噬菌体生物扩增法与常规方法在结核分枝杆菌检测中的比较

目的评价噬菌体生物扩增技术在结核分枝杆菌快速检测中的临床应用价值,并与其他两种常规方法进行比较。方法应用噬菌体生物扩增法（PhaB法）、Bactec 960培养法、涂片法同时对135份临床确诊为结核病（包括肺结核、结核性胸膜炎、结核性脑膜炎）的患者的标本（痰、胸腔积液、肺泡灌洗液、脑脊液）以及排除结核病的患者（21例慢性支气管炎、20例支气管扩张病、18例肺癌、8例肺炎）的痰液共计67份进行检测。结果 135份标本应用噬菌体生物扩增法、Bactec 960培养法与涂片法的阳性率为48.2%、44.4%、28.2%。噬菌体生物扩增法的阳性检出率较高于涂片法,差异有统计学意义,阳性符合率为58.5%（38/65）,阴性符合率为95.7%（67/70）,总体符合率为77.8%（105/135）。噬菌体生物扩增法与Bactec 960培养法比较差异有统计学意义,阳性符合率为78.5%（51/65）,阴性符合率为72.9%（51/70）,总体符合率为75.6%（102/135）。在涂片阴性、Bactec 960培养法检测均为阴性的75例标本中,用噬菌体生物扩增法检测出11例阳性,其检出率为14.7%。67份排除结核病的痰标本应用三种方法的阳性率均为0%。结论噬菌体生物扩增法检测结核分枝杆菌在诊断结核病中有较好的灵敏度和特异度,是辅助诊断和鉴别诊断结核病的有效手段。     

TRIM22通过PI3K/AKT信号通路调控胶质母细胞瘤增殖、侵袭和迁移的研究

目的：探讨基因TRIM22在人脑胶质母细胞瘤中的表达及对增殖、侵袭和迁移等生物能力的影响。方法：通过TCGA数据库分析胶质母细胞瘤组织和正常脑组织中TRIM22表达水平,采用实时定量PCR（qRT?PCR）和Western blot 两种方法分别检测胶质母细胞瘤细胞系U87和U251中TRIM22 mRNA和蛋白表达水平。应用Lipofectamine 3000将2种TRIM22?siRNA分别转染至U87及U251细胞中,再分别通过qRT?PCR和Western blot检测胶质母细胞瘤细胞中TRIM22敲低效率。 应用CCK?8法、细胞平板克隆形成实验来评估TRIM22敲低后对于细胞增殖能力的影响;应用细胞划痕实验和Transwell实验检测TRIM22敲低后细胞侵袭和迁移能力的变化。应用Western blot检测TRIM22敲低对PI3K/AKT信号通路蛋白和上皮间质化标记蛋白（N?cadherin、Vimentin、E?cadherin）表达的影响。结果：在U87及U251细胞中敲低TRIM22后,细胞增殖、侵袭和迁移都明显减弱,p?AKT（S473）、N?cadherin、Vimentin表达水平则明显降低,E?cadherin表达水平明显升高。结论：TRIM22可能通过调节PI3K/AKT信号通路调控胶质母细胞瘤增殖、侵袭和迁移能力。     

基于生物信息学对成人与青少年皮肌炎差异表达基因及关键通路的分析

目的 通过生物信息学方法筛选成人皮肌炎(adult dermatomyositis, ADM)和青少年皮肌炎(juvenile dermatomyositis, JDM)肌肉组织的核心基因和关键通路,为DM的研究提供新的理论依据。方法 从GEO(Gene Expression Omnibus, GEO)数据库下载符合筛选标准的基因表达芯片数据,分为ADM组和JDM组。利用R语言的相关软件包对两组数据进行处理,获得差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)并对其进行功能富集分析;利用STRING数据库及Cytoscape软件筛选核心基因并通过ROC曲线加以验证;借助CIBERSORT算法分析ADM组和JDM组免疫细胞浸润情况,使用Spearman相关性分析研究两组核心基因表达量与免疫浸润细胞丰度之间的相关性。结果 ADM组共筛选出552个DEGs,其中上调基因402个,下调基因150个。这些基因主要与信号转导、细胞质和蛋白质结合等方面有关,并富集在Epstein-Barr病毒感染、甲型流感和钙信号等通路上。JDM组共筛选出235个DEGs,上...     

常见倾向性评分匹配方法在真实世界研究中的应用

目的 倾向性评分匹配在真实世界研究中的应用评价。方法 采用最邻近匹配、卡钳半径匹配和逆概率加权匹配。结果 在大样本下小的卡钳半径能达到很好的匹配效果,但会损失部分信息。逆概率加权和最邻近匹配能保留所有信息,但是会造成过度匹配。结论 实际应用中,应根据样本量大小、混杂因素的数量和最终的分析目的来选择合适的匹配方法。大样本情况下可以选择卡钳值较小的匹配,使组间可比性增加。