肝细胞癌基因表达谱分析

目的:通过分析肝细胞癌(HCC)基因表达谱改变来探讨HCC发病机制.方法:从GEO数据库中下载HCC基因表达数据GSE14215和GSE29217,采用Genespring 11.0软件分析差异表达基因,运用统合分析(meta-analysis)方法确定共同差异表达基因,利用DAVID、KEGG、String和FABLE等生物信息学软件确定相关的生物学过程、分子功能、相互作用通路等.结果:HCC组织与正常肝组织相比,共同下调、上调的差异表达基因分别是281和227个,其中作为转录因子36个;与文献报道的HCC相关基因一致的有181个.差异表达基因主要与细胞周期调控、代谢调节、药物代谢酶系、DNA的损伤复制、p53和过氧化物酶体增殖物激活受体信号通路(PPAR)等信号通路有关.结论:HCC基因表达谱数据分析表明,细胞周期紊乱主要发生在S、M期;转录因子FOXM1/HNF3高表达与HCC的细胞周期紊乱密切相关.     

FSHR部分基因的真核表达质粒构建和生物信息学分析

目的克隆FSHR基因部分片段(145～330bp)(FSHRn),构建真核表达重组质粒,预测其编码蛋白作为候选避孕疫苗的可行性。方法提取小鼠睾丸组织的总RNA,利用RT-PCR技术反转录成cDNA,按照GenBank中小鼠FSHRN-端序列设计引物,扩增基因片段并插入pcDNA3.1/myc-His(-)B载体,重组质粒经PCR、双酶切和测序鉴定后用VectorNTI9.0软件作生物信息学分析。结果扩增片段长度为186bp,测序结果与已知序列吻合,重组真核表达质粒经PCR和双酶切鉴定获得正确重组子,生物信息学分析其编码蛋白抗原性肽段主要集中在15～20aa、22～27aa、32～36aa、42～48aa、58～67aa,与人的基因同源性为90%。结论成功克隆了FSHRn基因片段并构建了pcDNA3.1/FHSRn真核表达重组质粒;FSHRn具有良好的抗原性,FSHRn蛋白可作为良好的动物候选疫苗,为此段蛋白的深入研究和人类男性避孕疫苗的研制打下基础。     

干扰HTERT降低人乳腺癌MCF-7细胞对γ射线引起的DNA损伤反应

 目的 研究HTERT RNA干扰对人乳腺癌MCF-7细胞γ射线照射引起的DNA损伤反应的影响。方法 通过逆转录病毒为载体的HTERT-siRNA,抑制人乳腺癌MCF-7细胞中端粒酶催化亚单位HTERT表达,实时定量RT-PCR及Western blot确认HTERT表达水平、用137Cs放射源以3 Gy剂量γ射线照射细胞,于照射前以及照射后1、2、4、8和12h收集细胞,采用磷酸化53BP1 抗体进行免疫荧光染色,并于照射前、照射后1、4和12h收集细胞,Western blot检测53BP1蛋白磷酸化水平。结果 HTERT-siRNA处理的细胞HTERT表达水平比对照细胞降低3.20 (2-△△Ct)倍, HTERT蛋白水平降低2.56倍。HTERT-siRNA处理的细胞对γ射线引起的DNA损伤反应显著降低。结论 RNA干扰HTERT表达水平,可以降低人乳腺癌MCF-7细胞对γ射线照射引起的DNA损伤反应。     

融合基因Tat—HPV16L1的克隆及在大肠杆菌中的表达

目的:构建人乳头瘤病毒16型L1基因和蛋白转导肽基因Tat的融合表达载体,以大肠杆菌作为表达系统,探索制备经济而高效的人乳头瘤病毒疫苗的新方法.方法:以pBR322-HPV16质粒为模板扩增L1基因,与原核表达载体pET28a连接,重组质粒再与自行设计蛋白转导功能片段Tat连接,经测序鉴定后转入大肠杆菌表达菌株DE3进行诱导表达Tat-HPV16L1融合蛋白.结果:融合基因Tat-HPV16L1测序结果与预期完全符合,经过IPTG诱导表达后进行SDS-PAGE电泳分析,结果诱导表达成功.结论:本研究为制备经济而高效的人乳头瘤病毒疫苗打下了基础.     

基于以太网的虚拟生物医疗仪器系统的研究

介绍基于目前嵌入式生物医疗仪器和虚拟仪器技术（Ⅵ）的发展基础上，提出了虚拟式生物医疗仪器的以太网络设计的思想，目的就是在于利用虚拟仪器的概念来解决和弥补当前昂贵的传统生物医疗仪器方面不足，并以此来寻求一种适合商业化和网络发展新的医疗仪器理念，从而为生物医疗仪器领域的发展提供服务和指导。     

人肥胖基因的克隆及其在大肠杆菌中的表达

目的 克隆中国人的肥胖基因，并在大肠杆菌中高效表达人瘦素蛋白。方法 用RT-PCR从培养的中国人脂肪细胞提取的总RNA中扩增出肥胖基因，与TA载体连接后进行核酸序列测定．并将该基因定向克隆至高效表达质粒pBV220，在大肠杆菌中表达。结果 克隆出中国人肥胖基因，其cDNA序列与献报道的一致，构建了重组质粒pBV220-OB，并成功地实现了人肥胖基因在大肠杆菌中的表达。结论 人肥胖基因的克隆及其在大肠杆菌中的表达，为进一步研究该基因在肥胖症及其相关疾病中的作用，以及在脂肪代谢与脂肪细胞分化中的调控机制奠定基础。     

RNAi技术沉默K562细胞中c-myc基因的初步研究

目的运用RNAi技术，设计针对c-myc的小干扰RNA(siRNA)，研究其干扰效果。方法针对c-myc mRNA的第1357靶位点设计siRNAs，经Lipofectamine^TM 2000脂质体法转染K562细胞，进行RT-PCR、细胞计数和MTT法及流式细胞仪检测，观察其干扰效果。结果转染组与阴性对照组和空白对照组相比，c-myc mRNA表达明显减弱．细胞计数和MTTD(λ)值均有显降低，并有明显的凋亡率。结论运用RNAi技术，可以有效地干扰c-myc的表达．并进一步诱导细胞凋亡。     

两种氨基修饰的基因芯片表面制备方法比较

目的探讨两种氨基化方法修饰玻片表面的过程及其在基因芯片制备中应用的可行性。方法玻片经清洗、硅烷化后，一种用多组分多氨化合物包被，经次亚苯基二异硫氰酸盐表面活化；另一种方法采用的包被剂是丙烯酸-丙烯酰胺单体，活化剂是碳二业胺／N-羟基琥珀亚胺酯官能团分子。将被修饰好的玻片用于λ噬菌体基闲组DNA芯片的制备，并进行杂交检测分析结果经两种方法修饰后玻片表面分别形成分支结构和聚合物涂层，与商业化的芯片比较发现，两种芯片杂交、扫描检测后显示所得点阵的杂交信号均匀、稳定、清晰，杂交点饱满、同一性好。结论两种方法修饰的玻片用于制备基因芯片均取得了成功，其中丙烯酸-丙烯酰胺聚合物包被法处理过程简单、成本低廉、能大规模生产，是一种较理想的芯片表面制备方法。     

生物数据库与生物医学研究

采用分子生物信息学方法,通过计算机技术建立生物数据库,对大量、复杂的生物分子资料数据进行收集储存、加工整理和归类分析非常必要。生物数据库可随时通过计算机检索．找到研究所需的资料数据．并可进行横向比较和分子流行病学研究．从中找出疾病发生的分子机制和治疗靶子,为人类弄清疾病的病因,彻底征服疾病起巨大的推动作用。     

分子生物学技术诊断病毒性肝炎进展

分子生物学技术为诊断慢性病毒性肝炎提供了一种强有力的手段。可以利用它们检测血液及血液制品病毒分子，了解病毒活动感染情况，为临床的准确诊断，合理用药，判定预后提供切实可信的依据。