全基因组关联研究理论及其在流行病中的应用

全基因组关联研究(GWAS)利用遍布于全基因组范围的分子标记(主要为单核苷酸多态性,SNP)并借助强大统计学工具,对影响某些复杂性状如疾病易感的遗传变异进行鉴定和分析.     

马鞍山市食品中单核细胞增生李斯特菌污染调查及分子生物学特征

单核细胞增生李斯特菌(listerial monocytogenes,LM)在自然界分布广泛,主要以家畜、家禽为宿主,可引起人和动物脑膜炎、败血症、流产等症状,是人畜共患病的致病菌,病死率达20%～30%[1].近30年来,国外多次报道由LM引发的食物中毒事件.目前,国内虽没有LM引起食物中毒暴发的相关报道,但食品监测显示食品中LM污染情况较为严峻[2-3],同时我周也曾报道多起由该菌引起临床感染的病例报告[4-5].     

流行性乙型脑炎病毒在自然界的保存与扩散及传播媒介

流行性乙型脑炎(简称乙脑)国际上称为日本脑炎(Japanese encephalitis),是由蚊虫等吸血昆虫叮咬感染乙脑病毒引发的急性传染病.病死率较高,而且后遗症严重,对人类健康危害较大.乙脑也是一种人兽共患的自然疫源性疾病.     

2006－2016年我国畜禽动物源性沙门菌血清型分布及其耐药特征

目的了解2006 — 2016年我国畜禽动物来源沙门菌的血清型分布及其耐药特征，完善我国动物源性沙门菌耐药数据，为多重耐药沙门菌感染的预防控制决策提供依据。方法利用传统血清凝集试验，对主要来源于鸡、猪的沙门菌进行血清分型；采用微量肉汤稀释法测定所有实验菌株对16种抗生素的最小抑菌浓度，依据美国临床和实验室标准协会 2017版进行药敏结果判读。结果2006 — 2016年776株沙门菌分为49种血清型，以肠炎沙门菌（31.57%）、德尔卑沙门菌（17.53%）和鼠伤寒沙门菌（14.82%）为主。 猪和鸡源沙门菌的优势血清型分别为德尔卑沙门菌（39.15%）和肠炎沙门菌（51.62%）。 沙门菌对磺胺异恶唑、链霉素和萘啶酸的耐药率最高，分别为73.32%、70.88%、69.59%；对环丙沙星的耐药率为10.70%；对三代头孢的敏感性较高，达92.00%以上。 菌株多重耐药率达63.40%，鼠伤寒沙门菌多重耐药率最高（90.44%），次之为德尔卑沙门菌（63.24%）和肠炎沙门菌（58.78%）。结论我国主要畜禽动物源性沙门菌的多重耐药现象较严重。 随着时间的推移，菌株对多数药物的耐药水平呈上升趋势，需密切关注并实时监测耐药性的变迁、播散及其对环境、人群的潜在威胁，同时加强养殖业抗菌药物的合理应用及监管。     

苏州市2019年中小学校教学环境卫生现况

分析苏州市中小学校教学环境卫生现况,为教育及卫生健康部门确定重点学校公共卫生问题提供理论依据.方法 按比例分层抽取苏州10区县学校共204所1 253间教室,统计描述各教学环境卫生检测指标合格率及城乡、学段差异,采用Spearman相关探究学生近视与各检测指标相关关系.结果 灯桌间距合格率最高,为98.56%;课桌椅符合率最低,为0.96%.灯桌间距、黑板面平均照度、黑板壁反射比、教室人均面积、教室CO2体积百分比浓度合格率城乡差异均有统计学意义(P值均<0.05);采光系数、后墙壁反射比、课桌面及黑板面平均照度、教室人均面积、教室CO2体积百分比浓度合格率不同学段差异均有统计学意义(P值均<0.05);视力不良率与课桌面照度合格率的相关有统计学意义(r=0.42,P<0.05).结论 苏州地区课桌椅符合率及教室采光指标应是重点关注方向.卫生健康部门应实行差异化治理,根据各区县、学段重点卫生问题,有针对性地制定治理计划.     

利用基因芯片技术分析空肠弯曲菌的遗传特征

目的 为分析我国弯曲菌遗传特征,本研究根据已发表多株弯曲菌的全基因组测序特征及比对结果自行设计基因芯片,利用芯片对我国不同宿主来源菌株进行遗传特异性分析。方法 根据前期基因组水平比对分析的结果,利用Combimatrix tilingCustomArrayTM 90K芯片,设计DNA芯片。芯片包含已测序菌株 ICDCCJ07001、269.97、NCTC11168、81-176、81-116和RM1221共3384个CDS的探针序列,以及空肠弯曲菌耐药及致病性相关2个质粒共80个CDS的探针序列,与脂寡糖的合成相关基因簇16种共219个CDS的探针序列、荚膜多糖合成相关基因簇7种共160个CDS的所有序列。对我国不同宿主来源27株分离菌株提取DNA,利用芯片进行杂交,获得杂交信息并分析不同菌株CDS分布特征分析及聚类特点。结果 中国菌株的主要变异区域主要存在于与脂寡糖、荚膜多糖合成相关的基因簇、鞭毛修饰相关的基因簇、DNA限制/修饰相关的基因簇以及空肠弯曲菌Mu样噬菌体基因簇。基因组水平不同来源菌株CDS分布的聚类结果没有发现显著的宿主归因特点,但GBS相关菌株脂寡糖合成相关基因组成具有共性特征。结论 通过验证以及与过去研究的比较,本次研究中的基因芯片技术结果准确可信,本研究所用基因芯片在分析空肠弯曲菌基因多态性方面具有很好的优势,可用于弯曲菌遗传特征和重要毒力因子的分析和检测。     

建立检测产气肠杆菌的TaqMan荧光定量PCR和普通PCR方法

目的 建立敏感、特异的普通聚合酶链反应(PCR)方法和TaqMan 荧光定量PCR方法对产气肠杆菌进行快速检测。方法 以产气肠杆菌组氨酸脱氢酶基因(hdc)为靶基因设计引物以及TaqMan FAM探针,建立对产气肠杆菌进行检测的普通PCR方法和TaqMan 荧光定量PCR方法,并评价该方法的特异性、灵敏性和稳定性。结果 普通PCR和TaqMan 荧光定量PCR方法均能对产气肠杆菌进行特异检测;普通PCR方法对质粒标准品和粪便模拟标本的检测下限分别为 100 copies/l和1.0105 cfu/g,TaqMan 荧光定量PCR方法对质粒标准品和粪便模拟标本的检测下限分别为33 copies/l和1.0104 cfu/g;TaqMan 荧光定量PCR方法对质粒标准品和粪便模拟标本检测的扩增曲线良好;在稳定性评价试验中,普通PCR方法的重复性良好,TaqMan 荧光定量PCR方法对质粒标准品检测Ct值的组内差异为0.15%~0.98%,组间差异为0.55%~1.63%。结论 本研究建立的检测产气肠杆菌的普通PCR方法和TaqMan 荧光PCR方法特异性好、灵敏度高,能够用于产气肠杆菌的快速检测。     

2015年中国克雅氏病监测病例特征分析

目的 了解中国克雅氏病(Creutzfeldt-Jakob disease, CJD)的发病情况、流行病学及临床特征。方法 对2015年我国CJD监测网络获得的可疑CJD病例的临床及流行病学资料进行分析,收集患者脑脊液及血液样品,利用Western Blot方法检测脑脊液中14-3-3蛋白,提取全血基因组DNA并利用PCR及测序方法对PRNP基因进行129位多态性及基因突变分析。结果 2015年共监测病例366例,其中散发型CJD临床诊断病例134例,疑似诊断病例29例,致死性家族型失眠症病例4例,吉斯特曼-斯特劳斯综合征病例1例及家族型CJD病例17例,包括11例T188K、4例E200K、1例E196K及1例E196A突变。病例报告无季节聚集性,长久居住地呈散在分布,职业分布广泛。临床诊断病例平均年龄为63岁,男女性别比为1.13:1;疑似诊断病例平均年龄为60岁,男女性别比为1.64:1。快速进行性痴呆为最常见的首发症状,占全部诊断病例的36.81%。临床诊断病例比疑似诊断病例出现更多的典型临床表现。结论 2015年我国监测到的CJD病例以散发型为主,病例的报告时间、长久居住地分布、职业分布、性别比例以及年龄分布均符合散发型CJD的特点。     

中国6省莱姆病螺旋体主要宿主动物鼠的初步调查

目的了解中国吉林、山西、甘肃、青海、贵州、湖南6省林区莱姆病螺旋体宿主动物鼠的感染情况。方法在每个省各选取两个采样点进行捕鼠,采用病原分离培养和巢式PCR方法对野鼠的脾脏、肾脏和膀胱进行了病原学检测。并通过基因测序方法确定基因型。结果从贵州黑线姬鼠中分离到了2株莱姆病螺旋体;从5省(贵州未检测到)野鼠的脾脏和/或肾脏中检查到了莱姆病螺旋体的特异片段,其中青海黄南(28.85%)和湖南石门(19.6%)两地标本的PCR阳性率较高,各地区阳性率的差异有统计学意义。通过序列同源性分析确定吉林、青海、甘肃和山西的基因型均为Borrelia garinii。湖南的基因型为Borreliavalaisiana。结论本次调查表明各地宿主动物鼠的感染状况不同,各地应根据具体情况进一步扩大调查以明确当地的主要宿主动物种类及携带病原体情况。     

结核病的细胞免疫研究进展

结核病一直是人们关注的全球性健康问题。目前,全球已有20亿人感染结核菌,活动性结核患者达1500万,每年新发结核患者达800～1000万,有180万人因结核病死亡。结核病的感染、发生、发展及转