宁波市镇海区2008-2011年手足口病的时空聚集性分析

目的 探讨宁波市镇海区近几年来手足口病的时空分布特点.方法 采用SaTScan软件中的时空扫描统计量对镇海区2008-2011年手足口病的报告数据(n=1 095)进行时空聚集性分析.结果 时空扫描统计量探测出了两个可能的手足口病发病聚集区域:九龙湖镇、澥浦镇和骆驼街道区域在2011年5月至2011年11月期间手足口病的发病具有聚集性[P=0.001,相对风险(RR)=7.02];庄市街道和蛟川街道区域在2011年3月至2011年7月期间手足口病的发病具有聚集性(P =0.001,RR=6.45).结论 时空聚集性分析作为评价传染病聚集性的一种有效方法,可以对传染病的聚集性同时进行时间和空间两个维度上的分析,可为疾控部门提供预防和控制传染病暴发的相关信息,为手足口病的防治工作提供依据.     

提高克拉维酸发酵产量研究进展

克拉维酸是目前发现的最优秀的β－内酰胺酶抑制剂,其与β－内酰胺类抗生素组成的复合制剂,被广泛用于对抗产β－内酰胺酶耐药菌的感染。国内、外对如何提高克拉维酸的发酵水平一直在不断的探索,本文从产生菌的改良、培养基的优化及发酵工艺的改进等方面主要对国内外近5年来发表的有关提高克拉维酸发酵产量的文献进行了综述。     

应用信息论方法分析蛋白质中共进化残基

在蛋白质分子进化过程中,一些功能上十分重要的残基一旦变异,将引起蛋白质功能丧失,因而在源于不同物种的同源蛋白质中表现为高度的保守性。然而突变研究表明,蛋白质中一些非保守残基也可能是重要的功能残基,它们的变异可能为蛋白质序列中另一或另一些残基变异所补偿,从而维持了蛋白质结构和功能的稳定性。该文基于信息论中的互信息算法,对脯氨酰寡肽酶家族中的脯氨酰寡肽酶(Prolyl Oligopeptide)及其的酶活性区的多序列比对结果进行了共进化分析,分别使用MI、MI/H、R及R/H四种度量方式,并考察了不同截取值对于结果的影响。结果表明互信息的算法对于分析蛋白质的酶活性区域比分析整条蛋白质序列更为有效;在相同截取的情况下,R值可以更好地选择共进化残基,在不同的截取情况下,提高截取值可以提高MI及MI/H参数分析的精确度。     

抗栓肽基因的克隆和表达

抗栓肽(Decorsin)是糖蛋白Ⅱb-Ⅲa(GPⅡb-Ⅲa)的强拮抗剂,能抑制血小板聚集。实验通过设计两对引物,经PCR获得抗栓肽的结构基因,并将基因插入原核表达载体pET32a硫氧还蛋白(TrxA)的下游。将重组质粒转化至大肠杆菌BL21(DE3),进行诱导表达,表达产物以可溶形式存在于胞内,占菌体总蛋白的35%。利用表达载体自身所带的His×6纯化标签,可将融合蛋白通过金属螯合亲和层析柱一步纯化,纯化的蛋白质经SDS-PAGE分析达到电泳纯。体外的抑制血小板聚集实验结果表明,融合蛋白具有显著的抑制ADP诱导的血小板聚集活性,抑制常数IC50为500 nmol/L。     

NDM-1型金属-β-内酰胺酶及其抑制剂研究进展

金属β-内酰胺酶(MBLs)尤其是NDM-1型金属酶介导的细菌耐药性在全球范围内不断扩散,给人类健康带来日益严重的威胁。虽然使用抑制剂阻止酶的水解作用是临床上应对产β-内酰胺酶耐药菌的重要手段,并已成功上市了奥格门汀等药物,但临床所用抑制剂仅对丝氨酸β-内酰胺酶有效,对MBLs尤其是NDM-1没有效果。本综述概述了近年来NDM-1抑制剂的研究进展,介绍了MBLs抑制剂筛选新方法,以期为研究者们提供新的思路,更有效地设计或筛选出活性较好的MBLs抑制剂。     

PAMAM树状大分子与加替沙星相互作用的分子模拟研究

由于其它实验手段各自的局限性,为了解释PAMAM和加替沙星相互作用的机制,在生理条件下,对聚酰胺-胺树状大分子(PAMAM)、加替沙星及其复合物进行了计算机分子模拟研究。通过分子动力学模拟发现:PAMAM与加替沙星相互作用主要以非键作用力为主,其中又以静电力为主要作用力,并且PAMAM对加替沙星无手性识别作用。G2.0～G4.0复合物随着代数的增加,键角弯折能逐步增大,洞内对接值为:165.898<223.442<298.619;洞外对接值为:166.141<206.183<300.666,表明PAMAM外部枝折回增加,有利于形成内部包裹。PAMAM空腔内与加替沙星相互成键,可形成O-H,N-H,F-H等键。随着势能的降低,N代的PAMAM包裹加替沙星呈现出比N-1代PAMAM更稳定的趋势。在分子水平上解释了PAMAM和加替沙星相互作用的机制。     

抗癌新药9—Nitrocamptothecin

由美国Stehlin癌症研究基金会研制,SuperGen和Abbott公司获得转让许可的抗癌新药喜树碱的9-硝基取代物--9-Nitrocamptothecin(商品名为Camptogen,曾用代号9-NC)已完成了研发阶段的Ⅲ期临床实验.     

计算机辅助蔗糖酶结构模拟及其与阿拉伯糖相互作用研究

与阿卡波糖对α-葡萄糖苷酶的竞争性抑制类型不同,L-阿拉伯糖对蔗糖酶的抑制类型为反竞争性抑制,但由于人蔗糖酶结构尚未被实验测定,其抑制的分子机理尚未阐明。文章使用计算机辅助同源模建的方法,以人麦芽糖酶-葡糖淀粉酶(Maltase-glucoamylase)碳端亚基的三级结构为模版,模建了人肠道蔗糖酶的结构,并使用分子对接的方法,将L-阿拉伯糖对接到蔗糖酶的活性中心,建立了蔗糖-阿拉伯糖-蔗糖酶三元复合物的结构模型。模拟了两种可能的三元复合物结构,通过计算结合自由能,推断可能的复合物为酶-抑制剂-底物(E-I-S)类型。当底物蔗糖存在时,阿拉伯糖与蔗糖酶的亲和力增加,从而表现出反竞争抑制效果,。该模型可为深入研究其反竞争性抑制的分子机理提供帮助。     

免疫球蛋白结合结构域的研究进展

Z结构域,又叫免疫球蛋白结合结构域,是由金黄色葡萄球菌蛋白A(Staphylococal Protein A,SPA)中B结构域改构而成。SPA是从金黄色葡萄球菌的细胞壁中发现的能与多种哺乳动物的抗体相结合的天然蛋白,组成SPA的5个结构域中,以B结构域的抗体结合力及稳定性占绝对优势。将B结构域28～29位敏感性残基Asn-Gly定向诱变成为Asn-Ala后,得到的结构域被称为Z结构域,其稳定性更高,可耐受羟铵和溴化氢的处理。首尾相连的两个Z结构域,被命名为ZZ结构域,具有与SPA相类似的抗体结合容量以及更高的稳定性,可以耐受工业纯化中苛刻的环境。ZZ结构域以其独特的反3α螺旋结构、以及特有的抗体结合能力已广泛应用于外源蛋白的可溶表达及免疫检测、抗体纯化等领域。该文将对ZZ与抗体结合的机制研究以及它在各领域的应用研究进行综述。