两种实验动物感染艰难梭菌的特征比较

目的 研究分析树鼩和BALB/c小鼠感染艰难梭菌的特征,比较和评估二者作为艰难梭菌动物感染模型的适用性.方法 分别以树鼩和BALB/c小鼠作为研究对象,抗生素组合喂养后灌胃艰难梭菌RT078(105 CFU芽孢/只),7 d内观察动物的感染特征和表现,对感染动物的肠道组织进行组织病理学检查和分析.结果 树鼩自灌胃第2天...     

2019年云南省德宏州手足口病的病原构成及柯萨奇病毒A组16型基因特征分析

目的 对2019年云南省德宏州手足口病的病原构成及柯萨奇病毒A16型(coxsackievirus A16,CV-A16)的基因特征进行分析.方法 对2019年云南省德宏州的650份手足口病患者的粪便标本进行病毒分离,对分离到的肠道病毒(enterovirus,EV)毒株进行VP1区基因测序定型并对CV-A16的基因特...     

云南省一株柯萨奇病毒B组5型分离株的全基因组解析

目的对云南省2022年一例流感样病例的咽拭子分离得到的柯萨奇病毒B组5型(coxsackievirus B5, CVB5)病毒株进行全基因组测序, 并分析其遗传进化、基因突变和重组特征。方法通过人宫颈癌细胞培养获得病毒分离株, 应用全基因组测序技术对分离株进行病毒基因序列测定, 采用MEGA、RDP4及SimPlot软件, 解析病毒基因组学特征。结果分离株YN-01/CHN/2022与2株广东CVB5流行株核苷酸同源性为96.6%, 属GⅠ.C1分支, 与国内大多其他CVB5流行株相似度低(≤90.3%), 揭示国内CVB5流行株间基因组差异较大。该分离株VP1序列存在2个特有的氨基酸突变(T246A和T275A), 但其95位氨基酸未发生改变。基因重组分析显示YN-01/CHN/2022可能为重组株, 重组位点发生在P1区VP4(940)和P2区2A(3 540)。结论本研究分离株YN-01/CHN/2022属于CVB5 GⅠ.C1基因型, 存在特异的核苷酸分歧, 也证实了CVB5基因组有重组现象发生。该数据提示增强CVB5分子流行病学研究工作, 持续追踪病毒进化规律, 不断提高相关...     

2018-2021年云南省手足口病病例柯萨奇病毒A4型流行株基因特征

目的 分析云南省手足口病(Hand, foot and mouth disease, HFMD)病例柯萨奇病毒A组4型(Coxsackievirus A4,CVA4)分离株基因特征。方法 在云南省7个市州采集2018-2021年HFMD病例粪便标本,进行肠道病毒RNA提取、VP1区基因扩增、序列测定和基因型别鉴定;构建CVA4分离株与基因库中参考株系统进化树,分析核苷酸和氨基酸相似性。结果 从28 565例HFMD病例粪便标本中获得13株CVA4,其中2018年1株、2019年1株、2020年6株、2021年5株;C2基因亚型11株、C4基因亚型2株。C4和C2基因亚型之间核苷酸、氨基酸平均相似性分别为85.77%、93.27%;与原型株HighPoint相比,C2基因亚型核苷酸、氨基酸平均相似性分别为84.51%、93.27%,C4基因亚型分别为84.44%、93.78%。结论 2018-2021年云南省HFMD病例CVA4的优势流行株为C2基因亚型;需继续加强CVA4分子流行病学监测。     

2011-2016年云南省边境县手足口病流行特征聚类分析

目的 了解云南省边境县手足口病流行特征,为防控策略制定、跨境传染病联防联控工作提供参考依据。 方法 采用有序聚类和无序聚类方法,对2011-2016年云南省25个边境县的手足口病报告病例数和发病率,按不同月份、年龄段、县区进行分析。 结果 不同月份手足口病例数有序聚类可分为3类(1-3月、4-6月、7-12月各聚为一类)。无序分类可分为3类(1、4、7、9月; 5-6月及10-12月;2-3月及8月各聚为一类)。不同年龄段手足口病例数有序分类可分为3类(0~岁、1~3岁、4~岁以上各聚为一类)。无序分类可分为4类(1~岁、2~岁、0~岁及3~4岁、5~岁以上各聚为一类)。按手足口发病率可将25个县聚为4类:1类为瑞丽市、盈江县;2类为景洪市、勐海县、勐腊县、芒市;其余19个县可分别归为3类、4类。1类、2类县手足口病发病率高于3、4类。 结论 云南省25个边境县手足口病在不同时间、不同人群和不同地区之间流行具有差异性,应加强重点地区、重点人群的手足口病防控工作。     

云南省2003-2012年伤寒副伤寒流行特征分析

目的分析2003-2012年云南省伤寒副伤寒流行特征和趋势,为制定有效防控措施提供科学依据。方法利用10年全省伤寒副伤寒疫情资料和伤寒副伤寒暴发疫情数据,采用SPSS10.0软件统计分析伤寒副伤寒在云南省的发病和流行情况。结果 2003-2012年,云南省共报告伤寒副伤寒病例66 870例,死亡23例,年均发病率14.91/10万,病死率0.034%,报告病例数、发病率和病死率均呈逐年下降趋势,但仍高于全国平均水平(1.93/10万)。不同年份发病率差异有统计学意义(χ2=10 125.33,P0.001)。云南省伤寒副伤寒全年均有病例报告,季节性明显,感染高峰期在5-10月;发病地区分布广泛,但不同地区间发病率差异较大,发病率居前五位的州市年均发病水平呈交错排位;发病人数最多的职业是农民(39.50%),其次为学生和工人,近年散居儿童发病呈上升趋势。目前,云南省伤寒副伤寒暴发疫情起数和人数均维持在较低水平,伤寒副伤寒主要以散发病例为主,报告病例以实验室诊断居多(71.28%),近年来甲型副伤寒发病上升,在个别州市已成为优势菌感染。结论云南省10年来伤寒副伤寒发病虽然总体呈下降趋势,但仍高于全国平均水平。对以甲型副伤寒优势菌感染为主的重点州市应加以有效策略控制和分类指导;对农民发病较高和散居儿童发病上升应予以特别关注和警惕;在报告伤寒副伤寒病例诊断及实验检测技术和方法上需进一步提高和优化。     

云南省伤寒副伤寒空间分布特征及其气候影响因素研究

Objective To characterize the spatial distribution of typhoid and paratyphoid fever(TPF)in Yunnan province, China and to determine the effectiveness of meteorological factors on the epidemics of TPE Methods Data of reported TPF cases in Yunnan province(2001 -2007)from the China Information System for Diseases Control and Prevention was applied to GIS-based spatial analyses to detect their spatial distribution and clustering of TPF incidence at the county level.Panel data analysis was used to identify the relationships between the TPF incidence and meteorological factors including monthly average temperature, monthly cumulative precipitation and monthly average relative humidity. Results During the study period, the average incidence of TPF in Yunnan province was 23.11/100 000, with majority of the TPF cases emerged in summer and autumn. Although widely distributed, two TPF clusters were detected in Yunnan province based on the spatial analysis:one area around Yuxi city with the average annual incidence as 207.45/100 000 and another at the junctions of Yunnan province with Burma and Laos. Based on results from panel data analysis, the incidence of TFP was shown to be associated with meteorological factors such as temperature,precipitation, relative humidity and one month lag of temperature increase [10 ℃ increase in the monthly average temperature:IRR=1.30(95%CI: 1.24-1.36);10% increase in monthly average relative humidity:IRR= 1.07(95%CI: 1.05-1.09); 100 mm rise in monthly cumulative precipitation:IRR=1.02(95%CI: 1.00-1.03); and 10 ℃ average temperature increase, the last month: IRR=1.73(95%CI: 1.64-1.82)]. Conclusion Areas with high TPF incidence were detected in this study,which indicated the key areas for TPF control in Yunnan province. Meteorological factors such as temperature, precipitation and humidity played a role in the incidence of TPF.     

玉溪红塔区212株甲型副伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)结果分析

[目的]了解玉溪红塔区甲型副伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)基因型和流行优势型,为探讨传播途径、追踪传染源和确定流行范围等提供依据。[方法]利用XbaⅠ酶切染色体DNA进行PFGE分析。[结果]212株甲型副伤寒沙门菌共分为13种PFGE型,其中0002型123株,占58.02%,0003型46株,占21.7%,0001型32株,占15.1%,0007型2株,占0.94%,其余9个型各1株,分别占0.47%。其中优势型为0002型、0003型和0001型,这3种带型的菌株占到分离菌株的94.8%,并在不同月份和绝大部分乡镇中出现。菌株的带型变化在l～3条范围内,表明红塔区甲型副伤寒沙门菌变异不大,有可能是同一克隆系的甲型副伤寒沙门菌。[结论]红塔区甲型副伤寒沙门菌分离株PFGE型别集中,存在同型菌株的广泛流行。另外10种菌型少见,可能与红塔区甲型副伤寒高度散发有关。     

2018-2019年昆明市发热呼吸道综合征患者人呼吸道腺病毒的初步基因分型及流行特征分析

目的 了解2018-2019年云南省昆明市人呼吸道腺病毒(human adenovirus,HAdV)流行病学特征及其基因分型特征,为下一步防控工作提供科学依据.方法 对云南省2018年1月1日-2019年12月31日昆明市6家哨点医院收集的650份发热呼吸道综合征监测病例标本进行实时逆转录-聚合酶链反应(real-t...     

2021年云南省手足口病病例中柯萨奇病毒A2型的测序定型和基因特征分析

目的对2021年云南省昆明市及曲靖市手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)病例中非肠道病毒A组71型(enterovirus A71, EVA71)和非柯萨奇病毒A组16型(coxsackie-virus A16, CVA16)的其他肠道病毒进行VP4/VP2区及VP1区基因测序检测, 并对检测到的CVA2 VP1区基因进行基因进化分析, 为CVA2的预防及控制提供实验室证据。方法按《手足口病实验室手册(2018年版)》, 对2021年昆明市和曲靖市送到云南省疾病预防控制中心HFMD实验室的标本进行前处理, 提取病毒RNA后, 先用MD91/OL68-1引物扩增肠道病毒VP4/VP2结合区基因并测序, 编辑后的序列在GenBank上搜索确定病毒型别, 再用肠道病毒A组引物分两段扩增CVA2 VP1区基因完整序列并测序, 通过肠道病毒在线定型工具(Enterovirus Genotyping tool Version 0.1)进行病毒型别确认。按文献下载CVA2 VP1区基因型/亚型代表株序列, Mega5.2软件构建基因进化树, 分析病毒基因特...