监测活系统生化代谢的新方法 核磁共振

核磁共振(NMR)技术用于研究生命体系,特别是对生物大分子物质的研究已获得了很大的进展。近来,这一技术又被推广应用于研究活细胞、组织和器官的代谢;甚至用来直接研究动物体内某一局部组织的代谢,而无须任何损伤性手段的辅助。NMR 技术所以能如此广泛地应用于研究生命系统中的含     

22-17 绿色组链球菌口咽分离菌的氟喹诺酮耐药性与作用靶的变异和活性外排泵有关

绿色组链球菌与2类重要的感染性疾病有关,即 中性粒细胞减少症患者的菌血症和心内膜炎.革兰氏 阳性菌,特别是肺炎链球菌和绿色组链球菌的氟喹诺 酮耐药性与喹诺酮类药物的2个作用靶(拓扑异构酶 Ⅳ和DNA促旋酶)的变异有关. 绿色组链球菌临床分离株来自以下3组人员的 口咽标本:(1)30名接受氟喹诺酮类药物(环丙沙星, 氧氟沙星,培氟沙星)治疗平均12±3d的住院患者; (2)30名接受非氟喹诺酮类药物治疗至少5个月的 同期住院患者;(3)30名未接受治疗未住院的健康对 照.在包含3mg/L环丙沙星的琼脂平板上,从20分 口咽标本中分离出20株环丙沙星MIC≥4mg/L的 绿色组链球菌菌株,与相应的参考菌株相比,认为这 些菌株对氟喹诺酮类药物敏感性减弱,其中绝大多数 来自住院患者,而从30名健康对照的口炎标本中仅 分离出3株氟喹诺酮耐药性绿色组链球菌.参考菌株 有:缓症链球菌(S.mitis,SM)103335,口腔链球菌 (S.oralis,SO)102922,血链球菌(S.sanguis,SS) 55128.诺氟沙星、环丙沙星和司帕沙星对菌株SMB8 ～SMB14的MIC增至对参考菌株SM103335的2～ 32倍;对菌株SOB3～SOB14的MIC增至对参考菌 株SO102922的2～128倍;对菌株SSB1、SSB2的 MIC增至对参考菌株SS55128的8倍. 在氟喹诺酮耐药性缓症链球菌中,仅有SMB13 和SMB14在拓扑异构酶Ⅳ的C、E亚基(ParC,ParE) 或DNA促旋酶A亚基(GyrA)的喹诺酮耐药决定区 存在氨基酸取代,SMB13的ParC第79位Ser→Ile; SMB14的ParC无氨基酸取代,GyrA的第81位Ser →Phe,ParE的474位Glu→Lys,二者都与MIC的增 加有关.对缓症链球菌,当存在利血平时,诺氟沙星或 环丙沙星的MIC减至原来的1/4,认为存在外排泵表 型.在参考菌株SMB103335和菌株SMB9、SMB13、 SMB14中都观察到外排泵表型,该表型可以单独表 达(SMB103335,SMB9),也可以与拓扑异构酶Ⅳ、 DNA促旋酶的变异同时存在(SMB13,SMB14). 对口腔链球菌,当存在利血平时,诺氟沙星或环 丙沙星的MIC减至原来的1/4～1/16,认为存在外排 泵表型.12株口腔链球菌中,10株(包括典型菌株 SO102922)具有外排泵表型,特别是SOB5其喹诺酮 耐药决定区无氨基酸取代发生,在存在利血平时, MIC可降至典型菌株SO102922的水平.ParC的氨 基酸取代(79或83位)导致口腔链球菌对氟喹诺酮 类药物敏感性降低(SOB6～SOB9,SOB14);ParC和 GyrA(81或85位)同时发生氨基酸取代导致产生高 水平氟喹诺酮(尤其是司帕沙星)耐药性. 血链球菌SSB1在ParC的第83位Asp→Tyr; 而SSB2在ParC和GyrA的喹诺酮耐药决定区无氨 基酸取代,但存在显著的外排泵表型,在利血平存在谮 时,环丙沙星和诺氟沙星的MIC分别降至原来的1/8 和1/16. 用来自表达高水平外排泵耐药性的缓症链球菌 (SMB9)和口腔链球菌(SOB5)的DNA转化肺炎链 球菌R6,结果肺炎链球菌R6转化子获得外排泵表 型,在利血平存在时,肺炎链球菌R6转化子外排泵介 导的耐药水平可降至野生菌株R6的水平,表明外排 泵表型可以在种间传递. Guerin F, et al. Antimicrob Agents Chemoth er,2000,44(8):2197(英文)     

TTN突变相关基因特征对肝细胞肝癌预后的预测价值

目的:寻找新的有效生物标志物用于肝细胞肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的早期诊断和预后预测。方法:从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)下载HCC样本的转录组和临床数据,利用TCGA队列的mRNA丰度数据和TTN突变信息,根据野生型TTN和突变型TTN HCC患者之间的基因表达差异,表征特定的TTN突变相关特征。生存分析筛选与HCC患者预后相关的基因,单因素Cox回归构建预后风险模型。通过GO注释、途径富集分析、京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)和基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)确定与HCC患者预后相关的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)的功能。结果:通过单变量Cox回归和Kaplan-Meier生存分析确定的5个基因,腹前同源盒1(ventral anterior homeobox 1,VAX1)、基质金属蛋白酶3(matrix metalloproteinase 3,MMP3)、CXC型趋化因子5（CXC-type chemokine 5,CXCL5)、转酮醇酶样蛋白1(transketolase-like protein 1,TKTL1)和电压门控钾通道Kv1.3(voltage-gated potassium channel Kv1.3,KCNA3)构成了HCC患者总生存(overall survival,OS)预后基因特征。结论:5个TTN突变相关基因,包括VAX1、MMP3、CXCL5、TKTL1和KCNA3,可作为HCC患者生存和预后的潜在生物标志物和治疗靶点。     

中医病机语义关系特征研究

纵观医学领域语言系统和术语集的研究现状,介绍了当今医学界最先进的语义关系的组成和特点。比较中医病机与西医病理概念描述的差异,分析现有中医语义关系的局限性,研究、评估现有医学语义关系的重用性。从国家标准《中医临床诊疗术语疾病部分》抽取中医病机语义关系,并进行深入研究,为语义关系进一步形式化并编码提供理论支持。     

初议中医学是复杂性科学--中医标准化预备研究之二

在界定复杂性科学的基础上 ,论证了中医学是复杂性科学 ,并进一步介绍复杂性科学研究。主张在复杂性科学意义下来探讨、认识和部署中医学的发展问题