长沙市成人运动锻炼身体活动现状及影响因素分析

目的分析长沙市成年人运动锻炼身体活动现状及影响因素,为制定慢性病防制策略和措施提供依据。方法采用多阶段分层随机抽样法对长沙市≥18岁常住居民开展问卷调查。结果长沙市成人经常锻炼率为28.17%,女性高于男性,城市高于农村,年龄越大,经常锻炼率越高,差异均有统计学意义(P0.01)。参加锻炼的人群中,每日锻炼活动量达标率为32.10%,其中男性(30.78%)与女性(32.95%)间差异无统计学意义(χ~2=3.639,P=0.056),城市(32.86%)高于农村(30.17%)(χ~2=4.78,P0.05);每周运动锻炼时间达标率为47.19%,女性(54.46%)高于男性(50.27%)(χ~2=11.81,P0.01),农村(68.68%)高于城市(46.52%)(χ~2=282.21,P0.01),随着年龄的增长,每天活动量达标率(χ_趋势~2=187.37,P0.01)和每周运动时间达标率(χ_趋势~2=210.79,P0.01)均增加。结论长沙市成年人运动锻炼率、活动量及锻炼时间达标率均较低,相关部门应结合"健康长沙"建设出台包括加强健康宣教在内的针对性措施,提高居民锻炼意识。     

长沙市GI.6[P11]重组型诺如病毒引起的暴发疫情全基因组序列特征分析

目的 对长沙市2017年5月一起诺如病毒暴发疫情中的病毒基因型别进行鉴定,并对病毒全基因组序列特征进行分析。 方法 采集疫情中4份病例粪便标本和2份饮用井水标本,提取病毒核酸后实时荧光逆转录聚合酶链反应进行诺如病毒GI和GII型检测,逆转录聚合酶链反应扩增病毒开放阅读框(open reading frame,ORF),测定ORF1与ORF2连接区域序列并进行基因型别鉴定,应用二代测序技术对阳性标本进行全基因组序列测定和分析。 结果 采集的6份标本中有2份病例标本和1份井水标本诺如病毒GI型阳性,基于核酸序列的进化树分析发现ORF1区域序列位于GI.P11型别分支,ORF2区域序列位于GI.6型别分支。3份阳性标本毒株序列之间的同源性为99.8%~100.0%。全基因组序列毒株编号为Hu/CSNV0501/2017,基因组编码区全长为7 602 bp。Simplot软件分析重组位点位于ORF1区域序列约5 341 bp。 结论 本次疫情的传染源为井水污染传播,引起此次胃肠炎疫情的病原体为诺如病毒GI.6[P11]重组型。应加强对长沙市诺如病毒少见重组亚型的监测,为重组毒株的遗传进化和疫情防控提供参考。     

长沙市柯萨奇病毒A2型和A5型全基因组序列特征分析

目的 了解长沙市柯萨奇病毒A2型（coxsackievirus A2, CV-A2）和A5型（coxsackievirus A5, CV-A5）的序列分子特征及进化趋势。方法 采用二代测序技术获得CV-A2和CV-A5的全基因组序列,进行同源性和进化树分析,使用SimPlot查看毒株序列重组区域。结果 获得长沙市2019年手足口病常规监测病例中CV-A2和CV-A5毒株全基因组序列。CV-A2毒株命名为S281/Changsha/CHN/2019,基因组全长7 422 bp。CV-A5毒株命名为S272/Changsha/CHN/2019,基因组全长7 425 bp。CV-A2全基因组序列与国内CV-A2毒株进行同源性分析发现,非结构蛋白区比结构蛋白区同源性低。CV-A2毒株与原型株Fleetwood（NC038306）相比同源性为79.20%,与湖北省CV-A2毒株（MN419014）同源性最高为95.60%,但非结构蛋白3C和3D区同源性最低,分别为90.51%和92.06%。进化树分析发现3C和3D区位于CV-A4分支。非结构蛋白区新增多个氨基酸突变位点,结构蛋白区氨基酸序列保守。基因重组分析发现CV-A2毒株在3C和3D区存在重组现象。对CV-A5全基因组序列分析发现,与国内CV-A5毒株相比,非结构蛋白区比结构蛋白区同源性低。全基因组序列与CV-A5原型株Swartz（AY421763）相比同源性为80.7%,与澳大利亚毒株（MH111030）相比同源性最高为97.43%,进化树分析发现与MH111030位于同一分支,证明CV-A5为输入型毒株。CV-A5毒株结构蛋白区氨基酸序列保守。结果 长沙市CV-A2毒株为重组毒株,CV-A5毒株为国外输入型。本研究可帮助了解长沙地区CV-A2和CV-A5的全基因组特征,为了解柯萨奇病毒的进化趋势及遗传特征提供理论数据,以便及时有效地阻断疾病传播。     

长沙市诺如病毒暴发疫情中GⅡ.2[P16]型全基因组分子进化特征分析

目的 对长沙市2020年急性胃肠炎暴发疫情中诺如病毒GⅡ.2[P16]型进行全基因组序列测定以及遗传进化特征分析。方法 采集2020年诺如病毒暴发疫情标本,采用逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）方法扩增开放阅读框（ORF）1和ORF 2连接区进行分型鉴定。GⅡ.2[P16]型阳性标本在二代测序Miseq平台进行测序。测序结果进行序列比对及进化分析。结果 2020年本市共发生诺如病毒暴发疫情29起,共采集标本277份,阳性检出率为44.04%（122/277）。分型鉴定发现诺如病毒GⅡ.2[P16]型占比45.08%（55/122）。从疫情分布月份和机构来看,9—12月为暴发高峰,疫情发生在幼儿园和学校占比89.66%（26/29）。对53份GⅡ.2[P16]型ORF1和ORF2连接区序列进行进化树分析发现毒株处于多个分支,序列之间的同源性为98.5%~100%。对4株GⅡ.2[P16]型全基因组序列进行同源性比较发现毒株之间的同源性为98.5%~99.5%,与GⅡ.2[P16]2016-2017（KY771081）毒株同源性为97.9%~98.2%,进化树处于不同亚分支。RdRp区域氨基酸位点发生T396A和T464A突变,HBGA结合位点保守未发生突变。结论 长沙地区诺如病毒暴发疫情中以GⅡ.2[P16]型突变株传播为主,毒株由GⅡ.2[P16]2016-2017持续传播进化而来,并进化为另一个分支。本地区暴发的诺如病毒疫情主要发生在学校以及幼托机构,应持续加强对诺如病毒的监测。     

2018—2021年长沙市诺如病毒暴发疫情流行特征分析

目的 了解2018年1月至2021年3月长沙市诺如病毒(Norovirus, NoV)暴发疫情的流行病学和进化特征。方法 采集2018年1月至2021年3月急性胃肠炎暴发疫情临床病例标本463份，采用实时荧光RT-PCR法进行诺如病毒GI和GII基因群的鉴定；对阳性标本采用特异引物RT-PCR扩增，所得扩增产物测序后进行进化分析。结果 2018年1月至2021年3月共报告诺如病毒疫情64起，采集标本463份，NoV检出阳性率为57.67%,男性检出率为60.16%,女性检出率为54.71%;12～18岁年龄组检出率最高，达74.24%。每年冬春季(10月至次年3月)为流行高峰季节；有64.06%(41/64)的疫情发生在托幼机构。64起暴发疫情中由GII基因群NoV引起的占82.81%(53/64),由GI基因群NoV引起的占7.81%(5/64),混合基因型占9.38%(6/64)。GI基因群NoV的具体基因型别有GI.2[P2]、GI.3[P13]、GI.5[P4]、GI.6[P11];测序分型成功的GII基因群NoV具体基因型别有GII.1[P16]、GII.2[P16]、GII...