β肾上腺素能受体基因多态性与大动脉僵硬度的相关分析

目的:β肾上腺素能受体(β-adrenoceptor,β-AR)包括β1,β2和β33种亚型,分析其基因多态性与大动脉僵硬度的关系。方法:试验于2003-02/2004-09在重庆医科大学生物医学工程研究室进行。选择在重庆医科大学体检的健康受试者94名,男49名,女45名,对试验均知情同意。测试受试者平卧位的血压,然后计算脉压差(脉压差可反应大动脉僵硬度)。用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术和等位基因特异性聚合酶链反应法分析β1-AR的Ser49Gly和Arg389Gly,β2-AR的Arg16Gly和Gln27Glu,β3-AR的Trp64Arg基因多态性,并分析其基因多态性与脉压差的相关性。结果:94名受试者全部进入结果分析。①β2-AR的Arg16Gly基因多态性与脉压差有显著相关性(P<0.05),其中Arg/Gly杂合子基因型携带者的脉压差值最大(49.64±9.99)mmHg(1mmHg=0.133kPa),Arg/Arg纯合子基因型携带者的脉压差值最小(43.70±9.88)mmHg,而Gly/Gly纯合子基因型携带者的脉压差值居中(46.00±12.12)mmHg。②β1-AR的Ser49Gly和Arg389Gly、β2-AR的Gln27Glu和β3-AR的Trp64Arg基因多态性与脉压差无关(P>0.05)。结论:β2-AR的Arg16Gly基因多态性与脉压差值有显著相关性,故而β2-AR的Arg16Gly基因多态性与大动脉僵硬度有相关性。     

β肾上腺素能受体基因多态性与静息心率的关系

探讨β肾上腺素能受体(β-adrenoceptor,β-AR,包括β1、β2和β3三种亚型)基因多态性与静息心率(Resting heart rate,RHR)的关系。用计算机化心电信号分析系统自动测试150例健康受试者(男性80例,女性70例)平卧位的RHR。用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)技术和等位基因特异性PCR方法分析β1-AR的Ser49Gly和Arg389Gly;β2- AR的Arg16Gly和Gln27Glu;β3-AR的Trp64Arg基因多态性。β1-AR的Arg389Gly基因多态性与RHR有显著相关性(P<0．05)。而且男性的三种心率间的差异显著性高于女性(P=0．0030 vs 0．0045),其中Gly／Gly基因型受试者具有最大心率(男性:80．98±3．09;女性:84．23±6．28)。β1-AR的Ser49Gly及β2-AR的Arg16Gly和Gln27Glu、β3-AR的Trp64Arg基因多态性与RHR无显著相关性(P>0．05)。RHR与基因型有关,β1-AR的Arg389Gly基因多态性与RHR有显著相关性。男性的三种心率间的差异显著性更高,提示男性的RHR受基因型的影响更明显,从而可在基因水平解释“在男性中心率与死亡率的相关性高于女性”这一临床表象。     

一氧化氮合酶基因5个位点单核苷酸多态性及其与心动周期信号谱特征的关系

目的:探索汉族人群NOS2G-954C、NOS2C-1173T、NOS3T-786C、NOS3A-922G与NOS3G894T5个位点单核苷酸多态性及其等位基因与心动周期信号谱的关系。方法:随机选择自然人群个体166为研究对象(男89例,女77例,年龄为62.40±2.5岁),获取其静脉血白细胞基因组DNA。采用等位基因特异性引物PCR技术检测NOS35个位点的基因型。利用聚类分析法研究NOS3的5种SNP的等位基因;利用《HPS谱及其混沌特征分析系统软件》检测人群的心动周期信号谱(HPS)参数。结果:NOS2G-954C携带GG与GC等位基因者其APU、RPU、RUH、APH、RPH以及TPV等参数无显著性差异(P>0.05)。NOS2C-1173TSNP携带CC等位基因者的HPS谱参数中,仅RPH较TT等位基因者低,有显著性差异(P<0.05)。NOS3T-786C中携带TT、TC与CC各等位基因者HPS谱参数均无显著性差异(P>0.05)。NOS3A-922G中携带AA、AG与GG各等位基因者HPS谱参数亦无显著性差异(P>0.05)。NOS3G894T中携带GG、GT与TT各等位基因者HPS谱参数比较,携带GG等位基因者仅APH较TT等位基因者降低,有显著性差异(P<0.01)。结论:NOS2C-1173TSNP突变型TT与其RPH增高有关,NOS3G894T突变型TT亦与其APH增高有关,提示NOS2C-1173T与NOS3G894TSNP可能是导致其HPS谱特征差异性的深层次原因。     

关于开设生物信息学课程的建议

如何获取和利用基因组和后基因组学提供的大量信息,如何具有享用全人类共有的资源的初步能力,成了当今世纪的医学生必须掌握的基本技术、知识和必须具有的初步能力,也可以说是医学教育"面向现代化、面向未来"的课程体系改革的当务之急.去掉一些相对陈旧的课程设置,在医学本科(五、八年制)开设以获取和利用基因组信息为主要目标的"生物信息学"课程,是一种解决方案.     

基因信息处理与计算机信息处理

对基因信息处理和计算机信息处理进行了比较探索。根据遗传密码的简并特性提出了一种相似性搜索的新思想：以三联码为基础考虑简并特征的搜索策略似可将检出效率提高两倍。     

人、小鼠和大鼠的ADRB3比较及其生物学和药理学意义

目的：比较人、小鼠和大鼠的ADRB3并讨论结果的生物学和药理学意义。方法：由NCBI的GemBank数据库，搜索出人、小鼠和大鼠的ADRB3的基因序列，经过对准和比较。计算出其氨某酸序列的相似性和差异。结果：人、小鼠和大鼠的ADRB3的氨基酸序列长度分别为：408、404、400aa；人和小鼠、人和大鼠、小鼠和大鼠的ADRB3的氨基酸序列的排列和组成相似性分别为：79．3％、78．2％、92．6％；差异分别为：20.7％、21．8％、7．4％。最大差异在第四胞内段羧基尾部。结论：1．人与小鼠的序列长度更接近，排列和组成的差异更小。2．从序列的长度和相似性看。人与小鼠更接近，故推断进化顺序应为。3．序列最大差异在与胞内信号转导有关的第四胞内段。     

AAA—ICM技术单次提取图形视觉诱发电位的可行性分析

目的比较基于自参考、自相关、自适应干扰对消技术（AAA—ICM）的单次提取与传统叠加平均两种方法在图形视觉诱发电位（P—VEP）信号提取中的效果,并评估该技术临床应用的可行性。方法对40例青光眼患者与33例正常对照者进行P-VEP检测,分别应用单次提取及叠加平均两种方法提取出VEP波形,并计算出Pm波潜伏期（LPm）的正常值范围,参照正常值分析疾病组的检测结果,并与经叠加平均法计算所得结果进行比较。结果参照本研究得出的正常值范围,对患者组的检测结果进行分析,得出这种基于AAA—ICM技术的单次提取对青光眼检测的灵敏度为98．4％,特异度为88．9％,准确度为96．3％。两种信号提取方式得出的Pm潜伏期结果比较,差异无统计学意义（P〉0．05）。结论应用单次提取方式提取VEP,在对青光眼疾病的诊断结果上与传统叠加平均方法相一致,且用时短、患者耐受性好、背景干扰少,有较高的临床应用价值。     

GST-Pi三位点等位基因组合分布与难治性癫痫的相关性

目的:探索谷胱苷肽S-转移酶Pi(GST-Pi)基因3个位点(Ile105Val,Ala114Val,Asp147Tyr)的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)的基因组合分布与难治性癫痫的相关性.方法:采用等位基因特异性引物PCR技术对非难治性癫痫组、难治性癫痫组、正常组进行GST-Pi 3个位点SNPs的检测.结果:正常组与癫痫组(包括难治性和非难治性两组)3个位点中单个位点的基因型构成在两组间差异均有统计学意义(P<0.0001).从组合基因来分析,两个位点均变异的癫痫组20例(21.74%)高于正常组10例(2.17%),差异有统计学意义(P<0.0001);3个位点均变异的癫痫组68例(78.91%)高于正常组3例(6.52%),非难治性癫痫组41例(83.67%)高于难治性癫痫组27例(62.79%),差异均有统计学意义(P<0.0001).结论:GST-Pi基因变异尤其是多个位点变异的人群易患癫痫,而多个位点变异的患者不易发展成难治性癫痫.     

倍他洛克对心脏自主神经系统的影响

目的 :研究倍他洛克对心脏自主神经系统的影响。方法 :用我室研制的计算机分析系统 ,测定自愿受试者在给予倍他洛克(50mg,口服 )前和后3小时的心动周期信号的特征参数。结果 :倍他洛克能使心动周期、心动周期的标准差、谱的总功率、谱的高频成分显著增加 ,心率和谱的超低频成分的相对值 (Rpu)显著降低。结论 :(1)倍他洛克能使心动周期的标准差 (或心率的标准差 )增加 ,是使心动周期信号 (HPS)谱的高频成分显著增加的根本原因 ,也是副交感神经的张力增加的根本原因 ;(2)倍他洛克表现出降低心脏交感神经的张力 ,增加心脏副交感神经的张力 ,增加心脏自主神经系统的张力。     

图像挖掘技术及医学应用

目的：图像挖掘技术作为图像处理的一个分支,是一门正在受到强烈关注的学科。随着图像获取和存储技术的发展,人们每天都可以获取许多有用的图像信息,但缺乏有效的分析技术分析这些数据,因此如何获取包含许多有用的信息图像数据,并充分利用这些图像数据,是目前图像挖掘技术所讨论的热点。本文就对图像挖掘的研究和应用现状进行了深入研究和分析。方法：通过阐述图像挖掘的概念、主要框架、底层图像挖掘和高层图像挖掘的主要技术,探讨了图像挖掘技术在生物医药和DNA分析中、医学影像数据分析中及法医学中的应用。结果：图像挖掘技术是一种有效分析、获取图像中所隐含的有用信息、图像数据之间的关系和其他隐含的模式的技术,而且,随着工程学和医学学科的交互渗透,图像挖掘技术也开始应用于医学领域中。结论：本文总结了目前比较常用的图像挖掘技术,同时结合我们在该领域所做的工作,对涉及的技术进行了阐述,并指出今后在医学应用中的研究方向。