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目的研究广西HIV-1 CRF01-AE重组毒株env基因V3环序列变异及其与生物表型间的关系。方法从广西主要流行区收集来的50份HIV-1感染者血液样本中提取前病毒DNA,使用巢式聚合酶链反应(nested-PCR)扩增HIV-1 env基因片段并进行亚型鉴定,选择38份CRF01-AE重组型HIV-1毒株env,基因V3环及邻近区域的序列进行系统树和氨基酸变异分析。结果38份CBF01-AE重组毒株中36份与分离于广西地区的CRF01-AE.97CNGX2f和泰国代表毒株THCM240接近,另外2份与中非共和国代表株90CF402聚成一簇;CRF01-AE重组毒株V3环顶端四肽存在着4种类型:CPCQ、GPGR、GPGH和GPGA;根据V3环关键氨基酸推测辅助受体使用情况,结果显示:71.05%的CRF01-AE重组毒株可能使用CCR5作为辅助受体,28.95%不能对其辅助受体的使用情况做出预测。结论广西HIV-1 CRF01-AE重组毒株V3顶端四肽变异较大,而且大部分毒株可能为NSI型。这可为广西该毒株的防治和诊断试剂的更新提供参考。 相似文献
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目的 对比分析人工智能(artificial intelligence, AI)显微镜辅助和显微镜下视觉评估判读乳腺癌新辅助治疗后肿瘤浸润淋巴细胞(tumor infiltrating lymphocytes, TILs),探讨利用AI结合病理医师判读新辅助治疗后TILs的临床适用性。方法 收集行新辅助治疗乳腺癌且未获得完全缓解病例50例,由9名不同级别的病理医师通过视觉评估和AI显微镜辅助评估TILs。采用组内相关系数(intra-group correlation coefficient, ICC)和Bland-Altman散点图进行一致性分析。结果 视觉评估组9名病理医师间TILs判读结果差异有统计学意义(P<0.05,ICC=0.741,95%CI=0.656~0.821),仅高级病理医师对TILs判读结果差异较小,中级及初级病理医师的TILs判读结果差异有显著性(P<0.05)。通过AI显微镜辅助判读,不同级别病理医师对TILs判读结果差异无显著(ICC=0.955,95%CI=0.931~0.971),判读结果达到优等一致性。同时,通过对比AI辅助组与视觉评估组... 相似文献
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本文报道胸膜纤维板剥脱术治疗小儿慢性脓胸62例,随访40例,全部治愈。讨论了手术适应证,认为术前纠正患儿的消耗状态有助于提高手术的安全性。着重讨论了手术方法,强调应尽可能完整切除胸膜纤维板。 相似文献
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目的 分析柳州市1998-2012年新发现HIV基因亚型变化,比较HIV感染者首次CD4+T淋巴细胞计数(CD4),为艾滋病防治提供参考依据。方法 选取我国艾滋病综合防治信息系统中1998-2012年柳州市新发现HIV感染者,对其血浆进行RNA提取、扩增、测序和分型。采用Coharan-Armitage趋势检验法分析HIV基因亚型变化的趋势,采用Wilcoxon秩和检验法分析比较HIV感染者的首次CD4。结果 研究对象共有1 877例HIV感染者。1998-2012年,CRF01_AE、CRF01_AE(Cluster 1)和CRF07_BC亚型构成比分别从78.4%(76/97)上升至91.5%(1 441/1 574)、63.9%(62/97)上升至74.0%(1 164/1 574)和17.5%(17/97)下降至4.6%(72/1 574),趋势性检验差异均有统计学意义(Z=4.632,P<0.001;Z=2.455,P=0.014;Z=-5.943,P<0.001)。CRF01_AE(Cluster 1)、CRF01_AE(Cluster 2)、CRF07_BC和CRF08_BC亚型HIV感染者首次CD4的中位数及四分位数间距分别是230(83~375)、215(48~351)、365(254~503)和334(206~479)个/μl。CRF01_AE(Cluster 1)和CRF01_AE(Cluster 2)亚型HIV感染者的首次CD4均Z=-4.795,P<0.001;Z=-4.238,P<0.001)。结论 1998-2012年柳州市新发现HIV感染者以CRF01_AE亚型为主并呈上升趋势,其首次CD4较低,且新发现CRF01_AE亚簇的种类在增加,其亚簇构成比存在变化趋势。 相似文献
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HIV分子网络是近期被广泛报道的一种研究HIV感染者传播特征的方法,各国利用此方法在传播关系、传播热点、疫情监控等方面进行了大量的研究,有望为实现精确干预和防控提供依据。目前国际上主要报道有3种构建分子网络的方法:基于两两比对基因距离法、基于系统进化树节点校验值法、基于两者联合参数法。本文综述3种构建HIV分子网络方法研究HIV感染者传播特征的相关进展,以期为应用于指导防控HIV提供数据支撑。自分子网络方法出现以来,我国北京市、上海市、浙江省、四川省等陆续报道了应用分子网络方法分析的相关研究结果,为进一步开展精准防控提供了科学数据。近期国际上相关研究也预测基于分子网络的传播簇检测有望成为终结艾滋病流行的一种新方法。 相似文献
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目的 分析中周南方四省区HIV-1感染者中流行CRF01 AE病毒株的遗传特征.方法 从广东、广西、江西和湖南省(自治区)2006年新报告HIV-1感染者的血浆样本中提取病毒RNA,用反转录/巢式PCR方法扩增gag和env基因片段,对获得的CRF01 AE病毒株核酸序列进行系统进化分析,并通过计算基因距离和Entropy核苷酸多态性差异方法分析毒株的遗传特征.结果 从210例CRF01_AE病毒株感染者中,发现四省区流行的CRF01 AE病毒株存在2个主要的流行簇.流行簇Ⅰ共有123例样本,未发现与之直接相关的国际参考毒株.流行簇Ⅱ共有57例样本,与越南CRF01 AE病毒株关系密切,且存在不同时间样本的混杂.gag和env基因遗传距离分析结果表明,流行簇Ⅰ内基因遗传多样性均明显小于流行簇Ⅱ;核苷酸多态性分析结果显示,在gag基因片段42个位点核苷酸组成具有显著差异,env基因片段40个位点核苷酸组成存在显著差异;流行簇Ⅰ相对于流行簇Ⅱ多态性减少的位点上有61个,多态性增加的位点有21个.结论 在中国南方四省区流行的CRF01 AE病毒株中首次观察到2个独立的流行簇.流行簇Ⅰ病毒株为该地区最主要的CRF01 AE病毒株,其流行时间相对较短,在人群中所占比例较多,可能是病毒在流行过程中形成的具有传播优势的病毒株.流行簇Ⅱ病毒与来自于越南的CRF01 AE病毒株有较高同源性,且存在与越南病毒株间的多次传播. 相似文献
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安徽省人类免疫缺陷病毒1型流行毒株基因序列变化和亚型特征分析 总被引:2,自引:0,他引:2
我国人类免疫缺陷病毒1型(human immunodeficiency virus 1,HIV-1)流行毒株亚型复杂,自1996年以来,已报道A,B,B',C,D,F,亚型CRF01_AE,CRF02AG和CRF_BC重组毒株等亚型在我国同时流行[1-2]. 相似文献
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目的 调查2013年云南省德宏州未经抗病毒治疗的HIV-1感染者的基因型分布和耐药毒株传播水平.方法 根据HIV耐药警戒线调查实施方案,对2013年1-8月德宏州符合要求的54份年龄在16~25岁,新发现的HIV-1感染者的血浆样本进行HIV-1基因型检测和耐药毒株传播水平分析.结果 48份样本完成了基因型及耐药鉴定,中国籍占45.8%,缅甸籍占54.2%.通过进化分析对pol区进行分型,主要的基因型包括:C亚型(41.7%)、URF(31.3%)、CRF01_AE(12.5%)、CRF07_BC(10.4%)、CRF08_BC(2.1%)和B亚型(2.1%).中国籍感染者中首位的基因型是C亚型,而外籍感染者中首位的基因型是URF.在1份缅甸籍样本序列中检测到1个针对非核苷类反转录酶抑制剂类药物的耐药突变位点(K103N),按照耐药警戒线的统计方法估算耐药毒株流行率为< 5%.结论 本次调查提示德宏州新报告的HIV-1感染者中存在复杂的基因型,HIV-1耐药毒株处于低度流行水平.为控制耐药传播水平的上升,应进一步规范本地艾滋病抗病毒治疗及管理,并针对跨境传播开展包括耐药传播在内的相关监测. 相似文献
100.