双向电泳和质谱技术分析HCV NS3转化肝细胞的蛋白质组

目的:持续感染丙型肝炎病毒(HCV)在肝细胞癌(HCC)发生中起重要作用,细胞转染和成瘤实验表明HCV NS3对人肝细胞具有转化作用和致瘤活性.本实验旨在探讨HCV非结构蛋白3(NS3)转化肝细胞的蛋白质组.方法:构建稳定表达HCV NS3 N端多肽的人肝细胞(pRcHCNS3/QSG)及空白质粒转染细胞(pRcCMV/QSG),双向电泳技术分离两种细胞的总蛋白,差异蛋白质点进行质谱分析,Western印迹验证蛋白表达差异.结果:得到分辨率较高、重复性较好的双向电泳图谱.pRcHCNS3/QSG和pRcCMV/QSG细胞的蛋白质斑点数分别为(1 183±77)和(1 095±82)个,两组平均匹配数为(920±60)个.初步鉴定出15个有意义的蛋白质点.其中Ras,P38,HD53等参与调节信号转导的蛋白在pRcHCNS3/QSG细胞中表达上调,Western印迹结果亦证实pRcHCNS3/QSG细胞中磷酸化的P44/42和P38表达增加.鉴定出的差异蛋白质还包括一些调节细胞周期、免疫反应、与肿瘤侵袭和转移相关的蛋白质及参与肝脏代谢的蛋白质.结论:HCV NS3可能通过影响多种蛋白表达,经相应信号转导途径,如丝裂原活化蛋白激酶途径,使细胞发生恶性转化.进一步弄清信号转导过程和相互关系不仅对了解HCV相关性HCC的发生机制有重要意义,而且为从分子水平治疗HCC提供新思路.     

放疗诱导鼻咽癌细胞株CNE1热休克蛋白高表达

目的鼻咽癌是一种以放射治疗为主的头颈肿瘤,但部分鼻咽癌对放疗耐受。为了解鼻咽癌放疗耐受机制,本实验拟初步探讨人高分化鼻咽癌细胞株CNE1放疗后的蛋白质改变。方法利用固相pH梯度二维凝胶电泳,建立CNE1放疗前后总蛋白质2DE图谱,利用MALDI TOF MS及数据库搜索初步分析和鉴定部分放疗前后差异蛋白质点。结果高分子量酸性蛋白质在CNE1放疗后20min高表达,其中大多为热休克蛋白质HSPs(heatshockproteins,HSPs)。结论放射能诱导CNE1的热休克蛋白高表达,它们可能与鼻咽癌放疗耐受有关。     

鼻咽癌转移相关的分泌蛋白质的筛选

目的：筛选鼻咽癌（nasopharyngeal carcinoma, NPC）转移相关的分泌蛋白质,为阐明NPC转移机制以及筛选NPC转移分子标志物提供实验依据。方法：应用二维凝胶电泳（two-dimensional electrophoresis,2-DE）技术分离一对来自同一亲本,具有不同转移潜能的NPC细胞系5-8F和6-10B细胞的分泌蛋白质,图像分析识别差异表达的蛋白质点,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)和电喷雾-四极杆-串联质谱(ESI-Q-TOF MS/MS)对差异表达的蛋白质点进行鉴定。Western印迹法检测差异分泌蛋白质nm23-H1在两株细胞中的表达水平。结果：建立了5-8F和6-10B分泌蛋白质的2-DE图谱,质谱分析鉴定出14个非冗余的分泌蛋白质,其中Oncoprotein18等蛋白质在高转移潜能NPC细胞系5-8F中的表达水平高于无转移潜能的NPC细胞系,而nm23-H1等蛋白质在5-8F细胞系中的表达水平低于6-10B细胞系。Western印迹分析证实了nm23-H1在5-8F和6-10B细胞分泌蛋白质中的差异表达水平。结论：所鉴定的14个非冗余的差异分泌蛋白质为研究NPC转移机制以及筛选NPC转移分子标志物提供了实验依据。     

基于生物质谱的定量蛋白质组学分析策略

生物质谱技术作为蛋白质组学研究的关键技术 ,在定量蛋白质组学分析中起着十分重要的作用。目前基于生物质谱的定量蛋白质组学分析策略主要有 :荧光染色差异显示双向电泳、同位素代谢标记、同位素亲和标记 ,氨基酸化学标记和肽质图谱差异比较等     

染色体3p12-14区域一个肺癌负相关新基因的初步鉴定

染色体 3ｐ的纯合性缺失 (ｈｏｍｏｚｙｇｏｕｓｄｅｌｅｔｉｏｎ ,ＨＤ)和杂合性丢失 (ｌｏｓｓｏｆｈｅｔｅｒｏｚｙｇｏｓｉｔｙ ,ＬＯＨ)与包括肺癌、鼻咽癌等在内的多种人类实体肿瘤相关。 3ｐ1 2 - 1 4、3ｐ2 1、3ｐ2 5- 2 6是肺癌中缺失频率最高的染色体位点。有研究证明 ,3ｐ的缺失是肺癌变过程中最早发生的遗传学改变 ,发生在肺癌变过程的增生、间变期病变 ,提示染色体 3ｐ可能存在多个与肺癌癌变启动机制相关的抑瘤基因。目的和方法 :为了鉴定、克隆人类染色体 3ｐ1 2 - 1 4区域与肺癌相关的新基因。我们利用生物信息学方法 ,通过…     

亚细胞蛋白质组学研究

在蛋白质组学研究中首先要应用各种分离技术如双向电泳等将蛋白分离纯化,然后结合质谱技术、生物信息学方法对蛋白质进行鉴定。但细胞内的蛋白质种类繁多,性质多样．丰度差异大,常规蛋白质组学方法不能做到分离和检测细胞中的全部蛋白质。亚细胞蛋白质组学研究的着眼点在蛋白质组的特定成分,而非整个蛋白质组,能够有效弥补目前蛋白质组     

酯型儿茶素单体EGCG和GCG对人肠癌SW480细胞生长抑制作用及其机制

目的　以聚酯型儿茶素 (TS)为阳性对照 ,探讨其单体EGCG和GCG对人肠癌SW480细胞的生长抑制作用及其机制。方法　应用MTT法、软琼脂集落形成试验、Hoechst 3 3 2 5 8染色法和流式细胞术等方法探讨药物对细胞生长抑制作用。结果　单体EGCG和GCG与TS对SW 480细胞均呈剂量依赖性的抑制作用 ,其IC5 0值分别为 10 8 88、183 2 1、83 3 6μg·ml-1;以IC5 0浓度作用于SW 480细胞 2 4h后 ,EGCG、GCG、TS组的集落形成率显著低于对照组 (P <0 0 1) ;Hoechst 3 3 2 5 8染色观察到EGCG、GCG、TS组细胞出现明显的核浓缩或碎裂 ,其凋亡细胞比率显著高于对照组 (P <0 0 1) ;流式细胞术分析亦显示EGCG、GCG、TS组诱导的细胞凋亡率分别为对照组的 1 62、1 2 3、1 66倍。结论　与TS一致 ,EGCG、GCG对肠癌SW480细胞的生长有明显的抑制作用 ,其作用机制可能与诱导细胞凋亡有关。     

缺血预处理对兔肺缺血再灌注性损伤的蛋白质组学研究

目的观察缺血预处理对兔肺缺血再灌注性损伤的蛋白质变化，探讨其可能的肺保护机制。方法12只家兔，随机分为预处理组和对照组，每组6只。对照组经历单纯的缺血再灌注损伤，预处理组在缺血再灌注前予以缺血预处理。以二维电泳分离肺组织中的全部蛋白质，应用PDQuest软件寻找差异表达的蛋白质点并以MALDI-TOF质谱仪和Mascot软件对其鉴定。结果研究发现了35个明显差异表达的蛋白质，包括磷酸肌醇3激酶△催化亚单位在内的17个蛋白质达到了鉴定。结论通过磷酸肌醇3激酶信号传导通路抑制炎性反应可能是缺血预处理的保护机制。     

鼻咽癌成纤维细胞分泌性蛋白质的变化分析

目的 建立细胞分泌性蛋白质组学研究方法,分析鼻咽癌形成过程中成纤维细胞分泌蛋白的变化特征.方法 分别收集5份鼻咽癌和正常鼻咽组织标本,无血清培养成纤维细胞,收集细胞上清液,超滤法脱盐并浓缩上清液中分泌性蛋白,运用双向凝胶电泳(2-DE)技术建立分泌性蛋白表达图谱;并用比较蛋白质组学方法分析2组成纤维细胞分泌蛋白的差异,基质辅助激光解析飞行时间质谱分析鉴定差异蛋白;ELISA分析2组细胞上清液中半乳糖凝集素1的表达.结果 用自建细胞分泌性蛋白2-DE图谱,从2组细胞上清液中筛查出表达差异大于2倍的蛋白质点18个,质谱分析鉴定出11个分泌性蛋白;其中半胱氨酸蛋白酶抑制剂C、补体组分Cls前体、不均一性核糖核蛋白Al在鼻咽癌间质成纤维细胞(CAFs)上清液中表达下调,而其余8个包括半乳糖凝集素1、14-3-3sigma蛋白、组织蛋白酶L等分泌性蛋白在CAFs上清液中表达上调;2组细胞上清液中半乳糖凝集索1分别为(4.95±0.76)ng/ml、(9.90±0.36)ng//ml(CAFs组),二者差异有统计学意义(P＜0.05).结论 鼻咽癌形成过程中成纤维细胞分泌性蛋白的变化涉及细胞信号转导、蛋白合成与降解等途径,CAFs可能通过上述途径调控肿瘤微环境,影响鼻咽癌的发生、发展、侵袭转移;这为今后分泌组学研究奠定了实验基础.