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心血瘀阻证动态演变过程生物信息学研究 总被引:1,自引:0,他引:1
目的探讨冠心病心血瘀阻证动态演变过程中血瘀证前期、亚血瘀证期、心血瘀阻证期3个阶段的代谢组学通路。方法信号通路分析采用KEGG,代谢产物分子注释、相关的酶或转运蛋白及其相关性质分析采用HMDB,代谢产物路径可视化采用metPA网络软件。结果用MetPA分析的生物代谢通路显示,12个代谢产物参与了22条代谢路径。其中6条通路(氨酰-tRNA生物合成、缬氨酸,亮氨酸和异亮氨酸生物合成、缬氨酸,亮氨酸和异亮氨酸生物合成及降解、精氨酸和脯氨酸代谢、半乳糖代谢,D-精氨酸与D-鸟氨酸代谢)的影响值P0.05。结论 6条密切相关的通路主要集中在亚血瘀证期和心血瘀阻期。 相似文献
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目的以血压正常的wistar大鼠为对照,研究自发性高血压大鼠(spontaneously hypertensive rats,SHR)左心室肥厚心肌组织的小分子产物变化。方法采用气相色谱-质谱联用仪(GC-MS),对组织代谢产物进行检测分析;应用偏最小二乘法判别分析(partial least squares discriminant analysis,PLS-DA)分析差异代谢产物谱。依据变量重要性(VIP)、自变量系数探索SHR发生左心室肥厚心肌时代谢产物。结果与SHR组呈正相关的是:90角鲨烯、51对苯二甲酸、87麦芽糖、68棕榈油酸、77葡萄糖-6-磷酸1、8 2-羟基丁酸、78未知、74油酸、56果糖1、28三氰丙氨酸;负相关的是:21琥珀酸、24富马酸、2丙酮酸、34天门冬氨酸1、85未知、45未知、88甘油单油酸酯、86油精。结论进一步证实高血压导致的左心室肥厚与心肌细胞结构破坏以及能量失衡密切相关。 相似文献
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目的研究自发性高血压大鼠(spontaneously hypertensive rats,SHR)左心室肥厚心肌组织的蛋白质变化。方法对8只SHR与8只WKY大鼠组织蛋白质进行i TRAQ检测分析;通过对差异蛋白Pathway富集分析选择与通路相关的蛋白质。结果筛选出与通路相关的40个差异蛋白,SHR与WKY比较上调的差异蛋白有:1主要组织相容性复合物、2血小板活化因子乙酰水解酶、3有丝分裂原蛋白激酶、4热休克27k Da蛋白、5 Ighg3、6 14-3-3γ蛋白、7纤维蛋白原、8蛋白酶体26S、9纤维蛋白原γ链、10中性胆固醇酯水解酶、11溶血PAF乙酰转移酶、12纤连蛋白。下调的差异蛋白有:13丝氨酸蛋白酶、14载脂蛋白H、15血清锌α2糖蛋白、16泛醌9、17泛醌7、18α2-AP、19激肽原、20肝素2、21未知蛋白、22钠钾ATP转移酶、23胶原蛋白、24集聚蛋白、25对羟基苯丙酮酸双氧化酶、26C反应蛋白、27整合素、28凝血因子Ⅻ、29胎球蛋白、30整合素α7、31碳酸酐酶、32CD36、33免疫球蛋白重链γ多肽、34转胶蛋白、35血红蛋白-α。结论 SHR左心室肥厚发生涉及心肌凋亡、细胞增殖增生、炎症等多种细胞因子,导致细胞损伤与保护作用失衡。 相似文献
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冠心病血瘀证的DNA甲基化修饰与磁场干预的相关性探讨 总被引:1,自引:0,他引:1
基于甲基化的表观遗传学在阐明疾病基因和环境相互作用方面发挥重要作用。本文从对冠心病遗传基因甲基化和磁场干预研究、冠心病血瘀证的分子遗传学研究、磁场和中医证型的相关性研究等方面出发,探讨内外界环境磁场与冠心病血瘀证的表观遗传学之间的相关可能性机制。为从基因表达-内部表型-疾病模式-磁场干预的系统生物学角度出发进行个体化差异预防和治疗心血管疾病提供思路和方法。 相似文献
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目的:探讨湖南地区人群早发冠心病(CHD)血瘀证与血管紧张素原(angiotensinogen,AGT)基因Rs4762和Rs699多态性的关系。方法:通过基于飞行时间质谱分析技术(TOF-MS)和等位基因特异性PCR技术方法,从湖南地区人群中选取早发冠心病血瘀证患者50例,早发冠心病非血瘀证患者26例,非早发冠心病患者36例和健康对照组19例,对AGT基因Rs4762(T174M/C3889T)和Rs699(M235T/T4072C)多态性位点进行检测,分析四组等位基因频率以及基因型频率的差异性。结果:Rs4762、Rs699多态位点的等位基因在湖南地区人群中早发冠心病血瘀证组与健康对照组之间存在显著差异性(χ2=14.872,P<0.01;χ2=9.512,P<0.01),Rs4762、Rs699多态位点的基因型在湖南地区人群中早发冠心病血瘀证组与健康对照组之间也存在差异性(χ2=13.371,P<0.01;χ2=7.889,P<0.05)。结论:AGT基因Rs4762、Rs699多态性与湖南地区人群早发冠心病血瘀证均有相关性,Rs4762多态位点和Rs699多态位点CC型基因是湖南地区人群早发冠心病血瘀证的易感基因。 相似文献
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目的研究复方钩藤降压片干预自发性高血压大鼠(SHR)心肌组织蛋白质变化及高血压左心室肥厚潜在机制。方法将16只SHR分为2组后,治疗组予以复方钩藤降压片灌胃干预,对照组予以蒸馏水灌胃,干预12周后采取大鼠心肌组织蛋白质进行同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)检测分析。通过对富集Pathway分析,得到差异蛋白及通路,并将得到的差异蛋白利用STRING数据库绘制差异蛋白功能联系。结果差异蛋白富集Pathway分析提示存在11条通路。差异蛋白中上调蛋白6种,分别为:转胶蛋白、碳酸酐酶3、S期激酶相关蛋白1、C反应蛋白、纤维蛋白5、C-1-四氢叶酸合成酶;下调蛋白12种,分别为:谷胱甘肽S-转移酶、Ighg3蛋白、组氨酸三联核苷酸结合蛋白2、60S核糖体蛋白L4、40S核糖体蛋白S6、60S核糖体蛋白L13、14-3-3蛋白、LOC100911337蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶1、丝氨酸羟甲基转移酶、蛋白激酶B、泛素-40S核糖体蛋白S27A。在string绘制的关系网中:60S核糖体蛋白L4、40S核糖体蛋白S6、60S核糖体蛋白L13、泛素-40S核糖体蛋白S27A之间关系最为密切。结论复方钩藤降压片对高血压左心室肥厚的干预主要与改善血供、优化能量代谢、抑制心肌细胞的异常生长、增加血管和心脏的纤维蛋白密切相关;高血压左心室肥厚的发生可能与核糖体蛋白有关。 相似文献
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探讨养心通脉有效部位方(apr-YTF)对梗死心肌细胞因子分泌、血管新生及动员骨髓间充质干细胞(MSCs)归巢的影响。方法:取急性心肌梗死造模成功的SD雄性大鼠32只,随机分为apr-YTF组、香丹注射液组、重组人粒细胞集落刺激因子(rhG-CSF)组和模型对照组4组,每组8只;均于造模3h后给予相应药物,连续5d。经masson’s三色染色检测心肌瘢痕组织微小血管密度,免疫组化的方法检测心肌组织中CD34+细胞、Ⅷ因子、血管内皮生长因子(VEGF)、碱性成纤维细胞生长因子(bFGF)、血管内皮生长因子受体(Flk-1)的含量表达。结果:单个高倍视野下apr-YTF组和rhG-CSF组的心肌毛细血管数较模型组显著增加(P<0.01);与模型组比较,2组的CD34+细胞、Flk-1、bFGF表达显著增加(P<0.01),2组的Ⅷ因子表达亦增加(P<0.05),apr-YTF组的VEGF表达比模型组显著增加(P<0.01),rhG-CSF组的VEGF表达较模型组亦增加(P<0.05)。结论:apr-YTF能促进Ⅷ因子、Flk-1、VEGF、bFGF的分泌,促进血管新生,促进大鼠外周血MSCs归巢于急性梗死的心肌,... 相似文献
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目的:对养心通脉有效部位方(apr-YTF)应用于骨髓间充质干细胞(BMSCs)的作用蛋白组学蛋白进行生物信息学分析。方法:根据核素标记相对和绝对定量(iTRAQ)蛋白组学技术确定的apr-YTF对BMSCs作用靶点的差异蛋白,通过DAVID数据库搜索软件结合GO数据库搜索,进行注释和富集度分析,KEGG数据库进行信号转导通路分析;VISANT数据库检索蛋白质相互作用。结果:差异蛋白主要参与102种生物学过程、35种细胞组分、6种分子途径,差异蛋白主要参与3条信号转导通路,这些蛋白在3条信号转导通路上相互发生作用。结论:处于差异蛋白功能交互网中交叉点位置的Presenilin-1、Presenilin-2通过Notch信号通路,Syntaxin-4蛋白通过可溶性N-乙基顺丁烯二酰亚胺敏感性的融合蛋白附着蛋白(SNARE)信号通路,丝裂原活化蛋白激酶12(MAPK12)通过MAPK信号通路在apr-YTF诱导BMSCs向心肌分化过程中发挥重要作用,养心通脉有效部位方对骨髓间充质干细胞的作用是在多位点、多环节、多种生物学进程中发挥作用的,蛋白质组学生物信息学技术可以站在“整体观”的角度对中医药的作用机制作出预测,结合分子生物学验证是一条很好的中医药现代化途径。 相似文献