我国五省斯氏并殖吸虫群体DNA序列分析的研究

目的 主要研究我国五省(广东、福建、云南、湖北、四川)斯氏并殖吸虫各群体之间的遗传差异以及四川并殖吸虫独立性问题,并探讨异盘、宫崎、泡囊并殖吸虫在并殖属中的分类地位。方法 以GNT-K法抽提基因组DNA后,用特异引物,PCR扩增ITS2和部分CO1基因,将PCR扩增产物纯化后直接进行测序或克隆后测序,分析序列的同源性,并构建种系发生树。结果 从DNA序列结果来看,5省斯氏并殖吸虫群体之间存在的遗传性差异较小,其中四川并殖吸虫与斯氏并殖吸虫之间存在的遗传性差异亦小。遗传关系均比较接近。泡囊并殖吸虫在种系发生树上位于斯氏并殖吸虫各地域株之间。在种系发生树上,日本的宫崎并殖吸虫亦位于斯氏并殖吸虫各地域株之间,并且与福建地域株最为接近。异盘并殖吸虫在种系发生树上虽与斯氏并殖吸虫各地域株之间距离较远,但相对卫氏并殖吸虫而言,仍与斯氏并殖吸虫遗传距离较近。结论 广东、福建、云南、湖北和四川5省斯氏并殖吸虫群体均属斯氏并殖吸虫同一虫种,由于受地理因素影响,种内存在着不同的地域株。四川并殖吸虫与斯氏并殖吸虫系同种异名。泡囊并殖吸虫与日本的宫崎并殖吸虫很可能是斯氏并殖吸虫的同种异名。异盘并殖吸虫在形态上与种系发生树上,与斯氏并殖吸虫亲缘关系近于卫氏并殖吸虫,分类地位处于两     

陕西省发热呼吸道症候群病原谱和呼吸道合胞病毒基因特征

目的 分析陕西省发热呼吸道症候群患者咽拭子中16种呼吸道病毒病原谱构成和呼吸道合胞病毒基因特征.方法 2010年1月至2011年1月收集符合监测定义患者咽拭子标本208份,采用基于毛细管电泳的多重RT-PCR反应进行病毒核酸检测,包括人鼻病毒(HRV)、冠状病毒(HCOV)、流感病毒(Flu)、副流感病毒(HPIV)、腺病毒(ADV)、呼吸道合胞病毒(HRSV)、人偏肺病毒(HMPV)以及博卡病毒(HBOV),并对其中HRSV检测阳性的标本进行G基因羧基末端测序与种系进化分析,研究流行于陕西的HRSV分子流行病学特征.结果 总病毒检出率为53％(109/208),检测到的阳性病毒病原构成率分别为:HRSV42.2％、Flu24.5％、PIV20％,HRV13.6％,ADV10.9％,HCOV7.3％、HMPV4.6％和3份HBOV2.7％.有20％(22/109)病例为混合病毒感染,其中有14例为PIV与其他病毒混合感染,15 ～ 39岁年龄组混合感染率最高,差异有统计学意义(P＜0.05).总呼吸道病毒的感染率在各年龄组中差别不大,除Flu、HMPV和PIV外,其他病毒(HRV、HBoV、HCoV、ADV、HRSV)的感染人群主要以0～4岁小儿为主.46例多重RT-PCR HRSV阳性病例中,42例为HRSV A血清型的NA1基因型;2例为B血清型,其中1例为BA9基因型,1例为GB2基因型.结论 @@陕西发热呼吸道症候群由多种呼吸道病毒引起,存在2种或以上病毒的混合感染,其中以PIV与其他病毒混合感染为主.HRSV是2010年陕西省发热呼吸道症候群的主要病原,其中A血清型的NA1基因型是陕西2010年流行的绝对优势型别.     

中国风疹病毒基因型流行趋势研究

目的 分析1999-2012年中国（未包括香港、澳门特别行政区和台湾地区）风疹病毒基因型的流行趋势.方法 依据中国麻疹和风疹实验室网络病毒学监测数据库,以及国家麻疹和风疹实验室风疹病毒学监测数据,进行中国流行风疹病毒基因型的动态监测.结果 1999-2012年从全国27个省（自治区、直辖市）分离到1017株风疹病毒株：其中847株为1E基因型（2001-2012年）,分布于我国所有已开展风疹病毒学监测的27个省、区;15株为1F基因型（1999-2002年）,分布于河南、安徽和山东三省;3株为疫苗类似株2A基因型（2001年）,分离于山东省;152株为2B基因型（2000、2006、2008、2011、2012年）,从全国13个省、区、市分离到.在2002年之后未再检测到1F和2A基因型.结论 通过对1999-2012年中国27个省、区流行的风疹病毒的分子流行病学研究,阐明了我国流行的风疹病毒的基因型流行趋势及其在地域和年代上的分布,并证实近年来我国风疹病毒的流行是由1E和2B基因型共循环引起的多个传播链所致,其中1E基因型为优势,2B基因型为弱势.     

中国麻疹实验室网络的建立及运转

目的评价中国麻疹实验室网络建立的意义和建立初期运转情况。方法对2002~2004年中国麻疹实验室网络建立初期的各项运转指标进行评价。结果2001年,中国疾病预防控制中心(CDC)病毒病预防控制所国家麻疹实验室正式成立,并且在31个省(自治区、直辖市,下同)CDC建立了麻疹实验室,逐步建立了市(地区、州、盟,下同)级麻疹实验室,现已初步形成了一个包括国家麻疹实验室、31个省级CDC麻疹实验室、331个市级CDC麻疹实验室在内的麻疹实验室快速反应诊断系统。目前,已建立麻疹/风疹实验室的诊断标准,并为省、市级CDC麻疹/风疹实验室在监测方面提供培训和技术支持,组织对31个省级CDC麻疹实验室进行职能考核和血清复核等质量控制工作。31个省级CDC麻疹实验室和多数市级CDC麻疹实验室可开展常规的麻疹血清学检测。在血清学监测的基础上,省级CDC麻疹实验室开展了麻疹病毒学监测工作,1993~2004年通过省级CDC麻疹实验室网络的共同努力,在27个省共分离到366株麻疹病毒。结论中国三级麻疹实验室网络已经成功建立并运转良好,为疑似麻疹病例的实验室诊断和鉴别诊断提供了重要的技术支撑,为流行病学专家及时采取强化免疫措施,阻断麻疹病毒的传播,提供了重要的科学依据;建立了中国的麻疹病毒毒株库和基因数据库,为了解中国麻疹野病毒流行的基因型、病毒来源、基因变异情况和传播途径打下了基础;在评估人群对麻疹免疫力、疫苗免疫效果中起到了不可忽视的作用。     

用DNA序列分析我国5种并殖吸虫的分类地位

目的　采用分子生物学技术分析河口并殖吸虫、白水河并殖吸虫、勐腊并殖吸虫、曼谷并殖吸虫及象山并殖吸虫的分类地位。　方法　用明胶、乙基苯基聚乙二醇(NP40)、聚山梨酸200法抽提基因组DNA,用特异引物,PCR扩增ITS2和部分CO基因的目的基因。PCR扩增产物纯化后直接测序分析其同源性,构建种系发生树。　结果与结论　DNA序列分析结果表明,白水河并殖吸虫、勐腊并殖吸虫、曼谷并殖吸虫及象山并殖吸虫之间存在较小的差异。种系发生树可见,这4种并殖吸虫在并殖吸虫属中彼此比较接近,分类地位位于卫氏并殖吸虫与斯氏并殖吸虫之间。河口并殖吸虫与斯氏并殖吸虫在进化及亲缘关系上非常接近。     

2004年中国四省市腺病毒疫情的流行病学和病原学研究

目的对2004年发生在湖北省、江西省、江苏省和北京市的腺病毒暴发及散发的疫情进行流行病学总结和分析以及病原学研究,以了解中国腺病毒感染状况。方法对各地分离的共16株腺病毒毒株进行了病原学研究,包括病毒的培养,提取病毒核酸,针对Hexon蛋白基因的PCR扩增以及PCR产物的序列测定和分析,并根据流行病学资料对腺病毒的疫情特点进行总结和分析。结果2004年引起湖北省、江西省、江苏省和北京市的腺病毒暴发及散发的疫情均为腺病毒3型;分离到的16株腺病毒毒株,在所选的900bpHexon基因片段,基因变异较小,核苷酸和氨基酸的同源性在98.5%￣100%。结论目前我国学龄儿童以及低年龄组儿童的腺病毒感染主要为3型所致,各地分离的病毒株未观察到明显的基因变异。     

中国2012年麻疹/风疹实验室网络运转情况分析

目的评价中国2012年麻疹/风疹实验室网络（Measles/Rubella Laboratory Network,M/RLN）（未包括香港、澳门特别行政区和台湾地区,下同）运转情况。方法分析中国2012年M/RLN监测数据库、中国疾病预防控制中心（Center for Disease Control and Prevention,CDC）病毒病预防控制所国家麻疹/风疹实验室（National Measles/Rubella Laboratory,NM/RL）血清学和病毒学监测数据库,评价中国M/RLN运转的各项指标。结果①血清学监测：中国2012年共检测疑似麻疹血清学标本45 474份,其中麻疹免疫球蛋白（Immunoglobulin,Ig）M阳性6347例,占疑似麻疹病例的14.9%;共检测疑似风疹血清学标本44 076份,风疹IgM阳性7611例,占疑似麻疹病例的17.3%。②病毒学监测：2012年22个省（自治区、直辖市,下同）级CDC麻疹/风疹实验室（Measles/Rubella Laboratory,M/RL）共送检474株麻疹病毒,经基因定型证实454株为H1基因型的H1a基因亚型,同时也检测出6株A基因型（疫苗相关株）、13株输入性的D9和1株D8基因型;18个省级CDC M/RL共送检288株风疹病毒,其中198株为1E基因型,同时也检测出90株2B基因型风疹病毒。③M/RLN质量控制：NM/RL作为世界卫生组织（World Health Organization,WHO）西太平洋区参比实验室,通过了2012年度WHO的职能考核和现场认证;所有省级CDC M/RL通过了麻疹血清标本复核和职能考核,同时11个省级CDC M/RL通过了WHO专家组的现场考核。结论中国2012年M/RLN运转良好,为疑似麻疹病例的实验室诊断、鉴别诊断、麻疹/风疹病毒学监测提供了良好的技术平台,进一步建立了中国的麻疹/风疹病毒毒株库和基因型数据库,为消除麻疹奠定了良好的实验室基础,也为我国制定消除麻疹的策略提供重要的依据。     

中国2013年麻疹/风疹实验室网络的运转与监测

目的评价中国（未包括香港、澳门特别行政区和台湾地区,下同）2013年麻疹/风疹实验室网络（Measles/Rubella Laboratory Network,M/RLN）的运转状况。方法分析中国2013年麻疹监测报告管理信息系统中实验室数据和全国M/RLN监测数据,评价中国2013年M/RLN运转的各项指标。结果 1血清学检测：中国2013年共采集散发麻疹疑似病例（Measles-like Illnesses,MLIs）74 296例的血清标本,占中国散发MLIs的97.30%;实验室确诊的散发麻疹病例26 686例,占散发MLIs的34.02%;中国2013年报告MLIs爆发157起,实验室证实麻疹爆发108起,风疹爆发26起。2病毒学监测：中国2013年M/RLN从29个省（自治区、直辖市,下同）分离到2325株麻疹病毒,其中2217株为H1a基因亚型,13株为A基因型,47株为D9基因型,45株为D8基因型,3株为B3基因型。2013年从17个省分离到187株风疹病毒,其中103株为1E基因型,84株为2B基因型。3质量控制：作为世界卫生组织（World Health Organization,WHO）西太平洋区麻疹参比实验室,中国疾病预防控制中心（Center for Disease Control and Prevention,CDC）病毒病预防控制所国家麻疹/风疹实验室通过了2013年WHO的职能考核和现场认证。8个省级CDC麻疹/风疹实验室（Measles/Rubella Laboratory,M/RL）（包括新疆、北京、河北、四川、黑龙江、宁夏、广东和广西）通过了2013年WHO专家组的现场认证;32个省级（包括新疆生产建设兵团）CDC M/RL,全部通过了由M/RLN组织的血清标本复核和WHO组织的职能考核。结论中国2013年M/RLN运转良好,MLIs的实验室诊断比例和病原学检测比例进一步提高,为麻疹和风疹的鉴别诊断和病原学监测提供了良好的技术平台,同时也积累了大量的本土麻疹/风疹病毒流行株和输入株的基因背景资料,为在中国实现消除麻疹的目标提供了重要的和实验室技术支撑。     

河南省漯河市急性呼吸道感染病例人博卡病毒检出情况及病毒基因特征分析

目的 分析河南省漯河市急性呼吸道感染(ARI)病例中人博卡病毒(HBoV)的检出情况及病毒基因特征。方法 使用实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)对2018年6月至2020年12月收集的1 185例ARI病例咽拭子标本进行呼吸道多病毒检测。对HBoV核酸阳性的标本进行VP1基因巢式PCR扩增和序列测定,同时结合GenBank下载的中国地区HBoV1 VP1基因序列,进行病毒基因特征分析。结果 在1 185例ARI病例标本中,共有32例(2.70%)为HBoV阳性,其中17例(53.13%)同时检出≥2种病毒。96.88%(31/32)HBoV阳性病例为5岁以下的儿童,其中以12～23月龄患儿的检出率最高(5.52%),其次是6～11月龄(3.39%)。HBoV阳性病例主要集中在夏、秋、冬3个季节,但三者间差异无统计学意义(P>0.05)。HBoV的单一感染和混合感染均可引起上呼吸道或下呼吸道感染,但差异无统计学意义(P>0.05)。本研究所获得的21条HBoV序列均属于HBoV1。Ⅰb分支是2018—2020年河南省漯河市HBoV1主要优势流行株,与我国其他地区一致...