1995-2006年云南省狂犬病流行情况及防制对策

目的 分析近年来云南省狂犬病流行特征,探讨发病率回升的因素及存在问题并提出相应的防制措施.方法 对1995-2006年云南省狂犬病疫情报告、病例调查及监测资料进行分析.结果 1995-2006年云南省狂犬病发病95例,死亡95例,病死率100%.除1995、1996、1998年3年无病例报告外,其余各年均有病例发生,发病呈逐年增长趋势,以5～10月份相对较多,占73.7%.全省有11个州(市)报告病例,其中文山、曲靖、德宏等3个州(市)是主要发病地区,集中了79%的病例.发病最多为农民(52.6%),其次是学生(23.2%);年龄最小的2岁,最大的65岁,男女性别比为2.5:1.病例以犬伤为主,70%以上未进行任何伤口处理和免疫接种.结论 云南省狂犬病呈快速增长趋势.领导重视不够,犬只数量增多且缺乏监管,犬只免疫率极低,伤后大多未进行伤口处理和免疫接种等是狂犬病发病率回升的主要原因,今后应加强以上各方面的工作.     

2006年云南省部分地区健康人群流脑带菌状况调查

目的了解云南省健康人群中脑膜炎奈瑟菌菌群变迁情况。方法采用横断面调查,按整群抽样的方法,流脑流行期在云南省3个地州6个年龄组健康人群分别采集咽拭子进行脑膜炎奈瑟菌的分离;用乳胶凝集、血清分型、生化试验对所分离到菌株进行鉴定。结果共采集1249份健康人群咽拭子,共分离出21株脑膜炎奈瑟菌（A群5株、B群8株、C群7株、1892群1株）,阳性率为1.68%。结论云南省2006年健康人群流脑整体带菌水平相对较低,带菌菌群以B、C群为主。     

云南省2005-2012年91株甲型副伤寒沙门菌病原学特征分析

目的通过对分离自云南省不同地区、不同年份的甲型副伤寒沙门菌进行病原学分析研究,弄清云南省甲型副伤寒的流行特征,为查明云南省甲型副伤寒高发原因提供科学依据。方法采用K—B纸片扩散法对所有菌株进行药物敏感试验;采用脉冲场凝胶电泳（PFGE）对菌株进行分子分型研究。结果91株甲型副伤寒沙门菌药敏试验结果表明,大多数菌株对常用多种抗生素敏感,但有部分地区的菌株出现三重及多重耐药。所有菌株的PFGE结果显示,91株甲型副伤寒沙门菌Xba I酶切结果可分为两个大的聚类群,而且经Xba I和Spe I双酶切证实云南省不同地区、年份分离的菌株具有较高的同源性关系。结论云南省的甲型副伤寒沙门菌具有2种类型的优势菌株,并且具有较高的同源性关系,提示云南省不同地区、年份的甲型副伤寒的流行可能具有相似的传播途径,而菌株的药敏试验结果则能给临床治疗提供用药参考依据。     

中国五省份卫生实验室体系整体能力标准化评估

目的调查五省卫生实验室体系能力现状,为我国卫生实验室体系建设和管理提供实证。方法按GDP随机选5省,以WHO实验室评估工具评估省市县三级共70家疾控及临床实验室12个模块及38项具体能力。结果对于所有实验室,全部12个模块平均分82.40(良)。评为优的模块5个(41.7%),良6个(50.0%),中1个(8.3%)。38项具体能力中,未达到良的5项(占13.2%)。GDP较低与较高地区相比,4个模块(33.3%)得分有显著性差异(P0.05)。结论我国卫生实验室体系总体能力水平良好,唯一整体欠缺是公共卫生职能,其源于GDP较低地区公共卫生监测、反应、报告、样品处置等方面的能力欠缺。     

云南省伤寒副伤寒空间分布特征及其气候影响因素研究

目的 分析云南省2001-2007年伤寒副伤寒发病的空间分布特征以及气象因素与伤寒副伤寒流行的关联性.方法 收集2001-2007年云南省以县为单位的伤寒副伤寒发病数据,应用空间聚类、面板数据模型等方法分析伤寒副伤寒的分布特征,以及伤寒副伤寒流行与气温、降水、相对湿度等气象因素的关系.结果 2001-2007年云南省伤寒副伤寒的年均发病率为23.11/10万,病例主要分布于夏秋季.空间聚类分析发现两个伤寒副伤寒的高发聚集区:玉溪地区(7年平均发病率207.45/10万)及该省与缅甸、老挝交界地区.多因素面板数据分析显示,云南省伤寒副伤寒发病增加与气温升高、降水量增多和湿度增加等气候因素相关:月平均气温升高10℃,IRR=1.30(95%CI:1.24～1136);湿度增加10%,IRR=1.07(95%CI:1.05～1.09);月降水量增多100 mm,IRR=1.02(95%CI:1.00～1.03);前1个月的气温升高10℃,IRR=1.73(95%CI:1.64～1.82);P＜0.05.结论 云南省伤寒副伤寒发病存在聚集区,相对湿度等气候因素在流行中发挥了一定的作用.

Abstract：

Objective To characterize the spatial distribution of typhoid and paratyphoid fever(TPF)in Yunnan province, China and to determine the effectiveness of meteorological factors on the epidemics of TPE Methods Data of reported TPF cases in Yunnan province(2001 -2007)from the China Information System for Diseases Control and Prevention was applied to GIS-based spatial analyses to detect their spatial distribution and clustering of TPF incidence at the county level.Panel data analysis was used to identify the relationships between the TPF incidence and meteorological factors including monthly average temperature, monthly cumulative precipitation and monthly average relative humidity. Results During the study period, the average incidence of TPF in Yunnan province was 23.11/100 000, with majority of the TPF cases emerged in summer and autumn. Although widely distributed, two TPF clusters were detected in Yunnan province based on the spatial analysis:one area around Yuxi city with the average annual incidence as 207.45/100 000 and another at the junctions of Yunnan province with Burma and Laos. Based on results from panel data analysis, the incidence of TFP was shown to be associated with meteorological factors such as temperature,precipitation, relative humidity and one month lag of temperature increase [10 ℃ increase in the monthly average temperature:IRR=1.30(95%CI: 1.24-1.36);10% increase in monthly average relative humidity:IRR= 1.07(95%CI: 1.05-1.09); 100 mm rise in monthly cumulative precipitation:IRR=1.02(95%CI: 1.00-1.03); and 10 ℃ average temperature increase, the last month: IRR=1.73(95%CI: 1.64-1.82)]. Conclusion Areas with high TPF incidence were detected in this study,which indicated the key areas for TPF control in Yunnan province. Meteorological factors such as temperature, precipitation and humidity played a role in the incidence of TPF.     

1998年-2008年潋江县伤寒、副伤寒疫情动态分析

[目的]了解潋江县伤寒、副伤寒的流行趋势,掌握其流行规律,为制定预防和控制伤寒、副伤寒的措施提供依据。[方法]对潋江县1998年～2008年伤寒、副伤寒资料进行统计分析。[结果]潋江县1998年～2004年伤寒、副伤寒发病率呈上升趋势,2004年达高峰;2004年～2008年呈下降趋势,年均发病率为119．48／10万;地区分布主要以坝区为主;季节分布集中在4月～8月份;人群分布以农民和学生为主;发病年龄主要集中在10岁～50岁组。[结论]及时发现和控制传染源、加强农村饮用水卫生的监测和管理力度、加强对重点人群的发热症状监测,并采取综合的防治手段,是控制潋江县伤寒、副伤寒流行的主要措施。     

云南省伤寒副伤寒空间分布特征及其气候影响因素研究

Objective To characterize the spatial distribution of typhoid and paratyphoid fever(TPF)in Yunnan province, China and to determine the effectiveness of meteorological factors on the epidemics of TPE Methods Data of reported TPF cases in Yunnan province(2001 -2007)from the China Information System for Diseases Control and Prevention was applied to GIS-based spatial analyses to detect their spatial distribution and clustering of TPF incidence at the county level.Panel data analysis was used to identify the relationships between the TPF incidence and meteorological factors including monthly average temperature, monthly cumulative precipitation and monthly average relative humidity. Results During the study period, the average incidence of TPF in Yunnan province was 23.11/100 000, with majority of the TPF cases emerged in summer and autumn. Although widely distributed, two TPF clusters were detected in Yunnan province based on the spatial analysis:one area around Yuxi city with the average annual incidence as 207.45/100 000 and another at the junctions of Yunnan province with Burma and Laos. Based on results from panel data analysis, the incidence of TFP was shown to be associated with meteorological factors such as temperature,precipitation, relative humidity and one month lag of temperature increase [10 ℃ increase in the monthly average temperature:IRR=1.30(95%CI: 1.24-1.36);10% increase in monthly average relative humidity:IRR= 1.07(95%CI: 1.05-1.09); 100 mm rise in monthly cumulative precipitation:IRR=1.02(95%CI: 1.00-1.03); and 10 ℃ average temperature increase, the last month: IRR=1.73(95%CI: 1.64-1.82)]. Conclusion Areas with high TPF incidence were detected in this study,which indicated the key areas for TPF control in Yunnan province. Meteorological factors such as temperature, precipitation and humidity played a role in the incidence of TPF.     

云南省2021年手足口病病例8株埃可病毒18型分离株基因特征

目的 分析云南省2021年手足口病(Hand, foot, and mouth disease, HFMD)病例埃可病毒18型(Echovirus 18,E18)分离株基因特征。方法 从2021年云南省2个市州HFMD病例粪便标本中分离E18;对VP1区基因进行扩增、测序和拼接,获得全序列;构建E18分离株与GenBank中参考株的系统进化树,分析基因特征。结果 从HFMD病例中获得8株E18分离株,其完整VP1区序列的核苷酸、氨基酸同源性分别为96.75%-99.77%、97.21%-100%;与原型株Metcalf相比的核苷酸、氨基酸同源性分别为77.24%-78.63%、91.99%-93.73%。基于VP1区分型,8株分离株均属于基因型5分支2,且在VP1区存在特有的氨基酸位点变异(T80A、I240V、T274S和H281R)。结论 本研究E18分离株属于基因型5,可能在环境中循环了一段时间。需进一步加强HFMD病例E18监测和分子生物学特征研究。     

SARS-CoV-2 Omicron变异株TaqMan探针法荧光定量RT-PCR的建立及应用

目的开发和评估一种快速、简单和经济的替代测序的Omicron变异株荧光定量RT-PCR(RT-qPCR)。方法针对SARS-CoV-2 ORF1ab保守区域、Omicron变异株S基因高频共同突变位点设计引物和TaqMan探针, 建立Omicron株RT-qPCR检测方法, 用经全基因组测序确定型别的样本进行验证, 并对该方法的特异度和敏感度进行评估。结果本研究建立的RT-qPCR分型法可以将Omicron变异株与包括早期A型流行株、Alpha和Delta变异株在内的SARS-CoV-2毒株进行区分, 结果与全基因组测序结果一致, 符合率为100.00%(28/28);与其他6种呼吸道病毒及柯萨奇病毒A组16型无交叉反应;该方法RNA标准品在109～103拷贝/μl之间呈良好的线性关系, 相关系数R2均大于0.99, 检测敏感度为103拷贝/μl。结论本研究设计的针对Omicron变异株的RT-qPCR敏感度高且特异度好, 在任何可以进行PCR检测的实验室中都容易开展, 可极大地促进对Omicron变异株的传播监测。     

传染病暴发或流行的探测、监测和预警

传染病继续成为全球发病死亡主要原因之一,影响公众健康生命、社会经济发展甚至国家安全。早期探测重点是及时、敏感地发现传染病暴发流行异常信息,并进行现场调查和核实,也是有效监测、预警系统的前期;有效监测、预警系统能够全面准确地认识特定传染病暴发流行可能发生的事实条件、驱动因素和传播链,并提出科学有效预防控制策略措施;因衡量收集具体数据的资源支撑和价值大小,难以及时、完整、准确地获得流行病学、病原学等数据信息。本文综述传染病早期探测、有效监测、有效预警理论技术,整合利用中国有效传染病监测预警体系和多时空节点触发与多学科渠道监测暴发流行情况、病因、风险、过程和驱动因素的多源数据,构建运行敏感特异、分期度量的中国（急性）传染病监测、预警和响应创新技术体系,为加强新发重大传染病和传染病突发公共卫生事件监测预警、避免应对不力传染病蔓延与防止过度响应资源浪费提供依据。