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21.
肠道病毒71型山东临沂分离株全基因组序列分析   总被引:2,自引:0,他引:2  
目的 自1例死亡患儿的标本中分离EV71,并分析其全基因组序列特点,研究其基因序列的改变是否与其神经毒力有关.方法 咽拭子标本采自山东临沂市人民医院1例死亡患儿,在人横纹肌瘤细胞(RD)上分离EV71,分段扩增获得EV71的全序列,用BLAST、Bioedit和MEGA 4进行序列分析.结果 获得1株EV71分离株SDLY107,基因组全长7405 bp,全基因组核苷酸序列与2008年的阜阳株Fuyang.Anhui.P.R.C/17.08/2同源性最高,为98.6%,与原型株BrCr/70的同源性为80.0%,与神经毒型株MS/87的同源性为86.5%.系统进化分析表明,SDLY107与中国大陆的北京株、河南株、广西株、深圳株、兰州株、阜阳株、重庆株、浙江株的亲缘关系较近,按照传统的VP1基因分型方法,可归为C4亚型,是近年来我国大陆流行的主要基因亚型.氨基酸序列分析发现,SDLY107与其他毒株相比,有2个特有的突变(E947D,K1873R).结论 SDLY107分离株属于C4亚型,氨基酸突变E947D和K1873R可能与EV71的致病性有关.
Abstract:
Objective To isolate enterovirus 71 from a death children,and analyze whether the neurovirulence was related to the variation of nucleotide and amino acid. Methods Enterovirus 71 was isolated from throat swabs which were colleted from Shandong Linyi People's Hospital. The full length genome was sequenced by amplification with RT-PCR and sequencing of 9 overlapped gene fragments covering full length of the genomes. The nucleotide and amino acid sequenced was aligned by BLAST, Bioedit and MEGA 4. Results A strain of enterovirus 71 was isolated and named as SDLY107. The full length was 7405 bp. The results of homology analysis of overall nucleotide sequence showed that strain Fuyang. Anhui. P. R. C/17.08/2 had highest homology (98.6%)with strain SDLY107, and the homology was 80.0% between strain SDLY107 with prototype strain BrCr/70,and 86. 5% between strain SDLY107 with nerve strain MS/87. Phylogenetic analysis showed that the phylogeny was close between SDLY107 with some isolated strains from Chinese Mainland, such as Beijing, Henan, Guangxi, Sbenzhen, Lanzhou, Fuyang, Chongqing and Zhejiang strains, which was clustered for C4 subtype. The results of amino acid sequence analysis showed that there were 2 mutations, E947D and K1873R, for strain SDLY107. Conclusion SDLY107 belonged to C4 subtype, amino acid mutations E947D and K1873R of which may be relevant to the pathogenicity of EV71.  相似文献   
22.
目的 了解副黏病毒融合蛋白(F)融合活性位点中的病毒特异性氨基酸在细胞融合中的作用.方法 以新城疫病毒(NDV)和人副流感病毒(hPIV)为例,在已确定的F蛋白融合活性位点中对病毒特异性氨基酸进行定点突变,然后将突变体F基因与同源或异源的血凝素.神经氨酸酶(HN)基因共转染BHK21细胞后,在真核细胞中表达.Giemsa染色和指示基因法检测细胞融合功能,荧光强度分析(FACS)检测F蛋白的表达效率.结果 在NDV F的突变体中,N150D-L152D的融合功能达到野毒株的46.31%;而N257D-N258D-Q259E、G271D-N272D和Q279E-Q281E的融合活性却几乎消失,分别只有野毒株的1.25%、3.14%和2.23%;N296D-N297D的融合功能是野毒株的97.68%.在hPIV F的突变体中,D143A-E145A的融合功能达到野毒株的32.63%;E223Q-K224A几乎不能形成合胞体,其融合活性只有野毒株的1.91%;K263A-R265A、D268A-D270A和R475A-R476A的融合功能分别是野毒株的14.63%、19.52%和28.95%.FACS结果表明,NDV F的N257D-N258D-Q259E、G271D-N272D和Q279E-Q281E突变体及hPIVF的E223Q-K224A突变体F蛋白在细胞表面几乎没有表达;其余所有突变体F蛋白的表达效率与野毒株相比,基本不变.结论 对于NDV F来说,N257、N258、Q259、G271、N272、Q279、Q281对NDV F的特异性细胞融合功能起重要作用;N150和L152也起一定的作用,但是N296和N297却没有作用.对于hPIV F来说,E223和K224对hPIV F的特异性细胞融合功能起非常重要的作用;D143、E145、K263、R265、D268、D270、R475、R476的作用也很重要.  相似文献   
23.
目的  初步确定汉坦病毒GM04-38株包膜糖蛋白上潜在的融合肽区域。  方法  采用基因定点突变技术将潜在融合肽区域的十个关键氨基酸突变成性质相左的氨基酸,转染Vero E6细胞后,间接免疫荧光(IFA)检测糖蛋白表达,采用Giemsa染色法观察细胞融合现象。  结果   在Vero E6细胞中成功表达出糖蛋白,IFA显示关键氨基酸突变前后细胞中均有荧光信号,呈胞浆分布,但细胞融合现象在突变后消失。  结论 潜在融合肽区域的十个氨基酸突变均对细胞融合产生明显的影响,提示该段区域很可能是病毒的融合肽。  相似文献   
24.
用指示基因法定量分析副粘病毒包膜糖蛋白所致的细胞融合   总被引:15,自引:0,他引:15  
目的建立一种定量分析副粘病毒包膜糖蛋白融合细胞功能的方法。方法 将Vtf|7重组痘苗病毒感染BHK21细胞后,分别转染待测基因DNA和Pg1nt7β-galDNA,16h后将两个细胞群混合,37℃15h后用NP-40裂解细胞,取上清进行显色反应,在SOFTMAX软件支持下用ELISA自动测定仪在570nm测吸光度A值。结果 指示基因法与细胞计数法有密切相关关系,r=0.9890(P<0.01);与面积判断法的符合率达100%。最佳主要反应条件包括16mmol/L底物浓度;显色反应20~25min;1μgDNA转染量;每种细胞群接种1×10  相似文献   
25.
艾滋病已经成为全球性性传播疾病,尤其是在非洲、北美洲、西欧以及亚洲的部分地区广为流行。这不仅仅是一个医学问题,也是一个社会学问题。本文对艾滋病的性传播及其相关因素进行探讨,包括艾滋病从男性到女性的传播、从女性到男性的传播、男性之间的传播、女性之间的传播、性紊乱者患艾滋病的某些危险因素,阻断艾滋病性能传播应采取的措施等。  相似文献   
26.
目的探讨玻璃体切割术治疗急性视网膜坏死性视网膜脱离的效果。方法对急性视坏死性视网膜脱离18例18眼中13眼行玻璃体切割、眼内视网膜光凝加硅油填充术,5眼行玻璃体切除、眼内光凝加C3F8填充术。结果15例患者的视网膜成功复位,炎症均控制良好。3例视网膜脱离复发,再次手术复位成功,视力光感;随访9个月至3年,15例视力分别为:0.3者2例,0.2者4例,0.1者5例,0.02~0.08者2例,指彬30cm者2例。结论视网膜脱离是急性视网膜坏死的严重并发症,通过玻璃体视网膜联合手术,可有效地提高视网膜脱离的复位率,挽救患者的视功能。  相似文献   
27.
风疹病毒检测方法研究进展   总被引:2,自引:0,他引:2  
风疹是由风疹病毒(rubella virus,RV)引起的急性呼吸道传染病。我国虽然已将其列入监测管理疾病,但风疹疫苗接种尚未列入计划免疫范畴。RV最严重的危害是经垂直传播导致胎儿先天性感染,未感染过RV的孕妇,以孕期3个月内感染RV对胎儿危害最大,可引起胎儿死亡或出生后表现为先天性心脏病、耳聋、白内障、智力发育低下等畸形,称为先天性风疹综合征(CRS)。近年来,优生优育日益受到重视,RV感染作为出生缺陷监测中的重要内容,需要较高水平的检测方法。现就RV检测方法研究进展综述如下。  相似文献   
28.
目的 对2017年山东省临沂市手足口病(hand, foot and mouth disease,HFMD)患儿粪便标本进行病毒分离与鉴定,并对其基因特征进行分析。方法 对HFMD患儿粪便标本进行核酸检测。用人横纹肌肉瘤细胞进行病毒分离。对病毒进行全基因组序列测定,通过与人类肠道病毒比较,对分离株进行系统发育分析和基因重组分析。结果 自重症HFMD患儿粪便标本中成功分离到1株柯萨奇病毒A组2型(coxsackievirus A group 2 type, CoV-A2),命名为CoV-A2 SD17-430,系统进化分析进一步确定其基因型属于D2基因型。SD17-430衣壳蛋白编码区与CoV-A2国际原始株同源性高,在非结构蛋白编码区与CoV-A4(MH086949)和CoV-A14(KP036482)同源性高。结论 与原始毒株相比,CoV-A2 SD17-430株发生了较大程度的遗传变异,其进化过程中可能与多个A组肠道病毒发生了基因重组。应继续加强对HFMD病原的全面监测,以便进一步了解其病原谱变化,为制定更有效的HFMD防控策略提供数据参考。  相似文献   
29.
30.
巴泰病毒(Bataivirus,BATV)是布尼亚病毒科(Bnuyavirus)布尼亚病毒属(Bunyavirus)布尼亚姆韦拉(Bunyamwera)血清组的成员。20世纪50年代首先在马来西亚捕获的库蚊中分离到,随后在欧亚等多个国家和地区的多种媒介生物中分离到该病毒,并证实巴泰病毒感染可引起发热,偶可引起病毒性脑炎症状。但是近年在非洲发现巴泰病毒感染的流行,造成数万人发病,部分患者死亡,研究发现该次流行的病原体是由巴泰病毒基因重配(genetic reassortment)形成新的毒株,引起国际社会的极大关注。  相似文献   
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