儿童双侧肾母细胞瘤差异性表达蛋白的筛选

目的采用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术筛选双侧肾母细胞瘤(BWT)的差异性表达蛋白。方法选取BWT患儿血清标本10例(BWT组),另选单侧肾母细胞瘤(UWT)患儿血清标本(UWT组)及健康儿童血清标本(对照组)各20例,采用SELDI-TOF-MS技术检测并收集相关数据。结果应用生物信息学方法对所得数据进行分析,得到差异性峰10个(P<0.01)。对比各组差异性表达蛋白峰值数据,筛选出质子数/电荷数(m/z)为5 648 Da的差异性表达蛋白1个,其在BWT组、UWT组及对照组中表达强度分别为3 889.36±1 796.83、2 886.81±1 404.65、432.21±730.42,三组相比,P均<0.01。结论采用SELDI-TOF-MS技术成功筛选出一种BWT差异性表达蛋白,其有望成为BWT早期诊断及预后判断的新的标志物。     

血清肿瘤标记物的人工神经网络模型在肺癌诊断中的应用

目的:联合检测多种血清肿瘤相关标记物,建立基于人工神经网络的肺癌血清标记物诊断模型。方法:应用酶联免疫吸附法分别测定100 例肺癌患者和113 例健康人对照的血清标本中癌胚抗原（CEA ）、甲胎蛋白（AFP）、癌抗原19-9（CA19-9）、癌抗原72-4（CA72-4）、癌抗原242（CA242）、癌抗原21-1（CA21-1）、神经元特异性烯醇化酶（NSE）和组织多肽抗原（TPA ）等8 种肿瘤相关标记物含量,结合生物信息学方法进行数据的分析。筛选出最优标记物组合,用150 例样本（肺癌70例,健康对照80例）建立诊断模型,并用63例样本（肺癌30例,健康对照33例）盲法测试集评估此模型。结果:应用曲线下面积方法结合神经网络筛选出CA211、CEA 两个最优组合的肿瘤标志物,建立的神经网络的肺癌血清标记物诊断模型经盲法验证预测的特异性为92.9% ,敏感度为86.0% ,阳性预测值85.5％。结论:本研究建立了基于人工神经网络的肺癌多种血清标记物诊断模型,其敏感性和特异性较高,对肺癌的临床诊断具有一定意义,对早期诊断也具有一定价值。      

尿蛋白组学筛选检测过敏性紫癜患者的肾损害

目的 表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)筛选早期过敏性紫癜肾炎患者尿液中的特异标志蛋白.方法 CM10(弱阳离子交换表面)蛋白芯片结合SELDI-TOF-MS技术,检测60例过敏性紫癜患者(30例伴发紫癜性肾炎,30例不伴肾炎)尿液中的蛋白质质谱,用浙江大学肿瘤研究所蛋白芯片数据分析系统筛选过敏性紫癜肾炎特异的尿液蛋白标志物.结果 共检测到154个经过信噪比和强调过滤的高质量质谱蛋白质峰,从中筛选出2个表达差异显著(P＜0.05)的蛋白标志物.用遗传算法结合支持向量机模型的方法筛选出最佳模型,用留一法评估模型的预测效果为敏感性84％,特异性71％.结论 尿蛋白质谱与生物信息学分析方法对早期过敏性紫癜肾炎的检测具有一定的敏感性和特异性.     

肾母细胞瘤患儿血清蛋白质标记物的筛选及鉴定

目的 筛选肾母细胞瘤患儿特异性血清蛋白质标记物并对其进行鉴定,以确定其作为肾母细胞瘤血清学诊断和预后监测的特异标志物.方法 应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测肾母细胞瘤患儿手术前后及正常小儿的血清蛋白质组,筛选差异蛋白质峰,并对目标蛋白质进行分离纯化、酶解,采用液质联用串联质谱(LC-MS/MS)分析,用SEQUST检索程序查询美国Bioworks公司提供的蛋白质序列数据库.结果 经SELDI-TOF-MS技术筛选出m/z位于6455.5和6984.4的蛋白质标志物在肾母细胞瘤组低表达(表达强度为1029±364、297±126),正常小儿组高表达(2108 ±837、753±226),差异均有统计学意义(均P＜0.01);m/z位于9190.8的蛋白质标志物在肾母细胞瘤术前组低表达(283±154),术后组和正常小儿组高表达(5974 ±657、6231±519)差异均有统计学意义(均P＜0.01).对m/z位于6455.5和9190.8的标志物进行鉴定,结果分别为载脂蛋白CⅢ和触珠蛋白.结论 检测血清中载脂蛋白CⅢ和触珠蛋白含量可能成为肾母细胞瘤的血清学诊断、恶性度分级和预后监测指标,值得进一步研究与应用.     

大肠癌术后肝转移的蛋白质指纹图谱检测及诊断模型的建立

大肠癌发病率和病死率逐年上升,预后较差,其主要原因为大肠癌肝转移[1].与其他肿瘤不同,大肠癌患者出现肝转移时并未完全失去治疗机会.采用具针对性的治疗措施可延长患者生存时间.目前早期诊断大肠癌术后肝转移的理想方法尚少.本研究旨在通过分析大肠癌术后肝转移患者、其他部位转移患者及术后无转移者的血清蛋白质指纹图谱,以期发现大肠癌肝转移的肿瘤标志物.     

支持向量机软件在胰腺癌早期诊断中的应用研究

目前应用于临床的血清标志物大多为肿瘤相关标志物，即一种标志物可在不同肿瘤中都可能有表达，特异性较低。我们应用统计学和生物信息学的支持向量机软件建立胰腺癌的肿瘤标志物的组合模式识别系统，用以判断正常，胰腺良性疾病及胰腺恶性肿瘤三种人群，并评价其临床意义，进而为其他肿瘤的诊断提供可行的判断方法。     

脑脊液蛋白质指纹图谱模型在急性颅脑损伤研究中的应用

颅脑损伤是当今威胁人类生命的主要疾患之一,尽管对颅脑损伤的研究不断深入,但颅脑损伤仍有高伤残率和高致死率.常规的颅腩损伤诊断多依赖于CT、MRI、SPECT(单光子发射计算机断层扫描)等神经影像学技术,这些诊断工具在判定患者的一般脑功能状态上是有价值的,但缺乏对脑损伤程度的精确及量化的评估.     

脑膜瘤和脑良性肿瘤及脑外伤患者脑脊液蛋白质谱差异表达模型的研究

目的用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)和生物信息学分析技术寻找脑脊液中能鉴别脑膜瘤和其他脑良性肿瘤及脑外伤诊断的新标志物。方法收集14例脑膜瘤、9例其他脑良性肿瘤和27例轻度脑外伤患者的脑脊液标本，用H4蛋白芯片和SELDI-TOF-MS检测蛋白质谱的表达。用Biomarker PattemsTM Software分析软件进行数据处理，建立区分脑膜瘤和脑外伤患者脑脊液中蛋白质谱差异表达模型和区分脑膜瘤和其他脑良性肿瘤脑脊液中蛋白质谱差异表达模型；并用2个模型对各2例脑膜瘤、其他脑良性肿瘤和脑外伤患者进行盲法交叉验证。结果用5个质荷比峰建立的区分脑膜瘤和脑外伤脑脊液蛋白质谱差异表达模型的准确率为98％(49/50)．敏感性为100％(14/14)，特异性为96．3％(26/27)，阳性预测率为93．3％(14/15)，阴性预测率为100％(27/27)。用4个质荷比峰建立的区分脑膜瘤和其他脑良性肿瘤脑脊液蛋白质谱差异表达模型的准确率为96％(48/50)，敏感性为100％(14/14)，特异性为94．4％(34/36)，阳性预测率为92．3％(14/16)，阴性预测率为100％(34/34)。盲法交叉验证，第一个模型能将脑肿瘤、其他脑良性肿瘤和脑外伤全部正判，第二个模型将1例脑外伤误判。结论用SELDI-TOF-MS技术平台和生物信息学技术初步建立的区分脑膜瘤与脑外伤和其他脑良性肿瘤的脑脊液蛋白差异表达模型，为寻找脑膜瘤中新的肿瘤标志物进行蛋白质组学研究开辟了一条新的途径。     

滋阴清热方对狼疮鼠脾淋巴细胞的核蛋白质的影响

目的:探讨滋阴清热方和泼尼松对狼疮鼠脾淋巴细胞的核蛋白质的影响。方法:用生理盐水(对照组)、中药、西药和中西药等不同的干预措施处理狼疮鼠5周,提取脾淋巴细胞核蛋白质,运用表面增强激光解析离子化-飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)检测各处理组狼疮鼠核蛋白质的表达差异,揭示滋阴清热方以及联合泼尼松治疗SLE的作用环节。结果:在脾淋巴细胞的核蛋白质中发现对照组出现一些加重自身免疫的蛋白质,而西药组出现一些抑制免疫反应的蛋白质;中西药组和西药组对脾淋巴细胞的核蛋白质影响的结果是相似的。结论:滋阴清热方中药和或泼尼松可能通过影响脾淋巴细胞细胞的分化和蛋白质的表达达到治疗目的。     

血清蛋白质指纹图谱在甲状腺癌诊断中的应用

目的 检测甲状腺癌、甲状腺良性结节和正常人血清中蛋白质组图谱，筛选特异的蛋白质标记物。构建用于甲状腺癌早期诊断的血清蛋白质指纹图谱模型。方法 应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱（SELDI-TOF-MS）技术检测108例血清标本的蛋白质质谱，其中甲状腺癌40例（Ⅰ～Ⅱ期26例，Ⅲ～Ⅳ期14例），甲状腺良性结节36例，正常人32例。随机抽取87例标本（甲状腺癌32例，甲状腺良性结节30例，正常人25例）作为训练组，应用支持向量机和判别分析的方法分析质谱数据，建立甲状腺癌诊断模型，留一法交叉验证。结果区分甲状腺癌和正常人的诊断模型交叉检验敏感性87．5％，特异性80．0％，用15例未知血清盲法测试敏感性100％。特异性86％。区分甲状腺癌和甲状腺良性结节的诊断模型交叉检验敏感性81％，特异性87％，用14例未知血清盲法测试敏感性88％，特异性83％。结论 SELDI-TOF-MS技术结合生物信息学方法检测甲状腺癌血清蛋白质指纹图谱是早期诊断甲状腺癌的一种特异性强。敏感性高的新方法。值得进一步研究。