肠道病毒71型北京分离株全基因组序列分析

目的 了解2008年北京地区肠道病毒71型(EV71)分离株的全基因序列特点.方法 收集北京地区手足口病患儿的咽拭子样本12份,对其中1份样品08YM-3,经Vero细胞分离培养,提取病毒RNA.利用RT-PCR和5'、3'RACE扩增EV71全长基因.对PCR产物克隆和测序.利用DNAStar软件包的MegAlign进行核苷酸序列分析,构建系统进化树.结果 分离的EV71病毒株经过扩增后克隆得到3个涵盖EV71全基因组的阳性质粒,测序后拼接为EV71全基因组,命名为BJ08株.BJ08的5'非编码区(UTR)、P1、P2、P3、3'非编码区(UTR)和全基因组的核苷酸与C4亚型的参考序列同源性均最高,分别为95.6%～96.7%、88.3%～96.1%、78.1%～94.0%、90.8%～94.6%、85.9%～94.1%和90.9%～93.9%.BJ08株与其他亚型各区段的核酸同源性均低于90%.在全基因序列与VP1区构建的系统进化树中,BJ08株均与C4亚型在同一分支.BJ08株与C4亚型参考株VP1区的6个亚型相关氨基酸序列一致,VP1抗原性表位(92～107aa)无变异.结论 北京BJ08 EV71病毒分离株为C4业型.     

肠道病毒71型北京分离株全基因组序列分析

目的 了解2008年北京地区肠道病毒71型(EV71)分离株的全基因序列特点.方法 收集北京地区手足口病患儿的咽拭子样本12份,对其中1份样品08YM-3,经Vero细胞分离培养,提取病毒RNA.利用RT-PCR和5'、3'RACE扩增EV71全长基因.对PCR产物克隆和测序.利用DNAStar软件包的MegAlign进行核苷酸序列分析,构建系统进化树.结果 分离的EV71病毒株经过扩增后克隆得到3个涵盖EV71全基因组的阳性质粒,测序后拼接为EV71全基因组,命名为BJ08株.BJ08的5'非编码区(UTR)、P1、P2、P3、3'非编码区(UTR)和全基因组的核苷酸与C4亚型的参考序列同源性均最高,分别为95.6%～96.7%、88.3%～96.1%、78.1%～94.0%、90.8%～94.6%、85.9%～94.1%和90.9%～93.9%.BJ08株与其他亚型各区段的核酸同源性均低于90%.在全基因序列与VP1区构建的系统进化树中,BJ08株均与C4亚型在同一分支.BJ08株与C4亚型参考株VP1区的6个亚型相关氨基酸序列一致,VP1抗原性表位(92～107aa)无变异.结论 北京BJ08 EV71病毒分离株为C4业型.     

肠道病毒71型北京分离株全基因组序列分析

目的 了解2008年北京地区肠道病毒71型(EV71)分离株的全基因序列特点.方法 收集北京地区手足口病患儿的咽拭子样本12份,对其中1份样品08YM-3,经Vero细胞分离培养,提取病毒RNA.利用RT-PCR和5'、3'RACE扩增EV71全长基因.对PCR产物克隆和测序.利用DNAStar软件包的MegAlign进行核苷酸序列分析,构建系统进化树.结果 分离的EV71病毒株经过扩增后克隆得到3个涵盖EV71全基因组的阳性质粒,测序后拼接为EV71全基因组,命名为BJ08株.BJ08的5'非编码区(UTR)、P1、P2、P3、3'非编码区(UTR)和全基因组的核苷酸与C4亚型的参考序列同源性均最高,分别为95.6%～96.7%、88.3%～96.1%、78.1%～94.0%、90.8%～94.6%、85.9%～94.1%和90.9%～93.9%.BJ08株与其他亚型各区段的核酸同源性均低于90%.在全基因序列与VP1区构建的系统进化树中,BJ08株均与C4亚型在同一分支.BJ08株与C4亚型参考株VP1区的6个亚型相关氨基酸序列一致,VP1抗原性表位(92～107aa)无变异.结论 北京BJ08 EV71病毒分离株为C4业型.     

柯萨奇病毒B组3型疫苗研究进展

柯萨奇病毒B组3型（coxsackie virus B3,CVB3）属于小核糖核酸病毒科（picornaviridae）,肠道病毒属（enterovirus）,通常感染后会使人出现发热、打喷嚏、咳嗽等感冒症状,但也可导致新生儿、婴幼儿以及免疫缺陷的成人出现严重的心脏、胰腺及中枢神经系统症状[1]。根据美国疾病预防控制中心（CDC）统计数据发现,     

肠道病毒71型假病毒荧光定量检测方法在疫苗中和抗体检测中的应用

目的假病毒荧光定量方法（PVLA）应用于EV71疫苗动物样本和人体样本检测的适用性研究。方法分别采用细胞病变法（CPE）和PVLA方法检测82份EV71试验小鼠血清以及27份疫苗临床试验人体血清样本,比较两者检测的一致性。结果应用两种方法检测82份疫苗免疫小鼠血清,EV71中和抗体滴度的相关系数为0．842,Bland—Altman分析显示高度一致性;检测27份EV71临床试验人体血清样本的中和抗体,两种方法具有高度一致性。结论PVLA与CPE方法具有高度一致性,适用于疫苗免疫动物样本和临床评价人体样本EV71中和抗体的检测。     

新型肠道病毒71型(EV71)疫苗质量控制和评价标准的研究

目的 研究建立新型肠道病毒71型(EV71)疫苗质量控制标准和评价体系,为EV71疫苗研发提供基础.方法 根据创新型疫苗研发的要求,充分发挥技术优势,开展EV71疫苗质控标准、标准品和评价方法研究.结果与结论 建立EV71灭活疫苗的中和抗体和抗原定量测定标准品,统一不同企业疫苗的质控标准,规范疫苗的评价体系,为EV71疫苗的研发提供保障.     

幽门螺杆菌对甲硝唑耐药与rdxA基因分型及cagA基因的关系

目的: 研究幽门螺杆菌(Helicobacter pylori H. pylori)甲硝唑耐药菌株相关基因的突变与甲硝唑耐药性的关系。方法: 将贵阳医学院附属医院胃镜室分离H. pylori采用E-Test法对甲硝唑进行药敏试验后,PCR扩增rdxA、frxA、fdxB和cagA并对该基因进行测序。采用限制性内切酶片段长度多态性分型方法(RFLP)对rdxA基因进行分型。结果: 313株H. pylori对甲硝唑耐药率为87.2%。其与NCBI已登录的国际标准菌株H. pylori 26695相应基因序列比对,cagA基因阳性率为100%, cagA基因在某些位点存在共同突变,还存在大量其他位点的随机散在突变, rdxA基因除了存在4个位点共同突变外,还有其他位点的散在突变。rdxA基因可分为两型,Ⅰ型与Ⅱ型的比例为293:20,Ⅰ型耐药率为86.3%,Ⅱ型耐药率为100%。同时发现fdxB、frxA基因突变呈现出一定的规律性,具有碱基替换、插入和缺失3种类型的突变。结论: 我院幽门螺杆菌甲硝唑耐药率较高,rdxA基因以Ⅰ型为主,而rdxA基因Ⅱ型的H. pylori均产生甲硝唑耐药,与H. pylori甲硝唑耐药性密切相关。rdxA基因突变及cagA基因阳性是耐甲硝唑的主要原因。     

傣族治疗产后病的药用民族植物学研究

西双版纳傣族地区常年高温高湿,妇女产后病是傣医妇科类常见疾病。通过对西双版纳傣族妇女产后用药情况开展药用民族植物学调查研究,共调查到药用植物27种;植物选择上对生长在村寨附近的药用植物利用程度最高,在用药部位上体现了一定的空间层次性和时间特征;用药方式以水煎服为主,药物多配伍使用以达综合调节治病的目的。研究认为傣医治疗产后病具有适时应景、复杂多变的特点,应充分重视傣医药民族植物学研究工作。     

对31种乙型肝炎病毒表面抗原酶联免疫试剂盒的分析灵敏度评价

目的 评价乙型肝炎病毒表面抗原(HBsAg)酶联免疫(EIA)试剂盒的分析灵敏度.方法 对2007年6月至2008年6月申报批批检验的31种HBsAg EIA试剂盒,应用国家参考品进行检测,并用国家参考品中的灵敏度标准品,建立浓度和吸光度(A)值双对数曲线,将各试剂盒的Cut-off值代入曲线方程,计算其分析灵敏度,然后进行比较.结果 对27个国内厂家(351批)和4个国外厂家(27批)HBsAg EIA试剂盒进行分析,其中2个批次国产试剂盒的灵敏度低于国家要求的质量标准,总符合率为99.43%(349/351).国产试剂盒对adr、adw、ay血清型的分析灵敏度均值分别为0.307、0.419、0.513 ng/ml,差异有统计学意义(F=97.30,P<0.01);进口试剂盒的分析灵敏度均值分别为0.054、0.066、0.050 ng/ml,差异无统计学意义(F=0.65,P>0.05).进口试剂盒各血清型分析灵敏度均高于国产试剂盒(P<0.01).部分国产试剂盒与进口试剂盒对相同血清型的分析灵敏度差异有统计学意义.同一厂家试剂盒加酶后孵育30min和60min,其血清型分析灵敏度差异无统计学意义(P>0.05);同一厂家生产的试剂盒显色10 min和15 min,其血清型分析灵敏度的差异有统计学意义(P<0.01).结论 国产试剂盒应提高分析灵敏度,特别是对adw和ay血清型.     

EV71疫苗诱导小鼠CD4~+ T细胞受体Vβ17基因家族克隆化改变

目的分析EV71疫苗诱导BALB/c小鼠CD4+TCR Vβ基因家族克隆化改变,探讨EV71疫苗免疫机制。方法采用TCR克隆化检测试剂盒和基因扫描技术对EV71疫苗诱导的BALB/c小鼠CD4+TCRVβ基因家族克隆化进行分析,并结合ELISPOT方法、Luminex技术和体外微量中和试验研究EV71疫苗诱导的细胞免疫和体液免疫应答情况,探讨EV71疫苗免疫机制。结果通过对小鼠CD4+TCR Vβ1-20克隆化检测,发现免疫组的Vβ17基因家族出现单克隆或寡克隆改变,对照组Vβ17为多克隆化,未见克隆化改变。免疫组小鼠脾MNC(去除CD8+)IFN-γ和IL-6的分泌水平较对照组显著增高(P均<0.01),血清EV71中和抗体应答均为阳性。进一步测序发现,免疫组Vβ17的CDR3区氨基酸序列为TASQNTLY。结论成功筛选出EV71疫苗诱导BALB/c小鼠CD4+TCR特异性改变的Vβ基因家族为Vβ17,与MHC-EV71抗原肽特异性结合的CDR3区氨基酸序列为TASQNTLY。