基于机器学习的抗纤维化中药化合物筛选研究

目的构建新型抗纤维化中药化合物虚拟筛选预测模型,并对模型的预测性能进行验证。方法通过对比使用随机森林与梯度提升决策树算法,实现化合物分子指纹的降维与特征优化。构建"特征优化—机器学习"的混合模型,将优化的特征作为输入分别送入逻辑回归、人工神经网络机器学习算法进行训练。使用准确率、召回率、F1值对不同组合的模型进行性能评价。根据模型性能结果确定抗纤维化中药化合物虚拟筛选预测模型。随后,对比此模型和分子对接模型对中药化合物的抗纤维化活性预测结果,进一步验证该模型的预测性能。结果随机森林模型准确率0.76,召回率0.75,F1值0.74,曲线下面积(AUC)值0.818;梯度提升决策树模型准确率0.76,召回率0.74,F1值0.72,AUC值0.829;人工神经网络模型准确率0.75,召回率0.75,F1值0.75,AUC值0.802;随机森林+逻辑回归模型准确率0.77,召回率0.76,F1值0.75,AUC值0.840;随机森林+人工神经网络模型准确率0.74,召回率0.84,F1值0.79,AUC值0.850;梯度提升决策树+逻辑回归模型准确率0.80,召回率0.80,F1值0.79,AUC值0.872;梯度提升决策树+人工神经网络模型准确率0.73,召回率0.91,F1值0.81,AUC值0.837。中药化合物姜黄素、甘草酸、羟基红花黄色素A、大黄素、绞股蓝皀苷分子对接活性结果与本模型预测结果一致。结论梯度提升决策树+逻辑回归模型表现较其他模型准确。通过对比该模型与分子对接模型,进一步确认了该模型在中药化合物预测方面的稳定性;且本模型具有高通量筛选的特性,可以弥补分子对接在筛选化合物效率方面的不足,可作为抗纤维化中药化合物虚拟筛选预测的新方法。     

教学过程中大学生科学研究性思维的培养

大学生的科学研究性思维是检验大学课堂教学质量的重要指标。批判性思维与信息获取能力是科学研究性思维的组成部分。教学实践表明,在课堂教学过程中教师如果能够发挥教学的主导作用,调动学生的学习主动性,掌握科学思维和学生学习思考过程的规律,大学生科学研究性思维的形成是可能实现的。     

An animal study on transmission of hepatitis B virus through mosquitoes.

Three gena of mosquitoes were fed with human blood infected with hepatitis B virus (HBV) artificially. When blood in the stomach was completely digested, mosquitoes were used to bite monkeys Tnpaia Belangeri. A month after biting, venous blood samples were taken from the monkeys to detect serum HBsAg, HBeAg, Anti-HBs and Anti-HBc. Among 29 test monkeys, 9 were HBV infective serum markers positive, In 4 of 16 test monkey liver biopsies, acute inflammatory changes were found with Hematoxylin-Eosine staining. In the hepatic cells, HBsAg and HBcAg were detected by immuno-histochemical double-labeling assays, and HBV-DNA was also positive by in situ hybridization in monkey liver sections. These results provided an evidence for the possibility of transmission of HBV through mosquitoes and suggest its epidemiological significance in mosquito infested areas.     

霉酚酸对肝细胞自噬相关因子表达的影响

目的 比较日本爆发性丙型肝炎病毒1型(hepatitis C virus Japanese fulminant hepatitis-1,HCV JFH-1)感染的Huh7细胞中细胞自噬因子在霉酚酸(mycophenolic acid,MPA)处理组与对照组的表达差异,探讨MPA对肝细胞自噬相关因子的调节影响.方法 用HCV JFH-1感染Huh7细胞,用5μg/ml的霉酚酸处理细胞24 h,用实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real-time polymerase chain reaction,qPCR)和蛋白免疫印迹法测定细胞内HCV、微管相关蛋白1轻链3(microtubule-associated-protein 1 light chain,MAP1-LC3B,简写LC3B)、自噬相关因子3(autophagy-related gene 3,ATG3)和自噬相关因子7(autophagy-related gene 7,ATG7)的信使核糖核酸(messenger ribonucleic acid,mRNA)和蛋白相对表达量,比较上述因子在处理组和对照组之间的差异.结果 在核糖核酸(ribonucleic acid,RNA)和蛋白水平上,MPA可以降低HCV在Huh7细胞中的表达并且降低自噬标记物LC3B mRNA和LC3 B-II的蛋白质表达(均有P＜0.001);MPA可以使Huh7细胞中的自噬相关因子 ATG3和ATG7的mRNA和蛋白相对表达量下降(P ＜0.001;P =0.003;P=0.010;P =0.002).结论 MPA可以抑制HCV JFH-1在Huh7细胞中的复制和细胞自噬,并且可以下调自噬因子ATG3和ATG7的表达,推测MPA可能通过调节自噬关键因子表达来抑制细胞自噬从而拮抗HCV的复制.     

姜黄素对博来霉素诱导肺纤维化C57BL/6小鼠cathepsin K表达的影响

目的探讨姜黄素抗C57BL/6小鼠肺纤维化与组织蛋白酶K(cathepsin K)表达的相关性。方法博来霉素气管注射造小鼠肺纤维化模型,随机分组:对照组(气管内注入0.1 mL生理盐水),模型组(气管内注入0.025 U博来霉素),姜黄素组(气管内注入0.025 U博来霉素);造模第2天,对照组和模型组给予0.5%羧甲基纤维素钠生理盐水灌胃,姜黄素组给予200 mg/(kg.d)姜黄素(0.5%羧甲基纤维素钠助溶)灌胃,分别于造模后7、14、28 d取材。采用HE及Mallory染色观察肺组织病理学变化;应用免疫组化检测cathepsin K蛋白的表达,经图像分析各组之间的差异。结果 HE及Mallory染色结果显示姜黄素组、模型组与对照组比较都有不同程度的炎症及纤维化病灶,姜黄素组与模型组比较炎症及纤维化程度减轻;姜黄素组、模型组与对照组比较cathepsin K表达都有不同程度增加;姜黄素组与模型组比较cathepsin K蛋白表达显著增加,其中14 d,P<0.01;7 d和28 d,P<0.05。结论姜黄素可能是通过增加cathepsin K的表达从而降解胶原而实现抗纤维化作用。     

中心静脉置管在急诊血液透析治疗中的应用及护理

目的 总结急诊血液透析(HD)治疗患者建立临时性血管通路的经验及护理体会.方法 回顾性分析应用临时性中心静脉置管行急诊HD治疗病例173例,其中右颈内静脉置管130例(75.2%),右锁骨下静脉置管31例(17.9%),右股静脉置管12例(6.9%).分析不同置管方法临床并发症的发生率及处理方法.结果 血流量不足20例(11.6%),导管相关感染13例(7.5%),导管栓塞9例(5.2%),导管意外脱落8例(4.6%).经及时处理,无1例出现严重后果.结论 中心静脉置管具有方便快捷、操作简便、并发症低、预防和治疗并发症、提供足够血流量等优点,是建立急诊HD治疗临时性血管通路的理想方法.医护人员正确的操作技术和做好对病人的宣教和精心的护理是防治中心静脉置管各种并发症发生的关键.     

温脾汤对5/6肾切除大鼠残余肾脏影响的实验研究

目的　观察温脾汤对大鼠血清肌酐、尿素氮及 2 4h尿蛋白的影响。方法　采用 5 / 6肾切除方法制作大鼠肾纤维化模型 ,以PASM染色方法观察大鼠组织形态学变化 ,并应用图像分析技术对病理染色结果进行分析。结果　温脾汤能够显著降低 5 / 6肾切除大鼠的血清肌酐 (P <0 0 5 )、尿素氮 (P <0 0 1)水平及 2 4h尿蛋白 (P <0 0 1) ,降低肾重体重比 ,抑制残余肾脏的代偿性肥大 ,减轻肾小球硬化及肾间质纤维化程度。结论　温脾汤可降低肾重体重比 ,抑制残余肾脏的代偿性肥大 ,减轻肾小球硬化及肾间质纤维化程度 ,具有保护肾脏的功能     

293例腹膜透析相关性腹膜炎的致病菌及其耐药性分析

目的分析腹膜透析相关性腹膜炎（PDAP）致病菌的类型、药物敏感性及临床转归,以期为临床合理用药提供参考。方法回顾性分析2011年3月至2019年10月陕西省人民医院收治的PDAP患者293例,留取入院当日第1袋浑浊腹膜透出液进行致病菌培养,观察药敏试验结果、患者疗效及转归。结果293例患者腹膜透出液致病菌培养阳性率为75.09％,其中革兰阳性菌为70.00％,革兰阴性菌为24.09％,真菌为3.64％,混合感染为2.27％。革兰阳性菌感染比例男性高于女性,以凝固酶阴性葡萄球菌最多,占64.28％;革兰阴性菌感染比例女性高于男性,以大肠埃希菌最多,占47.17％。药敏试验结果显示葡萄球菌中耐甲氧西林金黄色葡萄球菌和耐甲氧西林凝固酶阴性葡萄球菌分离率分别为45.00%和45.45%。293例PDAP患者的治愈率为85.67%,拔管改血液透析率为8.53%,病死率为3.75%,放弃治疗率为2.05%。结论陕西省人民医院PDAP致病菌以革兰阳性菌为主,但存在性别差异,近8年PDAP治愈率较高。     

中药制剂分析实验教学改革初探

在如何提高中药制剂分析实验教学中合理安排实验内容、设计实验方案、教学模式和实验考核制度的改革等方面进行阐述,旨在通过实验教学改革,加强培养学生的基本操作技能,注重培养学生分析问题、解决问题的综合素质,锻炼学生的创造能力,为进一步提高中医药院校实验课程教学质量提供有益的探索。     

胶原纤维与器官纤维化

胶原纤维是组成细胞外基质的主要成分，在正常组织中发挥着重要作用。临床上多发的各种器官纤维化的主要病因在于胶原纤维的过度生成和降解严重不足，从而导致细胞外基质过度沉积。胶原纤维的装配与降解过程受严格的细胞调控，并有多种细胞因子参与该过程。如今，探索如何从不同水平人工干预胶原纤维的装配，从而逆转各种器官的纤维化已经成为医学及生物学研究的热点。本文综述了近年来胶原纤维与多器官纤维化方面的研究现状和取得的新观点。