新型胶颗粒芯片技术检测痰标本中结核分枝杆菌及其耐药性的研究

目的 评估一种新型胶颗粒芯片技术[TruArray胶颗粒芯片(Gel element arrays),简称为“TruArray芯片”]用于痰标本中结核分枝杆菌及利福平(RFP)和异烟肼(INH)耐药性的检测效能。 方法 选取2016年8月在首都医科大学附属北京胸科医院就诊的149例疑似肺结核患者痰标本,分别进行涂片镜检、BACTEC MGIT 960快速液体培养系统(简称“MGIT 960”)、TruArray芯片和GeneXpert MTB/RIF(简称“GeneXpert”)检测,对液体培养阳性菌株进行测序菌种鉴定、MGIT 960药物敏感性试验(简称“药敏试验”)和耐药相关基因测序,分析TruArray芯片检测痰标本中结核分枝杆菌及其耐药性的检测效能。 结果 液体培养、GeneXpert和TruArray芯片对结核分枝杆菌的检出率分别为32.2%(48/149),53.7%(80/149)和57.0%(85/149),TruArray芯片和GeneXpert两种方法检出率差异无统计学意义(χ ²=0.34,P=0.560),但TruArray芯片检测阳性率高于液体培养(χ ²=18.59,P<0.01)。以MGIT 960试验结果为标准,TruArray芯片检测痰标本中结核分枝杆菌的敏感度和特异度分别为97.9%(47/48)和61.4%(62/101);以GeneXpert检测结果为标准,TruArray芯片检测结核分枝杆菌的敏感度和特异度分别为97.5%(78/80)和88.4%(61/69)。以MGIT 960药敏试验结果为标准,TruArray芯片检测RFP耐药的敏感度和特异度分别为91.7%(11/12)和96.8%(30/31);以GeneXpert检测结果为标准,TruArray芯片检测RFP耐药的敏感度和特异度为85.0%(17/20)和97.9%(47/48);以耐药基因测序结果为标准,TruArray芯片检测RFP耐药的敏感度和特异度分别为92.3%(12/13)和100.0%(30/30)。以MGIT 960液体药敏试验结果为标准,TruArray芯片技术检测INH耐药的敏感度和特异度分别为78.6%(11/14)和93.8%(30/32);以耐药基因测序结果为判断标准,TruArray芯片检测INH耐药的敏感度和特异度分别为100.0%(11/11)和94.3%(33/35)。 结论 TruArray芯片检测技术快速、可靠,在结核病及耐多药结核病快速诊断方面具有非常好的应用前景。     

13种抗生素对快生长分枝杆菌的体外抑菌效果评价

目的 评价快生长分枝杆菌(rapidly growing mycobacteria,RGM)临床分离株对13种抗生素的敏感性特征。方法 收集首都医科大学附属北京胸科医院2015年1月至2019年12月从临床样本中分离出的98株RGM,包括25株偶发分枝杆菌、70株脓肿分枝杆菌和3株龟分枝杆菌。使用Sensititre RAPMYCO药敏板测定13种抗生素(阿米卡星、妥布霉素、阿莫西林-克拉维酸、头孢西丁、亚胺培南、环丙沙星、莫西沙星、克拉霉素、利奈唑胺、米诺环素、多西霉素、替加环素、甲氧苄啶-磺胺甲噁唑)对98株RGM临床分离株的体外抑菌活性。结果 在所测定的13种抗生素中,阿米卡星对所检测的3种RGM临床分离株的体外抑菌活性最佳,对偶发分枝杆菌和脓肿分枝杆菌临床分离株的敏感率分别100.0%(25/25)和90.0%(63/70)。与多西环素、米诺环素相比,替加环素对RGM临床分离株的体外抑菌效果更好,对偶发分枝杆菌和脓肿分枝杆菌临床分离株的敏感率分别为100.0%(25/25)和72.9%(51/70)。莫西沙星和环丙沙星对偶发分枝杆菌临床分离株表现出较强的抑菌活性,敏感率分别为100.0%(25/25)和92.0%(23/25),而对脓肿分枝杆菌临床分离株几乎没有体外抑菌活性,耐药率均为95.7%(67/70)。此外,几乎所有检测的RGM临床分离株均对头孢西丁、多西环素、利奈唑胺、亚胺培南和甲氧嘧啶-磺胺甲噁唑耐药。结论 阿米卡星、替加环素和克拉霉素对脓肿分枝杆菌和偶发分枝杆菌临床分离株具有较好的体外抑菌活性,但在不同菌株间依然存在差异,需要对每个菌种或临床分离菌株进行单独的药物敏感性试验。     

堪萨斯分枝杆菌临床分离株对异烟肼敏感性差异机制研究

目的:测定堪萨斯分枝杆菌临床分离株对异烟肼的敏感性,并探讨引发其差异的原因。方法:结核分枝杆菌标准株H37Rv(ATCC27294)、堪萨斯分枝杆菌标准株(ATCC12478),以及35株分离自非结核分枝杆菌感染患者的堪萨斯分枝杆菌临床分离株均来源于首都医科大学附属北京胸科医院。微孔板法测定35株堪萨斯分枝杆菌临床分离株加入外排泵抑制剂(氰化羰基-3-氯苯腙、二环己基碳二亚胺、维拉帕米和利血平)前后的异烟肼体外最低抑菌浓度(minimum inhibitory concentration, MIC)变化,并评估其关联性;测定已知与异烟肼耐药相关的基因序列,了解基因序列多态性与MIC值的相关性。过表达结核分枝杆菌和堪萨斯分枝杆菌过氧化氢-过氧化物酶(KatG),利用生物层干涉技术检测蛋白与异烟肼亲和力,利用酶联免疫法检测蛋白过氧化物-过氧化氢酶活性。结果:35株堪萨斯分枝杆菌临床分离株中,异烟肼对5.7%(2/35)、71.4%(25/35)、2.9%(1/35)和20.0%(7/35)的菌株的MIC值分别为0.5、1、4和>32μg/ml;分别加入适量氰化羰基-3-氯苯腙、二环己...     

中国耐利福平结核分支杆菌rpoB基因突变特点

目的：为了阐明中国结核病耐利福平菌株rpoB基因突变特点。方法：对212株结核分支杆菌菌株包括rpoB基因核心区域81个碱基在内的588个碱基进行序列测定,其中利福平耐药株163株;利福平敏感株46株,及人工诱导的利福平耐药株3株。结果：有89．0％（145／163）的耐药株存在rpoB基因突变,而对照敏感株无突变。531位氨基酸突变率为49．1％;526位氨基酸突变率为17．8％;联合突变发生率为12．3％;还有2株细菌存在同义突变;未检测到发生缺失或插入突变的菌株。高耐药组（耐250μg/ml利福平）531位氨基酸的突变率显著高于低耐药组（耐50μg/ml利福平）,P＜0．05。结论：中国结核菌耐利福平菌株的rpoB基因突变的发生率约为90％,其中最常见的突变位点是531位色氨酸和526位组氨酸,二者总体突变率是66．9％;利福平高耐药组531位氨基酸发生突变的几率高于低耐药组,插入和缺失突变在我国比较罕见;DNA序列分析对临床用药有指导意义。     

结核分支杆菌耐利福平与rpoB基因

90年代初 ,全球结核病呈现死灰复燃趋势。到目前为止 ,结核病仍是造成成人死亡的感染性疾病中最常见的病因 ,全球 2 6 %的可避免死亡与结核病有关。我国约有 6 0 0万结核病患者 ,每年死于结核病者约 2 5万 ,为死于其他各类传染病人数总和的 2倍 ,每年由结核病带来的直接损失超过 35亿。结核病疫情恶化的原因主要有两方面 :一是耐药 ,尤其是耐多药结核 (ＭＤＲ ＴＢ)的出现 ;另一原因是人类免疫缺陷病毒 (ＨＩＶ)感染的爆发流行。我国结核病具有耐药率高的特点 ,初治病人中耐药结核病占 2 8 1% ,复治病人中占 41 1%。耐药结核病中继发耐药占…     

利福平和利福布汀对结核分枝杆菌交叉耐药率的初步探讨

目的通过对结核分枝杆菌MIC的测定,初步探讨利福平和利福布汀两药间的交叉耐药率。方法利用Alarmar Blue法(Alamar blue susceptibility test,MABA)检测116株结核分枝杆菌临床分离株对利福平和利福布汀的体外MIC。结果 36株利福平敏感株均对利福布汀敏感;80株利福平耐药株中有58株对利福布汀也同时耐药(对利福布汀的MIC>0.5 ug/ml),利福平与利福布汀间的交叉耐药率为72.5%(58/80);同时对利福平和利福布汀耐药的菌株对两种药物的耐药程度呈现正相关。结论利福布汀较利福平有更好的体外抗菌活性。对于利福平耐药而利福布汀敏感的患者仍可选择利福布汀作为联合化疗的有效药物之一。     

应用多重PCR方法快速鉴定结核分枝杆菌复合群与非结核分枝杆菌的研究

目的 建立并评估快速鉴定结核分枝杆菌复合群（MTBC）与非结核分枝杆菌（NTM）的多重PCR方法。 方法 应用分别针对MTBC的oxyR-ahpC基因间隔区、MTBC和NTM的rpoB基因可变区的3对分枝杆菌特异性引物进行多重PCR扩增,扩增产物分别为473 bp、235 bp和136 bp。应用该多重PCR方法对6株MTBC标准株、50株NTM标准株、312株MTBC临床分离株和300株NTM临床分离株进行了初步菌种鉴定。 结果 经多重PCR 扩增后进行凝胶电泳,MTBC标准株473 bp和235 bp片段均可见,NTM标准株仅见136 bp片段。312株MTBC临床分离株中,310株扩增出473 bp和235 bp片段,敏感度为99.36%（310/312）,特异度为99.32%（294/296）;300株NTM临床分离株中,294株扩增出136 bp片段,敏感度为98.00%（294/300）,特异度为100.00%（310/310）。 结论 该多重PCR方法可检测并鉴别MTBC及NTM,具有高度的特异度和敏感度,有可能作为鉴别MTBC与NTM的有价值的检测手段。     

贝达喹啉、氯法齐明和德拉马尼对常见致病性非结核分枝杆菌体外抑菌活性及耐药机制的研究进展

近年来,非结核分枝杆菌(non-tuberculous mycobacteria, NTM)引起的感染呈逐渐上升趋势,严重威胁人类健康。NTM致病的菌种繁多,不同菌种NTM对药品的敏感性各异,使其治疗存在较大困难。因此,寻找NTM病治疗效果较佳的药品非常有必要。NTM种属分布常具有地域特点,在多数地区鸟-胞内分枝杆菌复合群、脓肿分枝杆菌和堪萨斯分枝杆菌为较常见的致病菌种。贝达喹啉(bedaquiline, Bdq)、氯法齐明(clofazimine,Cfz)及德拉马尼(delamanid,Dlm)因对治疗NTM病体现出了良好的治疗潜力而受到泛关注。为了提高对抗NTM药品敏感性及耐药机制的认识,作者就Bdq、Cfz和Dlm对以上常见致病性NTM的体外抑菌活性及耐药相关机制进行综述。     

鸟-胞内分枝杆菌复合菌组肺病与脓肿分枝杆菌肺病临床表现的对比观察

目的 比较鸟-胞内分枝杆菌复合菌组(MAC)肺病和脓肿分枝杆菌肺病临床表现的差异.方法 回顾性分析北京胸科医院2010-2011年新发并有完整资料的MAC肺病18例和脓肿分枝杆菌肺病9例的临床资料,旨在提高对NTM肺病的诊断水平.结果 MAC肺病和脓肿分枝杆菌肺病患者在性别、年龄、体重指数、基础疾病、症状和痰抗酸染色阳性等方面无显著差别.MAC肺病以上叶空洞型较常见(13/18),脓肿分枝杆菌肺病以结节支气管扩张型较常见(8/9);脓肿分枝杆菌肺病患者双肺微结节(8/9)、树芽征(7/9)和多发支气管扩张(8/9)较MAC肺病(7/18、6/18和5/18)常见,MAC肺病患者上叶空洞(13/18)较脓肿分枝杆菌肺病(2/9)常见.结论 MAC肺病和脓肿分枝杆菌肺病的许多特点相类似,但双肺微结节、树芽征和多发支气管扩张多见于脓肿分枝杆菌肺病,上叶空洞多见于MAC肺病.     

中国耐利福平结核分支杆菌rpoB基因突变特点

目的 为了阐明中国结核分支杆菌耐利福平析rpoB基因突变特点。方法 对242株结核分支杆菌临床分离包括rpoB基因核心区域81个碱基在内的588个碱基进行序列测定,其中耐利福平株193株,利福平敏感株46株,人工诱导的耐利福平株3株。结果 89．1％（172．193）的临床分离耐药株存在rpoB基因突变,而46株敏感株无突变。531位氨基酸突变率为46．1％;526位氨基酸突变率为17．1％;联合突变发生率为12．4％;还有4株细菌发生同义突变;未检测到发生缺失或插入突变的菌株。高耐药组（耐250μg/ml利福平）531位氨基酸的突变率显著高于低耐药组（耐50μg/ml利福平）,P＜0．05。结论 中国结核分支杆菌耐利福平株的rpoB基因突变的发生率约为90％,其中最常见的突变位点是531位丝氨酸和526位组氨酸,两者突变率之和约为63％;利福平高耐药组531位氨基酸发生突变的几率高于低耐药组;受度蓖株未发现搬运入或缺失突变;DNA序列分析对临床用药有指导意义。