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百两金Ardisia crispa (Thunb.) A. DC.为传统苗药药材,在治疗咽喉痛、扁桃腺炎、肾炎水肿及跌打风湿等方面具有显著疗效。大叶百两金Ardisia crispa var. amplifolia和细柄百两金Ardisia crispa var. dielsii是百两金的变种,两者在物种进化关系及分类鉴定方面存在争议。本研究利用Illumina平台测序获取两者叶绿体全基因组序列,对其进行组装、注释和特征分析,采用生物信息学方法比较叶绿体基因组间的结构特征与变异程度,同时下载报春花科Primulaceae和紫金牛科Myrsinaceae植物叶绿体全基因组序列信息构建系统发育树解析其系统发育关系。结果表明大叶百两金和细柄百两金完整叶绿体基因组序列全长156 749 bp、156 748 bp,均注释到基因132个,其中蛋白质编码基因87个;密码子偏好性A/U大于G/C;基因组比较分析中两者在rps15和rpoB基因编码区存在差异,为两者分子鉴定提供新的位点;与同属物种相比较叶绿体基因组中ycf1、ycf2、rpoC1、ycf3、petD及rpl16等基因编码区存在差异,可... 相似文献
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