抗HIV确认阴性的艾滋病1例报告

1 病例介绍 患者男性,69岁,广西农民,有冶游史,2011年因＂抗HIV阳性12 d,发热、咳嗽1周,皮疹3 d＂在我院艾滋病科住院治疗,住院诊断＂肺部感染,青霉病,口腔真菌感染,中度贫血＂.2010-12-22广西壮族自治区疾病预防控制中心给予HIV抗体确认检测DETERMINE检测方法的结果显示阳性反应,免疫印迹试验（WB）带型结果示gp160,CD4＋结果示8 cell/ul,2011-01-28 HIV-1病毒载量检测报告72 000 copies/ml;在此期间患者反复因机会性感染（肺结核、带状疱疹等）多次在我科住院,经治疗病情均好转出院.2011-02-22 HIV抗体确认检测结果同上,2011-10-20 HIV抗体确认检测WB带型结果示gp160 gp120,HIV抗体不确定报告;2012-01-04 HIV抗体确认检测WB带型结果示gp160,HIV抗体阴性报告.     

AIDS患者合并感染耶氏肺孢子虫的巢式PCR检测及ITS基因的克隆测序

目的 探讨ITS巢式PCR检测AIDS患者合并耶氏肺孢子虫感染的应用价值并对ITS1-5.8S rDNA-ITS2基因进行克隆测序.方法 收集AIDS患者痰液标本,用二硫苏糖醇(DTT)消化处理后进行六亚甲基四胺银(CMS)染色镜检;提取肺孢子虫DNA后进行巢式PCR扩增,选取GMS染色和PCR同时阳性的112号和仅PCR阳性的185、200号病例的PCR产物进行TA克隆、测序,然后用Blastn程序和DNANAN软件对所测序列进行同源性比较和序列间比对,并和GenBank登录的耶氏肺孢子虫ITS1-5.KS rDNA-ITS2序列进行比较分析.结果 用ITS巢式PCR法检测AIDS患者99例,耶氏肺孢子虫DNA阳性43例,阳性率为43.4%(43/99),用GMS染色法检测,阳性率为4.04%(4/99),两者比较,有非常显著性差异(P<0.01).TA克隆112、185、200号病例的耶氏肺孢子虫ITS1-5.8S rDNA-ITS2基因序列长度分别为523bp、515bp、51lbp,三者之间的基因同源性为95%～97%,与GenBank登录的耶氏肺孢子虫(U07220)、(U07221)、(U07222)和(U07226)的ITS1-5.8S rDNA-ITS2基因的同源性为95%～98%,其变异位点多在ITS1和ITS2基因片段.结论 ITS巢式PCR法检测耶氏肺孢子虫敏感性明显高于GMS染色法.ITS巢式PCR法可作为肺孢子虫肺炎早期诊断方法,尤其适用无创性标本的检测,CMS染色法对无创性标本痰液的检测敏感性低,在临床上意义不大;成功获取广西株耶氏肺孢子虫ITS1-5.8S rDNA-ITS2的基因序列,与GenBank登录的外国株耶氏肺孢子虫基因序列高度同源,其中5.8S rDNA高度保守,ITS1和ITS2基因变异较大.     

广西新诊断HIV/AIDS患者HIV-1整合酶区基因突变及整合酶抑制剂耐药分析

目的 了解广西新诊断HIV-1感染者整合酶抑制剂（integrase stand transfer inhibitors,INSTIs）耐药率、HIV-1整合酶区耐药相关多态性位点的突变率及影响因素。方法 使用课题组2019年10月—2020年3月收集的广西新诊断HIV/AIDS患者血液样本，提取HIV-1整合酶区RNA、巢式PCR扩增整合酶基因并测序。利用斯坦福HIV耐药数据库确定患者HIV-1整合酶区耐药突变位点并计算患者耐药率。通过序列比对分析HIV-1整合酶区耐药相关多态性突变位点，使用多因素logistic回归分析HIV-1整合酶区耐药相关多态性位点发生突变的影响因素。结果 320例HIV-1患者的HIV-1整合酶区序列中，以CRF01＿AE亚型（39.4%）为主，耐药率为2.19%，主要耐药突变位点为E92K(0.62%),次要耐药突变位点主要为E157Q(1.25%)。发生频率较高的HIV-1整合酶区耐药相关多态性位点有L74V(0.94%)、E138D(1.25%)和G163E(3.13%)。多因素logistic回归分析显示：HIV-1整合酶区耐药相关多态性突变的影响...     

2012—2022年广西HIV-1独特重组型毒株近似全长基因序列特征分析

目的：研究广西HIV-1独特重组型毒株（URFs）的基因重组特点，为广西HIV-1疫情防控提供科学依据。方法：对1例pol区基因序列初步判断为URF的HIV-1感染者的血液样本进行RNA提取、巢式PCR扩增全长基因并测序，从PubMed等数据库检索2012—2022年发表的有关广西URFs近似全长基因组的文章及对应的序列，构建系统进化树，并进行重组模式、断点分析和耐药突变位点分析。结果：测序获得1例长度约8.9 kb的URF，该URF是以CRF08＿BC为骨架插入CRF01＿AE片段构成的二代重组毒株。将该URF与数据库中检索到的12例广西URFs共同分析，发现广西URFs主要来源于性传播途径感染者和静脉吸毒感染者。所有URFs均包含CRF01＿AE片段，以01＿AE/07＿BC重组比例最高（69.2%,9/13）,1例URF含有主要耐药位点。结论：广西已鉴定的URFs数量较少，以01＿AE/07＿BC重组为主，应加强对URFs的监测和鉴定，以全面了解广西HIV-1重组毒株的特点。