广东省2003年急性弛缓性麻痹病例病原流行病学分析

对广东省 2 0 0 3年急性弛缓性麻痹 (AFP)病例进行病原流行病学分析。采集 2 79例AFP病例粪便标本 ,分离到脊髓灰质炎 (脊灰 )病毒 (PV) 2 5株 ,阳性率为 8 96 %,均为疫苗株。其中PVⅡ型 1 4株 ,占 5 6 %。分离到非脊灰肠道病毒 (NPEV) 1 7株 ,阳性率为 6 0 9%。对 2 0 0 3年AFP病例的免疫史、性别、年龄与病原学结果之间的关系进行了分析 ,结果显示 :口服脊灰减毒活疫苗“零”剂次免疫的AFP病例的PV分离率依次高于 1～ 2次和≥ 3次免疫者 ,分别为 4 3 75 %、2 2 2 2 %和 2 37%;1 8例 6 0d后随访残留麻痹的病例PVⅡ分离率为 38 89%。     

广东省急性弛缓性麻痹病例及其接触者粪便标本的病毒监测结果分析

分析了广东省急性弛缓性麻痹（ＡＦＰ）病例密切接触者粪便标本的采集情况和病毒分离结果,发现在ＡＦＰ病例接触者粪便标本采集率逐年提高的情况下,脊髓灰质炎（脊灰）病毒分离率维持在２－４ ％ ～４－６％ 之间,而且ＡＦＰ病例接触者与ＡＦＰ病例粪便标本病毒分离同时阳性的比例较低。阻断脊灰野病毒循环后采集ＡＦＰ病例接触者粪便标本进行病毒分离意义不大。     

2006年人禽流感H_5N_1毒株PA基因特性、变异和进化

目的通过对人禽流感H5N1毒株PA基因序列的变异分析,揭示毒株PA基因特征、变异与进化。方法检测广东地区人禽流感H5N1毒株PA基因核苷酸序列,同时检索全球人禽流感H5N1毒株PA基因序列,采用MEGA4.0软件对检索的人禽流感H5N1毒株PA基因核苷酸序列进行比对和分析;并结合流行病学资料对变异毒株进行进化速度分析。结果PA蛋白呈酸性,等电点pH5.4。1997-2006年52株毒株PA基因核苷酸序列同源性分成两组,1997年毒株为第一组(G1),2003-2006年香港、越南、泰国、印尼、中国大陆毒株、土耳其、伊拉克、阿塞拜疆、埃及毒株为第二组(G2)。PA基因114个氨基酸位点置换,占15.9(114/716),其中2003-2006年毒株PA基因有17个氨基酸位点不同于1997年毒株。PA基因Ks值为30.9×10-6～46.1×10-6Nt/d,Ka值为4.50×10-6～8.13×10-6Nt/d;而PA基因的同义突变速度是错义突变速度的5.7～6.9倍,显示PA基因受到机体免疫压力较小;检验发现PA基因进化存在负选择性压力。PA基因中潜在的7个糖基化位点基本稳定,毒株IDNS-569H-06的PA基因半胱氨酸发生置换(S224C)。结论PA基因进化分成两系列,PA基因进化特点是自发突变较快,而受到机体免疫机制压力较小;A基因与其它多聚酶基因(PB2和PB1)比较,核苷酸序列同源性和进化在时间特征和地区特征方面具有一致性;来自中国大陆的毒株进化值得关注。人禽流感H5N1毒株PA基因在自然界变异频繁,可能影响HN毒株致病性和在人-人传播能力。     

广州市海珠区托幼机构手足口病疫情危险因素分析

探讨托幼机构手足口病疫情的危险因素,为完善托幼机构手足口病防控措施提供参考依据.方法 选取广州市海珠区2013年4-7月发生手足口病疫情的30个托幼机构,在每个托幼机构选取发生聚集性病例疫情、散发病例疫情和无病例3种情况的班级各1个共90个班级,用病例对照研究方法研究相关因素与手足口病疫情的关系.结果 单因素分析显示,聚集性病例疫情、散发病例疫情和无病例3种情况的班级间教室温度、教室通风面积、教室窗地比、玩具表面细菌菌落数、老师手足口病知识得分、规范洗手率和午检率差异均有统计学意义(F值分别为3.72,3.87,4.02,8.55,4.08,4.20,7.42,P值均<0.05);线性回归结果显示,教室通风面积(B=-0.319)和午检率(B=-0.233)为手足口病疫情发生的保护因素,而玩具表面细菌菌落数较多(B=-0.319,P<0.05)为手足口病疫情发生的危险因素(P值均<0.05).结论 加强教室通风、提高教师防控能力和做好玩具消毒对预防手足口病疫情发生有积极作用.     

华南地区常见的8种食源性致病菌检测基因芯片研制

目的 研制能同时检测华南地区常见8种食源性致病菌的oligo基因芯片.针对8种食源性致病菌基因组上的特征性靶区域,设计70 mer的寡核甘酸探针.方法 分别以检测8种食源性致病菌中每一种菌的检测探针组构建一个亚阵列;然后再将上述的8个亚阵列构建为一个大阵列,并命名为Biosafood-8芯片.用Biosafood-8芯片检测18个种属样品后进行PPR的排序与比较.结果 LM亚阵列检测李斯特菌属的3个李斯特菌LM、Lin和Liv的PPR分别为68.8%、51.8%和59.6%,而其它非李斯特菌属样品的PPR都在43%以下;VC亚阵列检测VC样品的PPR为54.1%,而其它非VC样品的PPR都在17.2%以下;VP亚阵列检测VP样品为66.7%,而其它非VP样品都在24.2%以下;Sal亚阵列检测Sal样品为55.9%,而其它非Sal样品都在50.5%以下;Shi亚阵列检测Shi样品为53.8%,而其它非Shi样品都在36.6%以下;SA亚阵列检测SA样品为65.2%,而其它非SA样品都在22.7%以下;CJ亚阵列检测CJ和CC分别为88.2%和58.8%,而其它非弯曲菌样品都在35.3%以下;EC亚阵列检测EC样品为47.9%,而其它非EC样品都在41.6%以下.结论 用Biosafood-8芯片检测18个不同种属来源的已知参考生物样品,从全阵列和芯片上每一个亚阵列两个不同的水平,都证实该芯片能够通过集成的8个目标菌检测探针亚阵列,在整体芯片阵列水平,清晰而又明确地区分目标致病菌样品和非目标致病菌样品,特异而又准确地显示被检测样品的目标菌种属.     

全球禽流感流行概况及研究现状

禽流感作为一种人禽共患病,近年来对养禽业和公共卫生均形成重大挑战,尤其是在出现人感染高致病性禽流感后,全世界开展了大量针对疫情防控和病毒的传播及其分子特征的研究。本文通过回顾禽流感病毒在禽间和人间的感染流行情况,以及病毒感染的流行病学特征,综述了当前禽流感研究的主要成果,认为未来禽流感的研究和防控工作的重点应主要集中于病毒变异、重组,要特别关注病毒重组与禽类贸易链的关系。     

珠江三角洲活禽市场外环境甲型流感病毒核酸监测

目的了解活禽市场外环境甲型流感病毒核酸分布情况。方法 2007年5月至2008年4月,在珠江三角洲7个市（广州、深圳、珠海、佛山、东莞、中山、江门）选取活禽市场,每市至少选取1个批发市场和2个以上零售市场,使用统一的《活禽市场调查表》调查活禽市场的一般情况。用拭子涂抹的方法,每市每月至少采集外环境样本（包括笼子、地板、粪便、水渠等）40份,每个活禽市场每月至少采集样本4份。采用Real-time RT-PCR方法检测甲型流感病毒核酸。并采用描述性流行病学方法分析甲型流感病毒核酸在活禽市场的分布特点。结果共调查42个活禽市场,其中批发市场7个,每市各1个,市场均没有活禽宰杀,其他35个均为零售市场,均有活禽宰杀。水禽与其他家禽交易区域有分开的23个,占54.8%;建立休市制度的7个,占16.7%。检测外环境样本3 864份,阳性876份,阳性率为22.67%。7个市均检测有阳性,阳性率介于7.23%~32.20%之间。每个月均检出阳性,其中9月份至次年2月份阳性率高于平均阳性率（22.67%）。样本种类分布分析单纯与鸭有关外环境样本阳性率为37.53%（298/794）,高于其他动物相关的样本的阳性率（样本阳性率介于16.73%~25.83%之间）;与水禽类有关的样本的阳性率（31.02%,482/1 554）高于非水禽类相关样本的阳性率（16.89%,377/2 232）（P〈0.01）。零售市场的样本阳性率（25.06%,766/3 056）高于批发市场的（13.61%,110/808）（P〈0.01）。水禽与其他家禽交易区域没有分开市场的样本阳性率（27.23%,488/1 792）高于有分开的市场的样本阳性率（18.72%,388/2 072）（P〈0.01）。结论活禽市场甲型流感核酸的阳性率较高,存在从活禽市场感染甲型流感的风险,可以通过将水禽与其他家禽交易区域分开、减少活禽现场宰杀等规范管理市场降低风险。     

2008年广东省食物中毒副溶血弧菌分子特征研究

目的了解2008年广东省副溶血弧菌食物中毒分离株的血清分型及分子特征。方法对2008年广东省14起副溶血弧菌食物中毒事件中90株分离自病例和9株分离自相关食物的菌株进行血清分型,耐热溶血素基因（tlh）、耐热直接溶血素相关基因（trh）和耐热直接溶血素基因（tdh）PCR检测以及选取优势菌型O3∶K6和O4∶K8血清型进行ER IC-PCR分子分型。结果 90株病例来源菌株以O3∶K6（62.2%）和O4∶K8（14.4%）血清型为主,9株食物来源菌株血清型别多样,无优势菌型,且同时分离到病例及食物来源菌株的4件事件中有3起食物来源菌株的血清型与同一事件中从病例分离到的血清型不同。PCR检测发现,99株副溶血弧菌tlh基因均为阳性,trh基因均为阴性,tdh基因88株阳性,其中食物来源菌株tdh基因阳性率为11.1%（1/9）,病例来源菌株tdh基因阳性率为96.7%（87/90）。选取22株O3∶K6血清型和10株O4∶K8血清型菌株（均分离自病例）进行ER IC-PCR分子分型分析,结果显示,2种血清型菌株可分为8个ER IC型别,且可区分为2类不同的聚类,这2类聚类之间的相似值为54.7%。同1起食物中毒事件中分离到的O3∶K6或O4∶K8血清型,其ER IC型别表现出多样性;而不同食物中毒事件中分离到的O3∶K6或O4∶K8血清型,部分菌株ER IC型别表现出100%的相似性。结论广东省副溶血弧菌食物中毒分离株血清型多样,同一血清型菌株存在遗传多样性,一群遗传关系密切的trh阴性、tdh阳性的O3∶K6和O4∶K8血清型为副溶血弧菌食物中毒优势菌型。     

狂犬病病毒分子流行病学研究进展

狂犬病病毒分子流行病学研究是防控狂犬病暴发的前提.已有的研究成果显示,对狂犬病病毒分子流行病学研究以全基因组测序为好,提高犬狂犬病疫苗免疫覆盖率和建立健全狂犬病疫情预警网络平台可能是扭转我国目前狂犬病高发的关键所在.此文综述了基因序列分析和氨基酸序列分析的狂犬病病毒分子流行病学研究进展.     

脊髓灰质炎病毒型内鉴别及毒力分析的新方法

脊髓灰质炎（下称脊灰）的实验室诊断是世界卫生组织（ＷＨＯ）关于全球消灭脊灰活动的重要部分。最近建立了临床标本中脊灰病毒检测、型内鉴定，脊灰病毒神经毒力分析及脊灰抗体检测的新方法。本文对脊灰病毒型内鉴定及神经毒力分析的新方法作一介绍。