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生物信息学是一门整合计算机科学及生命科学的交叉学科,已有30余年历史,但仍方兴未艾。21世纪以来,生物医学已逐渐进入大数据时代,海量的以测序为代表的基因组、转录组、蛋白质组数据将为深刻揭示人类疾病发生机制及寻找治疗药物提供了前所未有的契机。目前,在临床医学研究及教学中,生物信息学方法及应用尚未得到足够重视。作者结合临床生物信息学发展现状及未来趋势,探讨了临床生物信息学学科在临床医学教学及转化研究中的作用。 相似文献
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目的 通过生物信息学方法筛选成人皮肌炎(adult dermatomyositis, ADM)和青少年皮肌炎(juvenile dermatomyositis, JDM)肌肉组织的核心基因和关键通路,为DM的研究提供新的理论依据。方法 从GEO(Gene Expression Omnibus, GEO)数据库下载符合筛选标准的基因表达芯片数据,分为ADM组和JDM组。利用R语言的相关软件包对两组数据进行处理,获得差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)并对其进行功能富集分析;利用STRING数据库及Cytoscape软件筛选核心基因并通过ROC曲线加以验证;借助CIBERSORT算法分析ADM组和JDM组免疫细胞浸润情况,使用Spearman相关性分析研究两组核心基因表达量与免疫浸润细胞丰度之间的相关性。结果 ADM组共筛选出552个DEGs,其中上调基因402个,下调基因150个。这些基因主要与信号转导、细胞质和蛋白质结合等方面有关,并富集在Epstein-Barr病毒感染、甲型流感和钙信号等通路上。JDM组共筛选出235个DEGs,上... 相似文献
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目的/意义 在医学人才培养中深度融入信息教育,有助于提升医学人才培养质量,探索高等医学教育改革新方向。方法/过程 结合山西医科大学医信融合教育实践经验,阐述医信融合人才培养体系构建路径。结果/结论 形成从知识生产到学生认知建构的模式转变,改进建构主义教育教学理论,对学科交叉融合过程中医学人才培养具有显著理论指导意义。 相似文献
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目的:利用GEO数据库和TCGA数据库的数据,通过多组学分析方法分析与急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)发生、发展及不良预后相关的分子标志物。方法:从GEO数据库下载符合要求的转录组数据,运用R语言Limma程序包进行差异表达基因的筛选,并对差异表达基因进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,同时使用STRING数据库数据,利用Cytoscape软件构建蛋白质相互作用网络,筛选出hub gene,结合TCGA数据库附带的临床信息对hub gene进行预后分析。结果:共筛选出620个差异基因,上调的差异表达基因162个,下调的差异表达基因458个。综合GO功能富集、KEGG通路富集分析及蛋白相互作用网络结果,筛选出CXCL4、CXCR4、CXCR1、CXCR2、CCL5、JUN为hub gene。生存分析显示,CXCL4、CXCR1、CCL5高表达是患者预后不良的危险因素。结论:CXCL4、CXCR1、CCL5可以作为AML发生、发展的相关生物标志物,且与不良预后相关,这可以为进一步研究提供依据。 相似文献
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目的:通过分析国内现有的信息行为研究文献,揭示国内信息行为研究领域研究主题和热点。方法:运用因子分析和共词聚类方法对国内信息行为的研究文献中的关键词进行分析及聚类,并探讨该领域研究主题的结构。结果:目前国内信息行为研究主题集中在信息素养、网络信息行为、信息行为模型、信息传播、图书馆信息服务等12个方面。结论:国内信息行为热点研究存在着研究对象多样化、研究主题分散化、研究热度均衡化等特征。 相似文献