基于基因组SNP信息分析新疆夏洛莱牛群体的遗传结构和遗传背景初报

近50年来，引入的夏洛莱牛在塔额盆地已初步形成遗传性能稳定、产肉性能好的新类群。然而，在夏洛莱牛的杂交改良和选育过程中，缺乏系统的育种档案资料，存在着群体遗传背景不清、血缘关系不明等问题。本研究利用基因组高通量检测技术，分析新疆夏洛莱杂交新类群核心群中的全基因组水平SNPs变化，样本SNP数据平均检出率（Call Rate值）大于90%(99.40%)，检测后分析群体中有效群体含量（Ne）、群体的多态性标记比例（Pn），群体的期望杂合度（He）和观察杂合度（Ho）等数据，得出现有新疆夏洛莱核心群体的纯度较好，有效群体含量为28.69，个体间的亲缘关系呈中等程度、整个群体分为26个家系，个体基于ROH的近交系数值是0.030。结论：基因组分析运用高通量测序，通过关联分析，对新疆夏洛莱肉牛群体明确系谱信息，开展全基因组选育，指导组建核心育种群，为群体的遗传背景和血缘关系提供科学依据，对提高今后新疆夏洛莱群体选种的正确性,缩短世代间隔,建立现代新型良种繁育体系有重要的意义。