中国人群醛固酮合成酶基因T-344C位点单核苷酸多态性频率分析

目的研究醛固酮合成酶(CYP11B2)基因T-344C单核苷酸多态性(SNP)在中国人群中的分布。方法采用PCR-RFLP法对中国人群进行醛固酮合成酶(CYP11B2)基因T-344CSNP频率分析比较。结果中国人群的醛固酮合成酶(CYP11B2)基因T-344C基因型频率分布:TT型占64.5%,TC型占30.8%,CC型占4.7%;等位基因频率T占79.9%,C占20.1%。各基因型频率、等位基因频率与西班牙人、德国人、苏格兰人、日本人差异非常显著。结论醛固酮合成酶(CYP11B2)基因T-344CSNP频率的分布有明显的种族差异。     

MTHFR基因多态性与精神分裂症的关联研究

目的探讨N5,N10-亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因多态性与精神分裂症发病的关系,为研究精神分裂症的发病原因提供基因学基础,也为精神分裂症的预防及治疗提供新的依据。方法采用病例-对照研究设计,收集104例精神分裂症患者和56例正常对照者的血液标本和他们的一般资料,用小剂量DNA提取试剂盒,提取人类基因组DNA。采用聚合酶连反应-限制性内切酶多态性(PCR-RFLP)技术,检测MTHFR基因多态性。结果 (1)MTHFR基因C677TSNP有3种基因型:纯合突变(T/T)型、杂合突变(T/C)型和野生突变(C/C)型;(2)精神分裂症患者组T/T型、T/C型、C/C型频率,分别为31.5%、56.8%和11.7%,正常对照组的频率分别为17.9%、57.1%和25%,统计结果显示:两组之间基因型分布存在着显著性差异P<0.05(χ2=6.649,P=0.036);(3)精神分裂症组T等位基因频率为59.9%,C等位基因频率为40.1%;正常对照组T等位基因频率为46.4%,C等位基因频率为53.6%,在精神分裂症组和对照组T等位基因频率分布存在着显著性差异P<0.05(χ2=5.476,P=0.019);(4)精神分裂症组TT基因型频率为32.7%,正常对照组TT基因纯合型频率为17.9%,TT基因纯合型在两组之间分布有显著性差异P<0.05(χ2=4.018,P=0.045)。结论根据对精神分裂症组与正常对照组的MTHFR基因多态性研究得出结论,在中国北方汉族人群中,存在着MTHFR基因的SNP,T等位基因频率在精神分裂症组显著高于正常对照组,MTHFR基因C677T多态性可能是精神分裂症疾病的危险因素之一。该结论可为精神分裂症的病因学研究提供基因学基础,也为该病诊断及预防提供依据。     

利用生物信息学技术分析APC基因同义突变SNP在家族性腺瘤性息肉病发病机制的研究

目的 利用生物信息学技术分析APC基因同义突变SNP(sSNP)在家族性腺瘤性息肉病(FAP)中的发病机制.方法 选取云南省遗传性大肠癌组织标本库中的5个FAP患者的组织标本进行APC基因突变比对分析,将筛选得到的sSNP进行生物信息学预测,包括蛋白编码、剪接调节、转录调节、翻译后调节,并对RNA二级结构影响分析方面的预测.结果 筛选得到5个可能对APC蛋白产生影响的sSNP,生物信息学预测提示这些sSNP在mRNA水平影响剪接增强子(ESE)从而引起APC外显子异常剪切,使APC蛋白截短而导致FAP.RNA二级结构分析发现这些sSNP对RNA稳定、与其他RNA或蛋白的相互作用等产生功能性影响.结论 利用生物信息学预测手段,APC基因的某些sSNP引起的突变效应可以解释部分APC阴性FAP的病因.     

单核苷酸多态性(SNP)在近交系小鼠遗传检测中的应用

目的 利用单核苷酸多态性(SNP)位点构建多重聚合酶链反应和链接酶反应(PCR-LDR)方案,为近交系小鼠的遗传检测提供一种快速、简便的方法.方法 在SNP公共数据库中挑选51个SNP位点,该51个位点分布于每条常染色体和性染色体,共分为5组,进行多重PCR-LDR方案构建,并将该方案作为遗传质量检测方法对采集的7个近交系样本进行检测.结果 在送检的7个近交系小鼠样本中,纯合度都为100％,相同来源相同品系小鼠的遗传背景一致,但在不同单位的近交系小鼠中,某些SNP位点有差异,CBA/Ca/BK1和CBA/JSlac在a9、a10、b5、b9、c1、c12、e1、e2位点的遗传检测结果不同,C57BL/6/BK1和C57BL/6JS1ac在c7、c10位点的遗传检测结果不同.另外,两家公司各有5个位点在所有品系中基因型相同,因此有效位点数各为46个.结论 构建的多重PCR-LDR方案能有效对两家动物生产单位的近交系小鼠进行检测,可用于常见近交系小鼠快速、高通量的基因分型,有利于大规模遗传质量检测和品系鉴定.     

CETP基因TaqIB多态性与海南汉族人群原发性高血压的相关性

目的：分析CETP基因TaqIB多态性与海南汉族人群原发性高血压(EH)的相关性。方法收集2013年3月至2014年1月在海南省干部疗养院进行体检及治疗的海南省汉族301名健康对照人群(对照组)和218例EH患者(EH组)的全血DNA,利用多聚酶链式反应/限制性片段长度多态性(PCR/RFLP)检测CETP基因TaqIB多态位点的基因型,利用SPSS21.0对检测结果进行统计学分析。结果 EH组人群的B1B1、B1B2和B2B2频率分别为38.53%、47.25%、14.22%,对照组人群分别为45.18%、39.87%、14.95%。EH组人群的B1和B2等位基因频率分别为62.16%、37.84%,对照组分别为65.12%、34.88%,上述各项指标组间两两比较差异均无统计学意义（P>0.05）;EH组CETP基因TaqIB位点B1B1、B1B2和B2B2基因型和B1/B2等位基因频率分布和对照组比较差异均无统计学意义(P>0.05)。结论 CETP基因TaqIB位点多态性与海南汉族人群EH无显著相关性。     

几个单核苷酸多态在布依族、苗族和汉族个体preproEGF基因中的分布分析

目的比较分析单核苷酸多态在布依族、苗族和汉族个体preproEGF基因第20、21外显子及其内含子中的分布状况。方法 设计合成11条引物分别以布依族、苗族和汉族各个体的基因组DNA为模板进行大片段PCR扩增;DNA测序各PCR扩增产物;以GenBank资料库相应的核酸序列为参照分析比较布依族、苗族、汉族个体和外国人种的单核苷酸多态分布。结果布依、苗和汉族个体基因组样本的PCR扩增均得到一条长约4.5kb的DNA片段,其长度复盖preproEGF基因的第20、21外显子及第20内含子;与汉族个体相比较,布依族个体DNA测序结果显示有两个单核苷酸多态位点存在,一个位于preproEGF基因序列的第84329bp(T/C),另一个位于第83634bp(T/-);而苗族个体则仅存在一段长约20bp的套峰区,其中可见两个明确的套峰,分别位于第84583bp(N)和84597bp(N);与GenBank的DNA序列对比分析发现布依族个体的(T/C)多态位点在资料库中虽已报道见于其它民族群体,但在布依民族则未见报道。结论本研究首次证实了在布依族个体第20内含子区段存在一个单核苷酸多态位点84329bp(T/C);另一个多...     

TNF-α基因多态性对TNF-α产物的影响及其与疾病的关系

肿瘤坏死因子α(TNF α)是一种致炎因子。人类TNF α基因位于染色体 6 p2 1.3区 ,这是个具有高度多态性的主要组织相容性复合体 (MHC)区域。TNF基因族含有许多多态性 ,如微卫星 (microsatellite)及单核苷酸多态性(SNPs)。许多多态性与HLAⅠ、Ⅱ等位基因连锁不平衡 ,其中一些影响了如 30 8SNP这样的TNF α在体外的表达。许多研究表明 ,SNP及TNF α基因中的其他多态性与不同炎症状态相关。这种现象是否由SNP直接作用所抑制或是与TNF基因或HLA系统的其他多态性所致 ,研究者们对此尚有争议。     

静脉注射硝普钠治疗精神分裂症有效性的Meta分析

目的 系统性评价静脉注射硝普钠（SNP）治疗精神分裂症（SZ）的有效性。方法 通过PubMed、Web of Science、EMbase、Cochrane Library等英文数据,以及中国生物医学文献数据库、维普、万方和中国知网等中文数据库,检索有关静脉注射硝普钠治疗精神分裂症的随机对照试验,所有数据库检索时限均于2020年11月7日截止。筛选文献、提取数据后,采用Review Manager 5.3软件进行Meta分析。结果 最终纳入4个随机对照试验,共134例患者,结果显示,SNP组与对照组PANSS一般精神病理量表评分［MD=0.05（95% CI：-2.63,2.73）,P >0.05］、PANSS阳性量表评分［MD=-0.76（95% CI：-1.74,0.23）,P >0.05］、PANSS阴性量表评分［MD=-1.77（95% CI：-5.28,1.74）,P >0.05］比较均无差异。敏感性分析后,SNP组与对照组PANSS阴性量表评分比较无差异 ［MD=-0.19（95% CI：-1.62,1.25）,P >0.05］。SNP组与对照组BPRS-18量表评分比较有差异 ［MD=-5.91（95% CI：-11.42,-0.41）,P <0.05］,但异质性较高（I² =54%）。结论 SZ患者对SNP耐受性较好,但与安慰剂比较,笔者无法得出SNP能够改善SZ相关精神症状的结论。     

A genetic variant in pseudogene E2F3P1 contributes to prognosis of hepatocellular carcinoma

Certain pseudogenes may regulate their protein-coding cousins by competing for miRNAs and play an active biological role in cancer. However, few studies have focused on the association of genetic variations in pseudogenes with cancer prognosis. We selected six potentially functional single nucleotide polymorphisms （SNPs） in cancerrelated pseudogenes, and performed a case-only study to assess the association between those SNPs and the prognosis of hepatocellular carcinoma （HCC） in 331 HBV-positive HCC patients without surgical treatment. Log-rank test and Cox proportional hazard models were used for survival analysis. We found that the A allele of rs9909601 in E2F3P1 was significantly associated with a better prognosis compared with the G allele [adjusted hazard ratio （HR） = 0.69, 95% confidence interval （CI） = 0.56-0.86, P = 0.001]. Additionally, this protective effect was more predominant for patients without chemotherapy and transcatheter hepatic arterial chemoembolization （TACE） treatment. Interestingly, we also detected a statistically significant multiplicative interaction between genotypes of rs9909601 and chemotherapy or TACE status on HCC survival （P for multiplicative interaction 〈 0.001）. These findings indicate that rs9909601 in the pseudogene E2F3P1 may be a genetic marker for HCC prognosis in Chinese.     

hCNT1及MRP4基因多态性对慢性乙型肝炎核苷类似物抗病毒治疗应答的影响

目的 探讨人核苷转运蛋白1(hCNT1/SLC28A1)及多药耐药蛋白4（MRP4/ABCC4）基因多态性与治疗乙型肝炎核苷类似物药物恩替卡韦(ETV)及替比夫定(LdT)治疗慢性乙型肝炎的病毒学应答关系。 方法 136例慢性乙型肝炎患者分别采用ETV和LdT治疗（各68例）,根据治疗后病毒学应答反应分为完全病毒应答（CVR）和原发部分应答（PPR）组,对两组患者的临床及病毒学检测结果进行分析,并采用多重单碱基延伸分型技术（Multiplex SNaPshot）检测两组初治患者hCNT1/SLC28A1基因4个位点（rs2242046, rs2242047, rs2290272, rs8187758）,以及MRP4/ABCC4基因4个位点（rs2274407, rs3765534, rs11568658, rs11568668）的基因型及等位基因频率,比较两组患者的基因多态性。 结果 136例慢性乙型肝炎患者ETV和LdT治疗后PPR患者77例（56.6%）,CVR患者59例（43.4%）,两组基线乙型肝炎病毒（HBV）DNA载量、HBV基因分型及乙肝表面E抗原（HBeAg）阳性对抗病毒应答疗效差异均无统计学意义(P=0.148,P=0.622,P=0.071)。hCNT1/SLC28A1基因的rs2290272位点、MRP4/ABCC4基因的rs11568658位点基因型分布差异有统计学意义（P=0.043,P=0.049）,其中rs2290272位点的等位基因频率差异有统计学意义(P=0.045)。单倍型分析发现,hCNT1/SLC28A1基因C/A/T/C组合及MRP4/ABCC4基因C/C/G/G组合中,CVR组高于PPR组（P=0.024,P=0.005）。 结论 hCNT1/SLC28A1基因的rs2290272 C/T和MRP4/ABCC4基因的rs11568658 G/G等位基因型会降低抗病毒疗效的应答。同时,单倍型C/A/T/C及C/C/G/G会提高核苷类似物ETV及TdL对乙肝病毒疗效的应答。