医学知识图谱构建研究进展

针对医学数据专业性强、结构复杂等特点,解析了构建医学知识图谱的关键技术,介绍了利用机器学习和深度学习的方法识别医学命名实体、实体链接和抽取语义关系,以及医学知识图谱在医院智能导诊、疾病筛查和预测、辅助临床诊断、医疗保险风险预测和医学知识科普方面的应用。结合当前我国医学知识图谱构建在数据和技术层面临的问题和挑战,提出了相应的对策和建议。     

基于全球研究数据注册仓储Re3data.org的医学科学数据仓储建设

目的：总结全球医学领域科学数据仓储建设现状、经验与不足,为我国医学科学数据仓储建设提供参考和借鉴。方法：利用统计分析、共现分析和社会网络分析等方法,结合可视化图表对2018年Re3data.org中收录的637个医学科学数据仓储的分布、建设等情况进行分析。结果：美国、英国和国际组织在仓储合作建设中贡献最为突出,其中美国参与建设的数据仓储占50%,独立建设仓储达241个。多数仓储收录3～6类数据,科学和统计数据是被收录最多的类型,收录数据主题丰富,64.36%的仓储提供数据质控。Dspace等7种软件被用于数据仓储建设,数据管理涉及5种唯一标识符、16种元数据。结论：欧美国家占据了数据仓储建设高地,需多方合作共促数据开放共享。开源技术降低了仓储搭建门槛,标准规范建设保障仓储运管,数据分级共享提供接口支持,政策许可可保障多方权益。     

花粉症知识图谱与过敏预警分析系统的设计与实现

目的：设计和实现一个基于花粉症的知识服务与过敏预警分析系统,弥补现有花粉过敏预警分析系统的不足之处。方法：在阐述花粉过敏预警系统和过敏预警 算法研究的现状和进展的基础上,对系统思路、系统架构进行设计,最后对数据进行采集和处理,实现功能模块,完成一个花粉症知识图谱与过敏预警分析系统。结果：该系统能够较好地实 现花粉过敏知识服务的功能,提高用户预防意识,为用户提供花粉过敏研究的参考资料,同时对现有花粉过敏预警系统有一定的优化。结论：应寻求多方合作,完善数据集,改进花粉过敏预 测模型。     

面向标准化数据整合的医学通用数据模型探析

美国观察性医疗结果合作组织（Observational Medical Outcomes Partnership,OMOP）建立的通用数据模型（Common Data Model,CDM）提供了数据结构和内容的标准化研究方法,目前已广泛地应用于各类科学研究。深入分析了CDM的主要模块架构,梳理和总结了多源数据向CDM转换的流程、每一步的实现方法和主要思路,介绍了模型的应用,探讨了模型应用中的关键问题,并提出了相关建议。     

基于场景化的人口健康科学大数据安全治理体系构建

介绍数据安全治理基本理念和国内外人口健康科学大数据安全实践,指出我国开展人口健康科学数据安全治理的必要性,分析了人口健康科学大数据的特点及其在全生命周期各个场景动态流转的安全风险,从人员组织、制度规范、技术支撑等多个层面构建了基于场景化的人口健康科学大数据安全治理体系,为促进我国人口健康科学数据中心开展大数据安全治理提供理论支撑与应用参考。     

健康医疗可穿戴设备数据安全与隐私保护意识实证分析研究

采用问卷调查北京协和医学院在校师生对健康医疗可穿戴设备的数据安全与隐私保护意识,从设备数据保障能力认知、数据权利主体认知、数据共享意愿认知、尊重他人隐私意识及数据保护和维权意识5个方面对调查结果进行分析,阐述存在的主要问题并提出应对措施。     

移动背景下医疗健康可穿戴设备的数据生命周期

简要介绍国内外医疗健康可穿戴设备数据生命周期研究现状并对代表案例加以分析。从数据采集、数据传输、互操作、数据集成和数据管理5个方面对医疗健康可穿戴设备数据的流通路径进行分析,结合代表案例G5移动健康血糖监测系统加以验证,发现医疗健康可穿戴设备数据流通过程中存在数据复用与交换、数据隐私安全与保护等问题。     

精准医学大数据汇交管控模型与应用研究

系统分析了精准医学数据汇交过程中面临的主要问题,针对不同病种、不同类型的异构精准医学数据,从汇交内容、数据质量、数据安全、数据标准等方面构建了多维度精准医学大数据汇交管控模型,并探讨了该模型在精准医学大数据汇交中不同阶段的应用,为数据汇交工作的开展提供指导和参考依据。     

临床指南结构化研究

针对临床指南知识密集性、结构多样性、语言不规范性、内容可扩展性等特点及其在实际应用中存在的问题,着重对临床指南结构化的方法与模型进行多维度对比分析,发现它们的特点与不足,以期为未来临床指南结构化方法与模型的选择、应用和完善提供参考。     

基于科研项目调查的人口健康领域研究分布分析

目的：对我国人口健康领域的国家级科研项目进行了调查和分析,以了解该领域的研究分布情况。方法：调查2009-2018年我国人口健康领域的国家科技计划项目,采用共现分析、社会网络分析等方法对项目的学科分布、类型分布、机构分布、主题分布等情况进行分析。结果：人口健康领域国家级科研项目主要由国家自然科学基金、国家重点研发计划、国家科技重大专项等构成,资助项目数量和经费金额呈逐年上升趋势。科研项目中,排在前3位的学科是临床医学、基础医学和中医学与中药学,排在前5位的机构为上海交通大学、中国科学院、复旦大学、中山大学和华中科技大学。“MicroRNA”“自噬”“信号通路”“分子机制”“巨噬细胞”“肿瘤干细胞”等是多数机构的研究热点。结论：国家对人口健康领域的支持力度不断加大,重点学科得到优先发展,活跃机构促使研究热点涌现,新增项目构成研究新格局。建议优先从重点研究方向、活跃机构和新增项目类型中遴选和共享精品数据集。