急性咽结膜热的分子病原学诊断

2004年夏季，浙江省某地发生了一起急性咽结膜热疫情，有62例发病，其中男38例，女24例，53例在发病前均有明确的游泳史。为明确病原学诊断，我们对部分急性期患者的咽拭子和眼拭子标本开展了荧光定量聚合酶链反应（PCR）检测和病毒分离，同时利用基因测序、BLAST比对和构建腺病毒hexon基因进化树确定了病毒型别特征。     

浙江省部分地区2009--2010年蚊媒中乙型脑炎病毒分子流行病学特征研究

目的 了解浙江省部分地区蚊媒携带流行性乙型脑炎(乙脑)病毒(JEV)情况及其分子流行病学特征.方法 2009-2010年7-8月从浙江省慈溪市和仙居县乙脑监测点采集蚊13620只,利用荧光定量PCR方法检测蚊中JEV核酸,用BHK-21细胞分离病毒,扩增JEV分离株E基因,然后选择6株进行测序并进行同源性分析.结果 慈溪和仙居监测点蚊中JEV带病毒率分别为17.0％(27/159)和3.4％( 1/29);从2010年143批蚊中分离到22株JEV,分离率为15.4％.6株测序株E基因全长均为1500个核苷酸(nt),推导编码500个氨基酸(aa),未发现nt插入和丢失,nt和aa同源性分别为99.2％～ 99.8％和100.0％,与浙江省2007-2008年JEV分离株的nt和aa同源性分别为99.1％～99.3％和99.2％～ 99.8％,与乙脑疫苗株SA14-14-2同源性分别为87.6％～88.0％和97.8％.E基因进化树显示,6株测序株位于基因Ⅰ型分支上.结论 浙江省慈溪市和仙居县监测点蚊媒携带JEV,其中慈溪监测点蚊媒中乙脑带病毒率明显高于仙居监测点,JEV分离株均为基因Ⅰ型.     

浙江省1996年急性弛缓性麻痹病例病原学分析

浙江省１９９６年报告急性弛缓性麻痹（ＡＦＰ）病例１６３例，采集粪便标本１６１例，分离到肠道病毒（ＥＶ）３７株，阳性率为２３０％。其中脊髓灰质炎（脊灰）病毒（ＰＶ）８株，分离率为５０％；非脊灰肠道病毒（ＮＰＥＶ）２９株，分离率为１８０％。８株ＰＶ经国家脊灰实验室鉴定均为疫苗株。对２６株ＮＰＥＶ定型，其中柯萨奇Ｂ组（ＣｏｘＢ）１０株，艾可（ＥＣＨＯ）７株，不能被中和９株。１９９６年采集ＡＦＰ病例接触者粪便标本１０２例，分离到ＮＰＥＶ３５株。     

2016年-2018年浙江省义乌市输入1型登革病毒分子溯源分析

目的对2016年-2018年义乌市输入1型登革热病例进行实验室检测与分子溯源分析。方法采集登革热病例急性期血清标本进行NS1抗原和核酸检测,用RT-PCR法扩增包膜蛋白(Envelope protein,E)基因,测定核苷酸序列并进行系统进化分析。结果6例登革热病例NS1抗原和核酸检测结果均为阳性。6株毒株之间的E基因核苷酸和氨基酸同源性分别为96.6%~99.3%和98.8%~100%,系统进化分析显示,E基因序列均属于登革病毒1型的GⅠ亚型,与东南亚2003年-2016年分离病毒株亲缘关系最近。结论2016年-2018年义乌市输入登革病毒1型的亚型主要为GⅠ亚型,输入来源主要为东南亚国家。     

流感病毒型别及亚型的多重RT-PCR方法快速检测

目的为适应流感疫情监测中快速诊断的需要,建立敏感特异的流感病毒多重逆转录PCR(MRTPCR)检测方法。方法对甲1型(H1N1)、甲3型(H3N2)、乙型流感病毒的血凝素(HA)基因保守区域分别设计引物进行MRTPCR。另设计了两对引物对H1N1和H3N2亚型流感病毒的神经氨酸酶(NA)N1、N2作亚型判断。结果MRTPCR可特异性检测出各型流感病毒的目的片段,相互间无交叉反应。二次PCR反应后对H1N1、H3N2流感病毒的检测灵敏度可达0.10TCID50/50μl以下,对乙型流感病毒的检测灵敏度可达0.01TCID50/50μl以下。应用此方法也可特异性地检测出H1N1和H3N2流感病毒的NA基因。结论用MRTPCR从临床患者含漱液标本中检出相关流感病毒的灵敏度要高于用狗肾传代细胞(MDCK)或鸡胚分离的灵敏度,达到了快速、敏感、正确检测流感病毒及其亚型的目的。     

1998年浙江省流行性感冒的病原学及血清学检测

１９９８年３月份我省发生流行性感冒（以下简称流感）的大规模流行,我们对疑似流感病人分别进行了病原分离及血清学鉴定。从３０余份含漱液中检出５份阳性标本,用流感标准抗血清进行了型别鉴定,结果为甲３型;同时对采集的部分患者急性期与恢复期的双份血清,分别测定甲 １、甲 ３和乙型相关 ＨＩ抗体滴度测定,也显示甲 ３型抗体滴度明显升高（ｔ＝ ４． １２ ｐ＜０．０１）,从病原学和血清学两方面均证实这次波及我省的为甲３型流感病毒。     

婴幼儿急性腹泻患者轮状病毒抗原及核酸检测

轮状病毒是引起婴幼儿急性腹泻的重要病原,在世界范围内广泛流行,在发达国家和发展中国家均有较高的发病率,但病死率后者明显高于前者。为了解本地区由轮状病毒引起的婴幼儿急性腹泻情况,我们于１９９７、１９９８年秋冬季节在浙江省儿童保健医院采集粪便标本进行轮状病毒抗原及核酸检测,现将结果报告如下。 材料和方法 １．粪便标本来源： １９９７、 １９９８年秋冬季（ １１～１２月份）,在浙江省儿童保健医院门诊部采集婴幼儿急性腹泻患者的粪便标本１０４份,置洁净的容器内,带冰运送到实验室,置－７０℃低温冰箱保存备检。 ２…     

浙江省2008-2009年三起诺如病毒胃肠炎暴发的病原分子特征分析

Objective To study the molecular characteristic of norovirus in 3 outbreaks of gastroenteritis in Zhejiang province. Methods During January 2008 and December 2009, fecal specimens of patients were collected from 3 outbreaks of acute viral gastroenteritis. Noroviruses were detected by Real-time RT-PCR. Part of the positive samples were randomly selected and detected by RT-PCR. PCR products were sequenced. Sequence analysis was undertaken based on partial sequence of RNA dependent RNA polymerase(RdRp)and capsid protein gene. Some positive samples were amplified by 3' RACE(rapid amplification of cDNA 3' ends), 3200 bp in length. The exact whole ORF2, ORF3 and 3' untranslation regions(UTR)gene of norovims were identified. Results There were in total 3 outbreaks of viral gastroenteritis caused by norovirus being reported. A total of 62 stools were obtained from cases with acute gastroentefitis. Noroviruses were detected in 41 cases including 27 strains of genogroup Ⅰ norovirus and 9 strains of genogroup Ⅱ norovirus, 5 strains of genogroup Ⅰ + Ⅱ norovirus. Four genotypes including G Ⅰ .8, G Ⅱ .b, G Ⅰ .2/0 Ⅰ .6 recombination together with co-infection of G Ⅰ .8 and G Ⅱ .b were detected. Conclusion Norovirus was confirmed as the major cause of outbreaks of viral gastroenteritis in Zhejiang province and multiple genotype of norovirus were identified from the outbreaks. It was the first time to have found a recombinant of G Ⅰ .6 capsid and G Ⅰ .2 polymerase norovims as well as the co-infection of G Ⅰ .8 and G Ⅱ .b norovirus in the same sample.     

浙江省2007-2008年急性出血性结膜炎暴发疫情病原学研究

急性出血性结膜炎(AHC),又称流行性出血性结膜炎,俗称"红眼病".1969年该病首次在加纳暴发流行,此后,在世界各地发生过多次大流行及局部地区暴发[1].引起该病的主要病原体为肠道病毒70型(EV70)和柯萨奇病毒A24变异株(CA24v).2007-2008年浙江省发生AHC流行,为迅速查明病因,及时采取有效的控制措施,本研究对患者的眼拭子样本进行病原学检测.     

浙江省2002－2018年病毒性脑膜炎病原学与分子流行病学特征

目的 了解2002-2018年浙江省病毒性脑膜炎病原学及分子流行病学特征。方法 从设立的监测点医院采集疑似病毒性脑膜炎患者样本2 173份,其中脑脊液1 718份、粪便455份,用荧光定量PCR方法检测脑脊液中人类肠道病毒(HEV)、腮腺炎病毒(MuV)、单纯疱疹病毒(HSV)、巨细胞病毒(CMV)和乙型脑炎病毒(JEV)核酸,粪便样本只检测HEV;用ELISA方法检测脑脊液中上述5种病毒IgM抗体;对HEV核酸阳性样本扩增病毒VP1基因和测序,确定病毒型别并进行进化分析。结果 在2002-2018年2 173份样本中检出HEV核酸阳性871份(40.1%),其中脑脊液1 718份、阳性654份(38.1%),粪便455份、阳性217份(47.7%);871份HEV核酸阳性样本,VP1扩增测序阳性670份,其中HEV-A 5份、HEV-B 665份,涉及23个病毒血清型,分别为柯萨奇病毒(CV)A组CVA4、CVA6、CVA9、CVA10,CVB组1~5, 埃可病毒(EchoV;E)E3、E4、E6、E7、E9、E11、E14、E16、E18、E21、E25、E30、E33和肠道病毒(EV)-71,位于前3位的分别为E30、E6和CVB5,该3个血清型间隔若干年呈现病毒活动性增强的趋势。从2012-2015和2018年795份脑脊液中检出HEV核酸阳性374份、MuV 6份、HSV和CMV均为5份,对其中的368份脑脊液同时检测5种病毒IgM抗体,HEV抗体阳性2份、JEV 6份、MuV 1份。670份HEV中除1份EV-71外,EchoV 517份、CV 152份,两者之比为3.4:1,两类病毒间隔3~5年存在优势株交替变化的趋势。VP1进化树显示,浙江省HEV位于HEV-A和HEV-B分支上,E30存在h和i基因亚型。结论 浙江省病毒性脑膜炎的主要病原为HEV-B;EchoV检出率明显高于CV,两类病毒存在交替变化的趋势;优势血清型E30、CVB5和E6间隔若干年呈现病毒活动性增强的趋势;监测点HEV活动强度与病毒性脑膜炎暴发疫情的发生两者之间在时间上有较好的相关性。