2008年北京市HIV-1耐药株传播调查

目的 了解2008年北京市未经抗病毒治疗HIV-1感染者中耐药株传播水平,为耐药监测和临床抗病毒治疗工作提供本底资料.方法 参照WHO提出的HIV耐药警戒线调查方法(HIV drug resistance threshold survey,HIVDR-TS)指导方案,收集6个月内检测发现的60～70名小于25岁的感染者血浆样本,检测HIV-1 pol区亚型及耐药基因型,并计算耐药株检出率、评价传播水平.结果 61份符合要求的样本共获得50个有效pol区序列.感染途径以同性传播为主,占62%;亚型分布以B(42%)、CRF01_AE(28%)、CRF07_BC(26%)3种为主.出现1例针对PI类药物的耐药突变株,检出率为2%(1/50);出现1例针对NRTI类药物的耐药突变株,检出率为2%(1/50);未出现针对NNRTI类药物的耐药突变株,检出率为0.蛋白酶(PR)区和逆转录酶(RT)区的耐药突变株检出率均为2%,均属于低度传播范围(<5%).结论 北京市未经抗病毒治疗HIV-1感染者中出现PR和RT区的耐药突变株,传播水平尚处于低流行状态,现有的抗病毒治疗方案是可行的,治疗前尚不需要进行大规模耐药性检测.     

一种HIV-1耐药基因型检测方法的一致性分析

目的评价一种实验室自建（in-house）HIV-1耐药基因型检测方法的可重复性。方法从2008-2010年已进行HIV-1耐药基因型检测（in-house法）的样品中抽取204份再次进行基因型检测,包括核酸的提取、扩增、测序和序列分析,对两次的耐药结果进行比较。结果 204份样品中,对群体耐药发生的判断上一致性很高,可达98.5%（201/204）,在每种抗病毒药物是否发生耐药的判断上[92.2%（188/204）]具有一致性,对每种抗病毒药物的耐药程度判断一致性为81.9%（167/204）,84份样品中共有159个位点在两次检测中出现耐药突变位点上不一致的情况,其中不完全一致的位点有149个,蛋白酶区第71位（13/204,6.4%）和逆转录酶区第103位分别出现最多（12/204,5.9%）,完全不一致的位点有10个,出现在蛋白酶区第71位,核苷类逆转录酶抑制剂（NRTI）耐药相关突变位点第67、69、70、215、219位,以及与非核苷类逆转录酶抑制剂（NNR-TI）耐药相关突变位点第90、181、221位。结论 in-house方法双重检测对耐药发生及耐药程度的判断上总体具有良好的一致性。但在方法学尤其是混合碱基的判读上需进一步标化以达到更好的可重复性。由于混合碱基的判读会影响耐药突变位点的确定,加强对检测人员的培训,使他们更加严格地执行混合碱基的判断标准和控制序列的质量是非常重要的。     

我国主要HIV-1流行株耐药基因型检测方法的研究

目的 研究针对中国主要HIV-1流行株优化的实验室自建耐药基因型实验室自建检测方法( in-house)的扩增效果及检测敏感度.方法 选取中国主要流行亚型的B、CRF07 _BC、CRF01_AE亚型各10份样本,这些样本为2007 -2009年本实验室采集采自河南、新疆、湖南三地已接受抗病毒治疗患者的样本,并已确定亚型.选用生物梅里埃公司的Nuclisens Easy Q方法对选取的30份样本的病毒载量平行进行3次病毒载量检测,取平均值作为载量数值.对每份样本用HIV阴性血浆进行5个浓度的梯度稀释,稀释为＞ 1000、401～1000、101 ～400、50 ～100和＜50拷贝/ml 5个浓度梯度.提取核酸后,进行RT-PCR和巢式PCR扩增,对扩增结果进行统计扩增结果,确定每种亚型的扩增效果和最低检测限.随机选取12份样本的初浓度和最低浓度进行测序,对测序结果进行耐药结果分析和序列一致性分析.结果 所选样本的病毒载量介于2.03×102 ～5.92×104拷贝/ml之间.自建的In-house法对载量50 ～1000拷贝/ml范围的样本仍可达到较高的扩增效果(86％).样本稀释前后耐药位点相似,序列一致性在97％以上,在低病毒载量时优势病毒株的检测则更敏感.结论 自建的实验室方法的灵敏度较高,对低病毒载量水平的样本仍有较高的扩增效果.     

基于HIV-1 pol基因DNA或RNA序列的分子传播网络的配对比较

目的 了解HIV感染者成对pol区DNA序列和RNA序列构建分子传播网络的差异，为利用DNA序列构建分子传播网络提供科学数据。方法 采集广西柳州2014年本底存活和2015—2018年新报告HIV感染者全血和血浆标本，分别进行DNA和RNA提取、序列扩增和序列测序、序列拼接、序列比对及亚型判定，构建DNA序列和RNA序列分子传播网络，并比较DNA序列构建的分子传播网络和RNA序列构建的分子传播网络的一致性。结果 本研究中2014年本底和2015—2018年新报告HIV感染者共2 983例，其中2014年本底仅有DNA序列2 590例、2014年本底和2015—2018年新报告的成对pol区DNA序列和RNA序列分别为196例和197例。在393例成对pol区DNA序列和RNA序列中，DNA序列和RNA序列的基因亚型一致，成对DNA序列和RNA序列的基因距离比较差异无统计学意义（Z=-2.72,P=1.00）。2015—2018年新报告HIV感染者成对pol区DNA序列和RNA序列与2014年本底DNA序列构建的分子传播网络连接一致性为91.4%(180/197);2015—2018年新...     

中国2007-2009年HIV-1耐药基因型检测质量评估结果

目的对2007-2009年统一发放至各省,针对艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)蛋白酶和反转录酶基因的耐药突变基因型外部质控品的检测结果,进行分析和检测技术能力评价。方法对3年共5次由各省提交的,应用实验室自建方法(In house)、Viroseq(雅培公司,Abbott)和TruGene(西门子公司,Siemens)检测系统获得的耐药基因型数据进行综合分析。质控盘由6份血浆(HIV-1B及B/C重组毒株)组成,覆盖病毒的蛋白酶和反转录酶基因区的野生型和耐药突变型。每份序列与共享序列比较,使用扣分制对各实验室的结果进行评价。结果除3家核心实验室外,累计有19个省23家省市级疾病预防控制中心(CDC)或医院自愿参加,共提交了95份结果,其中3家实验室使用ViroSeq检测系统;提交了9份结果;1家使用TruGene检测系统;提交了1份结果;其余85份使用in-house检测系统。考核品总的序列阳性率(获得合格序列率)为97.7%,其中的低载量(1 000拷贝/mL)样本均得到阳性结果;根据累计提交的序列结果看,耐药位点判读的完全一致率为78.9%(75/95),序列编辑分析的一致率也有76.8%(73/95)。参加能力验证的省市级实验室由2007年的15家增加到2009年下半年的23家,合格率(001PT)由73.3%上升到(004PT)95.2%,3次以上优秀的实验室有13家。结论目前的检测方法均可成功扩增中国主要亚型流行毒株。所有检测结果在各实验室间的一致性均较高,因此基因型耐药检测技术是可靠的,但各实验室检测能力也存在差异。我国具备耐药基因型检测能力的实验室数量不断增加,检测水平逐年提高。     

云南省140例HIV／AIDS患者抗病毒治疗效果和耐药检测分析

[目的]观察接受中国现行一线艾滋病抗病毒药物治疗的HIV／AIDS患者,在治疗1年内免疫学应答、病毒载量抑制效果,以及耐药性产生的情况。[方法]入组既往未接受过抗病毒治疗的HIV／AIDS患者140例,观察治疗0月、6月、12月CD41淋巴细胞计数（CD4）、病毒载量（vL）,对治疗后VL〉1000拷贝／ml的患者进行耐药检测。[结果]入纽患者治疗前的CD4平均值为164个／μl,在治疗6个月和12个月分别上升至327个／μl和377个／μl。基线VL〈1000拷贝／ml的患者比例为2．1％,治疗6个月和12个月后,分别上升至94．7％和94．4％。基线样本的耐药性检测未发现主要耐药突变位点。治疗6个月时有7例患者VL〉1000拷贝／ml,耐药检测未发现耐药突变位点。治疗12个月时有7例VL〉1000拷贝／ml,其中3例同时出现了对核苷类药物和非核苷类药物不同程度的耐药。[结论]云南省使用现行一线抗病毒治疗方案取得了良好的治疗效果。抗病毒治疗1年时,2．4％的患者出现了抗HIV药物耐药。出现耐药时需要及时更换抗病毒治疗方案,避免耐药位点的累积导致交叉耐药,保障抗病毒治疗疗效。     

广西壮族自治区婚检人群婚前感染HIV危险因素调查

目的了解适婚年轻人群婚前感染艾滋病病毒(HIV)的危险因素及保护因素,以探寻有针对性的防控措施。方法在全区重点市县的婚检人群中,采用1∶1病例对照的方法,根据性别匹配选择婚检时感染和未感染HIV的婚检人员,采用单因素和Logistic多因素分析方法,分析与感染HIV相关的因素。结果调查HIV感染者和非HIV感染者共290人(145对),男性180人(62.1%),女性110人(37.9%)。多因素回归分析结果显示,在其他因素相同的情况下,年龄越大感染率越高[比值比(OR)=2.169,95%可信区间(CI):1.198~3.929],曾有外出史者较无外出史者感染率高(OR=2.831,95%CI:1.517~5.284),此次婚检前结过婚或有过长期同居的异性性伴较此前无该行为者感染率高(OR=4.273,95%CI:2.336~7.816),曾经吸毒者较无吸毒史者感染率高(OR=21.801,95%CI:2.752~172.700);听说过艾滋病者较未听说过者感染率低(OR=0.150,95%CI:0.027~0.817),从电视(OR=0.501,95%CI:0.271~0.926)及学校教育(OR=0.423,95%CI:0.219~0.814)获得艾滋病预防信息者较未从这两个途径获取预防信息者感染率低,差异均有统计学意义。结论曾有外出史、此次婚检前结过婚或有过长期同居的异性性伴及曾经吸毒是造成年轻人群感染HIV的主要危险因素,听说过艾滋病、从电视及学校教育获得艾滋病预防信息则是减少该类人群感染HIV的保护因素。     

治疗前耐药对HIV感染者抗病毒治疗12个月病毒抑制影响

目的 了解治疗前耐药（pretreatment drug resistance,PDR）对抗病毒治疗12个月病毒抑制影响情况,为艾滋病进一步扩大治疗并提高效果提供科学数据。方法 从我国艾滋病综合防治信息系统中选取广西钦州市2014年1月—2020年6月治疗前HIV感染者并收集现场和治疗数据,并对血样进行病毒RNA提取、pol基因区扩增和测序及耐药分析。采用Logistic回归模型分析治疗前耐药对抗病毒治疗12个月病毒抑制影响情况。结果 调查对象治疗前耐药率为5.5%(116/2 122, 95%CI:4.5～6.4),NNRTIs类药物的耐药率最高（3.1%,66/2 122）。抗病毒治疗12个月病毒抑制率为96.0%,其中治疗前不耐药组和耐药组分别为96.4%(1 213/1 259, 95%CI:95.2～97.3)和89.7%(70/78, 95%CI:80.8～95.5),两者之间差异有统计学意义（P=0.015）。在3个多因素Logistic回归模型分析中,与抗病毒治疗12个月病毒抑制有关的因素包括治疗前耐药（AOR=0.35, 95%CI:0.15～0.82）（模型1）;治...     

2017-2019年广西钦州市部分新报告HIV/AIDS感染者病毒亚型及细胞嗜性研究

目的 了解2017-2019年广西壮族自治区(广西)钦州市新报告人类免疫缺陷病毒(HIV)感染者/艾滋病患者(AIDS)中病毒基因亚型、耐药及细胞嗜性情况.方法 选取2017-2019年钦州市部分新报告HIV/AIDS,检测CD4+T淋巴细胞数量,并对HIV的pol、env基因区进行扩增、测序,构建系统进化树判定基因亚...     

HIV-1 CRF08BC亚型感染者治疗前耐药和多态性位点分析

目的了解我国HIV-1 CRF08_BC感染者治疗前耐药情况与基因多态性特征。方法采用横断面调查方法, 收集2018年全国治疗前耐药调查中的HIV感染者血浆样本, 提取RNA, 扩增蛋白酶和逆转录酶(PR/RT)区基因片段并测序, 利用HIVdb软件进行耐药判定, 使用χ2检验分析治疗前耐药与非耐药感染者氨基酸位点突变的差异, 利用CorMut R包分析耐药位点与多态性位点间突变共变异情况, 运用HIV-TRACE软件构建分子传播网络。结果共获得来自25个省市的465个CRF08_BC感染者的HIV序列, 总耐药率为17.8%(83/465), 非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTIs)、核苷类逆转录酶抑制剂(NRTIs)、蛋白酶类抑制剂(PIs)耐药率分别为16.6%(77/465)、1.1%(5/465)、0.9%(4/465), 其中利匹韦林(RPV)的耐药率最高(15.7%, 73/465)。位点E138A耐药突变的频率最高(11.6%, 54/465), 有6个多态性位点(S162C、K102Q、T200A、V179E、I202V、T200...