疫情防控策略优化后上海市新型冠状病毒感染疫情的预测和估计

目的量化预测在不同场景下上海市新型冠状病毒(新冠病毒)感染疫情的发展规模和医疗卫生资源需求, 模拟评估新冠病毒疫苗接种情况、非药物干预措施(NPIs)、居家隔离意愿和入境情况等因素对新冠病毒感染疫情发展规模的影响。方法基于新冠病毒的自然史、上海市新冠病毒疫苗接种情况和NPIs情况构建具有年龄结构的SEIR传染病动力学模型(SEIR模型), 以2022年12月1日作为模型模拟起点的当日实际情况, 对疫情发展规模和床位需求情况进行模拟估计。结果上海市在新冠病毒疫苗接种的实际情况下, 100 d的模拟期内累计有住院需求的感染人数为18.02万。相比于新冠病毒疫苗接种的实际情况, 当人群加强针接种率达到理想情况时, 累计有住院需求的感染人数下降73.20%, 与不实施NPIs相比, 仅关闭学校、关闭学校和工作场所的措施对普通床位需求数的峰值分别降低24.04%、37.73%, 感染者居家隔离意愿的提高可降低每日新增感染人数并推迟峰值出现时间, 入境人数的变化对于疫情发展规模的影响较小。结论上海市在新冠病毒感染的流行特征和新冠病毒疫苗接种的实际情况下, 可通过提高新冠病毒疫苗接种率、尽早实施NP...     

新型冠状病毒感染者航班同乘风险人员排查效果分析

目的 分析新型冠状病毒（新冠病毒）感染者航班同乘人员新冠病毒核酸阳性检出情况,为有效确定风险人员排查范围提供依据。方法 回顾性收集我国2020年4月1日至2022年4月30日本土新冠病毒感染者航班同乘人员信息,采用χ²检验分析比较指示病例发病前不同时间、不同座位距离和不同新冠病毒变异株流行期的同乘人员核酸阳性检出率。结果 研究期间,新冠病毒感染者共涉及370架次航班和23 548名同乘人员,累计判定指示病例433名。指示病例的同乘人员中,核酸检测阳性人员72名,其中,与指示病例同行人员57名,非同行人员15名。对15名非同行的阳性同乘人员进一步分析显示,86.67%在指示病例诊断后3 d内发病或检测阳性,乘机时间均在指示病例发病前4 d内,指示病例前后三排内的阳性检出率为0.15%（95%CI：0.08%~0.27%）,显著高于前后三排外的阳性检出率［0.04%（95%CI：0.02%~0.10%）,P=0.007］,前后三排内各排的阳性检出率差异无统计学意义（P=0.577）。不同类型变异株流行期间,非同行的同乘人员阳性检出率差异无统计学意义（P=0.565）。Omicron变异株流行期中,非同行人员阳性检出集中在指示病例发病前3 d内。结论 指示病例航班同乘人员的风险排查时间可设定为指示病例发病前4 d内。指示病例前后三排内的同乘人员应作为优先排查人员,并作为密切接触者进行管理,座位距离在指示病例前后三排外的同乘人员可作为一般风险人员进行排查和管理。     

2007-2021年我国诺如病毒急性胃肠炎暴发疫情流行特征及影响因素分析

目的 分析我国诺如病毒急性胃肠炎暴发疫情流行病学特征,探讨暴发疫情规模的影响因素,为及早控制暴发疫情提供科学依据。方法 对突发公共卫生事件管理信息系统2007年1月1日至2021年12月31日全国诺如病毒急性胃肠炎暴发疫情进行描述性流行病学分析,应用非条件logistic回归模型分析暴发疫情规模的影响因素。结果 2007-2021年共报告暴发诺如病毒急性胃肠炎疫情1 725起,报告疫情起数呈上升趋势。南方省份每年10月至次年3月为疫情高峰,北方省份疫情高峰为每年10-12月和次年3-6月。疫情报告地区从东南沿海省份逐步向中部、东北和西部省份扩散。疫情主要发生在学校和托幼机构（1 539起,89.22%）,其次为企事业单位（67起,3.88%）和社区家庭（55起,3.19%）。人与人接触为主要传播途径1 262起（73.16%）,GⅡ基因型为引起暴发疫情的主要病原型别（899起,81.58%）。首例病例发病至疫情报告时间间隔M（Q₁,Q₃）为3（2,6）d,疫情规模M（Q₁,Q₃）为38（28,62）例。近年来,疫情报告及时性提升,疫情规模随年份呈下降趋势,二者在不同发生场所之间差异均有统计学意义（P<0.001）。发生场所、传播途径、报告及时性和居住地类型是暴发疫情规模的影响因素（P<0.05）。结论 2007-2021年我国诺如病毒急性胃肠炎暴发疫情整体呈上升趋势,疫情波及地区范围不断扩大,但疫情发生规模整体呈下降趋势,疫情报告及时性提升,提高监测灵敏度和及早报告可有效控制疫情发生规模。     

18～45岁已婚HIV感染者生育安全认知现状调查

目的了解18～45岁已婚HIV感染者生育安全认知现状, 为艾滋病感染家庭生育安全干预提供依据。方法选择重庆市6个区和四川省自贡市2021年11月至2022年4月接受随访的18～45岁已婚HIV感染者进行问卷调查, 收集其一般人口学特征、性行为史、生育意愿、生育安全认知等, 采用非条件logistic回归分析和Poisson回归分析研究对象生育安全认知的相关因素。结果 266名研究对象中, 女性占58.3%(155/266), 有生育意愿的HIV感染者占48.9%(130/266)。研究对象的生育安全知识知晓率为59.4%(158/266), 生育安全知识知晓情况的多因素logistic回归分析结果显示, 女性生育安全知识知晓率是男性的2.14(95%CI:1.25～3.66)倍;高中及以上文化程度者生育安全知识知晓率是高中以下文化程度的1.88(95%CI:1.08～3.27)倍;有生育意愿者生育安全知识知晓率是无生育意愿的1.88(95%CI:1.10～3.22)倍, 接受过艾滋病知识宣传教育者生育安全知识知晓率是未接受过艾滋病知识宣传教育的9.06(95%CI:2.46～33.32...     

我国食品来源金黄色葡萄球菌种群结构分析

目的了解我国食源性金黄色葡萄球菌(金葡菌)的种群结构。方法通过全基因组测序方法对2006-2020年我国16个省份收集的763株食源性金葡菌进行多位点序列分型、葡萄球菌蛋白A编码基因(spa)和葡萄球菌染色体mec基因盒(SCCmec)分型, 使用BioNumerics 7.5软件创建基于ST类型的最小生成树。国外进口食品分离到的金葡菌31株被纳入基因组系统发育树的构建。结果 763株金葡菌共鉴定出90个ST型和160个spa型别, 其中20种为新ST型别。72个(72/90, 80.0%)ST型属于22个克隆群, 其中主要型别为CC7、CC1、CC5、CC398、CC188、CC59、CC6、CC88、CC15和CC25, 占82.44%(629/763)。其中优势克隆群中ST型和spa型别随着时间的变化呈多态性变化。耐甲氧西林金葡菌(MRSA)的阳性率为7.60%, 共鉴定出7种SCCmec型别, 以ST59-t437-Ⅳa(17.24%, 10/58)、ST239-t030-Ⅲ(12.07%, 7/58)、ST59-t437-Ⅴb(8.62%, 5/58)、ST338-t437-...     

我国老年人群艾滋病防控现状与挑战

近年来我国老年人群艾滋病疫情呈现快速上升趋势,老年人群艾滋病防治面临新的挑战。老年人群对HIV感染风险认知较低,发生无保护的临时性行为或商业性行为比例较高,HIV感染风险较高。老年HIV感染者和感染风险较高的老年人群文化程度和社会经济水平普遍偏低,获取艾滋病相关知识和检测服务机会较为有限,老年HIV感染者由于检测发现晚、合并慢性疾病等因素,死亡风险显著上升。需从行为特征、社会经济、文化、心理等方面多维度深入开展老年人艾滋病防治研究,探索和采取适合老年人群特点的防治艾滋病健康服务的策略措施,强化对老年感染者全流程综合管理模式的研究。     

串联杂种泛素结合结构域蛋白（ThUBD）在大肠杆菌中的可溶性高效表达

目的：提高人工串联杂种泛素结合结构域蛋白（ tandem hybrid UBD, ThUBD）在大肠杆菌中的可溶性表达量,为泛素化蛋白研究提供高效特异的富集方法。方法根据大肠杆菌同义密码子相对频率（ RFSC）表对大肠杆菌的密码子进行分类,计算ThUBD密码子的相对适应度,并根据分析结果对ThUBD的密码子进行优化;诱导表达和蛋白定量检测密码子的优化结果;亲和纯化及泛素化蛋白富集研究检测密码子优化后的ThUBD－S的UbC结合能力。结果根据分析结果优化ThUBD密码子,使得适于大肠杆菌基因表达的密码子从48％增加到75％,并消除了阻碍转录翻译的密码子,其密码子适应指数（CAI）从0．63升高到0．88。密码子优化后的ThUBD其可溶性蛋白ThUBD－S的表达量增加了4倍,达到总蛋白的13．06％。同时,优化后的ThUBD－S可能具有更高的UbC的结合能力。结论 ThUBD的基因序列经过优化后,其在大肠杆菌中的表达量升高4倍左右。同时,序列优化不影响融合蛋白ThUBD在大肠杆菌中的可溶性表达和结合UbC的能力。     

CDC42在HBx介导肝细胞恶性转化中作用的定量蛋白质组学研究

目的寻找在乙肝病毒 X 蛋白（HBx）诱发肝细胞恶性转化过程中 CDC42信号通路发挥作用的介导因子。方法利用基于质量亏损的准等重二甲基标记（pIDL）的定量蛋白质组学方法,检测 CDC42基因敲除前后HBx 转基因细胞蛋白质组的差异。筛选差异蛋白并对差异蛋白进行基因本体（gene ontology,GO）功能分析。结果与结论共定量到3409个蛋白,筛选出220个差异蛋白,通过 GO 分析发现与细胞骨架组织相关的 palladin、成蛋白样亚家族1（formin-like 1,FMNL1）和角蛋白-19均发生显著下调。该研究为 CDC42在 HBx 介导 Huh7细胞恶性转化的机制研究提供了候选基因和蛋白。