基于GroEL基因的实时荧光定量PCR检测恙虫病东方体方法的建立及评价

目的 建立一种敏感、特异的实时荧光定量PCR方法,用于检测临床标本中的恙虫病东方体。方法 根据恙虫病东方体GroEL蛋白基因序列设计引物和探针,建立实时荧光定量PCR检测方法。并从灵敏度、特异度、重复性及临床标本的检测能力等方面对本方法进行综合评价。结果 建立的实时荧光定量PCR方法具有良好的特异性,可检测出恙虫病东方体Gilliam、Karp、Kato和Kawasaki株。建立的标准曲线循环阈值(Ct)与模板拷贝数呈现良好的线性关系(r=0.99),灵敏度分析显示样品最低检出浓度为21.8拷贝/μL。批内及批间重复性实验变异系数均小于1.5%,显示本方法具有良好的重复性。对本实验室保存的82份临床标本进行检测,并与常规巢式PCR方法比较,本方法检测出26份阳性标本中的25份,检出率为96.15%。结论 本研究建立的实时荧光定量PCR方法具有较高的敏感性、特异性和稳定性,可用于临床病人及暴发疫情的实验室快速检测。     

多杀巴斯德菌致泪小管炎1例报道

<正>多杀巴斯德菌(Pasteurella multocida)是引起人畜共患病常见的病原菌,属于一种小的革兰阴性球杆菌,主要存在于家禽和猫狗等动物的口腔和上呼吸道,人常因被猫狗抓伤、咬伤,或接触猫狗唾液而感染。现报道1例多杀巴斯德菌引起泪小管炎病例。     

江苏省输入性登革热1例病毒分离鉴定及分子特征分析

目的:从江苏省2012年4月1例菲律宾输入的疑似登革热患者急性期血清中分离病毒并分析其分子生物学特征,以找出病原学证据?方法:收集患者血清样本,采用胶体金法检测登革病毒的IgM?IgG抗体;用C6/36细胞分离病毒,对细胞病变的标本进行RT-PCR及荧光定量PCR检测登革病毒RNA和鉴定型别;采用高通量测序技术对该分离株进行编码区基因测序,用MEGA6.0软件对其进行序列比对和进化分析?结果:从患者血清样本中检测到登革病毒的IgM抗体,分离到的毒株经鉴定为登革病毒1型,与美国HawO3663毒株的核苷酸同源性>98%?结论:该病例是由登革病毒1型引起的输入性病例?     

江苏省环境来源的O139群霍乱弧菌的核酸特征分析

目的 分析江苏省2003-2005年之间从环境样本中分离到的霍乱弧菌的核酸特征,及其差异的程度.方法 将11株目的菌株的表型特征(包括血清型,耐药谱,生化特征以及El Tor霍乱弧菌的噬菌体分型)和核酸特征(包括霍乱毒素基因ctx-A、zot、ace、tcp-A的分布情况和脉冲场凝胶电泳指纹图谱)结合起来进行比较和分析.结果 11株菌株中有10株O139群霍乱弧菌,1株El Tor小川;其中6株O139同时对5种以上抗生素耐受,2株O139对4种抗生素耐受,1株0139对2种抗生素耐受,另外1株O139(属于PFGE-C型)和1株小川分别只对一种抗生素耐受;11株霍乱弧菌的生化特征没有明显差异;8株O139同时携带4种毒力相关基因,1株0139只携带zot和ace,另外1株O139(05052)和1株小川未携带这4种基因;9株O139的脉冲场凝胶电泳指纹图谱聚为一类,另外1株O139和小川各自聚为一类.结论 10株O139中有1株(属于PFGE-C型)的耐药谱、毒力相关基因分布及PFGE指纹图谱与其他9株不同,而与分离地点相同的小川相似,提示自然环境中的O139群霍乱弧菌存在着差异.     

江苏省一起急性胃肠炎爆发的疫情调查

调查和分析一起发生在江苏省常州市某小学急性胃肠炎爆发疫情,明确流行病学特征和基因型特征。方法根据统一设计的流行病学调查表,对病例和对照的饮食、饮水和卫生习惯等情况开展病例对照研究。对病例的排毒情况进行跟踪调查,明确排毒期长短。采集病例和对照的标本,进行荧光定量PCR方法检测,对部分阳性结果标本进行测序以明确基因型。结果11月22日起出现首例病例,11月22日至12月2日为主要发病阶段。此期共发病269例,其中学生发病264例,罹患率17.4%,教师发病5例,罹患率4.4%,两者存在统计学差异(χ2=13,P＜0.01);排毒期调查结果显示,本起暴发疫情最短排毒期为发病后3 d,最长为14 d,中位时间为7 d。共采集172份标本,其中82份检测结果为诺如病毒GII型阳性,未检测到轮状病毒及腺病毒,18份诺如病毒GII型阳性标本测序分析显示均为GII.12基因型。结论结合病例临床特征、流行病学调查及实验室检测结果综合分析,判定本起疫情为诺如病毒GII.12型感染导致的急性胃肠炎爆发疫情,该型别在我省尚为首次发现。爆发原因可能为呕吐物 口引起的大范围传播。     

丙肝疫情3种不同疾病预测预警方法比较

目的 分析Markov链模型、Holt-Winters指数平滑模型、控制图预警模型3种预测预警方法对江苏省丙型肝炎(丙肝)疫情的预测效果,为丙肝的预防控制提供科学依据.方法 收集江苏省传染病疫情管理系统1997-2009年法定报告传染病疫情中丙肝的发病资料,分别建立Markov链模型、Holt-Winters指数平滑模型以及控制图预警模型,比较3种方法对丙肝预测的效果.结果 Markov链模型预测江苏省2009年9-12月丙肝的发病数均>120例,与实际发病例数的164、125、145、138例相符;Holt-Winters季节迭加模型(α=0.46,β=0.001,γ=0.001)预测效果较好,RMSE和MAPE分别为12.629 85和19.18%;控制图5年预警模型可以用于丙肝疫情的预警,将P₇₀作为预警界值,灵敏度、特异度均 >90%.结论 Markov链模型、Holt-Winters指数平滑模型是丙肝预测的良好方法,控制图预警模型可用于丙肝疫情的预警.     

痰液纹带棒状杆菌的分离与鉴定

目的重视痰液纹带棒状杆菌的分离与鉴定,提高分离率,有助于临床该菌感染的治疗。方法来源于免疫力低下且高龄患者的痰液,分别接种血平板和巧克力平板,同时涂片,革兰染色,镜检。24h、48h观察平板菌落生长状况和菌落形态,基础试验:凝固酶、溶血加强(CAMP),仪器鉴定(VITEK2-compact、VITEK MS)种属。结果血平板上连续数例病例中均可看到纹带棒状杆菌与金黄色葡萄球菌出现月牙形β溶血加强区,有的甚至形成环状溶血加强区。结论痰液纹带棒状杆菌的检出,若无金黄色葡萄球菌,无法与其形成溶血加强区,往往容易被忽视,导致漏检。     

2016-2019年江苏省南京市人感染副溶血弧菌分子特征分析

  目的  了解江苏省南京市副溶血弧菌临床分离株的分子特征,为其防控提供参考。  方法  收集2016—2019年从腹泻和食物中毒患者分离的副溶血弧菌临床分离株并进行血清型分型,运用聚合酶链式反应（PCR）方法检测菌株的tlh、tdh、trh、toxRS/new、ORF8五种毒力基因,采用多位点序列分型（MLST）对菌株进行分子分型分析。  结果  2016—2019年共收集93株临床分离株,菌株优势血清型为O3∶K6（65/93,69.9%）,均携带tlh基因,73株属于tdh+trh- toxRS/new+的大流行菌群,非大流行菌群菌株中有5株为tdh-trh-非致病株。 共检出13个ST型,以ST3为主（68/93,73.1%）。  结论  南京地区副溶血弧菌以O3∶K6、ST3型大流行菌群菌株为主,非大流行菌群、非致病株并存。     

不同剂量HBIG联合乙肝疫苗阻断HBV母婴传播效果的随机对照研究

目的:评价乙肝疫苗联合不同剂量乙型肝炎免疫球蛋白(hepatitis B immunoglobulin,HBIG)对HBV母婴阻断的效果,探讨有效经济的联合免疫阻断方法?方法:将HBsAg阳性母亲的新生儿随机分为100 IU HBIG免疫组和200 IU HBIG免疫组,分别在出生12 h内注射100 IU或200 IU HBIG,同时新生儿都按0?1?6的程序接种10 μg乙肝疫苗,在婴儿7个月龄时观察HBV母婴阻断效果?结果:100 IU?200 IU组母婴阻断成功率分别为98.3%?98.0%,两组的阻断效果无明显差异,结合母亲HBV感染状态分析,两组的阻断效果亦无明显差异?结论:在新生儿HBV母婴阻断中,100 IU HBIG或200 IU HBIG联合10 μg乙肝疫苗的主被动联合免疫可获相似的阻断效果?     

2004-2012年全国肺结核流行特征及时空聚集性分析

目的描述全国肺结核病的流行病学特征及空间分布规律,为决策者制定防治策略及防范重点、合理分配卫生资源等提供科学依据。方法从中国CDC法定报告传染病数据库获取全国2004-2012年肺结核病的疫情资料,采用描述性流行病学、季节指数法以及时空重排扫描统计方法对数据进行分析。结果累计报告肺结核病9 663 729例,年均报告率为81.46/10万,其中2005年最高,为96.88/10万。10岁以下的婴幼儿及儿童肺结核发病水平最低,年均报告率为5.12/10万;60岁以后迅速上升,年均报告率150/10万。结核病流行期为1-6月(季节指数均1),高峰期为1月和3月。全国共检测到7个时空聚集区,且均发生在2005-2008年,其中重症一类聚集覆盖地区为重庆、贵州及广西。结论中老年为结核病重点防治人群;东部、中部、西部地区肺结核病流行强度不同,但各地区该病季节性变化规律基本相同。