研究

目的 探讨孕期生殖道菌群变化特征及其与不良妊娠结局的相关性.方法 选取2015年1月-2015年9月期间在我院妇产科门诊进行常规产科检查的90例孕妇为研究对象,根据孕期分为孕早期组28例(孕周<14周),孕中期组29例(孕周14~28周),孕晚期组33例(29~42周).采集阴道分泌物或宫颈分泌物,对生殖道菌群进行检测.比较三组生殖道菌群分布情况.根据细菌检测结果分为阳性组与阴性组,分别为44例、46例.观察两组不良妊娠结局发生情况,分析生殖道菌群变化特征及其与不良妊娠结局的相关性.结果 90例孕妇中,细菌检测阳性44例,占48.89%,依次为解脲脲原体20例(45.45%)、假丝酵母菌属9例(20.45%)、肠杆菌属8例(18.18%)、葡萄球菌属3例(6.82%)、阴道加德纳菌属2例(4.55%)与衣原体2例(4.55%);孕早期、孕中期、孕晚期孕妇生殖道菌群分布情况相比,差异无统计学意义(P>0.05);细菌检测阳性者胎膜早破、产褥感染、新生儿感染、早产发生率高于细菌检测阴性者,差异有统计学意义(P<0.05);不同菌属类型者不良妊娠结局相比,差异无统计学意义(P>0.05).结论 孕期生殖道菌群以解脲脲原体、假丝酵母菌属、肠杆菌属为主,细菌检测阳性者不良妊娠结局发生率高,而不同菌属类型与不良妊娠结局无关.     

阿克曼菌对AOM/DSS炎症相关性结直肠癌发生的作用

目的 探讨阿克曼菌（AKK）对氧化偶氮甲烷（AOM）/葡聚糖硫酸钠（DSS）诱导的炎症相关性结直肠癌小鼠模型及其肠道干细胞的影响。方法 AOM/DSS诱导小鼠炎症相关性结直肠癌模型随机分为三组,通过灌胃方式给予三组不同的药物分别为模型组（Model）、AKK组及阿司匹林组（Aspirin）。干预10周后观察小鼠的肿瘤数目、肿瘤大小、肿瘤分布及分析肿瘤负荷情况。免疫组织化学分析表征肿瘤恶性化的蛋白Ki67和表征干细胞的特异性蛋白Lgr5的表达变化。qRT-PCR检测干细胞分化特性的基因Lgr5、CD133、Nanog和ALDH1的mRNA表达。结果 与模型组相比,AKK组的肿瘤数目、肿瘤大小及肿瘤负荷明显减小（P<0.01）;相较于模型组小鼠,AKK组的肿瘤组织中Ki67和Lgr5表达明显下降（P<0.05）;CD133、Nanog和ALDH1的mRNA表达明显下调。结论 AKK对AOM/DSS诱导的结肠炎相关性结直肠癌小鼠具有防治作用,其作用机制可能与结直肠干细胞活性密切相关。     

基于16S rDNA测序技术探索白头翁汤灌肠对湿热型溃疡性结肠炎大鼠肠道菌群的影响

目的 采用不同剂量白头翁汤对比美沙拉嗪干预治疗湿热型溃疡性结肠炎（ulcerative colitis,UC）大鼠,观察肠道菌群是否参与了UC的发病过程及药物治疗前后肠道菌群的变化情况。方法 随机将62只SD健康雄性大鼠分为正常组,模型组,白头翁汤低、中、高剂量组和美沙拉嗪组,其中正常组12只,其余各组10只。采用三硝基苯磺酸/乙醇复合法复制UC大鼠模型。模型复制成功后,白头翁汤低、中、高剂量组分别以白头翁汤每日2.15、4.31、8.62 g/kg灌肠,美沙拉嗪组予以美沙拉嗪灌肠液每日0.35 g/kg灌肠,正常组和模型组予以生理盐水灌肠,连续给药14 d。治疗结束后观察各组大鼠一般情况和疾病活动指数,光镜下观察结肠病理变化,并收集大鼠结肠新鲜的粪便,提取粪便微生物DNA,测序及分析PCR扩增基因组DNA,采用Miseq平台测序。结果 ①与模型组相比,白头翁汤各剂量组和美沙拉嗪组体质量逐渐回升,便血及腹泻次数减少。②与模型组比较,白头翁汤各剂量组、美沙拉嗪组疾病活动指数评分明显降低,差异均有统计学意义（P＜0.05）。③模型组大鼠菌群丰度、多样性均降低,白头翁汤及美沙拉嗪治疗后菌群丰度及多样性均有提升。④模型组大鼠厚壁菌门与拟杆菌门比值较正常组升高,白头翁汤和美沙拉嗪治疗后二者比值回调。⑤在菌群构成方面,UC大鼠较正常大鼠具有较低的普氏菌属、乳杆菌属生物丰度,白头翁汤和美沙拉嗪治疗后可回调普氏菌属、乳杆菌属益生菌丰度。结论 肠道菌群参与了UC的发病过程,白头翁汤和美沙拉嗪可能通过调节肠道益生菌而起到对于疾病的治疗作用。     

疏肝利胆汤治疗老年患者腹腔镜下胆囊切除术后慢性腹泻的临床疗效

目的：观察疏肝利胆汤治疗老年患者腹腔镜下胆囊切除术后慢性腹泻的临床疗效及对肠道菌群的影响。方法：纳入2022年1月—12月南通市中医院普外科治疗的腹腔镜胆囊切除术后腹泻老年患者60例,根据随机数字表法分为治疗组和对照组,每组30例。对照组予以双歧杆菌三联活菌胶囊联合盐酸洛哌丁胺胶囊口服;治疗组在对照组基础上予以疏肝利胆汤口服,疗程3个月。观察并比较两组的中医疗效、临床症状积分（便次、腹痛、腹胀、恶心呕吐、食欲减退）、肠道菌群测定（双歧杆菌、嗜酸球菌、大肠埃希菌、肠球菌）、肠道分泌型免疫球蛋白A(sIgA)及血清D-乳酸、血清胃肠激素[血清胃泌素（GAS）、胆囊收缩素（CCK）、血管活性肠肽（VIP）、5-羟色胺（5-HT）、神经肽（NPY）]水平。结果：治疗组患者临床总有效率（96.66%）高于对照组（76.66%）,差异有统计学意义（P <0.05）;治疗组临床症状积分、肠道菌群测定、肠道sIgA及血清D-乳酸和血清胃肠激素均明显改善,且较对照组更明显,差异有统计学意义（P <0.05）,两组均无不良事件发生。结论：疏肝利胆汤治疗老年患者腹腔镜下胆囊切除术后慢性腹泻患者,...     

翼状胬肉患者眼表微生物菌群分析

目的：研究翼状胬肉患者的眼表微生物菌群组成,探索眼表微生物菌群和翼状胬肉的相关性。

方法：收集2018-09/2019-01在我院就诊的原发性翼状胬肉患者,翼状胬肉组为患翼状胬肉的26眼,正常对照组为9只对侧正常眼,采用MiseqPE301+8+8+301平台进行细菌16S rDNA基因V3～V4区双端测序,分析比较翼状胬肉组与正常对照组眼表微生物菌群结构与组成差异。

结果：两组样品共得到1 837个OTU; Alpha多样性分析,正常对照组物种的多样性高于翼状胬肉组。同时两组优势菌群相似。构成以棒状杆菌、葡萄球菌、链球菌、丙酸杆菌等革兰氏阳性菌为主,其次为革兰氏阴性菌。棒状杆菌在翼状胬肉组比例增高。

结论：翼状胬肉组眼表物种多样性下降,棒状杆菌在翼状胬肉患者眼表菌群的丰度显著增高,可能参与眼表免疫状态调节,并影响翼状胬肉的发生与发展。     

Defining and quantifying the core microbiome: Challenges and prospects

The term “core microbiome” has become widely used in microbial ecology over the last decade. Broadly, the core microbiome refers to any set of microbial taxa, or the genomic and functional attributes associated with those taxa, that are characteristic of a host or environment of interest. Most commonly, core microbiomes are measured as the microbial taxa shared among two or more samples from a particular host or environment. Despite the popularity of this term and its growing use, there is little consensus about how a core microbiome should be quantified in practice. Here, we present a brief history of the core microbiome concept and use a representative sample of the literature to review the different metrics commonly used for quantifying the core. Empirical analyses have used a wide range of metrics for quantifying the core microbiome, including arbitrary occurrence and abundance cutoff values, with the focal taxonomic level of the core ranging from phyla to amplicon sequence variants. However, many of these metrics are susceptible to sampling and other biases. Developing a standardized set of metrics for quantifying the core that accounts for such biases is necessary for testing specific hypotheses about the functional and ecological roles of core microbiomes.