下一代测序在孟德尔型运动障碍中的应用(英文)

在过去10年中，下一代测序技术(next generation sequencing，NGS)得到了十分迅速的发展。与传统测序相比，NGS具有高通量和高灵敏性等优点。孟德尔型运动障碍是一类常见的神经疾病。由于样本较少等原因，通过连锁分析等传统方法寻找新的孟德尔型运动障碍尤其是罕见疾病的致病基因已经变得越来越困难，而NGS则可作为发现新的致病基因的理想手段。目前NGS已被应用于多种孟德尔型运动障碍的研究。本文将从基因组和转录组的角度对NGS在孟德尔型运动障碍中的最新应用进行综述，并展望NGS在罕见孟德尔型疾病中的应用。     

染色体位点与癌变

本文通过对85个肿瘤相关断裂点、89个脆性部位、34个细胞瘤基因位点在人基因纽中定位分布的比较,发现三类染色体位点有极大的位点相似性。根据肿瘤分子生物学研究的最新进展,提出了癌变的肿瘤始动部位假说,详细论述了三类染色体位点的功能及其与癌变的关系。此外,重点分析了染色体缺失断裂点的分布规律,讨论了抗瘤基因在人类基因组中存在的可能性,井认为抗瘤基因对瘤基因的调节是一种顺位作用调节方式。这种调节形式对稳定细胞的表型可能有重要作用。     

核致癌蛋白与核抗癌蛋白

有关癌基因致癌机理的研究认为,核内癌基因编码的致癌蛋白与核内抗癌基因编码的抗癌蛋白的结合是引起抗癌蛋白灭活、导致细胞恶性转化的关键。本文着重介绍了近两年有关这方面研究的最新进展。     

染色体位点与癌变(续)

二、肿瘤中出现的非随机染色体重排实际上是三类染色体位点的 DNA 序列重排。从图1与表3中,不难发现,在每一个染色体重排方式的两个染色体连接部位的断裂点上分布着与重排的启动、形成可能有关的DNA 序列,即细胞瘤基因和脆性部位。染色体易位是恶性肿瘤中的重要的重排方式。如前所述,85个肿瘤相关断裂点中就有65个是染色体易位的好发部位,居恶性肿瘤中染色体重排之首,因此,也是研究三类染色体位点序列重排的最好例证。表3是本研究根据第八届国际人类基因定位会议公布的44种染色体易位方式进     

四种恶性肿瘤患者外周淋巴细胞的姊妹染色单体互换频率

本文用姊妹染色单体互换(SCE)分析法研究了四种恶性肿瘤患者外周淋巴细胞SCE频率的变化。结果表明:宫颈癌、直肠癌、乳腺癌和胃癌患者的SCE频率分别为10.8±0.8010.82±0.76、9.27±0.51、9.39±0.98,显著高于正常人(6.55±0.46)。此外,宫颈癌患者的SCE 频率还明显高于宫颈鳞状上皮不典型增生性慢性宫颈炎症和子宫肌瘤患者。本文对四种恶性肿瘤患者 SCE频率变化的生物学意义进行了讨论,认为SCE在一定条件下可能是某些恶性肿瘤患者的细胞遗传学指标。     

F-Box蛋白家族新成员FBXO30基因的融合表达

采用非定向克隆技术将FBXO3 0 (F boxonlyprotein 3 0 )基因编码区cDNA序列克隆到哺乳类融合表达载体pEGFP C2中 ,通过脂质体转染 ,将pEGFP C2 /FBX0 3 0导入NIH 3T3细胞株 ,并在荧光显微镜下观察融合蛋白的表达。采用定向克隆技术将FBXO3 0基因编码区cDNA序列克隆到表达载体pGEX 4T 2中 ,转化大肠杆菌。结果显示FBXO3 0蛋白主要存在于胞浆中。十二烷基硫酸钠 聚丙烯酰胺凝胶电泳和免疫印迹均检测到一条约 6 5 5kD左右的新增蛋白泳带。此外 ,还用谷胱甘肽Sepharose 4B亲和层析柱获得了纯化的该融合表达产物。FBXO3 0蛋白为胞浆蛋白 ,以可溶性的形式存在 ,它能在原核表达体系中稳定表达 ,这对制备其特异性抗体和从蛋白水平研究其功能均具有十分重要的意义     

Toll 样受体与非可控性炎症相关肿瘤

Toll样受体(Toll-like receptors,TLRs)是一类单一的、非催化的、具有较高同源性的模式识别受体,在天然 免疫中发挥了重要作用,是连接天然免疫和特异性免疫的桥梁。Toll样受体在非可控性炎症相关肿瘤中的炎症微环境 形成、免疫逃逸、侵袭和转移等方面均发挥了重要作用。深入研究Toll样受体在非可控性炎症相关肿瘤中的作用机 制,可以为肿瘤的预防、早期诊断及治疗提供新的方向。     

IN SILICO EXPRESSION ANALYSIS OF HUMAN NOVEL GENE UBAP1 IN MULTIPLE CANCERS

Loss of heterozygosity (LOH) on human chromosome 9p2l-22 is one of the most frequent genetic alterations in many common sporadic cancers, including breast cancer, lung cancer, bladder cancer, melanomas, gliomas and nasopharyngeal carcinoma. So it was postulated that there might be some other unknown tumor susceptibility or suppressor genes, which are correlated with the occurrence of these cancers[1-5]. In order to obtain the novel genes associated with human nasopharyngeal carcinoma (NPC) o…     

精细定位和克隆9p21-22区域内鼻咽癌候选抑瘤基因

目的：进一步精细限定鼻咽癌９p２１－２２区域等位基因杂合性丢失的频率和范围,筛选 和克隆其共同缺失区内鼻咽癌相关的候选抑瘤基因。方法：应用１１个定位于９p２１－２ ２区域的高密度微卫星位点,检测２５例低分化鼻咽癌患者的杂合笥技失,确定其共同缺失区;用ＲＴ－ＰＣＲ和Ｎｏｒｔｈｅｒｎ筛出在鼻咽癌细胞株ＨＮＥ１和鼻咽癌活检组织中表达下调的、定位于共同缺失区内的３’末端ＥＳＴs（Ｅｘｐｒｉｓｓ Ｓｅｑｕｅｎｃ     

Expression of nitroreductase gene NOR<Subscript>1</Subscript> in E.Coli and the preparation of antiserum

Objective: To express nitroreductase gene NOR1 in Escherichia coli and to purify the expressed protein in order to get the polyelonai antibody of NOR1. Methods: The full length of NOR1 gene was amplified by reverse transeription-polymerase chain reaction (RT-PCR) and digested with BamHI and XhoI restriction endonucleases.The plasmid pGEX-4T-2 was also digested with BamHI and XhoI, then the NOR1 gene was inserted into vector pGEX-4T-2. The recombinant expression vector pGEX-4T-2/NOR1 was identified by sequencing and restriction enzymes digestion. E.coli Jm105 transformed with the recombinant plasmid was induced by IPTG to express the GST fusion protein. The purified targeted protein obtained by affinity chromatography was used to immunize New Zealand rabbits to acquire antiserum. Antiserum was analyzed with immunobiot. Results: The 1.25 kb NOR1 gene was successfully isolated. After induction, a new anticipated protein of 74 kDa appeared on sodium dodecylsuifate polyacrylamide (SDS-PAGE). The result was confirmed by Western blot analysis, and the purified targeted protein was obtained by affinity chromatography.The titer of antiserum was 1:8. Conclusion: A high level of expression of GST-NOR1 is obtained in JM 105, and its antiserum can be prepared successfully.