胰腺癌与慢性胰腺炎的胰液差异蛋白组学研究

目的观察并探讨胰腺癌与慢性胰腺炎患者的胰液差异蛋白组学情况。方法选取自20i2年6月～2013年6月,湖南省郴州市第一人民医院消化内科所收治的人胰液标本共计20例作为研究对象。12例标本为慢性胰腺炎患者,划分为慢性胰腺炎组,8例标本为胰腺癌患者,划分为胰腺癌组。对双向电泳方法下,慢性胰腺炎、胰腺癌患者所对应的可重复蛋白质点数值进行对比,观察银染处理后,表达量较高4个差异蛋白质点的质谱情况。结果胰腺癌患者可重复性蛋白质为81．00％,慢性胰腺炎患者可重复性蛋白质为82.00％,2组患者对比数据差异无统计学意义;胰腺癌患者丝氨酸蛋白酶2前蛋白原、胰腺相关蛋白反应检出数值明显高于慢性胰腺炎患者,弹性蛋白酶3B前蛋白原、糜蛋白酶原B前体检出数值明显低于慢性胰腺炎患者,差异有统计学意义（P〈0．05）。结论胰腺癌、慢性胰腺炎患者胰液蛋白质谱表达存在明显差异,可将其作为临床鉴别诊断胰腺癌、慢性胰腺炎疾病的主要依据。     

组织芯片技术及其在子宫内膜癌中的应用

随着人类在分子生物水平研究的进一步深入,大量新的基因和蛋白被不断地发现,在组织学水平研究它们的生物特性和功能就显得尤为重要.传统的分子病理技术的低效率已难以满足临床肿瘤学上的诊断需要,而组织芯片,作为生物芯片的一个重要分支,已经成为促进分子遗传学、基因组学和蛋白组学研究成果迅速向临床应用转化和研究肿瘤基因型和表现型的重要工具.     

HCT-116人结肠癌裸鼠动物模型体内微量蛋白谱分析

目的 分析HCT-116人结肠癌裸鼠动物模型体内微量蛋白谱,为结肠癌的早期诊断寻找特有的微量蛋白标志物.方法 按随机分配原则,将20只BALB/C-nu,4周龄的裸小鼠分成实验组和对照组各10只,建立HCT-116人结肠癌裸鼠动物模型,在不同时间采集裸鼠血标本,用PBSⅡ/C型蛋白质指纹图谱仪检测标本中的微量蛋白谱,通过Ciphergen Proteinehip 3.0和Biomarker Wizard 3.1软件自动采集和分析数据,寻找差异表达蛋白.结果 在实验组和对照组间发现120个蛋白质,这些蛋白质在实验组和对照组间的差异具有统计学意义(P＜0.01),但具有规律性变化的有5个,其质荷比分别为2357Da,2424Da,2637Da,8183Da和10133Da,其中2637Da,8183Da和10133Da三种微量蛋白在接种后裸鼠体内表达逐渐增强,2357Da和2424Da两种微量蛋白在接种后裸鼠体内表达逐渐减弱,通过蛋白数据库查询,了解到以上蛋白在诱导细胞有丝分裂、增强钙离子活性、参与细胞迁移和转录调控等方面具有重要作用.结论 在HCT-116人结肠癌裸鼠动物模型体内具有特异的微量蛋白表达,所发现的5种具有规律性变化的微量差异表达蛋白,有望成为结肠癌早期诊断的微量蛋白标志物.     

旋毛虫新生幼虫可溶性抗原的免疫蛋白组学分析

目的 鉴定能被旋毛虫感染血清识别的新生幼虫蛋白,为抗新生幼虫疫苗筛选候选抗原。方法 从感染旋毛虫的BALB/c小鼠肠道收集成虫,培养后收集新生幼虫,制备新生幼虫可溶性性抗原,通过蛋白质免疫印迹（Western blotting）筛选出能被旋毛虫感染小鼠血清识别的新生幼虫可溶性抗原蛋白带进行液相色谱串联质谱（LC-MS/MS）鉴定,并与Uniprot数据库中的旋毛虫数据进行比对,利用生物信息学在线网站分析所鉴定的旋毛虫蛋白的理化性质,使用WEGO在线软件对匹配的蛋白进行基因本体（GO）分类。收集旋毛虫肌幼虫、肠道感染性幼虫（感染后6 h）、成虫（感染后2 d）和新生幼虫等不同发育期的虫体,提取虫体总RNA,反转录为cDNA。qPCR扩增旋毛虫C型凝集素（CTL）、钙网蛋白（CRT）、锌指蛋白（ZFP）和丙酮酸激酶（PK）基因,以甘油醛-3-磷酸脱氢酶（GAPDH）基因为内参,以肌幼虫的相对转录水平为对照,比较4个旋毛虫基因在不同发育期的相对转录水平。不同发育期相对转录水平的比较采用单因素方差分析。结果 Western blotting结果显示,新生幼虫可溶性抗原的11条蛋白条带中有4条被...     

蛋白组学在大肠癌研究中的应用

利用蛋白组学筛选、检测和鉴定大肠癌的生物学标志物,并应用于临床治疗成为了大肠癌研究的最前沿领域和热点之一。本文对近年来蛋白组学在大肠癌研究中的应用进展予以简要综述。     

利用shotgun蛋白组学策略构建变形链球菌蛋白质表达谱

目的：建立变形链球菌蛋白质表达谱,为变形链球菌蛋白质组学研究奠定基础。方法：提取变形链球菌总蛋白,溶液内酶解,肽段混合物在色谱上分离后shotgun鉴定,并利用生物信息学软件对鉴定出的蛋白质进行分析。结果：建立了变形链球菌蛋白质表达谱,共鉴定出752种蛋白质,其中高可信度298种,并利用Gene Ontology软件对其按分子功能和生物学途径进行归类。结论：变形链球菌蛋白质表达谱的建立,为变形链球菌蛋白质组学研究提供了重要的信息和资料。     

基于系统生物学的非小细胞肺癌阴虚内热证多组学联合分析研究

目的:探讨阴虚内热型非小细胞肺癌肠道菌群、代谢组学和蛋白组学的基本特征.方法:选择阴虚内热型非小细胞肺癌患者15例作为阴虚内热证肺癌组,选择健康志愿者15名作为健康对照组,收集两组粪便标本,用16S rDNA技术检测肠道微生态.采集两组血清标本,通过液相色谱-质谱联用技术比较两组代谢组学和蛋白质组学差异.最后通过WGC...     

系统生物学技术用于中药肝毒性机制的研究进展

介绍研究中药肝毒性的重要性及其现状,中药毒性古今不同定义和现代研究对其毒性成分和作用机制的研究情况,以及系统生物学技术在中药毒性研究中的优势,系统生物学各方面的技术应用在中药毒理学当中的研究进展,包括通过对不同基因比较的基因组学分析、通过进行比较差异蛋白表达的蛋白组学分析、通过差异代谢物的代谢组学比对分析以及通过基因转...     

胰腺癌血清蛋白组学的研究

目的 采用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测血清蛋白指纹图,通过差异蛋白组学筛选胰腺癌特有的蛋白标记物,为研究胰腺癌的病理过程和实验诊断奠定基础.方法 用Ciphergen公司生产的PBSII/c型蛋白质指纹图谱仪和ProtienChip CM10(弱阳离子交换表面)蛋白芯片采集23例胰腺癌、25例正常对照组和19例胰腺对照组血清蛋白质谱图,采用Biomaker Wizard 3.1版分析软件筛选差异蛋白.结果 发现胰腺癌患者与正常对照、胰腺对照的血清蛋白质指纹图谱有44个差异表达的蛋白质(P<0.05),其中m/z 2732敏感性为91.30%(21/23),特异性为68.18%(30/44),受试者工作特征曲线下面积(AUC)=0.76;m/z 9111敏感性为52.17%(12/23),特异性为81.82%(36/44),AUC=0.57.结论 利用SEL-DI-TOF-MS技术和CM10芯片能发现胰腺癌患者血清中的特征蛋白,对胰腺癌的早期诊断具有重要意义.     

小鼠胼胝体的蛋白组学研究(英文)

目的:探讨胼胝体内主要蛋白的构成。方法:通过二维电泳技术分离小鼠胼胝体的蛋白,用PDQuest软件对蛋白点进行分析,用串联飞行质谱仪对蛋白进行鉴定,并用Western Blot和免疫组织化学对鉴定的蛋白进行分析。结果:二维凝胶电泳显示在小鼠胼胝体有679个蛋白点。选取47个高丰度蛋白点进行质谱鉴定,鉴定为44种蛋白,它们分别为结构、代谢、信号转导、转运和应激蛋白。WesternBlot和免疫组织化学方法进一步证实了蛋白在胼胝体的表达和分布。结论:该结果为胼胝体主要蛋白的构成提供了资料。