传染病暴发或流行的探测、监测和预警

传染病继续成为全球发病死亡主要原因之一,影响公众健康生命、社会经济发展甚至国家安全。早期探测重点是及时、敏感地发现传染病暴发流行异常信息,并进行现场调查和核实,也是有效监测、预警系统的前期;有效监测、预警系统能够全面准确地认识特定传染病暴发流行可能发生的事实条件、驱动因素和传播链,并提出科学有效预防控制策略措施;因衡量收集具体数据的资源支撑和价值大小,难以及时、完整、准确地获得流行病学、病原学等数据信息。本文综述传染病早期探测、有效监测、有效预警理论技术,整合利用中国有效传染病监测预警体系和多时空节点触发与多学科渠道监测暴发流行情况、病因、风险、过程和驱动因素的多源数据,构建运行敏感特异、分期度量的中国（急性）传染病监测、预警和响应创新技术体系,为加强新发重大传染病和传染病突发公共卫生事件监测预警、避免应对不力传染病蔓延与防止过度响应资源浪费提供依据。     

昆明地区2018-2020年腹泻患者中艰难梭菌感染特征分析

目的对2018-2020年昆明地区腹泻患者中艰难梭菌感染特征进行分析, 为后续监测和防治提供数据支持。方法收集2018-2020年云南省4家哨点医院腹泻患者粪便标本共388份, 使用实时荧光定量PCR方法进行艰难梭菌粪便毒素基因检测, 对结果阳性的粪便标本进行菌株的分离, 用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱鉴定菌株。提取分离菌株的基因组DNA进行多位点序列分型(MLST)。分析毒素阳性和菌株分离阳性与患者的临床特征以及艰难梭菌阳性与其他病原共感染的情况。结果 388份粪便标本中, 艰难梭菌内参tpi基因阳性标本47份, 总阳性率为12.11%。其中, 非产毒艰难梭菌4份(8.51%), 产毒艰难梭菌43份(91.49%)。47份阳性标本分离得到18株艰难梭菌, 阳性标本的分离率为38.30%。其中tcdA、tcdB、tcdC、tcdR和tcdE基因均为阳性的菌株14株。18株艰难梭菌的二元毒素均为阴性。所有分离菌株的MLST结果共形成10种序列型(ST), 其中ST37型5株(27.78%);ST129、ST3、ST54和ST2型各2株;ST35、ST532、ST48、ST27和ST3...     

云南省宁蒗县地震灾区震后重点传染病风险评估分析

目的分析云南省宁蒗县地震灾区震后重点传染病的发生、传播风险及影响,为震区灾后传染病防控工作提供依据。方法收集并分析2007-2012年（截至6月24日）震前灾区的甲乙丙类传染病疫情数据;通过风险评估常用方法分析地震灾害对灾区传染病发生、传播可能产生的影响并对灾区重点传染病的发生和传播划分风险等级,提供防控建议。结果2007至2012年,宁蒗县主要报告病种为乙型病毒性肝炎和肺结核;其次是流行性腮腺炎、甲型病毒性肝炎和细菌性痢疾。综合评估判定细菌性痢疾和感染性腹泻在灾区发生局部暴发或流行的风险极高;甲肝、伤寒副伤寒和流行性感冒在灾区发生和流行的风险为中等至较高;肺结核、麻疹、风疹、手足口病、流行性腮腺炎风险为低至中等。结论灾后重点防控的疾病是肠道传染病,其次是呼吸道传染病。     

云南省发现1株携带NDM-1基因的产酸克雷伯菌

目的 研究1株产酸克雷伯菌的相关耐药机制。 方法 对菌株进行了生化鉴定、PCR检测、序列测定、药敏试验。 结果 经过鉴定,证明此菌株为携带NDM-1基因的产酸克雷伯菌;但不是多重耐药菌。 结论 耐药问题形势严峻,需要加强监测力度。     

云南省2007-2011年学校突发公共卫生事件分析

目的 了解云南省学校突发公共卫生事件的流行特点,为有效预防和控制学校突发公共卫生事件提供科学依据.方法 应用描述性流行病学方法,对云南省2007-2011年通过网络报告的学校突发公共卫生事件资料进行统计分析.结果 2007-2011年云南省共报告学校突发公共卫生事件660起,占同期突发公共卫生事件报告起数的65.02％(660/1 015).学校突发公共卫生事件以传染病事件为主,占总起数的89.09％ (588/660),呼吸道传染病占传染病事件数的84.18％ (495/588);报告事件数最多的是2009年,占总报告起数的35％ (231/660);出现2个发病高峰期,分别为4-6月和9-12月;农村学校的事件数和发病数均高于城市学校,死亡病例仅出现在乡镇学校.结论 学校突发公共卫生事件频发,应更加关注学校卫生工作,特别是农村学校的传染病预防控制.加强突发公共卫生事件的监测和及时预警是关键.     

2021年昆明市手足口病流行病学和肠道病毒病原谱特征

目的 了解昆明市手足口病(Hand, foot and mouth disease, HFMD)流行病学和肠道病毒(Enterovirus, EV)病原谱特征。方法 通过中国传染病报告信息管理系统收集2021年昆明市HFMD病例信息进行描述性流行病学分析；采集部分HFMD病例标本，采用荧光定量PCR检测肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)、柯萨奇病毒A16型(Coxsackievirus A16,CVA16)、CVA6和其他EV,采用一步法RT-PCR对其他EV进行扩增和基因型鉴定；构建各基因型EV与参考株的VP1区全基因序列系统进化树，分析亲缘性。结果 2021年昆明市HFMD报告发病率为103.72/10万(8 804例),其中0-4岁、5-9岁、10-14岁、≥15岁分别为8 724.75/10万、1 649.25/10万、29.08/10万、9.35/10万，主城区、郊县分别为524.10/10万、965.68/10万。HFMD病例标本的EV检测阳性率为63.15%(538/852);在538株EV中，CVA16、CVA6、EV71、CVA4、CVA2、CV...     

2019年云南省文山州柯萨奇病毒A16型的基因特征

  目的  对云南省文山州2019年手足口病（hand，foot and mouth disease，hfmd）病原分离情况和14株柯萨奇病毒a16型（coxsackievirus a16，cv-a16）的基因特征进行分析。  方法  对文山州2019年hfmd实验室送到云南省疾病预防控制中心hfmd实验室的595份手足口病患者粪便标本进行病毒分离，并对分离到的74株肠道病毒（enterovirus，ev）vp1区基因进行扩增和测序定型，对cv-a16病毒进行基因特征和分子流行病学分析。  结果  共从595份标本中分离到74株ev，ev分离率为12.44%（74/595），其中a组病毒（enterovirus species a，ev-a）72株，占97.30%（72/74），ev-b组病毒2株，占2.70%（2/74），未分离到ev-c和ev-d组病毒。ev-a组病毒中，cv-a6病毒最多，共44株，占ev-a组分离数的61.11%（44/72），cv-a16次之，共14株，占ev-a组病毒的19.44%（14/72），ev-a10 9株，占12.50%（9/72）。基因进化分析表明，14株cv-a16均为b1基因亚型（subgenotype b1）。它们分为2个不同的进化分支（b1a和b1b），其中8株为b1a，6株为b1b。  结论  2019年文山州hfmd病原以cv-a6组为主，cv-a16次之。cv-a16病毒b1a和b1b两个分支同时在文山州流行。     

2017年云南省流感病毒监测及甲型H1N1流感病毒血凝素基因特征分析

目的 了解2017年云南省流感病毒的流行情况和甲型H1N1流感病毒的血凝素（HA）基因分子特征。方法 对2017年云南省流感监测哨点医院采集的21 672份标本使用real - time RT - PCR方法检测流感病毒,核酸阳性标本使用MDCK细胞进行病毒分离,采用血凝素凝集试验及抑制试验进行病毒抗原性分析。选取12株抗原性变异较大的甲型H1N1流感毒株进行基因测序,使用MEGA软件分析其HA基因特征。结果 2017年共检出流感核酸阳性标本2 372份,分离出流感毒株1 180株,全年共有2个流行高峰,H3亚型和甲型H1N1亚型交替成为优势株,BY亚型和BV亚型共同流行。毒株分离高峰与ILI%高峰基本一致。甲型H1N1流感病毒ＨＡ基因无明显变异,疫苗株仍具有保护作用。结论 继续加强监测力度,提高监测敏感性并做到及时预警,控制流感流行风险。