TET2、IDH1基因突变在老年急性髓系白血病中的研究

目的:探讨老年急性髓系白血病(AML)患者表观遗传学调控基因TET2、IDH1突变的发生率,并了解其临床特征.方法:采用基因组DNA-PCR方法扩增TET2、IDH1基因外显子,基因测序来分析其基因突变,同时检测NPM1、FLT3-TKD、FLT3-ITD、C-KIT、CEPBA、JAK2V617及MLL-PTD突变情...     

乌鲁木齐地区线粒体12SrRNA基因突变筛查分析

目的　研究乌鲁木齐地区非综合征性聋患者线粒体12S rRNA基因突变情况。方法　收集乌鲁木齐非综合征性聋患者标本609例,对其进行临床和分子遗传学评估。结果　12S rRNA基因突变分析共发现11个突变位点,已知的A1555G、961DelT、C1494T突变分别占2.96%,1.15%,0.16%。另外A1047G突变相关报道较少,A1585G突变未见相关报道。其他突变均为多态性位点。结论　线粒体12S rRNA突变是引起遗传性聋的重要因素,此次乌鲁木齐地区线粒体12S rRNA A1555G突变在聋病人群中的检出率与前期报道相比有所降低,可能与耳毒性药物使用量降低有关。A1047G与新发现的A1585G突变是否与聋相关,还需进一步研究。对筛查中阳性突变携带者及其母系家庭成员需告知氨基糖苷类抗生素使用风险,使其避免使用,逐步降低药物性聋的发生率。     

甘肃省375例非综合征型聋患者聋病易感基因突变检测分析

目的 通过对甘肃省部分非综合征型聋患者进行聋病易感基因筛查,从分子水平了解其遗传病因及特点.方法 采集甘肃省375例非综合征型聋患者的外周静脉血5~10 ml,提取基因组DNA,运用SNPscan技术检测GJB2基因2个外显子36个突变位点、SLC26A4基因21个外显子77个突变位点和mtDNA12SrRNA A1555G及C1494T突变.结果 375例非综合征型聋患者中,23例携带mtDNA12SrRNA A1555G均质性突变(6.13%, 23/375),2例携带mtDNA12SrRNA C1494T均质性突变(0.53%, 2/375);检出GJB2基因突变致聋者42例(11.20%, 42/375),其中纯合突变31例(8.27%, 31/375)、复合杂合突变11例(2.93%, 11/375),GJB2基因单杂合突变携带者25例(6.67%,25/375),c.235delC为最常见的突变类型,等位基因频率为8.80%(66/750);检出SLC26A4基因突变致聋者29例(7.73%, 29/375),其中纯合突变17例(4.53%, 17/375)、复合杂合突变12例(3.20%, 12/375),SLC26A4基因单杂合突变携带者14例(3.73%,14/375),c.919-2A>G和c.2168A>G为其最主要的突变类型,等位基因频率分别为5.20%(39/750)和2.0%(15/750).结论 甘肃省部分非综合征型聋患者mt DNA12SrRNA A1555G突变检出率明显高于全国水平(2.83%,57/2016),而GJB2、SLC26A4基因突变检出率与全国水平相近;三个常见聋病易感基因筛查可为25.60%的本组耳聋患者提供明确的分子病因学诊断.     

DJ-1基因及其与帕金森病关系的研究进展

帕金森病是目前世界上最常见的神经系统退行性病变之一,DJ-1基因是一个与帕金森病相关的基因,其致病机制还不完全清楚.很多研究人员对DJ-1蛋白的功能进行了研究,目前已经发现DJ-1蛋白具有抗氧化、调节转录、参与能量代谢、抑制细胞凋亡等作用,本文总结了DJ-1基因的结构、突变形式、生物学作用及其与帕金森病发生的关系,以及DJ-1基因与其他导致帕金森病的基因之间的相互作用.对研究和了解帕金森病及其基因治疗具有重要意义.     

Critical Amino Acid Residues for Nicotine 5＇ -Hydroxylation in Human CYP2A Enzymes

Objective： We have continued previous work in which we demonstrated that #117 and #372 amino acids contributed to the high activities of human CYP2A13 in catalyzing 4-methylnitrosamino-1-（3-pyridyl）-1-butanone（NNK） and aflatoxin BI（AFB1） carcinogenic activation. The present study was designed to identify other potential amino acid residues that contribute to the different catalytic characteristics of two CYP2A enzymes, CYP2A6 and CYP2A13, in nicotine metabolism and provide insights of the substrate and related amino acid residues interactions. Methods： A series of reciprocally substituted mutants of CYP2A6lle^300→ Phe, CYP2A6Gly^301aAla, CYP2A6Ser^369 → Gly, CYP2A13Phe^300→ Ile, CYP2A13Ala^301 → Gly and CYP2A13Gly^369 → Set were generated by site-directed mutagenesis/baculovirus-Sf9 insect cells expression. Comparative kinetic analysis of nicotine 5＇hydroxylatin by wild type and mutant CYP2A proteins was performed. Results：All amino acid residue substitutions at 300, 301 and 369 caused significant kinetic property changes in nicotine metabolism. While CYP2A6Ile^300→ Phe and CYP2A6Gly^301→Ala mutations had notable catalytic efficiency increases compared to that for the wild type CYP2A6, CYP2A13Phe^300→Ile and CYP2A13Ala^301→Gly replacement introduced remarkable catalytic efficiency decreases. In addition, all these catalytic efficiency alterations were caused by Vmax variations rather than Km changes. Substitution of #369 residue significantly affected both Km and Vmax values. CYP2A6Ser^369 → Gly increase the catalytic efficiency via a significant Km decrease versus Vmax enhancement, while the opposite effects were seen with CYP2A13Gly^369 → Ser. Conclusion：#300, #301 and #369 residues in human CYP2A6/13 play important roles in nicotine 5＇ -oxidation. Switching #300 or #301 residues did not affect the CYP2A protein affinities toward nicotine, although these amino acids are located in the active center. Set369 to Gly substitution indirectly affected nicotine binding by     

甲基化遁逸与保守氨基酸的进化

甲基化造成的大量C→T转换，为进化提供了源源不断的突变，而同时其所编码的氨基酸则逐渐丧失了遗传上的保守性。与此相反，由G至A的原发性转换可能甚少，相应密码子所对应的氨基酸则相对稳定，从而使可避免甲基化的GDN和DGN三联密码成为保守氨基酸进化的必要条件。     

伴内耳畸形的人工耳蜗植入患者SLC26A4(PDS)基因突变分析

目的探讨伴内耳畸形的人工耳蜗植入患者SLC26A4（PDS）基因突变发生的概率、突变类型,以及SLC26A4（PDS）基因突变与各种内耳畸形及术中听神经电诱发复合动作电位（ECAP）检出率之间的关系。方法选取48例伴有内耳畸形的人工耳蜗植入者及50例健康对照。取外周血提取基因组DNA,经聚合酶链反应扩增SLC26A4（PDS）基因全部编码区,包括2～21号外显子,扩增产物纯化后直接测序分析突变。48例患者在人工耳蜗植入术中通过神经反应遥测（NRT）技术,直接近场记录听神经电诱发复合动作电位（ECAP）。结果前庭水管扩大组中70．3％（26／37）、其他内耳畸形组中18．2％（2／11）的患者发现有SLC26A4（PDS）基因突变。本研究中共发现15种突变类型,其中有8种为新发现的类型。IVS7-2A〉G是最常见的SLC26A4（PDS）基因突变类型,45．9％（17／37）的前庭水管扩大患者发现此种突变。在伴内耳畸形的人工耳蜗植入者患者中,未发现SLC26A4（PDS）基因突变与术中听神经电诱发复合动作电位（ECAP）检出率之间有相关性。结论SLC26A4（PDS）基因突变是前庭水管扩大畸形的主要病因,IVST-2A〉G是其最常见的突变类型。     

天花粉蛋白突变体TCSFYY163-165CSA的构建表达与纯化

目的:构建天花粉蛋白(TCS)突变体基因,并在原核系统进行表达及纯化.方法:应用计算机预测TCS分子上可能的抗原决定簇(FYY163 - 165),并进行定点突变.以栝楼基因组DNA为模扳,经PCR扩增突变基因,与pRSET-A表达载体连接,转化感受态E.coli DH5α,提取质粒进行酶切鉴定及测序.将阳性重组质粒转化感受态E.coli BL21(DE3),经IPTG诱导表达后,对表达产物进行Western blot法鉴定和Ni-NTA层析纯化.结果:构建了带有TCS突变体基因(TCSFYY163- 165CSA)的重组表达质粒,使目的蛋白在大肠杆菌中获得高效可溶性表达,表达产物经纯化后,得到均一的TCS突变体蛋白.结论:成功地构建了TCS突变体基因TCSFYY163 - 165CSA,并获得高效表达,为基因工程方法改造TCS提供了新的途径.     

FBN1基因c.4336G>A突变导致35号外显子缺失可能引发马方综合征

目的探究1例马方综合征家系的遗传学病因及检出突变c.4336G>A对原纤维蛋白-1(FBN1)基因剪接效应的影响。方法对2019年8月就诊于空军军医大学西京医院心血管外科的1例胸主动脉夹层动脉瘤患者, 采用多重PCR联合二代测序技术对其进行遗传性主动脉疾病相关的15个基因的组合检测, 应用Sanger测序技术对检出位点进行验证并对部分家庭成员进行同一位点的检测。通过剪接预测软件预测该突变位点对剪接的影响, 并提取正常人及患者新鲜外周血中RNA, 通过逆转录PCR及Sanger测序, 验证突变对剪接过程的影响。根据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)遗传变异分类标准与指南分析检出位点的致病性。结果基因组合检测结果显示先证者携带有FBN1基因杂合变异c.4336G>A, Sanger测序结果与二代测序结果一致。Sanger测序对部分家庭成员检测发现, 该家系中还存在4名携带者, 其中3例已出现胸主动脉瘤或夹层的表现;dbscSNV_ada_score 和dbscSNV_rf_score预测检出位...     

循环肿瘤DNA检测西妥昔单抗联合化疗一线治疗晚期结直肠癌的获得性基因突变

<正>1文献来源Raghav K,Ou F-S,Venook AP,et al. Acquiredgenomic alterations on first-line chemotherapy with cetuximab in advanced colorectal cancer:circulatingtumor DNA analysis of the CALGB/SWOG-80405Trial (Alliance)[J]. J Clin Oncol, 2022:JCO2200365. Online ahead of print.2证据水平1b。