国产姜黄属药用植物RAPD分析与分类鉴定

运用ＲＡＰＤ技术刻划了国产姜黄属药用植物的遗传背景差异,并结合经典分类和异地栽培观察和聚类分析,初步澄清了姜黄属植物的一些分类学争议,从ＤＮＡ分子水平上为姜黄属植物分类与中药鉴定提供了参考依据。     

幽门螺杆菌基因型与慢性胃炎和消化性溃疡的相关性

目的 探讨Hp基因型与慢性胃炎、消化性溃疡的关系。方法 对标准株和临床分离株幽门螺杆菌空泡毒素基因vacA和致病岛基因的cagA、cagE、cagT片段进行PCR扩增，对基因组DNA进行随机扩增多态性分析（RAPD），并以Hela细胞测定全部菌株的VacA毒素活性。SPSS13．0软件聚类分析进行基因分型。结果 全部菌株被分为3个型别，慢性胃炎、消化性溃疡和非胃炎非溃疡分别有自己的优势基因型，且各型之间的总体分布差异具有统计学意义。结论 Hp基因型与疾病类型有关，空泡毒素基因和致病岛基因可作为Hp基因分型的靶基因，RAPD是有效的基因分型手段。     

烧伤病房铜绿假单胞菌多重耐药流行病学调查

目的了解烧伤病房铜绿假单胞菌环境寄生及烧伤患者多重耐药表型、产酶情况,铜绿假单胞菌医院感染的流行病学。方法全自动细菌鉴定和药敏分析系统(VITEK-32);改良三维法对β-内酰胺酶进行分析;金属酶试验用Etest条;随机扩增多态性DNA基因扩增(RAPD)方法对患者分离株和环境分离株分型,从检出时间、地点或部位进行动态分析。结果4 246份样本共检出铜绿假单胞菌352株,分离率为8.3%;患者与环境及医护人员检出的铜绿假单胞菌未见有关联;铜绿假单胞菌可产生多种β-内酰胺酶。结论铜绿假单胞菌广泛存在于烧伤病房的患者及环境中;铜绿假单胞菌医院感染外源性因素不主要,患者多是自身感染。     

布鲁氏菌AP-PCR最优反应体系的建立

目的建立布鲁氏菌的随机扩增DNA多态性的优化反应体系，用于布鲁氏菌分子流行病学研究。方法利用几种随机引物及其组合(Pl、P2、P3、P4、P5、OPLO4、P3／5、P4／5)进行随机引物PCR的反应(AP—PCR，又称RAPD)，及重复片断引物ERICIR／ERIC2的随机扩增多态性；另外针对优选引物P5和OPLO4，分别对Mg^2 浓度、dNTPs浓度、模板DNA浓度、引物的浓度及扩增过程中的退火温度等影响反应结果的因素，进行了一系列优化组合方案的试验及系统分析。结果引物Ps、OPLO4和引物组合P4，5可以得到布鲁氏菌的高分辨率的分型带谱，并建立相应的优化反应体系。结论在严格的优化反应条件下。建立简单、快捷、灵敏度高的RAPD方法，用于布鲁氏菌的DNA多态性研究，为布鲁氏菌分子流行病学的深入研究提供资料。     

Genotypic characterization of thermophilic bacilli: A study on new soil isolates and several reference strains

A genotypic study using amplified ribosomal DNA restriction analysis (ARDRA), random amplified polymorphic DNA fingerprinting (RAPD) and ribosomal spacer analysis (RSA) in comparison with DNA-DNA reassociation experiments was carried out with 85 thermophilic Bacillus isolates from uncultivated soil of 14 different geographical areas and seventeen reference strains representing defined thermophilic Bacillus species. This approach permitted the attribution of 51 % of the new isolates to the Bacillus thermoleovorans group and the identification of 40% of the new isolates as B. “thermodenitrificans”. Moreover, 2 strains were assigned to B. pallidus species and 1 isolate to B. thermosphaericus species. The remaining 6% of our thermophilic isolates from soil, constituting 2 DNA-DNA homology groups, are still unidentified. A detailed genotypic characterization of the heterogeneous species of B. thermoleovorans and B. stearothermophilus was also presented.     

我国不同地区马来丝虫DNA多态性的比较分析

目的 分析我国周期型马来丝虫DNA多态性。方法收集长爪沙鼠保种的湖北谷城（H）株、四川乐山（S）株和浙江安吉（Z）株马来丝虫成虫，提取基因组DNA，采用RAPD技术分析DNA多态性。结果得到17个DNA扩增片段，大小为50～1000bp。其中a、c为H、S、Z株共有条带，d、e、f、g为H、S株共有条带，b、h、i为H株特有条带。结论RAPD分析3个地区株马来丝虫在基因结构上既有同源性，又存在差异，表明我国马来丝虫似有种内分化的趋向。     

七种媒介硬蜱基因组随机扩增多态性DNA分析

目的　研究7种硬蜱的基因组随机扩增多态性DNA(RAPD)以及种间的遗传距离。　方法　用5条不同的多聚核苷酸单链引物对草原革蜱、森林革蜱、青海血蜱、台湾血蜱、刻点血蜱、龟形花蜱、卵形硬蜱7种硬蜱基因组DNA进行随机扩增,分析DNA图谱并计算 7种硬蜱间的遗传距离。　结果　 7种硬蜱基因组随机扩增产物均有各自独特的DNA条带,种间的平均遗传距离为071。　结论　RAPD技术可以区分这7种硬蜱。     

Cloning of a novel specific SCAR marker for species identification in Lactobacillus pentosus

Identifying Lactobacillus species using only phenotypic and genotypic (16S rDNA sequence analysis) techniques yields inaccurate results. The objective of this study was to develop species-specific primers based on randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) fingerprinting to distinguish species within the closely related Lactobacillus plantarum group. One of these primers, OPD-3, produced a species-specific band that was found only in the tested Lactobacillus pentosus. This specific fragment was isolated from agarose gel and ligated into a vector for DNA sequencing. A pair of primers, SpOPD3Lpen-F1/R1, that were highly specific sequence-characterized-amplified-regions (SCARs) were designed according to the nucleotide sequences of the specific RAPD marker. These primers were used for PCR analysis of the template DNA of the Lactobacillus strains, and a single 542 bp species-specific band was found only in L. pentosus. Using PCR, a novel species-specific primer pair is shown to rapidly, accurately and effectively distinguish L. pentosus from other species in the L. plantarum group of probiotic bacteria.     

幽门螺杆菌的分子分型及其分子流行病学研究

目的在基因分型基础上探讨不同基因型别的幽门螺杆菌(Hp)与疾病之间的关系。方法采用随机扩增的多态性DNA(RAPD)和PCR-RFLP法对50株来自不同病人的Hp进行分析,在此基础上运用聚类分析进行基因分型,并用病例对照研究探讨不同基因型别的Hp与疾病之间的关系。结果RAPD结果显示,不同基因型别的Hp与不同的疾病结局有关。PCR-RFLP结果显示,单个基因的分析结果均未能说明不同基因型别的Hp与不同的疾病结局有关,而多个基因的综合分析结果则说明不同基因型别的Hp确实与不同的疾病结局有关。将RAPD和PCR-RFLP的分析结果进行综合分析,也从多方法水平说明不同基因型别的Hp确实与不同的疾病结局有关。结论对于Hp来说,多基因性状数值分类法的分型效率高于单基因数值分类法,这为建立Hp的多基因、多方法的数值分类系统打下了基础。     

我国金银花栽培品种的遗传多样性

目的:对国内金银花主产区的栽培品种进行遗传多样性分析,为了解不同产区金银花栽培品种的亲缘关系以及金银花新品种选育提供参考。方法:利用RAPD技术分析国内不同产区采集的11份栽培金银花和1份山银花样品,用NTSYS 2.10e软件对统计结果进行聚类分析。结果:17条RAPD引物共扩增出150条清晰可辨的DNA条带,其中113条在不同样品间具有多态性,通过聚类分析可将12份金银花样品分为4个大类。结论:河南封丘、河北巨鹿的金银花品种遗传差异较小,品种较为单一;山东平邑的金银花种质资源相对丰富。研究还发现,不同金银花种源间的遗传关系与地理分布存在相关性。