宁夏汉坦病毒分离株M基因片段的序列分析

目的比较它们与已知汉坦病毒的同源性和亲缘关系。方法用RT－PCR扩增了宁夏汉坦病毒分离株的M基因330hP片段,通过PGEM－T载体质粒将基因片段克隆进入大肠杆菌JM109,并进行核苷酸序列的测定;与其它汉坦病毒核苷酸序列的同源性比较。结果NX－143株病毒与HTN型毒株核着酸序列的同源性在79．4％～82．4％之间,与其它血清型毒株的同源性为57．6％～71．5％。表明NX－143属于HTN型病毒。结论NX－143属于HTN病毒新的基因亚型,国内可能同时存在多种亚型的HTN型病毒。     

献血员中TTV感染的检测及部分基因序列分析

目的　探讨湛江地区献血员中输血传播病毒 (TTV)的感染状况及部分TTV的基因序列。方法　采用SDS和蛋白酶K法提取 4 80份正常献血员、6 0份血清丙氨酸转氨酶 (ALT)异常献血员的血清标本DNA ,应用套式PCR方法检测TTV的感染状况 ,并对部分扩增出的阳性片段进行克隆测序 ,与国内外报道的序列进行同源性比较。结果　在 4 80份正常献血员血清标本中 ,5 2份 (10 83% )TTVDNA阳性 ;在ALT异常的 6 0份献血员血清标本中 ,15份TTVDNA阳性 ,阳性检出率为 2 5 % ,明显高于正常献血员人群 (χ2 =9 84 7,P <0 0 1)。序列分析结果显示 ,从献血员中随机选出的 5例TTVDNA阳性片段 ,其序列与日本株 (AB0 0 8394 )和中国株 (TTVCH1)相应位置核苷酸序列的同源性大于97% ,可能属同一基因型。结论　湛江地区献血员中存在TTV感染 ,输血可能成为TTV感染的传播途径之一。     

Air Pollution and the Cerebro Cardio-vascular Diseases Mortality of Population in Guangzhou: a Time-series Analysis

目的 探讨广州市空气污染物(PM10、SO2、NO2)对心脑血管疾病死亡的短期影响.方法 收集广州市城区居民心脑血管疾病死亡统计资料及同期大气污染物浓度、气象监测资料,采用时间序列的自回归模型,在控制长期趋势、短期趋势、气象因素等混杂因素的基础上,分析广州中心城区2006年1月1日—2008年12月31日空气污染物与居民心脑血管疾病每日死亡人数的关系.结果 2007年和2008年的死亡病例数高于2006年,每年3-12月的死亡病例数低于1月和2月.NO2和PM10浓度与心脑血管疾病每日死亡人数呈正相关,空气中NO2和PM10的浓度每升高lμg/m3,心脑血管疾病每日死亡人数将分别增加1.8％和1.1％,前6d的NO2和PM10水平对当天的疾病死亡病例数有负影响.PM10、SO2、NO2浓度之间呈现一定正相关,并具有滞后现象.结论 广州市大气中NO2和PM10对人群健康存在短期影响,能增加人群心脑血管疾病死亡.     

桑黄肌动蛋白基因片段的克隆及序列分析

目的 对桑黄肌动蛋白(Actin)基因进行克隆及序列分析.方法 搜索网上已知数据库中Actin基因,与本实验室测得的桑黄转录组数据进行生物信息学比对,找到转录组数据中与Actin相似性最高的片段,并根据其设计引物,提取桑黄菌丝体总RNA为模板,采用RT-PCR的方法扩增Actin基因片段并对PCR产物进行测序.结果 得到一段839 bp的序列,序列分析表明,该片段编码279个氨基酸,与其他物种Actin基因核苷酸序列同源性在87％以上.结论 首次从桑黄中克隆出了Actin基因,为有效利用该基因奠定了基础.     

阿胶酶解物抗氧化肽的分离与质谱分析

采用阴离子交换纤维及Sephadex G-25柱色谱法对阿胶酶解物进行分离纯化,以DPPH,ABTS法对阿胶酶解物及其不同部位进行体外抗氧化能力测定,从阿胶酶解物中筛选出体外抗氧化活性最强的部位,命名为GFC-1.GFC-1质量浓度为2.0g·L-1时对DPPH清除率为47.95％,0.40 g· L-1时对ABTS清除率为97.20％;利用LC-ESI-MS/MS结合TurboSEQUEST检索软件及Swiss-Prot数据库从GFC-1中鉴定出9个小分子肽,并从中识别出高重复核心序列GPAGPP* GPP*(P*为羟脯氨酸).     

一株宽宿主谱大肠埃希菌噬菌体的RNA比较分析及其环境微生物杀灭效应观察

目的通过比较研究一株分离自医院污水的宽宿主范围大肠埃希菌(E．coli)噬菌体与野生型单一宿主谱E．coli噬菌体的核酸序列和微生物杀灭效应等生物学特性的改变探讨噬菌体识别特异性机制和将噬菌体作为生物消毒剂应用于环境污水净化的可行性。方法采用抗体沉淀-盐酸胍一步法分别提取单一宿主谱E．coli噬菌体f2株及宽宿主谱E、coli噬菌体株的RNA，通过琼脂糖凝胶电泳鉴定其纯度；采用简并引物逆转录聚合酶链反应(RT—PCR)及随机引物随机扩增多态性DNA(RAPD)-PCR比较分析噬菌体宿主谱改变时核酸序列组成的变化；通过以上两噬菌体对环境样本中活菌和E．coil的杀灭效果的观察，比较分析宿主谱改变对噬菌体的微生物杀灭效应这一生物学特性的影响。结果噬菌体核酸分析试验证实，f2噬菌体及宽噬噬菌体均为6000bp左右的单链RNA噬菌体。RAPD—PCR结果显示，两噬菌体基因eDNA扩增出的RAPD—DNA片段有明显的差异，其中26条为可区分的DNA带型。利用简并引物进行的RT—PCR反应显示，噬菌体f2cDNA在450bp附近出现重复性较好的扩增片段，而宽噬噬菌体cDNA在相同条件下未出现扩增产物。环境水样本微生物杀灭试验结果显示，宽宿主谱株噬菌体对环境水样本中的E．coli杀灭率为36．75％～56．28％，对水样本中活菌杀灭率为30.84％～47．96％；而噬菌体f2对环境水样本中的E．coli杀灭率则为19．19％～35．06％，对水样本中活菌杀灭率为13．05％～27.85％。结论宽宿主谱噬菌体微生物杀灭率明显高于野生型单一宿主谱噬菌体f2(P=0．000)；核酸分析证实两噬菌体宿主特异性裂解效应已从基因水平发牛了变化。     

浙江地区幽门螺杆菌临床菌株空泡毒素基因的变异及其表达活性分析

目的 了解浙江地区消化性溃疡(PU)和慢性胃炎(CG)患者感染幽门螺杆菌(Hp)vacA基因的变异及其空泡毒素表达情况。方法 从70株Hp中选择部分菌株测定其vacA基因的s区和m区核苷酸序列。用细胞培养的方法检测Hp菌株的空泡毒性。结果 6株sla型Hp菌株的s区扩增产物与报道的sla型60190株核苷酸序列相似性为93．2％～98．3％，4株m2型Hp菌株的m区扩增产物与报道的m2型87—203株核苷酸序列之间相似性为93．8％～97．6％。1株m1b型Hp菌株的m区扩增产物与报道的m1型60190株相应序列相似性为87．3％，与m2型87—203株相应序列之间相似性为71．7％。所有5株sla／m1型Hp对HeLa、RK-13和SGC-7901三种细胞均有明显的空泡毒作用；仅27.9％(12／43)的sla／m2型菌株对HeLa细胞表现为空泡毒作用，但分别有65．1％(28／43)和62.8％(27／43)的菌株对RK-13细胞和SGC-7901细胞有空泡毒作用。所有sla／m1b和sla／m1b—m2型Hp菌株对三种细胞均有明显的空泡毒作用，以RK-13细胞计，81.0％(17／21)的sla／m1b型Hp菌株和1株sla／m1b—m2型有空泡毒性。PU组感染的Hp菌株空泡毒性(84．4％)强于CG组(60．5％)，差异有统计学意义(P＜0．05)。结论 浙江地区患者感染的Hp菌株vacA基因变异主要在于m区。vacA基因空泡毒性的表达在HeLa细胞中低毒性的sla／m2型菌株在RK-13和SGC-7901细胞中仍有较高的空泡毒性。m1b型Hp空泡毒性强度介于m1和m2型之间。PU患者感染的Hp菌株其空泡毒性明显强于CG组。     

新发现的呼吸道病毒：人偏肺病毒

副黏病毒科包括副黏病毒亚科及肺病毒亚科，肺病毒亚科包括肺病毒属与偏肺病毒属；肺病毒属中的病毒许多是人类和动物疾病的主要病原体，如人呼吸道合胞病毒（hRSV）。但是，人类以前没有发现偏肺病毒属与哺乳动物的感染或疾病有联系。2001年，VandenHoogen等在荷兰首先从患呼吸道感染的儿童分离到一种以前未被检出的副黏病毒，根据序列同源性和基因群的分析，该病毒被暂时定为偏肺病毒属中的新成员，命名为人偏肺病毒（或称人间质肺病毒，human metapneumovirus，hMPV）。     

江苏省启东市1972-2001年肺癌发病趋势分析及预测模型比较研究

目的引入时间序列分析江苏省启东市1972—2001年肺癌发病资料并预测其到2010年的变化趋势。方法利用启东市肿瘤登记处积累的肺癌1972—2001年的登记资料，采用时间序列分析方法中的趋势外推法、指数平滑法、自回归综合移动平均模型（ARIMA模型）等分析该地肺癌发病率的变化趋势。比较各方法预测精度，赋予不同权重，建立组合预测模型。结果各种分析方法预测趋势结果：肺癌的发病率将呈现上升趋势；预测今后十年仍继续呈现上升趋势，估计至2010年启东市男性肺癌发病率将突破70／10万，女性将达到20／10万，在2001年基础上将增长33％和10％以上，接近周边大城市肺癌发病率水平。结论通过预测模型的分析和比较，认为运用时间序列分析预测肺癌发病率趋势是恰当的，建立组合模型可以提高预测精度。组合模型与ARIMA法预测启东市肺癌发病率结果相近，可以用ARIMA法作为肺癌发病率预测的主要方法。     

高效液相色谱-电化学检测法测定尿中8-羟基脱氧鸟苷含量

活性氧引起的DNA氧化损伤与衰老和一些疾病有关。DNA中碱基鸟嘌呤C8位易受羟自由基攻击，形成碱基修饰产物8-羟基脱氧鸟嘌呤核苷(8-OHdG)。8-OHdG是DNA氧化损伤的特异产物，是公认的内源性及外源性因素对DNA氧化损伤的生物标志物。当机体修复机制正常时，8-OHdG可在酶的作用下从DNA链上切除并重新掺人正常的鸟嘌呤碱基，而切下的8-OHdG则经尿液排出体外。