人感染高致病性H5N6禽流感病毒表面糖蛋白分子进化特征

目的  对19例人感染高致病性H5N6禽流感病毒的血凝素(hemagglutinin, HA)和神经氨酸酶(neuraminidase, NA)蛋白进行分子进化分析。 方法  运用下一代测序平台对病毒分离物进行全基因组测序, 从美国国家生物技术信息中心(national center for biotechnology information, NCBI)和全球流感序列数据库(global initiative on sharing avian influenza data, GISAID)下载参考序列, 利用Blasts、Mega 6.1及Clustal X 2.1等软件进行序列分析。 结果  2014-2018年中国共发生23例人感染H5N6禽流感病毒病例。对19个病例的H5N6病毒的HA和NA基因进行进化分析。HA进化分析显示病毒都属于Clade 2.3.4.4, 其中涉及17个病例的病毒属于Group C; 首例H5N6病例毒株(A/Sichuan/26221/2014)属于Group D; 福建一个病例(A/Fujian-Sanyuan/21099/2017)属于Group B。所有19个病例的病毒HA蛋白的裂解位点含有多个碱性氨基酸。所有病毒的HA蛋白的受体结合位点226~228位氨基酸是QS(R)G(氨基酸排序以H3-HA为准), 理论上对禽类受体α2-3半乳糖苷唾液酸(SAα2-3Gal)有嗜性。18病例病毒的HA蛋白发生了T160A的突变, 导致在158N位点失去糖基化。除了A/Sichuan/26221/2014外, 18个病例的病毒NA蛋白在58~68位缺失了10个氨基酸。9个病例的病毒PB2蛋白发生E627K突变。 结论  2014-2018年间中国人感染H5N6病毒进化活跃, 具有明显的基因多样性, 需要加强对病毒分子进化的监测。     

流感及H5N1亚型禽流感病毒液相检测芯片的制备

目的 建立利用液相芯片技术检测甲、乙型流感和H5N1亚型高致病性禽流感病毒的方法,并对该方法进行评价。方法 对GenBank中甲型流感病毒的NP、乙型流感病毒的HA以及高致病性禽流感病毒（H5N1）的H5、N1基因片段序列进行同源性比对,根据保守序列,设计针对各基因的简并引物和寡核苷酸探针,制备探针偶联微球,将样本核酸多重PCR扩增产物与微球进行杂交,以Bio-Plex液相芯片检测系统进行芯片检测。结果 该方法可以对甲型流感病毒的NP基因、乙型流感病毒的HA基因以及高致病性禽流感病毒（H5N1）的H5、N1基因同时进行检测,病毒核酸的最低检出量为1pg,检测特异性高。结论 成功构建了甲、乙型流感病毒和H5N1亚型高致病性禽流感病毒液相芯片检测系统,为流感、禽流感的快速检测、诊断奠定了基础。     

H7N9禽流感病毒的生物学特征及进化趋势

新出现H7N9亚型禽流感病毒对人类健康和公共卫生造成严重的威胁。本文就H7N9禽流感病毒的起源、分子特征、传播力和致病性等研究进展进行评述,并对病毒未来进化趋势作了分析。     

江苏省2009年3岁以上自然人群新甲型H1N1流感血清流行病学调查

目的 了解江苏省2009年3岁以上自然人群新甲型H1N1流感抗体水平及流行趋势.方法 利用微量半加敏血凝抑制(HI)方法检测江苏省不同时间(2008年11月和2009年7、8、11月)人群新甲型H1N1流感抗体,比较不同时间、人群及地区的新甲型H1N1流感保护性抗体阳性率和抗体几何平均滴度(GMTs).结果 在新甲型H1N1流感输入江苏地区后第一个流行季节内,2009年7、8、11月人群HI保护性抗体阳性率依次为3.46%、7.59%和16.94%,表现出随时间推移而呈总体增长趋势(P=0.000),不同时间点的性别间保护性抗体阳性率的差异无统计学意义(P＞0.05);除2009年11月外,不同性别间的抗体GMT差异均无统计学意义.同一时间点不同年龄组间、同一年龄组的不同时间点间,HI保护性抗体阳性率、抗体GMT水平比较的差异均有统计学意义(P＜0.05).HI保护性抗体阳性率和抗体GMT存在地区差异(P＜0.05).结论 在2009年8月后江苏地区12～17岁人群成为新甲型H1N1流感暴发的主要人群,至2009年11月该人群总体新甲型H1N1流感保护性抗体阳性率仍较低,该病在全省的流行仍将持续一段时间.     

猪流感病毒流行特点及其新型甲型HIN1流感病毒的基因来源分析

猪流感（Swine influenza,SI）是由A型流感病毒引起的一种猪的急性呼吸道传染病。虽然也从猪体内分离到了C型流感病毒,但感染猪的主要还是A型流感病毒。日前该病呈世界分布,但主要以地方性流行为主。世界各地流行的猪流感病毒（Swine influenza virus,SIV）包括三种主要的亚型：H1N1,H3N2和H1N2亚型,其中又包括不同的基因型：古典猪H1N1,类禽H1N1,类人H3N2,基因重配的H3N2以及多基因型的H1N2亚型^[1,2,3]。猪流感病毒对养猪业和人类公共卫生都有重大影响．     

江苏省手足口病病原学流行特征分析

手足口病(hand-foot-mouth disease,HFMD)是由多种肠道病毒引起的常见传染病,以婴幼儿发病为主.引起手足口病的肠道病毒包括肠道病毒71型(enterovirus type 71,EV71)和A组柯萨奇病毒(Coxsackie A,CoxA)、埃可病毒的某些血清型[1].     

2013年3月江苏省禽流感职业暴露人群H5N1抗体水平及影响因素分析

目的:调查H7N9流行初始江苏省职业暴露人群H5N1禽流感抗体水平及其影响因素?方法:分别使用香港株?广东株与安徽株抗原,用血清凝集抑制法(hemagglutination inhibition,HI)测定血清样本抗体滴度,计算几何平均滴度(geometric mean titer,GMT),统计分析影响抗体水平的因素?结果:检测职业暴露人群血清标本416份,性别与抗原株对职业暴露人群抗体滴度有显著影响?结论:江苏省职业暴露人群H5N1禽流感抗体滴度普遍较低?男性抗体滴度低于女性,广东株抗原与禽流感病毒现有流行株较为接近?     

江苏省2009年甲型HIN1流感流行病学及病原学特征分析

目的：探讨2009年度江苏省甲型H1N1流感流行特点及其病原遗传学特征。方法：对2009年6月12日～10月15日在“甲型H1N1流感监测系统”中报告确诊的1888例病人信息进行描述性分析,并对3例输入性病例分离的病毒进行全基因组序列分析。结果：甲型H1N1流感输入后疫情呈现上升趋势,36周达到高峰,随后疫情有所下降;苏南、苏中、苏北地区的确诊病例数占总病例数的构成比分别为48．18％、29．45％、22．14％,全省甲型H1N1流感病例主要集中于学生和青壮年人群。3例输入性病例分离毒株的8个基因片段核苷酸序列同源性高达99％～100％。与参考株相比,分离株A／Naming／1／2009HA蛋白突变的5个氨基酸中有一个位于Ca抗原位点208位氨基酸（R—K）。分离株同时具有人、禽和猪流感病毒的分子特点,不具备高致病性禽流感病毒的分子基础。结论：江苏省甲型H1N1流感输入后疫情发展存在地区差异,学生和青壮年人群是主要的发病群体;随着病毒在人群中的进一步适应和持续存在,除了抗原漂移外,病毒的某些分子特征也可能发生变化,应特别关注这些变化对病毒的传播力和致病性的影响。     

江苏省2009～2011年流感监测和流行特征分析

目的 监测江苏省2009～2011年间流感病例,掌握季节性流感优势毒株的变化及流行特征,为流感防制提供科学依据.方法 搜集2009年1月～2011年12月间14家流感监测网络实验室所接受的流感样病例(Influenza-like Ill-ness,ILI)监测信息,如病例信息、病毒核酸分离和检测,并对数据进行统计分析.结果 共受理标本69 774例,核酸阳性标本约占19.7％;不同性别ILI的核酸检出阳性率没有统计学差异,不同年龄组、实验室和月份组ILI的阳性检出率存在统计学差异:10～30岁年龄组ILI的阳性检出率相对较高,常州市疾控中心的ILI检出率相对较高,9月份至第二年4月份间为阳性率高峰期.季节性H3N2、新甲型H1N1和B型的顺序交替成为江苏省2009年6月～2011年6月间的优势毒株,B型流感成为2011年4月后唯一的流行毒株.结论 在流感病毒检出率较高的年龄组、地区和月份,如10～30岁等,应加强流感的预防控制;在季节性H3N2、新甲型H1N1和B型流感的流行季节制定疫苗接种等有效措施,以减少流感流行造成的疾病负担.     

江苏省2009年手足口病流行特征的聚类分析

目的：描述和分析江苏省2009年手足口病的流行特征。方法：利用＂中国疾病预防控制信息系统＂数据库,统计2009年江苏省手足口病各月发病数,不同年龄组及不同地区发病率,根据《江苏统计年鉴—2009》所提供的影响手足口病发病的社会经济因素相关资料,采用系统聚类方法分别对其进行统计分析。结果：江苏省2009年手足口病不同月份的发病数、15岁以下年龄组的发病率、不同地区的发病率及社会经济影响均聚集成3类。结论：江苏省手足口病流行具有明显的季节性、人群性以及地区性;聚类分析可以作为判定手足口病流行特征的一种统计方法。