焦磷酸测序用于COL1A1基因多态性与骨肉瘤易感性关系分析

目的观察骨肉瘤患者Ⅰ型胶原α1(COL1A1)基因多态性,探讨骨肉瘤与COL1A1基因多态性的相关性。方法收集骨肉瘤以及正常患者外周血样本,应用焦磷酸测序方法(Pyrosequencing)对54例骨肉瘤患者与126例健康对照者COL1A1基因rs1061970位点进行分析。结果 54例骨肉瘤患者COL1A1rs1061970位点基因型频率中,TT(13.0%)和CT(48.1%)要显著高于正常对照组TT基因型频率11.9%及CT等位基因频率30.2%(P<0.05),骨肉瘤患者组中T等位基因的频率为37.0%,高于对照组的27.0%,OR为1.59,95%CI 0.99~2.57,差异无统计学意义(P>0.05),但是骨肉瘤的发病风险仍呈上升趋势。结论 COL1A1基因多态性与骨肉瘤的发生具有相关性,携带COL1A基因T等位基因的发生骨肉瘤的风险增高。     

中国广东籍汉族人细胞色素P450_2E_1基因5'侧翼区多态性

目的：探讨中国广东籍汉族人细胞色素Ｐ４５０２Ｅ１基因５′侧翼区的多态性分布规律。方法：利用聚合酶链反应和ＲｓａⅠ、ＰｓｔⅠ限制性片段长度多态性（ＰＣＲＲＦＬＰ）技术对８２名正常中国广东籍汉族人的细胞色素Ｐ４５０２Ｅ１基因５′侧翼区的多态性进行了检测。结果：８２名正常中国广东籍汉族人的细胞色素Ｐ４５０２Ｅ１基因５′侧翼区Ｃ１（ＲｓａⅠ＋,ＰｓｔⅠ）、Ｃ２（ＲｓａⅠ,ＰｓｔⅠ＋）等位基因频率分别为０８５４,０１４６;基因型Ｃ１Ｃ１、Ｃ１Ｃ２、Ｃ２Ｃ２的比率分别为０７３２、０２４４、００２４,符合ＨａｒｄｙＷｅｉｎｂｅｒｇ平衡分布。结论：中国广东籍汉族人细胞色素Ｐ４５０２Ｅ１基因５′侧翼区ＲｓａⅠ和ＰｓｔⅠ多态性分布规律与欧美人显著不同。     

TLR4基因单核苷酸多态性与哮喘严重度及哮喘相关临床指标的关系

目的:探讨Toll 样受体4(TLR4)单核苷酸多态性(SNPs)与哮喘发病严重度和哮喘相关临床指标的相关性?方法:在HapMap上挑选TLR4的全部标签SNPs?连续性招募哮喘患者318例?采用SNPstream和Taqmans法进行基因分型?流式细胞技术检测外周血中CD4+CD25high调节性T细胞及其表面TLR4的表达?结果:TLR4的4个标签SNPs rs1927914?rs10983755?rs11536879?rs1927907与哮喘患者外周血嗜酸性粒细胞?血清总IgE和hsCRP无相关性?但是rs1927914 TT基因型比TC和CC基因型的FEV1%要低(P = 0.043),哮喘发病程度更严重(P = 0.024)? 同样,rs10983755 GG基因型比GA和AA基因型?rs1927907 GG基因型比GA和AA基因型哮喘发病程度更严重(P = 0.009和P = 0.013)?TLR4 SNPs与哮喘患者外周血CD4+CD25high调节性T细胞无相关性,但是和CD4+CD25high 调节性T细胞表面TLR4的表达量有关?结论:TLR4 SNPs和哮喘严重度分级及CD4+CD25high 调节性T细胞表面TLR4的表达量相关,与哮喘其他表型无相关性?TLR4 SNPs可能影响哮喘症状的严重度,这为哮喘的基因治疗提供了一定理论基础?     

肿瘤坏死因子α基因多态性与老年2型糖尿病的相关性研究

目的研究肿瘤坏死因子α(TNF-α)基因多态性与老年2型糖尿病的相关性。方法利用DNA测序法对60例老年2型糖尿病患者及30例正常对照者的TNF-α基因-308位点和-238位点进行基因多态性分析。结果TNF-α基因-308位点在患病组中变异的G/A基因型频率为21.7%,与对照组组间比较有高度显著差异(P<0.01),而-238位点在两组之间无显著性差异(P>0.05)。结论TNF-α基因G-308A单核苷酸多态性与老年2型糖尿病可能存在相关性。     

Single nucleotide polymorphisms in the D-loop region of mitochondrial DNA and age-at-onset of patients with chronic kidney disease

Background The mitochondrial displacement loop （D-loop） accumulates mutations and single nucleotide polymorphisms （SNPs） at a higher frequency than other regions of mitochondrial DNA （mtDNA）.We previously identified disease riskassociated SNPs in the D-loop of chronic kidney disease （CKD） patients; in this study,we investigated the association of age-at-onset and D-loop SNPs in CKD patients.Methods The D-loop region of mtDNA was sequenced in 119 CKD patients attending the Fourth Hospital of Hebei Medical University between 2002 and 2008.The age-at-onset curve of the CKD patients was calculated using the KaplanMeier method at each SNP site,and compared using the log-rank test.Results The mean age of 119 CKD patients was （55.6±14.2） years,and 56.3% were males.The mean estimated glomerular filtration rate （eGFR） was （81.2±12.4） ml·min^-1·1.73 m^-2,with 79.8% （n=95） of patients having an eGFR 〈60 ml·min^-1·1.73 m^-2.All participants had an eGFR 〉30 ml·min^-1·1.73 m^-2.The age-at-onset for CKD patients who smoked was significantly lower than that of non-smoking CKD patients.The SNP sites of nucleotides 150C/T were identified for their association with age-at-onset using the log-rank test.The age-at-onset of patients with the minor allele T genotype was significantly lower than that of patients with the C genotype at the 150 SNP site （P=0.010）.Conclusions Genetic polymorphisms in the D-loop appear to be predictive markers for age-at-onset in CKD patients.Accordingly,the analysis of genetic polymorphisms in the mitochondrial D-loop may help identify CKD patient subgroups at high risk of early onset disease.     

CYP2D6*10基因多态性对托烷司琼术后止吐效果的影响

目的观察CYP2D6*10基因多态性对托烷司琼术后止吐效果的影响。方法选择择期手术行全身麻醉女性患者60例(ASAⅠ～Ⅱ级),手术结束前30 min静脉给予托烷司琼5 mg,记录术后发生恶心呕吐的情况并对其进行呕吐分级。全组患者于麻醉诱导前采集静脉血3 mL,运用等位基因特异扩增法(ASA-PCR)进行CYP2D6*10基因分型,并记录患者术中循环状态、术后疼痛评分及其他不良反应的情况。结果按照变异位点筛选出野生型纯合子(wt/wt)11例(3.1%),杂合子(m/wt)25例(65%),突变型纯合子(m/m)24例(21.7%),突变纯合子患者恶心呕吐发生率低于其他两类患者(P<0.05);术中循环状态平稳、无不良反应。结论 CYP2D6*10基因多态性是个体产生对托烷司琼代谢差异的影响原因之一,其中突变纯合子类患者术后托烷司琼止吐效果较好。     

嘌呤药物代谢及其甲基化多态性研究进展

巯嘌呤（6－mercaptopurine,6－MP）是抗代谢类抗肿瘤药物,本身无活性,是药物前体;药物经体内代谢生成活性化合物后,产生抗肿瘤作用;用于急性淋巴细胞性白血病的治疗。由于其存在的耐药性和造血系统毒性,使它的临床使用价值难以完全体现。近年来,由于分子药理学和...     

中国部分汉族人群GH1基因启动子区单核苷酸多态性与正常人群身高的关系

目的 研究中国部分汉族人群GH1基因启动子近侧区域内的单核苷酸多态性(SNP)与人体身高调控的关系.方法 采用直接测序法进行SNP检测,Logistic回归分析筛查可能与身高相关的基因多态性位点.分别构建所发现的GH1基因启动子区的-308T和-57G突变位点的pGL4荧光素酶报告基因载体,转染入GC细胞后进行双荧光素酶检测分析.结果 中国部分汉族人群GH1基因启动子近侧区域中存在12个SNP,有6个位点多态性的发生频率与白种人存在明显差异(P<0.01). 荧光素酶检测结果示野生型荧光表达量高于-57和-308位点突变型,差异有统计学意义(P<0.01).结论 GH1基因启动子邻近区域在中国部分汉族人群中表现出高度多态性,并存在一定的人种差异,其中有两处SNP可能影响到人群的身材高矮.     

胆固醇酯转运蛋白TaqIB和亚甲基四氢叶酸还原酶MTHFR C667T基因多态性与视网膜中央静脉阻塞的关系

目的:探讨胆固醇酯转运蛋白(CETP)基因TaqIB和N5 N10-亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因MTHFR C667T多态性与视网膜中央静脉阻塞的关系。方法:采用多聚酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性(PCR-RFLP)技术检测60例经视网膜荧光造影诊断的视网膜中央静脉阻塞患者和120例对照者的CETP和MTHFR基因多态性。结果:视网膜中央静脉阻塞组B1/B1基因型频率(33.3%)明显高于对照组(12.5%)(P<0.05),B1等位基因频率(51.8%)也明显高于对照组(31.8%)(P<0.05);视网膜中央静脉阻塞组T/T基因频率(30.0%)明显高于对照组(15.0%)(P<0.05),T等位基因频率(50.6%)也明显高于对照组(34.6%)(P<0.05);TaqIB基因的B1等位基因与MTHFR基因的T等位基因之间有协同作用(rs=0.954)。结论:CETP与MTHFR基因和视网膜中央静脉阻塞的发病有关,CETP和MTHFR基因之间有协同作用。     

青海省38株结核分枝杆菌plc基因多态性研究

目的 探讨青海地区临床分离的结核杆菌中磷脂酶C编码基因plcABCD的突变情况.方法 38株结核杆菌增菌后提取DNA,并对4个基因plcA,plcB,plcC,plcD同时进行扩增,用琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物并分析菌株基因的突变或缺失情况.结果 38株菌被分为6个基因型,其中12株含有完整的所有plcABCD基因,为plc野生株,占31.58％;26株菌有不同plc基因的缺失,为plc突变株,占68.42％.2株菌同时缺失了plcABD基因.plcA,plcB,plcC,plcD各基因的突变发生率分别为13.16％,10.53％,7.89％,47.37％.结论 青海地区临床分离的结核杆菌plc基因呈现多态性,plcD基因最易发生突变.