基于生物信息学构建胰腺癌患者预后相关miRNA预测模型及其应用价值

目的探讨基于生物信息学构建胰腺癌患者预后相关微小RNA(miRNA)预测模型及其应用价值。方法采用回顾性队列研究方法。收集肿瘤基因图谱计划(TCGA)数据库(https://cancergenome.nih.gov/)自建库起至2017年9月171例胰腺癌患者的临床病理资料;男93例,女78例;中位年龄为65岁,年龄范围为35~88岁。171例患者中,64例临床病理资料完整。171例患者采用随机抽样法按7∶3比例分为训练集123例和测试集48例。训练集用于构建预测模型,测试集用于验证预测模型效能。从GEO基因公共表达数据库中下载包含9对胰腺癌及对应癌旁组织的miRNA测序数据的数据集GSE41372,从癌组织及癌旁组织差异表达的miRNA中筛选出候选差异表达miRNA,基于训练集患者信息,进行LASSO-COX回归分析,从候选差异表达miRNA中筛选出与生存相关miRNA,将其拟合成一个相对精简的预后相关miRNA模型。分别在训练集和测试集中对构建的预后相关miRNA模型的预测效能进行验证,以受试者工作曲线下面积(AUC)评价模型准确性,以一致性指数(C-index值)评价模型效能。观察指标:(1)患者生存情况。(2)差异表达miRNA筛选结果。(3)预后相关miRNA模型的构建。(4)预后相关miRNA模型的验证。(5)胰腺癌患者临床病理因素比较。(6)影响胰腺癌患者预后的相关因素分析。(7)预后相关miRNA模型与第8版TNM分期预测效能的比较。正态分布的计量资料以±s表示,两组间比较采用Student-t检验,多组间比较采用方差分析。偏态分布的计量资料以M(范围)表示,组间比较采用Mann-Whitney U检验。计数资料以绝对数或百分比表示,组间比较采用χ2检验。等级资料分析采用秩和检验。采用计数资料相关性分析,挖掘预后相关miRNA模型与患者临床病理参数之间的相关性。采用COX进行单因素及多因素分析,并判断相关性,结果以风险比及95%可信区间表示,风险比<1时,证明该因素为保护因素;风险比>1时,证明该因素为危险因素;风险比=1时,说明对生存无明显影响。采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线并计算生存率,采用Log-rank检验进行生存分析。结果(1)患者生存情况:123例训练集患者随访时间为31~2141 d,中位随访时间为449 d,3、5年总体生存率分别为16.67%、8.06%。48例测试集患者随访时间为41~2182 d,中位随访时间为457 d,3、5年总体生存率分别为15.63%、9.68%。两组患者3、5年总体生存率比较,差异均无统计学意义(χ2=0.017,0.068,P>0.05)。(2)差异表达miRNA筛选结果:生物信息学分析结果显示,共筛选102个候选差异表达miRNA,其中63个miRNA在癌组织中上调,39个miRNA在癌组织中下调。(3)预后相关miRNA模型的构建:在102个候选差异表达基因中,筛选出5个与生存相关的miRNA。名称分别为miR-21、miR-125a-5p、miR-744、miR-374b、miR-664,差异表达模式(癌组织对比癌旁组织)分别为升高、升高、降低、升高、降低,差异表达倍数分别为4.00、3.43、3.85、2.62、2.35倍。由5个与生存相关miRNA构建的预后表达方程=0.454×miR-21表达量-0.492×miR-125a-5p表达量-0.49×miR-744表达量-0.419×miR-374b表达量-0.036×miR-664表达量。(4)预后相关miRNA模型的验证:在训练集和测试集中,预后相关miRNA模型C-index值分别为0.643和0.642。(5)胰腺癌患者临床病理因素比较:COX分析结果显示,预后相关miRNA模型与肿瘤病理学T分期和肿瘤位置具有相关性(Z=45.481,χ2=10.176,P<0.05)。(6)影响胰腺癌患者预后的相关因素分析:单因素分析结果显示为肿瘤病理学N分期、接受放射治疗、接受分子靶向治疗、预后相关miRNA模型评分是胰腺癌患者预后的相关因素(风险比=2.471,0.290,0.172,2.001,95%可信区间为1.012~6.032,0.101~0.833,0.082~0.364,1.371~2.922,P<0.05)。多因素分析结果显示:接受分子靶向治疗是胰腺癌患者预后的独立保护因素(风险比=0.261,95%可信区间为0.116~0.588,P<0.05);预后相关miRNA模型评分≥1.16分是胰腺癌患者预后的独立危险因素(风险比=1.608,95%可信区间为1.091~2.369,P<0.05)。(7)预后相关miRNA模型与第8版TNM分期预测效能的比较:在训练集中,预后相关miRNA模型对胰腺癌患者3、5年生存时间预测概率与第8版TNM分期比较,差异有统计学意义(Z=-1.671,-1.867,P<0.05)。预后相关miRNA模型与第8版TNM分期AUC分别为0.797、0.935与0.737、0.703,95%可信区间分别为0.622~0.972、0.828~1.042与0.571~0.904、0.456~0.951;C-index值分别为0.643与0.534。在测试集中,预后相关miRNA模型对胰腺癌患者3、5年生存时间预测概率与第8版TNM分期比较,差异有统计学意义(Z=-1.729,-1.923,P<0.05)。预后相关miRNA模型与第8版TNM分期AUC分别为0.750、0.873与0.721、0.703,95%可信区间分别为0.553~0.948、0.720~1.025与0.553~0.889、0.456~0.950;C-index值分别为0.642与0.544。结论基于5个与胰腺癌生存相关miRNA构建可用于胰腺癌患者生存预测的预后相关miRNA模型。该模型可与现有TNM分期系统及其他临床病理参数形成互补,为患者提供个体化、准确的生存时间预测,为临床治疗提供参考。     

480例全血细胞减少患者血片与骨髓象检查结果分析

目的了解全血细胞减少患者血片幼稚细胞检出与骨髓象分析情况。方法对480例全血细胞减少患者进行外周血涂片及骨髓象分析。结果480例全血细胞减少患者中，血片检出幼稚细胞98例（20．4％），其中急性白血病93例（94．9％），主要以急性非淋巴细胞性白血病（ANLL）-M2a、急性淋巴细胞性白血病（ALL）-L1、ANLL-M3a为主，其余5例（5．1％）为骨髓增生异常综合征（MDS）患者；未检出幼稚细胞者382例。骨髓检查主要以再生障碍性贫血（AA）为主，其次为缺铁性贫血（IDA）、巨幼红细胞性贫血（MA）、原发性血小板减少性紫癜（ITP）及脾功能亢进等疾病，其中急性白血病（AL）患者25例（6．5％），各急性白血病亚型数量多少差异无统计学意义，MDS患者47例（12．3％）。结论全血细胞减少患者外周血片幼稚细胞检出率主要与血液系统恶性疾病有关，患者宜早行骨髓象分析确诊。骨髓象分析是明确全血细胞减少病因的重要方法。     

三维适形放疗结合TACE在结直肠癌患者根治术后肝转移的临床应用

目的:探讨对于不宜或不能手术治疗的结直肠癌肝转移灶行TACE后根治性三维适形放射治疗的可行性,不良反应及疗效.方法: 对20例结直肠癌根治术后出现肝转移灶的病人,行TACE(ADM+碘油)后3周内,针对其肝转移灶行三维适形放疗,常规分割2Gy,总剂量60-66Gy.结果: 4例(20%)患者出现Ⅲ度恶心呕吐,3例(15%)出现Ⅲ度中性粒细胞减少,1例(5%)出现Ⅲ度血小板减少,4例(20%)出现Ⅲ度肝功能异常.治疗结束后,4例(20%)CR,11例(55%)PR,5例(25%)SD,无1例进展,有效率为75%. 结论: 对于结直肠癌根治术后出现不宜或不能手术的肝转移癌,应用三维适形放疗结合TACE的治疗模式,是可行的,无严重不良反应,近期疗效显著.     

自身免疫性肝炎患者血清 RF、ANA、ASMA及AMA检测与分析

目的分析自身免疫性肝炎(AIH)患者血清中类风湿因子(RF)与抗核抗体(ANA)、抗平滑肌抗体(ASMA)和抗线粒体抗体(AMA)的相互关系,为临床诊断AIH筛选和确立相应的实验辅助诊断指标.方法收集34例AIH患者血清,采用免疫浊度法检测血清中RF,间接免疫荧光法检测血清ANA、ASMA和AMA.结果患者血清RF的阳性率为67.6%(23/34),ANA、ASMA和AMA的阳性率分别为52.9%(18/34)、17.6%(6/34)和11.7%(4/34),3种自身抗体检出的总阳性率为58.8%(20/34).统计分析显示,RF阳性率与3种自身抗体检出的总阳性率之间无明显差异(P＞0.05).此外,20例自身抗体阳性血清均为RF阳性.进一步分析显示,血清RF含量与3种自身抗体阳性率之间具有密切相关性.结论 AIH患者血清中RF阳性率与其ANA、ASMA和AMA 3种自身抗体的阳性率密切相关,提示RF与ANA、ASMA和AMA均可作为实验诊断AIH的辅助参考指标.     

联合检测CEA、NSE和CYFRA21-1在肺癌诊断中的价值

目的探讨肿瘤标志物CEA、NSE和CYFRA21-1联合检测对肺癌的诊断价值。方法检测不同病理类型肺癌患者的血清中CEA、NSE和CYFRA21-1水平。结果肺癌组血清CEA、NSE和CYFRA21-1水平明显高于肺良性疾病患者(P0.05);CEA+NSE+CYFRA21-1诊断灵敏度明显高于单项肿瘤标志物(P0.05)。结论血清CEA、NSE和CYFRA21-1联合检测有助于肺癌临床诊断。     

乙型肝炎病毒基因变异与转氨酶和病毒复制量的关系探讨

目的探讨乙型肝炎病毒基因变异与转氨酶和HBV-DNA复制量的关系。方法采用PCR熔解曲线法检测474例慢性乙型肝炎病毒感染者的酪氨酸-蛋氨酸-天冬氨酸-天冬氨酸(Tyrosine-Methionine-Aspartic acid-Aspartie acid,YMDD)变异,对171例患者(YMDD变异株42例、YMDD野生株66例、YMDD阴性63例)测定ALT与AST并进行HBV-DNA荧光定量检测。结果474例中检出YMDD变异63例,阳性率为13.3%(63/474),其中单一变异株82.5%(52/63),双突变株4.8%(3/63),共生变异株12.7%(8/63)。171例患者中YMDD变异株、YMDD野生株和YM-DD阴性与ALT及AST的异常情况分别为45.2%、53.0%、19.0%及42.9%、43.9%、17.5%,其含量分别为(150.1±185.6)U/L、(121.1±89.0)U/L、(32.5±30.6)U/L及(95.1±127.8)U/L、(89.9±86.8)U/L、(28.9±22.4)U/L。171例中YMDD变异株、YMDD野生株和YMDD阴性与HBV-DNA拷贝数的对数值分别为(6.89±0.99)拷贝/ml、(7.34±1.19)拷贝/ml、(2.89±0.48)拷贝/ml。结论(1)门诊肝病患者YMDD变异株阳性率为13.3%(63/474)。(2)ALT与AST在YMDD变异株与YMDD野生株之间无统计学意义(P>0.05);YMDD变异株与YMDD阴性之间有统计学意义(P<0.05)。(3)HBV-DNA荧光定量YMDD变异株与YMDD野生株之间无统计学意义(t=1.15,P>0.05),YMDD变异株与YMDD阴性之间有统计学意义(t=12.76,P<0.001)。(4)PCR熔解曲线法测定YMDD变异株与ALT和AST及HBV-DNA荧光定量联合检测对慢性乙型肝炎患者的诊断,治疗有极其重要的价值。     

血浆同型半胱氨酸水平与心血管疾病相关性分析

目的：探讨应用循环酶法评价血浆同型半胱氨酸（HCY）水平与心血管疾病的关系。方法：应用日立71701A全自动生化分析仪（循环酶法）对82例冠心病患者和健康者进行血浆HCY浓度测定。结果：心血管疾病患者HCY浓度明显高于健康人,差异有统计学意义（P〈0.001）。结论：应用循环酶法测定血浆HCY时,高HCY是心血管疾病一个非常重要的独立危险因子。     

离子交换高效液相色谱法测定糖化血红蛋白的初步评价

目的 评价离子交换高效液相色谱法测定糖化血红蛋白(GHbA1C)的临床应用.方法 采用离子交换高效液相色谱法测定糖化血红蛋白.结果 参考范围在4.1%～6.1%,批间CV≤2.35%,批内CV≤0.81 %.结论 离子交换高效液相色谱法测定糖化血红蛋白(GHbA1C)的准确度高、精密度好、速度快,为临床医生调整糖尿病治疗方案提供了及时可靠的依据.     

急性胆囊炎腹腔镜胆囊切除术中转开腹危险因素分析

目的:探讨急性胆囊炎行腹腔镜胆囊切除术(laparoscopic cholecystectomy,LC)的危险因素。方法:回顾分析我科401例急性胆囊炎患者行LC的临床指标,并进行多因素分析。结果:391例成功完成LC,10例中转开腹。结论:急性胆囊炎LC失败的危险因素有上腹部手术史,白细胞、总胆红素、碱性磷酸酶增高,胆囊管结石嵌顿,发病超过72h。急性胆囊炎患者行LC的危险因素有助于外科医师在术前对患者进行全面评估,以提高LC的成功率,减少并发症的发生。