深圳市健康无偿献血者外周血淋巴细胞表面人类白细胞抗原-E的基因型特异性表达研究

目的 探讨深圳市无偿献血个体的外周血淋巴细胞表面人类白细胞抗原(HLA)-E表达水平,并分析HLA-E基因型与HLA表达水平的相关性.方法 采用简单随机抽样法选择2015年8月至10月于深圳市血液中心无偿献血的82例献血者作为研究对象.采用Sepmate淋巴细胞分离管分离82例献血者的外周血淋巴细胞,然后采用流式细胞技术检测淋巴细胞表面HLA-E的表达水平;同时提取研究对象的外周血的DNA,采用PCR-直接测序法(SBT)进行序列测定,判定其HLA-E基因型;并且采用方差分析和t检验的统计学方法,分析比较不同HLA-E基因型献血者外周血淋巴细胞表面HLA-E表达水平的差异.结果 本研究82例献血者中,检出的HLA-E*01∶01/*01∶01基因型频率为20.7％(17/82),HLA-E* 01∶01/* 01∶03基因型频率为41.5％(34/82),HLA-E*01∶03/*01;03基因型频率为37.8％(31/82),3种基因型献血者的外周血淋巴细胞表面HLA-E相对表达水平分别为2.57±0.66、3.32±1.33和3.77±1.26,三者比较,差异有统计学意义(F=6.062,P＜0.05).其中,HLA-E* 01∶03/* 01;03基因型献血者外周血淋巴细胞表面HLA-E相对表达量最高,其次为HLA-E*01∶01/*01∶03基因型献血者,HLA-E*01∶01/* 01∶01基因型献血者外周血淋巴细胞表面HLA-E相对表达量最低,并且两两比较,差异均有统计学意义(HLA-E*01∶03/*01∶03基因型与HLA-E*01∶01/* 01∶03基因型比较,t=2.402,P＜0.05;HLA-E*01∶03/*01∶03基因型与HLA-E* 01;01/*01∶01基因型比较,t=4.212,P＜0.001;HLA-E*01∶01/* 01∶03基因型与HLA-E*01∶01/*01∶01基因型比较,t=3.054,P＜0.01).结论 深圳市健康献血人群外周血淋巴细胞表面HLA-E表达水平与其基因型密切相关.     

深圳地区汉族人群人类主要组织相容性复合体Ⅰ类链相关基因B基因多态性及其分布特征分析

目的 探讨深圳地区汉族人群人类主要组织相容性复合体Ⅰ类链相关基因(MIC)B等位基因多态性及分布特征.方法 选择2012年8月至2014年12月,于广东省深圳市血液中心献血的202例无血缘关系的深圳地区汉族健康献血者为研究对象.根据自行设计的MICB基因聚合酶链反应(PCR)扩增引物及测序引物,采用PCR-直接测序(SBT)法对献血者MICB基因第2～4外显子进行序列测定,并采用统计学方法对本组深圳地区汉族人群等位基因频率及基因多态性结果与不同地区人群进行比较.本研究遵循的程序符合深圳市血液中心人体试验委员会制定的伦理学标准,得到该委员批准,征得受试对象知情同意,并于采血前与之签订相关伦理学文件.结果 本组202例深圳地区汉族人群中,共检出的MICB等位基因10种,基因型24种.本组人群的MICB基因多态性以MICB* 00502基因型等位基因频率最高,占51.2％,其次为MICB* 00201 (19.8％),MICB* 00401 (8.7％),MICB* 014(5.7％)及MICB* 008(5.2％).MICB基因型以MICB* 00502-MICB* 00502频率最高,占35.6％.MICB* 013为威尔士人群特有基因,在深圳地区汉族、韩国、西班牙人群中均未检出.MICB* 018等位基因在德国健康人群、奥地利、摩洛哥、澳大利亚及其他亚洲人群中均未检出,在深圳地区汉族人群却有较高的等位基因频率,等位基因频率达1.5％.结论 深圳地区汉族人群的MICB等位基因分布与其他不同地区人群相比,具有高度的遗传多态性且有其自身分布特点.     

MICA基因第2～4外显子大规模双向测序及分子克隆检测平台的建立

目的 建立稳定的、大规模的MICA基因第2～4外显子双向测序分型检测技术平台,并分析其单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP).方法 自行设计MICA基因第2～5外显子扩增引物及测序引物,探索PCR扩增及测序的最佳反应条件.用商品化的MICA基因单向测序分型试剂盒作为平行对照,对4个包含MICA* 010等位基因的样本采用自行设计引物扩增,并进行分子克隆和单倍体测序.结果 采用自行建立的MICA基因双向测序分型方法验证了100人份平行对照组单向测序分型结果.应用本研究建立的方法获得了中国人群MICA基因第2～4外显子22个SNP位点.两个新等位基因MICA* 065、MICA* 066获得了世界卫生组织的正式命名.首次发现了MICA等位基因第3内含子新的SNP位点,序列已提交IMGT/H LA数据库.结论 建立的MICA基因双向测序方法可大规模应用于中国人群的MICA基因多态性、组织器官移植配型和疾病研究.     

两种不同的KIR基因分型方法的对比研究

目的 探讨常用的序列特异性引物-PCR(PCR-SSP)及流式序列特异性寡核苷酸探针(Flow-rSSO)杂交方法在杀伤细胞免疫球蛋白样受体(KIR)框架基因分型结果中的符合率和准确性.方法 随机选择2011年6月77例深圳造血干细胞捐献者的外周血样,分别用PCR-SSP及Flow-rSSO商品化试剂盒进行KIR框架基因定型,分别通过凝胶电泳图及HLA Fusion 2.0 Research软件分析法,分析结果的一致性.对初检结果不一致的样本,采用同一厂家、不同批号的商品化试剂盒进行复检,并采用美国国立卫生研究院癌症研究所KIR PCR-SSP方法进行检测.结果 77例样本中,75例完全一致,另2例(2.6％) KIR2DL2的结果不一致,PCR-SSP方法对KIR 2DL2的初检、复检检测结果均为阴性,但用Flow-rSSO Lot#004批号试剂盒检测结果为阳性.更换新的Flow-rSSO Lot# 005批号试剂盒复检,结果与PCR-SSP方法的检测结果相一致.结论 为保证KIR基因分型的准确性,开展KIR基因分型的室内、室间质控工作至关重要.     

应用流式微珠高分辨分型方法对深圳汉族人群HLA基因频率的研究

目的 统计深圳地区汉族人群HLA-A,HLA-B和HLA-DRB1基因频率,分析该人群HLA等位基因多态性及其特点.方法 应用one Lambda公司的SSO分型试剂和Luminex流式微珠分析仪对457名健康、无血缘关系的深圳汉族人群标本进行高分辨分型检测.结果 共检出等位基因:A位点30个,B位点60个,DRB1位点39个.频率从高到低依次为A*1101(0.274 6),A*2402(0.154 3),A*3303(0.100 6);B*4001(0.141 1),B*4601(0.124 7),B*5801(0.084 2);DRB1*0901(0.138 9),DRB1*1202(0.106 1),DRB1*1501(0.097 3);基因型频率最高的分别为HLA-A*1101,2402(0.096 2);HLA-B* 4001,4601(0.037 3);HLA-DRB1*0901,1202(0.035 0).结论 深圳汉族人群HLA基因具有较为丰富的多态性,与国外不同人群比较,其基因频率分布既与亚洲人群有相似之处,又具有中国人群自身特点.     

汉族人群中新等位基因人类白细胞抗原-DPA1~*01:11的鉴定

背景:在群体遗传学研究中,发现一个样本人类白细胞抗原-DPA1位点结果异常,而国际上与人类白细胞抗原-DPA1等位基因相关的报道较少。目的:鉴定一个人类白细胞抗原-DPA1*01相关的新变异等位基因。方法:在群体遗传学研究中,采用PCR产物直接测序分型方法,对人类白细胞抗原-DPA1基因第2外显子进行双向测序。对出现异常分型结果的样本,进行分子克隆和单倍体测序。结果与结论:发现一个样本的人类白细胞抗原-DPA1位点结果异常,经分子克隆和单倍体测序,检出了一个正常的人类白细胞抗原-DPA1*01:03和一个DPA1*01相关的新变异等位基因,该新等位基因的序列与DPA1*01:03的序列最接近,其差异是在第二外显子区域的242位碱基发生A>G的替换,并导致了相应的第50位密码子由CAA>CGA,编码的氨基酸残基由谷氨酰胺变成精氨酸。该等位基因为人类白细胞抗原新的等位基因,已被世界卫生组织人类白细胞抗原因子命名委员会正式命名为人类白细胞抗原-DPA1*01:11(提交序列号HWS10015443)。     

HLA-A、B和DRB1流式微珠高分辨分型方法结果分析

目的 分析流式微珠高分辨分型试剂检测样品HLA-A、B和DRB1的结果.方法 用美国one lambda公司流式微珠高分辨分型试剂对631例骨髓库样品进行HLA-A、B和DRB1三个位点的检测,计算用此试剂最终能得出高分结果 的比率.结果 631份样本中,三个位点均仅出现一组结果的只有3例,占0.475%.出现多组结果,但根据ASHI及NMDP标准能判为高分辨的,A位点有489例,占77.50%;B位点有520例,占82.41%;DRB1位点有582例,占92.23%;A、B和DRB1三个位点均能得出高分辨结果的有374例,占59.27%.结论 使用流式微珠高分辨试剂指定高分辨结果是可行的,大多数标本可获得高分辨结果.     

深圳地区人群乙型肝炎病毒携带者HLA-DRB1 等位基因多态性及关联性分析

目的　研究深圳地区人群乙型肝炎病毒携带者人类白细胞抗原（human leukocyte antigen,HLA）DRB1 的等位 基因多态性分布特征,探讨乙型肝炎病毒携带与HLA-DRB1 等位基因之间的关联性。方法　采用聚合酶链反应- 直接 测序分型技术（PCR-SBT）对163 例深圳地区乙型肝炎病毒携带者（携带组）和314 例健康人群（对照组）进行HLADRB1 等位基因的检测,运用统计学方法比对分析两组人群的基因分型结果。结果　对照组检出的HLA-DRB1 等位基 因有32 种,其中占比大于5% 的基因型有6 种,分别为HLA-DRB1*09:01（16.40%）,12:02（11.15%）,15:01（9.87%）, 08:03（8.91%）,11:01（6.05%）和04:05（5.10%）;携带组中检出的HLA-DRB1 等位基因有28 种,其中占比大于5% 的基因型有6 种,分别为HLA-DRB1*09:01（20.55%）,12:02（14.72%）,15:01（9.20%）,03:01（7.06%）、08:03（5.52%） 和11:01（5.21%）。其中,携带组中HLA-DRB1*03:01 检出率高于对照组,差异有统计学意义（P=0.010）。结论　深 圳地区人群感染乙肝病毒的机会与HLA-DRB1*03:01 呈正相关。     

529例中国汉族健康人群HLA-DQB1基因型遗传特征研究

目的 探讨中国汉族健康人群HLA-DQB1基因型遗传特征.方法 应用聚合酶链反应-测序分型(polymerase chain reaction sequence-based typing,PCR-SBT)法对529例中国汉族健康人群HLA-DQB1位点进行基因测序分型.结果 在529例中国汉族健康人群中,共检出18种等...