原发免疫性血小板减少症关键基因与通路的筛选及中药研究

目的：应用生物信息学方法初步筛选原发免疫性血小板减少症（ITP）的关键基因并探索其发病机制，进而预测治疗ITP的潜在中药（TCM）。方法：基于美国国家生物技术信息中心（NCBI）的基因芯片原始数据集GSE80401，以P<0.05及|logFC|≥1条件筛选差异miRNA的标准进行分析，得到ITP的差异miRNA。采用miRTarBase、miRDB和TargetScan进行miRNA靶基因预测，在Genecards数据库搜索ITP的靶点，将预测的上调靶基因和下调靶基因分别与疾病靶点取交集，在此基础上，将映射的靶基因分别通过String数据库和Cytoscape构建PPI网络，筛选核心的靶基因，对核心靶基因在DAVID和Omicsbean数据库上进行GO和KEGG通路富集分析。将关键基因导入医学本体信息检索数据库（Coremine Medical）分析治疗关键基因的TCM。结果：筛选出符合条件的差异基因422个，关键基因17个，包括BCL2L1、CCND1、CD44、CDKN1A、CREB1、GRB2、MAPK1、MAPK8、PIK3R1、CDK2、CAV1、FGF2、IGF1、...     

基于iTRAQ技术筛选齐顺保利尔治疗过敏性紫癜前后的血清差异蛋白

目的：过敏性紫癜（HSP）是蒙古族医学治疗的优势病种之一，作为治疗HSP的主要方药，齐顺保利尔（QSBLE）临床效果显著，但其作用机制尚不明晰。基于此，本研究拟筛选患者用药前后血清中差异表达蛋白质，探讨QSBLE治疗HSP的分子作用机制。方法：以患者自身为对照，搜集6～45岁HSP患者30例，分别在每天12:00和24:00口服QSBLE，依据年龄调整剂量，疗程1周。测定所有入组患者治疗前后的蛋白尿、血尿和皮肤紫癜分布。随机选择10例经QSBLE治疗后临床症状明显缓解的患者的血清开展蛋白质组学分析。采用同位素标记相对和绝对定量（iTRAQ）联合液相色谱-串联质谱法（LC-MS/MS）对HSP患者用药前后血清蛋白进行分析，对差异蛋白进行生物信息学分析并构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络。结果：从血清中鉴定出378个蛋白，其中差异表达蛋白18个，较治疗前水平上调的蛋白有15个，下调的蛋白有3个。生物信息学分析表明，差异蛋白主要涉及适应性免疫应答、免疫应答、免疫球蛋白产生、吞噬作用等生物过程；以生物过程、通路和蛋白构建PPI网络，免疫球蛋白重常数γ1(IGHG1)、免疫球蛋白λ链7-4...