河弧菌可移动遗传元件的预测与分析

  目的  研究河弧菌中可移动遗传元件的种类和分布，探究其对河弧菌适应性进化的意义。  方法  从公共数据库中获取170株河弧菌的基因组数据，使用MGEfinder软件识别河弧菌中的可移动遗传元件，并对其种类、插入活性、分布及毒力因子进行研究。  结果  170株河弧菌基因组中共识别到1 227个可移动遗传元件。 这些元件可归类为完整噬菌体、不完整噬菌体、插入序列、含有第二类内含子的元件、含有丝氨酸/酪氨酸重组酶的元件、含有末端重复序列和编码基因的元件、只含有编码基因的元件以及不含任何开放读码框的元件共8类。 317个代表性元件序列簇中有307个转座活性都较低，但高转座活性的可移动遗传元件在河弧菌中分布更广泛。 可移动遗传元件携带的编码基因的功能主要涉及基因复制、重组、修复，以及基因转录等。 可移动遗传元件在环境分离株和临床分离株的分布没有差异。 在插入序列、含有丝氨酸/酪氨酸重组酶的元件、含有末端重复序列和编码基因的元件以及只含有编码基因的元件这4种可移动遗传元件中识别到多种毒力因子，且不同的可移动遗传元件携带的毒力因子不同。  结论  河弧菌含有多种类型、多种功能的可移动遗传元件，表现出以高转座活性可移动遗传元件为主导的适应性进化特征。     

水苏糖对艰难梭菌在小鼠肠道内定植与菌群的影响

目的利用艰难梭菌感染(CDI)小鼠模型,评价水苏糖是否具有抑制小鼠肠道内艰难梭菌定植的作用,并分析其对肠道菌群结构的影响。方法将C57BL/6雌鼠随机分为3组,其中不做任何处理的设定为空白对照组,水苏糖干预组和磷酸盐缓冲液(PBS)模型组在建立CDI小鼠模型后分别连续10 d每日给予水苏糖和PBS灌胃处理。利用荧光定量聚合酶链式反应(PCR)检测感染后第10 d各组小鼠粪便中艰难梭菌的含量,并利用16S rRNA基因测序分析各组小鼠肠道菌群结构的变化。结果水苏糖干预导致CDI小鼠粪便中艰难梭菌含量显著降低。水苏糖干预组小鼠粪便的菌群丰富度显著高于PBS模型组,但没有恢复到空白对照组的水平。在门水平上,水苏糖干预可导致CDI小鼠粪便的拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)的相对丰富度显著增高,变形菌门(Proteobacteria)的相对丰富度显著降低。在种水平上,水苏糖干预导致CDI小鼠粪便中格氏副拟杆菌(Parabacteroides goldsteinii)、汉森氏布氏菌(Blautia hansenii)、多形拟杆菌(Bacteroides thetaiotaomicron)的相对丰度显著增高;Parasutterella excrementihominis、狄氏副拟杆菌(Parabacteroides distasonis)的相对丰度显著降低。结论水苏糖干预可有效降低CDI小鼠肠道内艰难梭菌定植量,增加CDI小鼠肠道微生物丰富度,特异性地改变多形拟杆菌和格氏副拟杆菌等菌种的相对丰度。     

胸内食管胃机械吻合并发症分析

胸内食管胃机械吻合并发症分析高俊，黄元铭，高佩文ＧＦ－Ⅰ型吻合器在食管癌贲门癌手术中应用日益广泛，可明显缩短手术时间，降低吻合口并发症，但仍时有发生。现结合我们的病例就并发症发生的原因进行分析讨论如下：临床资料１９８２～１９９１年间我们为２３７１例食...     

甲型H1N1流感病毒感染对小鼠肺损伤及肠道菌群的影响

  目的  观察甲型H1N1流感病毒感染小鼠的一般状态、病毒载量、肺肠组织病理及肠道菌群的动态变化。  方法  用流感病毒A/PR/8(H1N1)滴鼻感染C57BL/6J小鼠,留取感染后第3、7天肺和结肠组织以及感染第0、3、7天粪便,记算肺指数,测量结肠长度、重量,采用实时荧光定量PCR法检测肺组织病毒载量,HE染色观察肺、结肠病理,16S rRNA法检测粪便菌群。  结果  感染组较空白组小鼠体重减轻,活动减少,第3天肺组织病毒载量显著升高,肺指数升高,肺病理出现损伤,结肠长度缩短,结肠病理未见明显损伤;第7天肺病毒载量有所下降,肺指数显著升高,肺组织病理损伤严重,结肠长度进一步缩短,结肠病理未见显著炎症。 感染后第3天粪便菌群乳酸菌丰度下降,第7天乳酸菌属丰度显著下降,志贺菌、肠球菌属显著升高。  结论  甲型流感病毒感染导致小鼠进食量减少、体重降低、肺组织病毒载量升高、肺组织病理损伤,同时引起结肠长度缩短,肠道菌群失调。     

植物乳杆菌DOMLa对创伤弧菌诱导炎症反应的抑制作用

目的 观察植物乳杆菌DOMLa对创伤弧菌诱导小鼠腹腔巨噬细胞产生细胞因子和细胞毒作用的影响,探讨其在协助机体抵抗细菌感染以及对过强炎性反应的影响。方法 选择合适剂量的创伤弧菌感染小鼠腹腔巨噬细胞,同时加入不同剂量的植物乳杆菌DOMLa共培养。作用3 h后,采用乳酸脱氢酶释放法检测细胞毒作用,酶联免疫吸附试验检测相关细胞因子的释放量。结果 在MOI=100时,植物乳杆菌DOMLa显著降低创伤弧菌的细胞毒作用,明显抑制了创伤弧菌诱导的三种促炎细胞因子IL-6、IL-1β、TNF-α的产量。结论 植物乳杆菌DOMLa可降低创伤弧菌对小鼠腹腔巨噬细胞的细胞毒作用,并可减轻病原菌诱导巨噬细胞的过强炎症反应。该植物乳杆菌对宿主免疫细胞的其他作用和影响还有待进一步研究。     

姜黄素抑制猪链球菌诱导的炎症反应的体外研究

目的观察姜黄素对猪链球菌诱导的小鼠脾细胞促炎性细胞因子的影响,探讨姜黄素对猪链球菌引起的急性中毒性休克的干预作用。方法采用乳酸脱氢酶释放法检测猪链球菌和姜黄素的细胞毒作用,酶联免疫吸附试验和流式细胞术检测相关炎症因子。结果所选剂量猪链球菌和姜黄素均未发现明显细胞毒作用。猪链球菌诱导脾细胞产生了促炎性细胞因子IL-6、TNF-α、IL-12和较高剂量的IFN-γ以及少量的IL-1β,同时也产生了抗炎因子IL-10。姜黄素对促炎因子都有抑制作用同时降低了促炎因子与抗炎因子的比例。结论姜黄素能够降低猪链球菌诱导小鼠脾细胞产生的促炎因子而发挥抗炎作用。     

河弧菌AL536_RS29525基因功能研究

目的 探讨河弧菌基因组中VflT6SS2核心基因簇上游paar基因簇中AL536_RS29525的序列特征、对VflT6SS2分泌功能和杀菌活性的影响以及可能的调控机制.方法 利用Muscle、GeneDoc软件进行AL536_RS29525基因编码产物的序列特征分析;同源重组技术构建AL536_RS29525的缺失株...     

姜黄素抑制超抗原TSST-1诱导脾细胞炎症因子的作用

目的 观察姜黄素对毒性休克综合征毒素-1(TSST-1)诱导的小鼠脾细胞炎症因子的影响,为进一步探讨姜黄素对炎症性休克的作用提供依据。方法 采用乳酸脱氢酶(LDH)释放法检测不同剂量的TSST-1和姜黄素的细胞毒作用,ELISA和流式细胞术检测相关炎症因子。结果 所选剂量TSST-1和姜黄素均未发现有明显细胞毒作用。TSST-1诱导脾细胞产生了大量的IFN-γ和IL-2,产生了少量的TNF-α,未能诱导出IL-1β、IL-6和IL-12。TSST-1诱导的Th1细胞因子产生不完全依赖于IL-12。姜黄素对IFN-γ和TNF-α的抑制作用与剂量有关,在15 μmol/L抑制效果最显著(P<0.05),但对IL-2无显著抑制作用(P>0.05)。结论 姜黄素能显著降低TSST-1诱导小鼠脾细胞产生的IFN-γ和TNF-α,但对T细胞增殖无明显抑制作用。     

甲型流感病毒H1N1感染致小鼠肠道损伤机制的研究

目的 观察甲型流感病毒H1N1感染小鼠的一般状态、肺组织病理、肠组织病理、结肠转录组、肠内容物代谢组的变化，探究甲型流感病毒H1N1感染致小鼠肠道损伤的机制。方法 用流感病毒PR8感染C57BL/6J小鼠，留取感染后第7天肺组织、结肠组织和盲肠内容物，计算肺指数，测量结肠长度，采用苏木素–伊红染色观察肺、肠组织病理，RNA-seq法进行结肠转录组测序，非靶向代谢组学检测盲肠内容物。结果 感染模型组小鼠较空白对照组小鼠体质量减轻、活动减少，肺指数增加，结肠长度缩短，肺、结肠组织病理出现损伤。空白对照组和感染模型组小鼠共有1 609个差异基因，437个差异代谢物，这些差异基因和差异代谢物共同富集到的通路包括花生四烯酸代谢通路和色氨酸代谢通路。结论 甲型流感病毒感染可能通过改变小鼠结肠内基因表达水平和盲肠内的代谢产物造成小鼠肠道损伤。     

基于转录组测序技术分析中医三阳合治法减轻流感病毒致小鼠结肠损伤的作用机制

目的应用转录组测序技术研究麻杏石甘汤合小柴胡汤(以下称"三阳合治")减轻流感病毒感染小鼠结肠损伤的作用机制。方法甲型流感病毒H1N1滴鼻诱导流感病毒致小鼠结肠损伤模型。小鼠分为空白组、模型组和三阳合治组, 每组10只小鼠。模型组、三阳合治组分别以PBS、麻杏石甘汤合小柴胡汤灌胃, 7天后取各组小鼠结肠组织, 观察结肠长度及结肠病理损伤情况, 并进行转录组测序, 筛选三阳合治组与模型组显著差异基因进行GO、KEGG和GSEA分析。结果三阳合治干预后显著改善了小鼠的结肠长度, 减轻了结肠病理损伤。三阳合治组与模型组有92个显著差异表达基因, GO分析提示差异基因富集于细胞因子和趋化因子产生的调节、炎症应答、防御反应、免疫反应、NIK/NF-κB信号的调节以及MAPK级联等生物过程, 以及刷状缘膜、刷状缘、微绒毛等与肠道屏障相关的细胞组分。KEGG分析提示差异基因富集于Toll样受体信号通路、产生IgA的肠道免疫网络、补体和凝血级联以及PPAR信号通路等。GSEA分析提示产生IgA的肠道免疫网络、PPAR信号通路以及丙酸代谢和丁酸盐代谢等在三阳合治干预后显著上调, 而凋亡和MAPK信号通路在...