南京市2006年～2009年流行性感冒的病原学检测分析

目的：对南京市4家医院就诊的流感样病例标本进行病原学检测,分析其病原学特点,为其流行病学研究提供资料,为流感防控提供病原学依据。方法：采用MDCK细胞分离流感病毒,用血凝抑制试验对病毒株进行分型鉴定,对2006年3月～2009年2月南京4家哨点医院就诊的流感样病例的2 447份鼻咽拭子标本进行检测,并结合感染人群人口学信息进行病原感染谱及亚型特点分析。结果：经国家流感中心复核共有阳性毒株313株,三个年度分别以甲3、甲1和甲3为主。全年有两个感染峰,分布于春季和夏季。3年中感染人群中5岁以下儿童感染率基本一致,均稍高于10%;60岁以上人群感染率呈递增趋势（12%,17%,24%）;其他人群（5～岁,15～岁,25～60岁）则无明显差异。男性感染率（54.7%）显著高于女性（45.3%）（P〈0.05）。结论：2006年～2009年南京市连续3年以甲型流感病毒为主,且60岁以上人群感染率呈递增趋势,故应加强此人群的预防接种,以提高免疫能力。     

苏州地区宫颈病患者HPV感染亚型分析

目的：探讨HPV亚型在苏州地区宫颈疾病谱中分布特点。方法：运用DNA杂交技术对2005例宫颈病患者进行HPV基因分型检测。结果：宫颈病患者HPV感染率为58.2%,复合感染率21.6%。HPV感染率,慢性宫颈炎患者为19.3%,CNⅠ患者为56.8%,CNⅡ患者为82.2%,CNⅢ患者为90.5%,宫颈癌患者为100%。21种HPV亚型全部检出,其中HPV16、52、58、33和18型最为常见的,分别占26.5%、25.0%、16.4%、12.3%和11.1%。结论：苏州地区宫颈疾病中HPV16型是最常见高危亚型。不同程度宫颈病变中感染的HPV亚型差异可能反映疾病的转归,提示临床医师应密切关注宫颈疾病患者HPV高危亚型特别是HPV16的携带情况。     

抗流感病毒天然化合物体外筛选模型的建立及应用

目的建立抗流感病毒天然化合物体外筛选模型。方法以扎那米韦为阳性药物,运用酶联免疫吸附实验(ELISA)和三磷酸腺苷荧光检测(ATPlite)技术,建立基于细胞培养的天然化合物抗流感病毒体外筛选模型,测定205种天然化合物的细胞毒性及其抗流感病毒活性。结果成功构建抗流感病毒天然化合物细胞体外筛选模型,以扎那米韦验证,流感病毒被有效抑制,对A型流感病毒的IC50为0.002 8μmol/L,对B型流感病毒的IC50为0.057μmol/L。205种天然提取化合物中,有143种无显著细胞毒性,应用体外模型筛选,未检出有抗流感活性的化合物。结论成功建立基于ELISA法和ATP荧光法的体外抗流感天然化合物细胞筛选模型,可用于抗流感药物大规模筛选。     

江苏省输入性登革热1例病毒分离鉴定及分子特征分析

目的:从江苏省2012年4月1例菲律宾输入的疑似登革热患者急性期血清中分离病毒并分析其分子生物学特征,以找出病原学证据?方法:收集患者血清样本,采用胶体金法检测登革病毒的IgM?IgG抗体;用C6/36细胞分离病毒,对细胞病变的标本进行RT-PCR及荧光定量PCR检测登革病毒RNA和鉴定型别;采用高通量测序技术对该分离株进行编码区基因测序,用MEGA6.0软件对其进行序列比对和进化分析?结果:从患者血清样本中检测到登革病毒的IgM抗体,分离到的毒株经鉴定为登革病毒1型,与美国HawO3663毒株的核苷酸同源性>98%?结论:该病例是由登革病毒1型引起的输入性病例?     

江苏省2009年手足口病流行特征的聚类分析

目的：描述和分析江苏省2009年手足口病的流行特征。方法：利用＂中国疾病预防控制信息系统＂数据库,统计2009年江苏省手足口病各月发病数,不同年龄组及不同地区发病率,根据《江苏统计年鉴—2009》所提供的影响手足口病发病的社会经济因素相关资料,采用系统聚类方法分别对其进行统计分析。结果：江苏省2009年手足口病不同月份的发病数、15岁以下年龄组的发病率、不同地区的发病率及社会经济影响均聚集成3类。结论：江苏省手足口病流行具有明显的季节性、人群性以及地区性;聚类分析可以作为判定手足口病流行特征的一种统计方法。     

江苏省2019—2022年乙型流感病毒Victoria系HA基因特征分析

目的分析江苏省2019—2022年乙型流感病毒Victoria系流行特征, 了解其基因变异情况, 监测江苏省流感活动水平和流行趋势。方法通过"中国流感监测信息系统"收集的江苏省2019—2022年流感样病例监测数据, 选取16株乙型流感病毒Victoria系毒株进行全基因组测序, 利用MEGA 7软件构建进化树并进行HA基因序列特征分析。结果江苏省2019—2022年监测到的流感病毒中乙型流感病毒Victoria系占绝对优势。16株标本株中2019—2020年度的毒株在V1A.3早期分支, 而2021—2022年度的毒株则聚类在3a.2亚型分支。与疫苗株相比, 2019—2020及2020—2021年度的毒株发生了1个氨基酸位点的改变并增加了1个糖基化位点, 而2021—2022年度的毒株则存在多个位点变异, 其中H122Q、A127T、R133G、P144L、N150K、S194D及K200R位于抗原决定簇上。结论江苏省乙型流感病毒Victoria系在多处基因位点发生了变异, 提示对该亚型变异的持续监测至关重要, 可为疫苗的更新提供重要依据。     

基于GroEL基因的实时荧光定量PCR检测恙虫病东方体方法的建立及评价

目的 建立一种敏感、特异的实时荧光定量PCR方法,用于检测临床标本中的恙虫病东方体。方法 根据恙虫病东方体GroEL蛋白基因序列设计引物和探针,建立实时荧光定量PCR检测方法。并从灵敏度、特异度、重复性及临床标本的检测能力等方面对本方法进行综合评价。结果 建立的实时荧光定量PCR方法具有良好的特异性,可检测出恙虫病东方体Gilliam、Karp、Kato和Kawasaki株。建立的标准曲线循环阈值(Ct)与模板拷贝数呈现良好的线性关系(r=0.99),灵敏度分析显示样品最低检出浓度为21.8拷贝/μL。批内及批间重复性实验变异系数均小于1.5%,显示本方法具有良好的重复性。对本实验室保存的82份临床标本进行检测,并与常规巢式PCR方法比较,本方法检测出26份阳性标本中的25份,检出率为96.15%。结论 本研究建立的实时荧光定量PCR方法具有较高的敏感性、特异性和稳定性,可用于临床病人及暴发疫情的实验室快速检测。     

江苏省一起急性胃肠炎爆发的疫情调查

调查和分析一起发生在江苏省常州市某小学急性胃肠炎爆发疫情,明确流行病学特征和基因型特征。方法根据统一设计的流行病学调查表,对病例和对照的饮食、饮水和卫生习惯等情况开展病例对照研究。对病例的排毒情况进行跟踪调查,明确排毒期长短。采集病例和对照的标本,进行荧光定量PCR方法检测,对部分阳性结果标本进行测序以明确基因型。结果11月22日起出现首例病例,11月22日至12月2日为主要发病阶段。此期共发病269例,其中学生发病264例,罹患率17.4%,教师发病5例,罹患率4.4%,两者存在统计学差异(χ2=13,P＜0.01);排毒期调查结果显示,本起暴发疫情最短排毒期为发病后3 d,最长为14 d,中位时间为7 d。共采集172份标本,其中82份检测结果为诺如病毒GII型阳性,未检测到轮状病毒及腺病毒,18份诺如病毒GII型阳性标本测序分析显示均为GII.12基因型。结论结合病例临床特征、流行病学调查及实验室检测结果综合分析,判定本起疫情为诺如病毒GII.12型感染导致的急性胃肠炎爆发疫情,该型别在我省尚为首次发现。爆发原因可能为呕吐物 口引起的大范围传播。     

江苏省2009～2011年流感监测和流行特征分析

目的 监测江苏省2009～2011年间流感病例,掌握季节性流感优势毒株的变化及流行特征,为流感防制提供科学依据.方法 搜集2009年1月～2011年12月间14家流感监测网络实验室所接受的流感样病例(Influenza-like Ill-ness,ILI)监测信息,如病例信息、病毒核酸分离和检测,并对数据进行统计分析.结果 共受理标本69 774例,核酸阳性标本约占19.7％;不同性别ILI的核酸检出阳性率没有统计学差异,不同年龄组、实验室和月份组ILI的阳性检出率存在统计学差异:10～30岁年龄组ILI的阳性检出率相对较高,常州市疾控中心的ILI检出率相对较高,9月份至第二年4月份间为阳性率高峰期.季节性H3N2、新甲型H1N1和B型的顺序交替成为江苏省2009年6月～2011年6月间的优势毒株,B型流感成为2011年4月后唯一的流行毒株.结论 在流感病毒检出率较高的年龄组、地区和月份,如10～30岁等,应加强流感的预防控制;在季节性H3N2、新甲型H1N1和B型流感的流行季节制定疫苗接种等有效措施,以减少流感流行造成的疾病负担.     

高通量测序H7N9禽流感病毒基因组模板制备方法的优化及应用

目的:建立一种较优的高通量测序H7N9禽流感病毒基因组模板制备方法,用于H7N9禽流感病毒基因组监测?方法:分别以6碱基随机引物反转录生成单链cDNA,合成双链cDNA;流感病毒通用反转录引物U12反转录生成单链cDNA,6碱基随机引物合成双链cDNA;U12引物反转录生成单链cDNA,通用流感病毒全基因扩增引物混合物生成双链cDNA制备高通量测序模板?构建测序文库?测序并分析数据,比较3种方法对高通量测序效率的影响,并与传统Sanger测序方法比较其测序的准确性,选择其中较优的方法用于高通量测序?结果:以U12引物反转录cDNA,通用流感病毒全基因扩增引物混合物生成双链cDNA制备的高通量测序模板,在测序族生成数?覆盖率?单核苷酸多态性及读长等方面均优于另外两种方法?结论:本研究建立的H7N9禽流感病毒基因组模板制备方法用于高通量测序具有准确性高,周期短,成本相对较低,可同时检测多个样本等特点,可用于大规模H7N9禽流感病毒基因组监测?